144 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_4253 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009485  BBta_4253  hypothetical protein  100 
 
 
144 aa  293  4e-79  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.825501  normal  0.678624 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1174  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  67.13 
 
 
142 aa  203  5e-52  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2167  hypothetical protein  41.35 
 
 
149 aa  109  1.0000000000000001e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5912  hypothetical protein  39.66 
 
 
155 aa  108  3e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0103  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  41.38 
 
 
153 aa  107  5e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0350  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  37.82 
 
 
217 aa  104  3e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0130  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  39.44 
 
 
149 aa  101  3e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2495  Rieske (2Fe-2S) domain protein  36.88 
 
 
151 aa  90.9  6e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.746892 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3574  Rieske (2Fe-2S) region  38.39 
 
 
117 aa  82.8  0.000000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.556915  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3370  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  32.04 
 
 
104 aa  78.2  0.00000000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0252226 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1935  hypothetical protein  34.19 
 
 
120 aa  73.9  0.0000000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.455363  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3193  Rieske (2Fe-2S) domain protein  42.5 
 
 
111 aa  73.2  0.000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.242192  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5626  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  35.92 
 
 
111 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.164476 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3905  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  35.34 
 
 
114 aa  72.4  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.391138  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0858  Rieske (2Fe-2S) region  34.75 
 
 
120 aa  70.9  0.000000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01838  rieske  39.24 
 
 
113 aa  70.5  0.000000000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.318103  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2849  Rieske (2Fe-2S) protein  30.91 
 
 
118 aa  70.5  0.000000000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1238  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  38.82 
 
 
109 aa  70.1  0.000000000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.724379  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42610  hypothetical protein  34.69 
 
 
105 aa  69.7  0.00000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.217045  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0992  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  29.7 
 
 
105 aa  69.7  0.00000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0130458  hitchhiker  0.00000000116756 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3650  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  35.24 
 
 
130 aa  70.1  0.00000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.27405 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0676  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.41 
 
 
123 aa  68.2  0.00000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1043  hypothetical protein  35.19 
 
 
138 aa  68.2  0.00000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0922873  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0114  Rieske (2Fe-2S) domain protein  31.19 
 
 
108 aa  67.8  0.00000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.225812  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4801  Rieske (2Fe-2S) region  32.65 
 
 
105 aa  67.4  0.00000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0146102  hitchhiker  0.00629459 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0972  iron-sulfur cluster-binding protein, Rieske family  29.29 
 
 
110 aa  67.4  0.00000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00000277135  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0973  Rieske (2Fe-2S) domain protein  30.97 
 
 
130 aa  67  0.00000000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0515815 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2437  Rieske (2Fe-2S) region  36.36 
 
 
127 aa  66.2  0.0000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.55603  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0908  Rieske (2Fe-2S) domain protein  31.78 
 
 
130 aa  66.2  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.313285  normal  0.0276254 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62360  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  28.71 
 
 
115 aa  66.2  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0838  Rieske [2Fe-2S] region  27.45 
 
 
132 aa  65.1  0.0000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000649112 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3141  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  29.84 
 
 
120 aa  65.1  0.0000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1710  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  34 
 
 
131 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0741905  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0114  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.78 
 
 
122 aa  64.7  0.0000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0228441  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0744  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  33.04 
 
 
105 aa  64.7  0.0000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.347579  hitchhiker  0.000000000639734 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1065  hypothetical protein  36 
 
 
133 aa  64.3  0.0000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.967629  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3084  Rieske (2Fe-2S) domain protein  40.45 
 
 
138 aa  64.3  0.0000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.325284  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5218  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  33.33 
 
 
111 aa  64.3  0.0000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.434864  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2392  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  38.54 
 
 
124 aa  63.9  0.0000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.348824  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3380  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  33.65 
 
 
111 aa  64.3  0.0000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2735  Rieske (2Fe-2S) protein  36.84 
 
 
111 aa  63.9  0.0000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0390389  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0523  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  36.49 
 
 
131 aa  63.9  0.0000000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.472442  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2487  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  36.49 
 
 
131 aa  63.9  0.0000000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00132222  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2795  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  36.49 
 
 
131 aa  63.9  0.0000000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00324792  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2799  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  36.49 
 
 
131 aa  63.9  0.0000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0503713  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2860  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  36.49 
 
 
131 aa  63.9  0.0000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0573473  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1810  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  36.49 
 
 
131 aa  63.9  0.0000000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3198  ferredoxin, 2Fe-2S  35.71 
 
 
112 aa  63.5  0.0000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.0027175  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2008  Rieske (2Fe-2S) region  32.17 
 
 
119 aa  63.2  0.000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0821  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  35.58 
 
 
130 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.239168  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3434  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  33.01 
 
 
111 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4829  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  33.64 
 
 
119 aa  62.8  0.000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.642068 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5427  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  28.71 
 
 
107 aa  63.2  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2272  Rieske (2Fe-2S) region  38.81 
 
 
134 aa  62  0.000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.308557  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0990  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  34 
 
 
136 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0659  hypothetical protein  30.63 
 
 
136 aa  61.6  0.000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4083  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.04 
 
 
111 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.171695  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0634  Rieske (2Fe-2S) region  33 
 
 
133 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1114  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  33 
 
 
133 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2919  Rieske (2Fe-2S) domain protein  35 
 
 
134 aa  60.5  0.000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00744341  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0994  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  33 
 
 
136 aa  60.1  0.000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4226  Rieske (2Fe-2S) protein  35.71 
 
 
133 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.40748  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6068  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.04 
 
 
111 aa  59.3  0.00000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0959217  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1072  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  37.14 
 
 
133 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.640953  normal  0.136055 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0589  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  37.04 
 
 
126 aa  60.1  0.00000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.03606 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4688  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  27.93 
 
 
105 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0626972  hitchhiker  0.0000000488951 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2190  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  35.71 
 
 
132 aa  58.2  0.00000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0622882 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5489  ferredoxin subunits of nitrite reductase and ring-hydroxylating dioxygenase  33.75 
 
 
119 aa  57.8  0.00000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.121832  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4785  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.46 
 
 
126 aa  57.4  0.00000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.453437 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1663  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  37.97 
 
 
118 aa  55.5  0.0000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1340  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  29.47 
 
 
116 aa  55.1  0.0000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000041033 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3228  nitrogen-fixing NifU domain-containing protein  31.86 
 
 
289 aa  55.1  0.0000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.769303  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1561  hypothetical protein  36.25 
 
 
116 aa  54.7  0.0000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.150485  normal  0.132727 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4690  Rieske (2Fe-2S) domain protein  25.23 
 
 
114 aa  54.3  0.0000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000178918 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3657  Rieske (2Fe-2S) region  40.3 
 
 
121 aa  54.3  0.0000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0036  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  36.46 
 
 
111 aa  54.3  0.0000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4554  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  27.55 
 
 
105 aa  54.3  0.0000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000741211 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2795  Rieske iron sulfur-like protein  41.79 
 
 
170 aa  53.9  0.0000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0559  Rieske (2Fe-2S) domain protein  36.59 
 
 
156 aa  53.5  0.0000009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2640  Rieske (2Fe-2S) domain protein  30.97 
 
 
125 aa  53.5  0.0000009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3287  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.97 
 
 
125 aa  53.5  0.0000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1421  Rieske (2Fe-2S) region  29.73 
 
 
122 aa  53.1  0.000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.606028 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1176  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.1 
 
 
125 aa  51.6  0.000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.262842  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1381  Rieske (2Fe-2S) domain protein  40.3 
 
 
123 aa  51.6  0.000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1723  Rieske (2Fe-2S) protein  32.81 
 
 
121 aa  51.2  0.000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3194  Rieske (2Fe-2S) region  42.62 
 
 
100 aa  49.7  0.00001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  6.5117e-17  hitchhiker  4.2038099999999998e-22 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3083  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  33.85 
 
 
121 aa  50.1  0.00001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1360  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  37.31 
 
 
151 aa  49.3  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5279  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  28.72 
 
 
124 aa  48.5  0.00003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.238737  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0161  Rieske (2Fe-2S) domain protein  50.91 
 
 
100 aa  47.4  0.00006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000000394797  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0144  Rieske (2Fe-2S) domain protein  50.91 
 
 
100 aa  47.4  0.00007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008036  Sala_3205  nitrogen-fixing NifU-like  36.99 
 
 
311 aa  47.4  0.00007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0987  Rieske 2Fe-2S family protein  40 
 
 
106 aa  46.2  0.0002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1488  PfkB  28.05 
 
 
401 aa  45.4  0.0002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2392  protein of unknown function DUF59  40.98 
 
 
238 aa  45.8  0.0002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0922  methanesulfonate monooxygenase component; iron sulfur protein  29.03 
 
 
242 aa  46.2  0.0002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.738029  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5415  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  33.33 
 
 
521 aa  46.2  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.792379  normal  0.597511 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1251  nitrogen-fixing NifU domain protein  34.29 
 
 
289 aa  45.4  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0473  Rieske (2Fe-2S) domain protein  41.82 
 
 
99 aa  44.7  0.0004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0073046  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0363  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  39.13 
 
 
132 aa  44.7  0.0005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000878318  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>