More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_4438 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_4438  exodeoxyribonuclease III  100 
 
 		 263 aa  543  1e-154  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3202  exodeoxyribonuclease III Xth  84.03 
 
 		 263 aa  467  9.999999999999999e-131  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.840556  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2804  exodeoxyribonuclease III  83.65 
 
 		 263 aa  462  1e-129  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.96481  normal  0.323562 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2758  exodeoxyribonuclease III  81.37 
 
 		 276 aa  452  1.0000000000000001e-126  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.139698  normal  0.30939 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2496  exodeoxyribonuclease III  81.37 
 
 		 267 aa  451  1.0000000000000001e-126  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.0083215  normal  0.338343 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1810  exodeoxyribonuclease III xth  79.47 
 
 		 266 aa  443  1e-123  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.962919 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1755  exodeoxyribonuclease III (xth)  79.47 
 
 		 266 aa  441  1e-123  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4240  exodeoxyribonuclease III Xth  68.99 
 
 		 262 aa  381  1e-105  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.381888  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0873  exodeoxyribonuclease III  64.57 
 
 		 260 aa  357  9.999999999999999e-98  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2355  exodeoxyribonuclease III Xth  65.75 
 
 		 260 aa  356  1.9999999999999998e-97  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.936665  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0864  exodeoxyribonuclease III  64.57 
 
 		 279 aa  354  6.999999999999999e-97  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1686  exodeoxyribonuclease III  63.08 
 
 		 262 aa  352  2.9999999999999997e-96  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1154  exodeoxyribonuclease III Xth  62.36 
 
 		 263 aa  343  1e-93  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.311062  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1479  exodeoxyribonuclease III Xth  63.22 
 
 		 263 aa  342  2.9999999999999997e-93  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.688806 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2680  exonuclease III  63.26 
 
 		 264 aa  342  4e-93  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.112967  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1677  exodeoxyribonuclease III Xth  63.98 
 
 		 263 aa  342  5e-93  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1683  exodeoxyribonuclease III  66.93 
 
 		 258 aa  335  5e-91  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.122396 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3018  exodeoxyribonuclease III Xth  61.54 
 
 		 261 aa  335  5.999999999999999e-91  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.176682  normal  0.802869 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3266  exodeoxyribonuclease III Xth  60.31 
 
 		 263 aa  329  2e-89  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1402  exodeoxyribonuclease III  62.6 
 
 		 258 aa  327  1.0000000000000001e-88  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.941543  normal  0.632012 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2700  exodeoxyribonuclease III Xth  58.17 
 
 		 270 aa  323  2e-87  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.6811 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1195  exodeoxyribonuclease III Xth  56.98 
 
 		 259 aa  311  4.999999999999999e-84  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.206462  normal  0.651553 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1956  exodeoxyribonuclease III Xth  58.02 
 
 		 264 aa  311  9e-84  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0751549  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1911  exodeoxyribonuclease III Xth  58.53 
 
 		 264 aa  309  2.9999999999999997e-83  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.566879  normal  0.517852 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1315  exodeoxyribonuclease III  57.36 
 
 		 259 aa  309  2.9999999999999997e-83  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2657  exodeoxyribonuclease III  56.98 
 
 		 259 aa  308  5.9999999999999995e-83  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.107023  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2232  exodeoxyribonuclease III Xth  57.63 
 
 		 264 aa  308  5.9999999999999995e-83  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.410107 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3127  exodeoxyribonuclease III Xth  57.03 
 
 		 262 aa  301  1e-80  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.427624 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0929  exodeoxyribonuclease III Xth  56.7 
 
 		 261 aa  298  6e-80  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0897  exodeoxyribonuclease III  53.53 
 
 		 268 aa  298  7e-80  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0660  exodeoxyribonuclease III  54.05 
 
 		 263 aa  297  1e-79  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.00000000969043  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0692  exodeoxyribonuclease III  54.05 
 
 		 263 aa  297  1e-79  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.0000190547  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2815  exodeoxyribonuclease III  55.04 
 
 		 261 aa  291  7e-78  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0879261  normal  0.730816 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2921  exodeoxyribonuclease III Xth  57.09 
 
 		 264 aa  291  9e-78  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1920  exodeoxyribonuclease III  53.46 
 
 		 262 aa  290  2e-77  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.19654  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1886  putative Exodeoxyribonuclease III  53.88 
 
 		 259 aa  288  8e-77  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0111436  normal  0.144129 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1784  exodeoxyribonuclease III  54.1 
 
 		 266 aa  273  1.0000000000000001e-72  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.144543  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3456  exodeoxyribonuclease III Xth  52.69 
 
 		 303 aa  274  1.0000000000000001e-72  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3378  exodeoxyribonuclease III Xth  51.16 
 
 		 259 aa  270  2e-71  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0851015 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0913  exodeoxyribonuclease III Xth  49.61 
 
 		 261 aa  268  5e-71  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.515839  normal  0.110771 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2122  exodeoxyribonuclease III  53.31 
 
 		 262 aa  267  2e-70  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.443475  normal  0.589868 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1964  exodeoxyribonuclease III Xth  50 
 
 		 258 aa  262  4e-69  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0747161  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2180  exodeoxyribonuclease III (xth)  51.56 
 
 		 256 aa  262  4e-69  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1868  exodeoxyribonuclease III  50.19 
 
 		 264 aa  259  3e-68  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0445089  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2159  exodeoxyribonuclease III Xth  49.23 
 
 		 260 aa  257  2e-67  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00188855  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2061  exodeoxyribonuclease III (exonuclease III)  48.83 
 
 		 255 aa  254  8e-67  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.240867  normal  0.343531 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1386  exodeoxyribonuclease III Xth  49.62 
 
 		 263 aa  254  1.0000000000000001e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.031293  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3911  exodeoxyribonuclease III  50.58 
 
 		 271 aa  254  1.0000000000000001e-66  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5283  exodeoxyribonuclease III Xth  49.81 
 
 		 269 aa  252  3e-66  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.974803  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1491  exodeoxyribonuclease III Xth  47.92 
 
 		 264 aa  247  1e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.74554 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0877  exodeoxyribonuclease III Xth  46.88 
 
 		 264 aa  247  1e-64  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00278743 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0156  exodeoxyribonuclease III  47.08 
 
 		 259 aa  245  4e-64  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5986  exodeoxyribonuclease III Xth  46.18 
 
 		 270 aa  245  4.9999999999999997e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.294616 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2221  exodeoxyribonuclease III  45.8 
 
 		 270 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.162729  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5537  exodeoxyribonuclease III Xth  45.25 
 
 		 308 aa  243  1.9999999999999999e-63  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0199533 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3045  exodeoxyribonuclease III  46.42 
 
 		 265 aa  243  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0213415  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2668  exodeoxyribonuclease III Xth  46.54 
 
 		 260 aa  240  2e-62  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.276969  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1085  exodeoxyribonuclease III  46.01 
 
 		 259 aa  239  2e-62  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.647883  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2707  exodeoxyribonuclease III, putative  46.04 
 
 		 265 aa  239  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3068  exodeoxyribonuclease III Xth  49.03 
 
 		 255 aa  239  4e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.504533 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3423  exodeoxyribonuclease III  49.23 
 
 		 255 aa  239  5e-62  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1964  exodeoxyribonuclease III Xth  46.56 
 
 		 260 aa  238  5.999999999999999e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.917664  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0675  exodeoxyribonuclease III  42.14 
 
 		 281 aa  237  1e-61  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.107108  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4910  exodeoxyribonuclease III  44.44 
 
 		 283 aa  237  1e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.38033  decreased coverage  0.000445359 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3424  exodeoxyribonuclease III  44.91 
 
 		 272 aa  236  2e-61  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.903718  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1993  exodeoxyribonuclease III (xth)  46.25 
 
 		 260 aa  236  2e-61  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0563751  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3010  exodeoxyribonuclease III Xth  46.3 
 
 		 265 aa  235  5.0000000000000005e-61  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3799  exodeoxyribonuclease III  45.31 
 
 		 256 aa  231  8.000000000000001e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.602523  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0921  exodeoxyribonuclease III  45.91 
 
 		 261 aa  231  1e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.784471  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1207  exodeoxyribonuclease III (xth)  45.14 
 
 		 256 aa  231  1e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0946  exodeoxyribonuclease III Xth  48.03 
 
 		 256 aa  229  3e-59  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.416202  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2898  exodeoxyribonuclease III  45.53 
 
 		 284 aa  229  3e-59  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.696489  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09930  putative exonuclease III  45.53 
 
 		 266 aa  228  7e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0994533  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2622  exodeoxyribonuclease III Xth  44.83 
 
 		 254 aa  228  9e-59  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.128111  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4299  exodeoxyribonuclease III Xth  44.92 
 
 		 257 aa  226  4e-58  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.231101  normal  0.275572 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0579  exodeoxyribonuclease III (xth)  43.14 
 
 		 274 aa  224  2e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3648  exodeoxyribonuclease III  42.64 
 
 		 254 aa  221  6e-57  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2418  exodeoxyribonuclease III  42.91 
 
 		 277 aa  219  1.9999999999999999e-56  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2467  exodeoxyribonuclease III  41.76 
 
 		 257 aa  219  3e-56  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.184552 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3728  exodeoxyribonuclease III Xth  44.53 
 
 		 256 aa  218  6e-56  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0371  exodeoxyribonuclease III  42.44 
 
 		 279 aa  218  7e-56  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.226435  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0446  exodeoxyribonuclease III Xth  46.92 
 
 		 258 aa  217  1e-55  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.255564  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1246  exodeoxyribonuclease III Xth  43.02 
 
 		 254 aa  216  2e-55  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0137674 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3070  exodeoxyribonuclease III  41.31 
 
 		 256 aa  216  2.9999999999999998e-55  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0007  exodeoxyribonuclease III Xth  42.25 
 
 		 255 aa  213  3.9999999999999995e-54  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.669681 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1699  exodeoxyribonuclease III xth  41.83 
 
 		 282 aa  211  1e-53  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0398069  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1001  exodeoxyribonuclease III  41.41 
 
 		 259 aa  210  2e-53  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0471864  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2071  exodeoxyribonuclease III  43.7 
 
 		 256 aa  210  2e-53  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.663777 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1847  exodeoxyribonuclease III  41.47 
 
 		 258 aa  210  2e-53  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1252  exodeoxyribonuclease III Xth  39.21 
 
 		 282 aa  210  2e-53  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.0010877  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2687  exodeoxyribonuclease III  41.09 
 
 		 258 aa  209  3e-53  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1520  exodeoxyribonuclease III  41.09 
 
 		 258 aa  209  3e-53  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.746689  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1738  exodeoxyribonuclease III  41.09 
 
 		 258 aa  209  3e-53  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2776  exodeoxyribonuclease III Xth  41.15 
 
 		 260 aa  209  3e-53  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0418103 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2631  exodeoxyribonuclease III  41.09 
 
 		 258 aa  209  3e-53  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.223347  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3071  exodeoxyribonuclease III  41.09 
 
 		 258 aa  209  3e-53  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2247  exodeoxyribonuclease III  41.09 
 
 		 258 aa  209  3e-53  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2765  exodeoxyribonuclease III  40.84 
 
 		 322 aa  209  4e-53  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06981  exodeoxyribonuclease III  40.68 
 
 		 279 aa  208  7e-53  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1526  exodeoxyribonuclease III  39.85 
 
 		 258 aa  208  8e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.541899  normal  0.12165 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>