286 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_4133 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_4133  putative carboxylase, like RuBisCO, small subunit  100 
 
 		 349 aa  698    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2833  allophanate hydrolase subunit 2  68.45 
 
 		 335 aa  448  1e-125  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.636901  normal  0.872567 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1502  allophanate hydrolase subunit 2  66.67 
 
 		 339 aa  434  1e-121  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0900497 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2635  allophanate hydrolase subunit 2  70.28 
 
 		 335 aa  437  1e-121  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.238129  decreased coverage  0.0000404715 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2041  allophanate hydrolase subunit 2  67.85 
 
 		 345 aa  428  1e-119  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2623  allophanate hydrolase subunit 2  68.96 
 
 		 334 aa  423  1e-117  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.285911 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2957  urea amidolyase related protein  64.86 
 
 		 336 aa  420  1e-116  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5816  urea amidolyase related protein  46.09 
 
 		 344 aa  234  1.0000000000000001e-60  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.174826  normal  0.0709434 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1535  urea amidolyase related protein  45.35 
 
 		 339 aa  234  1.0000000000000001e-60  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0888352 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1815  urea amidolyase related protein  46.25 
 
 		 339 aa  224  1e-57  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.22285  normal  0.131642 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1495  urea amidolyase related protein  43.15 
 
 		 344 aa  215  8e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0419081  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3094  urea amidolyase related protein  40.18 
 
 		 354 aa  215  8e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.604778  normal  0.778308 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3449  putative allophanate hydrolase subunit 2  39.88 
 
 		 354 aa  215  9.999999999999999e-55  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1105  urea amidolyase related protein  41.49 
 
 		 339 aa  212  7e-54  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0170901  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2048  urea amidolyase related protein  40 
 
 		 355 aa  206  3e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.984998  normal  0.316716 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1596  urea amidolyase related protein  37.54 
 
 		 334 aa  200  1.9999999999999998e-50  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1708  urea amidolyase related protein  44.48 
 
 		 339 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0203426  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3354  urea amidolyase related protein  43.99 
 
 		 338 aa  200  3e-50  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2373  urea amidolyase related protein  41.25 
 
 		 349 aa  194  2e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.586718  normal  0.68742 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1973  urea amidolyase related protein  39.64 
 
 		 348 aa  194  2e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3142  urea amidolyase related protein  37.35 
 
 		 347 aa  192  6e-48  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.440841  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2133  urea amidolyase related protein  43.31 
 
 		 359 aa  192  9e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.335875 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2170  hypothetical protein  41.32 
 
 		 353 aa  191  2e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.723282  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3431  urea amidolyase related protein  42.47 
 
 		 354 aa  190  2.9999999999999997e-47  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.782609  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1505  allophanate hydrolase subunit 2  40.36 
 
 		 353 aa  189  5e-47  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.38508  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1384  urea amidolyase related protein  37.54 
 
 		 338 aa  188  1e-46  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.669414 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0088  allophanate hydrolase subunit 2  42.11 
 
 		 339 aa  188  2e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.419671  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1146  urea amidolyase related protein  34.03 
 
 		 343 aa  185  8e-46  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.234826  normal  0.390267 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1137  urea amidolyase related protein  37.34 
 
 		 309 aa  184  2.0000000000000003e-45  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.878292  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3109  urea amidolyase related protein  39.16 
 
 		 314 aa  180  2.9999999999999997e-44  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1256  urea amidolyase related protein  39.38 
 
 		 310 aa  178  1e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0977176  normal  0.848518 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1227  urea amidolyase related protein  40.13 
 
 		 314 aa  178  1e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2921  urea amidolyase related protein  38.82 
 
 		 309 aa  177  2e-43  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0520  urea amidolyase related protein  39.77 
 
 		 350 aa  177  3e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3394  urea amidolyase related protein  38.66 
 
 		 315 aa  176  5e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0656137 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1271  urea amidolyase related protein  35.6 
 
 		 329 aa  176  7e-43  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1968  allophanate hydrolase subunit 2  38.41 
 
 		 286 aa  175  9.999999999999999e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.138307  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1438  putative allophanate hydrolase subunit 2  37.86 
 
 		 318 aa  174  9.999999999999999e-43  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1827  urea amidolyase related protein  37.04 
 
 		 310 aa  174  1.9999999999999998e-42  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.678216  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00672  predicted enzyme subunit  37.17 
 
 		 310 aa  173  2.9999999999999996e-42  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2924  urea amidolyase related protein  37.17 
 
 		 310 aa  173  2.9999999999999996e-42  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.126507  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0802  allophanate hydrolase, subunit 2  37.46 
 
 		 310 aa  174  2.9999999999999996e-42  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.316983  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0760  allophanate hydrolase, subunit 2  37.17 
 
 		 310 aa  173  2.9999999999999996e-42  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00661  hypothetical protein  37.17 
 
 		 310 aa  173  2.9999999999999996e-42  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2943  urea amidolyase related protein  37.17 
 
 		 310 aa  173  2.9999999999999996e-42  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0177  urea amidolyase related protein  36.62 
 
 		 389 aa  173  5e-42  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01990  biotin-dependent carboxylase-like protein  35.83 
 
 		 365 aa  172  5.999999999999999e-42  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.564153 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1949  urea amidolyase related protein  33.84 
 
 		 328 aa  171  1e-41  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000276448  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2804  allophanate hydrolase subunit 2  39.86 
 
 		 330 aa  172  1e-41  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.776372 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0737  allophanate hydrolase, subunit 2  37.13 
 
 		 310 aa  171  1e-41  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0629  allophanate hydrolase, subunit 2  37.13 
 
 		 310 aa  171  2e-41  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1168  urea amidolyase related protein  36.18 
 
 		 316 aa  171  2e-41  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  unclonable  0.000000000170574  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0727  allophanate hydrolase, subunit 2  37.13 
 
 		 310 aa  171  2e-41  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.25799  normal  0.390135 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0821  allophanate hydrolase, subunit 2  36.22 
 
 		 310 aa  170  3e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0263857  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3057  urea amidolyase related protein  36.56 
 
 		 355 aa  170  4e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.027939 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0836  allophanate hydrolase subunit 2  36.22 
 
 		 310 aa  169  4e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.631798  hitchhiker  0.00120762 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0870  allophanate hydrolase subunit 2  36.22 
 
 		 310 aa  169  4e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.25979 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0760  allophanate hydrolase, subunit 2  36.22 
 
 		 310 aa  169  4e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2424  allophanate hydrolase subunit 2  36.56 
 
 		 355 aa  170  4e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3038  urea amidolyase related protein  36.56 
 
 		 355 aa  170  4e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1116  biotin-dependent carboxylase domain-containing protein  36.18 
 
 		 316 aa  169  5e-41  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000309284  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1985  allophanate hydrolase domain-containing protein  35.37 
 
 		 322 aa  169  6e-41  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2904  urea amidolyase related protein  34.76 
 
 		 350 aa  169  7e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.293477 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3556  urea amidolyase related protein  40 
 
 		 308 aa  169  9e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.392081  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2949  urea amidolyase related protein  36.45 
 
 		 356 aa  168  1e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.485355  normal  0.639437 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0773  allophanate hydrolase subunit 2  36.93 
 
 		 310 aa  168  1e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.905688 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3590  biotin-dependent carboxylase domain-containing protein  35.86 
 
 		 316 aa  168  2e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0063  allophanate hydrolase subunit 2  39.68 
 
 		 339 aa  167  2e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3033  urea amidolyase related protein  36.89 
 
 		 355 aa  167  2e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.74353 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0448  urea amidolyase-like protein  36.17 
 
 		 359 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0194  Urea amidolyase-related protein  34.45 
 
 		 350 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0265  allophanate hydrolase, subunit 2  36.17 
 
 		 359 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0143689  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0253  allophanate hydrolase, subunit 2  36.17 
 
 		 359 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58515  hypothetical protein  36.13 
 
 		 309 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3368  allophanate hydrolase, subunit 2  36.17 
 
 		 371 aa  167  4e-40  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3310  allophanate hydrolase, subunit 2  36.17 
 
 		 371 aa  167  4e-40  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2112  allophanate hydrolase, subunit 2  36.17 
 
 		 371 aa  167  4e-40  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2980  allophanate hydrolase, subunit 2  36.17 
 
 		 371 aa  167  4e-40  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.409998  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3083  urea amidolyase related protein  35.84 
 
 		 356 aa  166  5.9999999999999996e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1902  hypothetical protein  36.27 
 
 		 321 aa  165  1.0000000000000001e-39  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5123  hypothetical protein  36.33 
 
 		 309 aa  164  3e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3742  urea amidolyase related protein  34.15 
 
 		 350 aa  164  3e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.485682 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0709  urea amidolyase related protein  36.48 
 
 		 353 aa  163  5.0000000000000005e-39  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0199666  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0989  allophanate hydrolase subunit 2  35.43 
 
 		 337 aa  162  9e-39  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  decreased coverage  0.00574869  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1215  urea amidolyase related protein  36.31 
 
 		 310 aa  162  1e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.478811  normal  0.0330317 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6385  allophanate hydrolase subunit 2  36.77 
 
 		 355 aa  162  1e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12470  allophanate hydrolase/urea amidolyase-related protein  36.42 
 
 		 301 aa  162  1e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0799674  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2873  urea amidolyase related protein  34.87 
 
 		 329 aa  160  2e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.614704  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1977  urea amidolyase related protein  36.75 
 
 		 320 aa  160  3e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0301643 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2225  urea amidolyase related protein  36.72 
 
 		 319 aa  160  4e-38  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0373  urea amidolyase related protein  37.29 
 
 		 317 aa  160  4e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.550706 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1528  hypothetical protein  34.53 
 
 		 321 aa  160  4e-38  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1714  hypothetical protein  35.69 
 
 		 321 aa  159  5e-38  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.768443  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2337  urea amidolyase related protein  34.81 
 
 		 323 aa  159  6e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0229  urea amidolyase-related protein  36.01 
 
 		 359 aa  159  8e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0477  allophanate hydrolase, subunit 2  36.71 
 
 		 330 aa  159  9e-38  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.230499  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3293  urea amidolyase related protein  39.26 
 
 		 536 aa  158  1e-37  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0095  urea amidolyase related protein  37.83 
 
 		 555 aa  158  2e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06210  biotin-dependent carboxylase-like protein  37.19 
 
 		 290 aa  157  2e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.447378  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1099  allophanate hydrolase subunit 2  35.37 
 
 		 307 aa  157  3e-37  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.279436  normal  0.154385 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>