129 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_4005 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009485  BBta_4005  hypothetical protein  100 
 
 
263 aa  536  9.999999999999999e-153  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.52012  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4482  hypothetical protein  79.22 
 
 
267 aa  407  1e-113  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4745  hypothetical protein  80.83 
 
 
246 aa  391  1e-108  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2026  hypothetical protein  62.12 
 
 
270 aa  305  4.0000000000000004e-82  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0180  hypothetical protein  53.39 
 
 
254 aa  261  6e-69  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.124198  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0095  hypothetical protein  51.76 
 
 
273 aa  258  9e-68  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0117028  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0048  hypothetical protein  56.76 
 
 
239 aa  253  1.0000000000000001e-66  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.665316  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1459  hypothetical protein  54.24 
 
 
248 aa  252  6e-66  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.360023  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0110  hypothetical protein  54.24 
 
 
248 aa  252  6e-66  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.151004 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0057  hypothetical protein  54.62 
 
 
246 aa  251  7e-66  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.184388 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0169  hypothetical protein  51.63 
 
 
271 aa  246  2e-64  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.654892  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3395  hypothetical protein  49.2 
 
 
432 aa  244  6.999999999999999e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3535  hypothetical protein  51.87 
 
 
264 aa  244  9.999999999999999e-64  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.098439  normal  0.0144387 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0659  hypothetical protein  50.19 
 
 
262 aa  242  3.9999999999999997e-63  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3691  hypothetical protein  51.6 
 
 
272 aa  242  5e-63  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3232  hypothetical protein  46.72 
 
 
419 aa  241  7e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0597283  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2071  hypothetical protein  50 
 
 
247 aa  240  1e-62  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.00000154426  normal  0.408823 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0670  protein of unknown function DUF88  50.62 
 
 
234 aa  239  2.9999999999999997e-62  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.135963  normal  0.923562 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0650  protein of unknown function DUF88  50.62 
 
 
234 aa  239  2.9999999999999997e-62  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1873  hypothetical protein  51.06 
 
 
252 aa  238  6.999999999999999e-62  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2044  hypothetical protein  48.93 
 
 
249 aa  234  1.0000000000000001e-60  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0376115  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0520  hypothetical protein  44.96 
 
 
262 aa  232  5e-60  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0316  hypothetical protein  49.16 
 
 
264 aa  229  3e-59  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7469  protein of unknown function DUF88  48.82 
 
 
260 aa  228  9e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2085  hypothetical protein  47.9 
 
 
249 aa  227  2e-58  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000000370224  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6293  protein of unknown function DUF88  47.06 
 
 
262 aa  225  5.0000000000000005e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0335  hypothetical protein  48.09 
 
 
247 aa  223  2e-57  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  unclonable  0.000000000159017  normal  0.161063 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2419  hypothetical protein  46.22 
 
 
247 aa  223  2e-57  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_11160  conserved hypothetical protein  47.35 
 
 
262 aa  220  1.9999999999999999e-56  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.997063  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2871  hypothetical protein  47.98 
 
 
240 aa  219  3.9999999999999997e-56  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.234327 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0806  protein of unknown function DUF88  46 
 
 
246 aa  218  6e-56  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.806829  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2410  hypothetical protein  45.67 
 
 
259 aa  218  6e-56  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.727494  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0105  hypothetical protein  48.73 
 
 
236 aa  218  7e-56  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3603  protein of unknown function DUF88  45.56 
 
 
259 aa  213  3.9999999999999995e-54  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.162611  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1453  hypothetical protein  45.23 
 
 
258 aa  212  5.999999999999999e-54  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.55452  normal  0.529403 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2768  hypothetical protein  45.12 
 
 
272 aa  209  3e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1822  hypothetical protein  41.76 
 
 
275 aa  208  6e-53  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.81231  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0707  protein of unknown function DUF88  42.62 
 
 
258 aa  207  1e-52  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000235983  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2652  protein of unknown function DUF88  43.91 
 
 
253 aa  204  9e-52  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000246678  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0118  hypothetical protein  42.7 
 
 
286 aa  199  3e-50  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.122838  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03707  hypothetical protein  47.19 
 
 
276 aa  199  3e-50  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1869  hypothetical protein  45.13 
 
 
335 aa  197  1.0000000000000001e-49  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.670416  normal  0.501233 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00290  hypothetical protein  45.69 
 
 
249 aa  194  1e-48  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0704  hypothetical protein  43.48 
 
 
268 aa  185  6e-46  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1025  hypothetical protein  38.87 
 
 
260 aa  184  2.0000000000000003e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0102117  normal  0.260028 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11150  hypothetical protein  42.65 
 
 
314 aa  181  7e-45  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.280093 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3564  hypothetical protein  41.9 
 
 
268 aa  182  7e-45  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0656546 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1934  protein of unknown function DUF88  40.39 
 
 
552 aa  181  7e-45  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000288494  normal  0.0274849 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0476  hypothetical protein  41.6 
 
 
265 aa  181  1e-44  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3658  hypothetical protein  41.48 
 
 
242 aa  175  5e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.339092  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05410  Protein of unknown function DUF88  41.59 
 
 
312 aa  173  2.9999999999999996e-42  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.00000245308  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3025  protein of unknown function DUF88  36.14 
 
 
285 aa  168  7e-41  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.775317  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3744  hypothetical protein  35.64 
 
 
287 aa  161  1e-38  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15160  conserved hypothetical protein TIGR00288  52.29 
 
 
371 aa  157  1e-37  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5232  hypothetical protein  33.83 
 
 
284 aa  154  1e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.682006 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1386  hypothetical protein  42.68 
 
 
303 aa  139  3.9999999999999997e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.351938  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2536  hypothetical protein  33.02 
 
 
313 aa  139  7e-32  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.13473  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4318  hypothetical protein  45.52 
 
 
298 aa  135  6.0000000000000005e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.577985  normal  0.180731 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1180  hypothetical protein  33.76 
 
 
259 aa  133  3.9999999999999996e-30  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0741  protein of unknown function DUF88  34.11 
 
 
251 aa  130  2.0000000000000002e-29  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.614685 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4909  hypothetical protein  32.52 
 
 
279 aa  130  3e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0665884  normal  0.351144 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0199  hypothetical protein  28.7 
 
 
232 aa  123  3e-27  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0182  hypothetical protein  29.25 
 
 
232 aa  122  4e-27  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.518612  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0220  hypothetical protein  29.25 
 
 
232 aa  122  5e-27  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1475  hypothetical protein  26.89 
 
 
229 aa  110  3e-23  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3462  hypothetical protein  39.89 
 
 
225 aa  101  1e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0939176 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1924  protein of unknown function DUF88  34.72 
 
 
334 aa  94.7  1e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000499479  unclonable  0.0000000129019 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0356  hypothetical protein  40.59 
 
 
160 aa  84  0.000000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0198586 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0857  protein of unknown function DUF88  39.37 
 
 
275 aa  77.4  0.0000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3120  hypothetical protein  26.27 
 
 
264 aa  77.4  0.0000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.462437  normal  0.0322119 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0380  hypothetical protein  80.95 
 
 
64 aa  76.6  0.0000000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1700  protein of unknown function DUF88  27.18 
 
 
564 aa  73.9  0.000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0123455  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1190  protein of unknown function DUF88  26.25 
 
 
275 aa  71.2  0.00000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5405  protein of unknown function DUF88  29.06 
 
 
450 aa  68.9  0.00000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.964746  normal  0.435049 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0449  hypothetical protein  35.67 
 
 
251 aa  68.9  0.00000000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.924551  normal  0.859158 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1542  hypothetical protein  27.94 
 
 
272 aa  66.2  0.0000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0775  hypothetical protein  23.64 
 
 
480 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.193151  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0980  protein of unknown function DUF88  26.46 
 
 
260 aa  65.1  0.000000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1734  hypothetical protein  27.2 
 
 
249 aa  64.7  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.322719 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3189  hypothetical protein  25.29 
 
 
421 aa  64.3  0.000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3809  protein of unknown function DUF88  31.78 
 
 
319 aa  64.7  0.000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.154504  normal  0.410999 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1940  hypothetical protein  28.19 
 
 
308 aa  63.9  0.000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2113  hypothetical protein  29.73 
 
 
508 aa  63.2  0.000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.827349  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0541  hypothetical protein  27.39 
 
 
440 aa  63.2  0.000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3191  protein of unknown function DUF88  27.39 
 
 
478 aa  62.8  0.000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.000122431  normal  0.16823 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2205  hypothetical protein  26.44 
 
 
381 aa  62.8  0.000000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1072  hypothetical protein  39.47 
 
 
507 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1168  hypothetical protein  39.47 
 
 
498 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.628977  normal  0.0240517 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1072  hypothetical protein  39.47 
 
 
501 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0492995  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0347  hypothetical protein  28.66 
 
 
483 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4302  hypothetical protein  28.29 
 
 
496 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.160322  normal  0.186883 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1099  hypothetical protein  28.66 
 
 
472 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.167735  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0714  hypothetical protein  39.47 
 
 
498 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1193  hypothetical protein  39.47 
 
 
498 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1883  hypothetical protein  28.38 
 
 
477 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.148092  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1798  hypothetical protein  28.66 
 
 
483 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.237942  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2469  protein of unknown function DUF88  30.12 
 
 
629 aa  59.7  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2090  hypothetical protein  28.57 
 
 
268 aa  59.7  0.00000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.164001 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2905  protein of unknown function DUF88  27.24 
 
 
253 aa  58.9  0.00000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.489552  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2817  hypothetical protein  27.24 
 
 
253 aa  58.5  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.556577  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>