254 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_4209 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_4209  hypothetical protein  100 
 
 		 254 aa  521  1e-147  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.810963  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2862  DSBA oxidoreductase  76.17 
 
 		 255 aa  382  1e-105  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.898425  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2185  DSBA oxidoreductase  79.57 
 
 		 255 aa  377  1e-104  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.829499  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3016  DSBA oxidoreductase  72.27 
 
 		 255 aa  352  2.9999999999999997e-96  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.517861  normal  0.845616 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2720  DSBA oxidoreductase  74.79 
 
 		 255 aa  352  4e-96  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2436  DSBA oxidoreductase  70.31 
 
 		 255 aa  347  8e-95  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.43203 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1750  DSBA oxidoreductase  79.46 
 
 		 254 aa  336  1.9999999999999998e-91  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0404971  normal  0.241511 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2703  DSBA oxidoreductase  50.19 
 
 		 260 aa  262  4e-69  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0600597  normal  0.0595664 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3499  DSBA oxidoreductase  56.68 
 
 		 266 aa  245  4.9999999999999997e-64  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.511327 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3948  DSBA oxidoreductase  45.95 
 
 		 259 aa  237  1e-61  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0375371  normal  0.31258 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3941  DSBA oxidoreductase  48.68 
 
 		 259 aa  237  1e-61  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0405057 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6044  DSBA oxidoreductase  49.56 
 
 		 257 aa  236  2e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.680515  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3655  DSBA oxidoreductase  48.05 
 
 		 259 aa  235  5.0000000000000005e-61  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5427  DSBA oxidoreductase  47.74 
 
 		 257 aa  235  5.0000000000000005e-61  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.878245 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1790  outer membrane protein  45.24 
 
 		 274 aa  231  1e-59  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1661  DSBA oxidoreductase  50 
 
 		 275 aa  222  4e-57  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.148876  normal  0.0992596 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0730  DSBA oxidoreductase  44.83 
 
 		 260 aa  218  7e-56  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.22688 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1733  DSBA oxidoreductase  43.53 
 
 		 252 aa  209  4e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.690258  normal  0.0758369 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0905  putative outer membrane protein  39.92 
 
 		 265 aa  202  3e-51  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.787524  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0909  outer membrane protein, putative  39.92 
 
 		 265 aa  202  3e-51  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1539  DSBA oxidoreductase  43.48 
 
 		 252 aa  203  3e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4108  DSBA oxidoreductase  46.76 
 
 		 247 aa  201  9e-51  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0955  DSBA oxidoreductase  43.05 
 
 		 255 aa  199  3e-50  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.616231  hitchhiker  0.0061431 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1713  DSBA oxidoreductase  46.05 
 
 		 252 aa  194  2e-48  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0344853  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2271  DSBA oxidoreductase  42.79 
 
 		 268 aa  188  8e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.112284  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3281  DSBA oxidoreductase  42.28 
 
 		 263 aa  181  8.000000000000001e-45  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.101876  normal  0.665873 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4063  DSBA oxidoreductase  39.84 
 
 		 243 aa  170  2e-41  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3787  DSBA oxidoreductase  39.84 
 
 		 243 aa  170  2e-41  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.117786  normal  0.763789 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0209  outer membrane protein  37.75 
 
 		 252 aa  166  4e-40  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00342599  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2114  outer membrane protein  37.75 
 
 		 252 aa  164  1.0000000000000001e-39  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.155557  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0763  thioredoxin domain-containing protein  33.89 
 
 		 265 aa  152  5e-36  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1860  DSBA oxidoreductase  37.67 
 
 		 247 aa  152  5.9999999999999996e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3792  DSBA oxidoreductase  42.25 
 
 		 205 aa  150  3e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.344865  normal  0.0187029 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2981  putative protein-disulfide isomerase  35.87 
 
 		 247 aa  147  1.0000000000000001e-34  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.241141  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1805  hypothetical protein  35.91 
 
 		 261 aa  147  2.0000000000000003e-34  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1806  hypothetical protein  35.91 
 
 		 261 aa  147  2.0000000000000003e-34  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1627  DSBA oxidoreductase  35.87 
 
 		 247 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3405  thiol:disulfide interchange protein DsbA  38.05 
 
 		 253 aa  146  3e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2428  DSBA oxidoreductase  34.96 
 
 		 255 aa  145  6e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.53532  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1819  DSBA oxidoreductase  35.84 
 
 		 250 aa  142  4e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.621459  normal  0.210082 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3850  DSBA oxidoreductase  35.16 
 
 		 253 aa  140  9.999999999999999e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.197074  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1270  DSBA oxidoreductase  32.92 
 
 		 248 aa  137  2e-31  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0360105  hitchhiker  0.00278647 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2538  DSBA oxidoreductase  38.28 
 
 		 250 aa  134  9.999999999999999e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.171459  normal  0.017866 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2570  DSBA oxidoreductase  32.38 
 
 		 245 aa  129  6e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.649073  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0863  DSBA oxidoreductase  31.35 
 
 		 254 aa  128  8.000000000000001e-29  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  decreased coverage  0.00216121  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4989  Fis family transcriptional regulator  37.58 
 
 		 209 aa  127  2.0000000000000002e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3349  DSBA oxidoreductase  32.9 
 
 		 238 aa  124  1e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0710  DSBA oxidoreductase  31.25 
 
 		 246 aa  120  1.9999999999999998e-26  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0293  disulfide oxidoreductase  31.2 
 
 		 246 aa  120  1.9999999999999998e-26  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4143  DSBA oxidoreductase  36.31 
 
 		 211 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0134  DSBA oxidoreductase  36 
 
 		 210 aa  120  3e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.631277  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3004  DSBA oxidoreductase  29.02 
 
 		 263 aa  119  6e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.159469  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0122  DSBA oxidoreductase  34.86 
 
 		 211 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0339396 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0229  DSBA oxidoreductase  35.43 
 
 		 265 aa  115  7.999999999999999e-25  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.12077  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0515  DSBA oxidoreductase  31.56 
 
 		 269 aa  111  1.0000000000000001e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.498642 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1504  DSBA oxidoreductase  36.26 
 
 		 228 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.146939  normal  0.747814 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0607  DSBA oxidoreductase  38.01 
 
 		 232 aa  107  1e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.574613 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4198  DSBA oxidoreductase  32.18 
 
 		 236 aa  107  2e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3170  DSBA oxidoreductase  31.37 
 
 		 535 aa  106  3e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0578033  normal  0.438922 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3248  DSBA oxidoreductase  34.48 
 
 		 226 aa  105  5e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0322461  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1504  DSBA oxidoreductase  36.84 
 
 		 228 aa  105  7e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.844939  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4224  DSBA oxidoreductase  26.21 
 
 		 294 aa  105  8e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6639  DSBA oxidoreductase  34.12 
 
 		 235 aa  104  1e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.100221 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3688  DSBA oxidoreductase  33.72 
 
 		 211 aa  103  2e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0968997 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1783  DSBA oxidoreductase  36.26 
 
 		 228 aa  103  2e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.277988  normal  0.178175 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0115  DSBA oxidoreductase  26.61 
 
 		 274 aa  103  2e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0538996  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1312  DsbA-like disulfide oxidoreductase  28.23 
 
 		 252 aa  103  3e-21  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0500823  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0741  DSBA oxidoreductase  30.65 
 
 		 222 aa  103  3e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.486242  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1102  hypothetical protein  35.44 
 
 		 211 aa  103  3e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.983538  normal  0.0993738 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1214  DSBA oxidoreductase  33.54 
 
 		 217 aa  102  4e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.734825  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4152  DSBA oxidoreductase  25.81 
 
 		 270 aa  102  5e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4356  DSBA oxidoreductase  25.81 
 
 		 294 aa  102  5e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3685  putative disulfide bond formation protein D precursor (disulfide oxidoreductase D)  32.03 
 
 		 211 aa  102  7e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0106163  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4361  DSBA oxidoreductase  34.3 
 
 		 210 aa  102  7e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  decreased coverage  0.00151652  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0622  twin-arginine translocation pathway signal  34.59 
 
 		 233 aa  102  8e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4299  twin-arginine translocation pathway signal  31.36 
 
 		 222 aa  100  2e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4908  DSBA oxidoreductase  33.14 
 
 		 210 aa  99  6e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.771858 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1073  DSBA oxidoreductase  33.33 
 
 		 209 aa  98.6  8e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1179  copper sensitivity supression protein  34.08 
 
 		 207 aa  98.6  8e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1190  suppressor for copper-sensitivity C  34.08 
 
 		 207 aa  97.8  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1210  copper sensitivity supression protein  34.08 
 
 		 207 aa  97.1  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.822664  normal  0.622691 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1074  suppressor for copper-sensitivity C  33.52 
 
 		 207 aa  97.4  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1225  copper sensitivity supression protein  34.08 
 
 		 207 aa  97.1  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.724279 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4245  DSBA oxidoreductase  31.43 
 
 		 210 aa  95.9  5e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.354657 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7384  DSBA oxidoreductase  33.96 
 
 		 230 aa  95.9  6e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3549  DsbA oxidoreductase  28.51 
 
 		 272 aa  95.9  6e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.421671  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3494  DSBA oxidoreductase  32.19 
 
 		 197 aa  93.2  3e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1217  DSBA oxidoreductase  26.67 
 
 		 263 aa  91.7  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.364209  normal  0.993383 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0476  Disulfide bonded thioredoxin protein  32.92 
 
 		 198 aa  89.7  3e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0901  disulfide oxidoreductase  28 
 
 		 257 aa  89.7  4e-17  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  hitchhiker  0.00296205  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3199  DSBA oxidoreductase  30.06 
 
 		 244 aa  89.7  4e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0366  twin-arginine translocation pathway signal sequence domain-containing protein  31.06 
 
 		 204 aa  89.4  5e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0381  twin-arginine translocation pathway signal sequence domain-containing protein  31.06 
 
 		 204 aa  89.4  5e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3906  DSBA oxidoreductase  33.8 
 
 		 273 aa  87.8  1e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0474  DSBA oxidoreductase  31.68 
 
 		 204 aa  86.3  5e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0844568  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2927  DSBA oxidoreductase  26.15 
 
 		 288 aa  84  0.000000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.54274 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3950  DsbA oxidoreductase  31.41 
 
 		 349 aa  83.6  0.000000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0031  hypothetical protein  29.41 
 
 		 281 aa  82.4  0.000000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.115246  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1379  thiol:disulfide interchange protein DsbA  24.46 
 
 		 242 aa  82  0.000000000000009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4310  DSBA oxidoreductase  26.11 
 
 		 262 aa  80.9  0.00000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.387734  hitchhiker  0.000746831 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>