255 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_4125 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_4125  hypothetical protein  100 
 
 		 156 aa  315  1e-85  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.380555  normal  0.637069 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1285  phenylacetic acid degradation-related protein  49.34 
 
 		 169 aa  145  3e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0959  phenylacetic acid degradation-related protein  51.43 
 
 		 169 aa  139  9.999999999999999e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.46096  normal  0.0335378 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1696  phenylacetic acid degradation-related protein  46.04 
 
 		 193 aa  128  3e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.13104  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5993  thioesterase superfamily protein  43.88 
 
 		 182 aa  126  9.000000000000001e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.202542 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2979  hypothetical protein  46.04 
 
 		 182 aa  126  1.0000000000000001e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.106033 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3697  thioesterase superfamily protein  42.45 
 
 		 182 aa  125  2.0000000000000002e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1900  thioesterase superfamily protein  46.04 
 
 		 204 aa  125  3e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0146088 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1560  thioesterase superfamily protein  48.92 
 
 		 183 aa  123  9e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.532155  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8061  thioesterase superfamily protein  45 
 
 		 184 aa  123  1e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.157988  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3546  phenylacetic acid degradation-related protein  43.17 
 
 		 185 aa  122  2e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.572373  normal  0.256771 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4940  phenylacetic acid degradation-related protein  42.86 
 
 		 158 aa  117  3.9999999999999996e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0315  phenylacetic acid degradation-related protein  44.93 
 
 		 187 aa  117  3.9999999999999996e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0944  thioesterase superfamily protein  42.76 
 
 		 170 aa  116  9.999999999999999e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0606  thioesterase superfamily protein  45.32 
 
 		 176 aa  115  3e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0448554 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2083  hypothetical protein  47.65 
 
 		 155 aa  114  3.9999999999999997e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.760397  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3413  thioesterase superfamily protein  41.13 
 
 		 144 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.001772  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3488  thioesterase superfamily protein  41.13 
 
 		 144 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000337364  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63860  hypothetical protein  40 
 
 		 179 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1102  thioesterase superfamily protein  40.67 
 
 		 189 aa  111  3e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.218192  normal  0.0165353 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0876  thioesterase superfamily protein  41.13 
 
 		 144 aa  112  3e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000000376008  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2924  hypothetical protein  39.47 
 
 		 189 aa  111  3e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1025  phenylacetic acid degradation-related protein  48.92 
 
 		 167 aa  111  4.0000000000000004e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.61355  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3611  thioesterase superfamily protein  41.43 
 
 		 144 aa  111  4.0000000000000004e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000157158  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1240  phenylacetic acid degradation-related protein  42.75 
 
 		 139 aa  110  7.000000000000001e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.154895  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4114  phenylacetic acid degradation-related protein  37.66 
 
 		 161 aa  110  1.0000000000000001e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0190  thioesterase superfamily protein  44.6 
 
 		 146 aa  109  1.0000000000000001e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5549  hypothetical protein  41.18 
 
 		 179 aa  108  3e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1893  thioesterase superfamily protein  43.26 
 
 		 225 aa  108  3e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.333222  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3308  hypothetical protein  36.43 
 
 		 147 aa  105  2e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0725  thioesterase superfamily protein  42.25 
 
 		 159 aa  105  2e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2573  thioesterase superfamily protein  40.79 
 
 		 232 aa  105  3e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.686458  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0688  hypothetical protein  41.73 
 
 		 146 aa  105  3e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.68886  hitchhiker  0.00534033 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0826  phenylacetic acid degradation-related protein  40.43 
 
 		 191 aa  104  5e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5253  phenylacetic acid degradation-related protein  41.13 
 
 		 176 aa  103  7e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5342  hypothetical protein  41.13 
 
 		 176 aa  103  7e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.331699  normal  0.285633 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5999  thioesterase superfamily protein  42.65 
 
 		 181 aa  103  1e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3942  thioesterase superfamily protein  38.06 
 
 		 191 aa  102  2e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1868  hypothetical protein  36.17 
 
 		 142 aa  102  3e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0606693  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4820  thioesterase superfamily protein  42.06 
 
 		 174 aa  100  7e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5089  thioesterase superfamily protein  41.09 
 
 		 165 aa  100  7e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.765529  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1650  thioesterase superfamily protein  39.42 
 
 		 145 aa  100  8e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.278043  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1510  hypothetical protein  35.21 
 
 		 145 aa  100  1e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.382765  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2491  hypothetical protein  40.88 
 
 		 145 aa  100  1e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.554624  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1701  phenylacetic acid degradation-related protein  41.38 
 
 		 160 aa  99.8  1e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0708243  normal  0.927888 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2612  thioesterase superfamily protein  43.88 
 
 		 164 aa  99  2e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000610036  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3305  phenylacetic acid degradation-related protein  38.06 
 
 		 209 aa  99  2e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1483  hypothetical protein  38 
 
 		 165 aa  97.8  5e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3278  thioesterase superfamily protein  39.86 
 
 		 144 aa  97.4  7e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1503  thioesterase superfamily protein  39.86 
 
 		 145 aa  97.1  8e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3600  thioesterase superfamily protein  39.86 
 
 		 144 aa  97.1  8e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.807912 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4725  phenylacetic acid degradation-related protein  40.15 
 
 		 145 aa  97.1  9e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.707083 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0703  hypothetical protein  41.73 
 
 		 158 aa  96.3  1e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1993  hypothetical protein  41.73 
 
 		 158 aa  96.7  1e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.762043  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1107  phenylacetic acid degradation-related protein  39.42 
 
 		 145 aa  95.1  3e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1587  hypothetical protein  39.42 
 
 		 145 aa  95.1  3e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1564  thioesterase superfamily protein  39.42 
 
 		 145 aa  94  6e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3939  thioesterase superfamily protein  38.84 
 
 		 179 aa  92.4  2e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0150452 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2002  thioesterase family protein  41.61 
 
 		 145 aa  90.5  9e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1848  thioesterase family protein  41.61 
 
 		 145 aa  90.5  9e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0365  hypothetical protein  41.61 
 
 		 145 aa  90.5  9e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0796  thioesterase family protein  41.61 
 
 		 145 aa  90.5  9e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.383566  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1708  hypothetical protein  41.61 
 
 		 145 aa  90.5  9e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.361715  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1835  thioesterase family protein  40.88 
 
 		 145 aa  88.6  3e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1223  hypothetical protein  40.88 
 
 		 145 aa  88.2  4e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.928128  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2088  thioesterase superfamily protein  39.69 
 
 		 148 aa  82.8  0.000000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.179421  hitchhiker  0.00000500183 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1137  hypothetical protein  34.81 
 
 		 153 aa  81.3  0.000000000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3607  thioesterase superfamily protein  34.29 
 
 		 155 aa  73.9  0.0000000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0168522  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0009  thioesterase superfamily protein  41.94 
 
 		 161 aa  69.3  0.00000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.239362  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1864  thioesterase superfamily protein  39.47 
 
 		 161 aa  68.9  0.00000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.236393 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4539  thioesterase superfamily protein  36.36 
 
 		 151 aa  69.7  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10860  hypothetical protein  30.83 
 
 		 161 aa  67.8  0.00000000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.405906  unclonable  0.00000000176552 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3360  thioesterase superfamily protein  38.84 
 
 		 161 aa  67.4  0.00000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.199811  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3389  hypothetical protein  37.29 
 
 		 182 aa  65.9  0.0000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0147102  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1736  hypothetical protein  30.33 
 
 		 135 aa  65.9  0.0000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0873993  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1677  hypothetical protein  30.33 
 
 		 135 aa  65.5  0.0000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2334  phenylacetic acid degradation-related protein  32.23 
 
 		 148 aa  65.1  0.0000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.788653  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4623  thioesterase superfamily protein  32.5 
 
 		 144 aa  65.1  0.0000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3025  thioesterase superfamily protein  34.48 
 
 		 146 aa  64.3  0.0000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0281155  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3656  thioesterase superfamily protein  34.17 
 
 		 127 aa  62.4  0.000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0447076  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4591  hypothetical protein  35.04 
 
 		 150 aa  62.8  0.000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.960972  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1292  thioesterase superfamily protein  35.29 
 
 		 159 aa  62  0.000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.430842  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4779  phenylacetic acid degradation-related protein  30.22 
 
 		 140 aa  60.8  0.000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1354  hypothetical protein  35 
 
 		 138 aa  60.5  0.000000008  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1093  phenylacetic acid degradation-related protein  32.5 
 
 		 132 aa  59.7  0.00000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0025  hypothetical protein  31.91 
 
 		 142 aa  59.7  0.00000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000180686  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3361  thioesterase superfamily protein  36.04 
 
 		 148 aa  58.2  0.00000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.754262 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0460  thioesterase superfamily protein  29.82 
 
 		 138 aa  58.2  0.00000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000488962  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0316  hypothetical protein  33.09 
 
 		 150 aa  58.5  0.00000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2147  hypothetical protein  32.08 
 
 		 160 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.505832  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1855  thioesterase superfamily protein  35.65 
 
 		 154 aa  57.8  0.00000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2901  thioesterase superfamily protein  36.13 
 
 		 181 aa  57.8  0.00000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1432  hypothetical protein  32.08 
 
 		 160 aa  57.4  0.00000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0530833  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2450  thioesterase family protein  32.08 
 
 		 160 aa  57.4  0.00000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2327  hypothetical protein  32.08 
 
 		 160 aa  57.4  0.00000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.711869  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2288  hypothetical protein  32.08 
 
 		 160 aa  57.4  0.00000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0356386  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1196  hypothetical protein  32.08 
 
 		 160 aa  57.4  0.00000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3381  hypothetical protein  32.08 
 
 		 160 aa  57.4  0.00000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.364467  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1923  hypothetical protein  32.08 
 
 		 160 aa  57.4  0.00000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3222  phenylacetic acid degradation-related protein  32.76 
 
 		 145 aa  57  0.0000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.663153  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>