More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_3969 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009485  BBta_3969  cysteine desulfurase  100 
 
 
415 aa  855  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0413583  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1661  cysteine desulphurases, SufS  86.92 
 
 
414 aa  764  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.278494  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2325  SufS subfamily cysteine desulfurase  87.17 
 
 
414 aa  762  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.553712  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2745  cysteine desulfurase, SufS subfamily  89.88 
 
 
415 aa  781  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5928  cysteine desulfurase  78.64 
 
 
413 aa  681  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2990  SufS subfamily cysteine desulfurase  89.32 
 
 
428 aa  776  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.398941  normal  0.104458 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2459  SufS subfamily cysteine desulfurase  89.4 
 
 
415 aa  786  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.117109  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0087  SufS subfamily cysteine desulfurase  77.48 
 
 
420 aa  674  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.595541  normal  0.828259 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2837  SufS subfamily cysteine desulfurase  87.95 
 
 
415 aa  769  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  decreased coverage  0.00234776  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5845  cysteine desulfurase, SufS subfamily  72.17 
 
 
413 aa  617  1e-176  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.187018  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1896  cysteine desulfurase, SufS subfamily  72.28 
 
 
413 aa  613  1e-174  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00682669 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5106  SufS subfamily cysteine desulfurase  71.67 
 
 
413 aa  612  1e-174  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0201229 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0698  SufS subfamily cysteine desulfurase  72.1 
 
 
414 aa  612  1e-174  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.13787  normal  0.199911 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2103  cysteine desulfurase, SufS subfamily  72.03 
 
 
413 aa  612  1e-174  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.105912 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1778  SufS subfamily cysteine desulfurase  70.44 
 
 
413 aa  610  1e-173  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.169204  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0101  SufS subfamily cysteine desulfurase  70.6 
 
 
414 aa  607  1e-172  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.724967 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3980  SufS subfamily cysteine desulfurase  69.44 
 
 
418 aa  599  1e-170  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.970806 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4348  cysteine desulfurase, SufS subfamily  69.68 
 
 
418 aa  599  1e-170  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4466  SufS subfamily cysteine desulfurase  68.36 
 
 
419 aa  592  1e-168  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.523936 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4460  cysteine desulfurase, SufS subfamily  69.7 
 
 
426 aa  585  1e-166  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.572328  normal  0.26876 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2440  aminotransferase  66.99 
 
 
416 aa  586  1e-166  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1465  SufS subfamily cysteine desulfurase  68.07 
 
 
413 aa  585  1e-166  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.204095  normal  0.0534707 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2252  SufS subfamily cysteine desulfurase  67.64 
 
 
414 aa  584  1e-165  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.766677  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0934  aminotransferase, class V  68.24 
 
 
414 aa  577  1e-163  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.603819  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0928  aminotransferase, class V  67.74 
 
 
414 aa  574  1e-163  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.870705  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3259  SufS subfamily cysteine desulfurase  63.9 
 
 
414 aa  565  1e-160  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.797453  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0813  cysteine desulfurase SufS  60.15 
 
 
414 aa  528  1e-149  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0265605  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1249  cysteine desulfurase  58.52 
 
 
406 aa  504  1e-142  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.491768  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2355  SufS subfamily cysteine desulfurase  59.85 
 
 
407 aa  498  1e-140  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.331891  normal  0.378457 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2593  SufS subfamily cysteine desulfurase  59.46 
 
 
408 aa  499  1e-140  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.266337  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2356  SufS subfamily cysteine desulfurase  58.91 
 
 
406 aa  490  1e-137  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0431  putative selenocysteine lyase  59.16 
 
 
406 aa  490  1e-137  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2088  SufS subfamily cysteine desulfurase  59.16 
 
 
406 aa  489  1e-137  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.519115 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0989  selenocysteine lyase  56.04 
 
 
414 aa  486  1e-136  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1623  cysteine desulfurase  57.43 
 
 
406 aa  479  1e-134  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0344832 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3970  SufS subfamily cysteine desulfurase  56.3 
 
 
403 aa  479  1e-134  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.615432  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4272  SufS subfamily cysteine desulfurase  57.36 
 
 
451 aa  473  1e-132  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5780  cysteine desulfurase, SufS subfamily  54.48 
 
 
408 aa  469  1e-131  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.649929  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0975  aminotransferase class 5 protein; selenocysteine lyase  52.66 
 
 
419 aa  467  1e-130  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.18075  normal  0.925491 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2487  cysteine desulphurases, SufS  52.45 
 
 
420 aa  464  1e-129  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2570  cysteine desulfurase  53.88 
 
 
422 aa  459  1e-128  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0699  SufS subfamily cysteine desulfurase  53.27 
 
 
419 aa  456  1e-127  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1505  cysteine desulfurases, SufS subfamily protein  51.58 
 
 
425 aa  458  1e-127  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0740826  normal  0.129164 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2025  cysteine desulfurase, SufS subfamily  53.52 
 
 
418 aa  455  1e-127  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0166  cysteine desulfurase, SufS subfamily  53.47 
 
 
412 aa  456  1e-127  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  3.85676e-08  unclonable  1.52095e-15 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1863  SufS subfamily cysteine desulfurase  54.46 
 
 
416 aa  453  1e-126  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0582  SufS subfamily cysteine desulfurase  52.51 
 
 
404 aa  452  1e-126  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0897789  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1445  cysteine desulfurase  52.76 
 
 
405 aa  449  1e-125  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1512  cysteine desulfurase SufS  52.76 
 
 
405 aa  448  1e-125  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0728  SufS subfamily cysteine desulfurase  54.3 
 
 
421 aa  445  1e-124  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.88575  normal  0.887973 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3281  cysteine desulfurase, SufS subfamily  52.17 
 
 
429 aa  447  1e-124  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.30955  normal  0.0478783 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1319  SufS subfamily cysteine desulfurase  54.27 
 
 
413 aa  446  1e-124  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0340803  normal  0.349427 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1608  cysteine desulfurase, SufS subfamily  52.27 
 
 
657 aa  443  1e-123  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2269  SufS subfamily cysteine desulfurase  52.2 
 
 
414 aa  441  1e-122  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.216373  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3637  SufS subfamily cysteine desulfurase  53.58 
 
 
678 aa  439  1e-122  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.51832  normal  0.140258 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0536  SufS subfamily cysteine desulfurase  50.74 
 
 
416 aa  439  1e-122  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1684  SufS subfamily cysteine desulfurase  51.38 
 
 
444 aa  436  1e-121  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3037  cysteine desulfurase, SufS subfamily  53.44 
 
 
404 aa  438  1e-121  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0138624 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3312  cysteine desulfurase, SufS subfamily  53.37 
 
 
415 aa  437  1e-121  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0757647 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2493  SufS subfamily cysteine desulfurase  53.63 
 
 
605 aa  435  1e-121  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0846  SufS subfamily cysteine desulfurase  52.21 
 
 
429 aa  436  1e-121  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.411085  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0892  cysteine desulfurase, SufS subfamily  50.74 
 
 
429 aa  431  1e-120  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0023  putative cysteine desulfurase  52.76 
 
 
661 aa  432  1e-120  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.493291 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2921  cysteine desulfurase, SufS subfamily  50.5 
 
 
406 aa  432  1e-120  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0617  SufS subfamily cysteine desulfurase  50.74 
 
 
621 aa  432  1e-120  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000358817  normal 
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2661  cysteine desulfurase  51.01 
 
 
626 aa  432  1e-120  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0591977  normal  0.463261 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0896  cysteine desulfurase, SufS subfamily  51.23 
 
 
429 aa  433  1e-120  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.825531  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0418  cysteine desulfurase, SufS subfamily  50.86 
 
 
419 aa  432  1e-120  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0488  cysteine desulfurase, SufS subfamily  50.51 
 
 
774 aa  430  1e-119  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1178  SufS subfamily cysteine desulfurase  49.13 
 
 
404 aa  429  1e-119  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.99383  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0124  cysteine desulphurases, SufS  51.51 
 
 
688 aa  431  1e-119  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0429  cysteine desulfurase, SufS subfamily  50.37 
 
 
419 aa  431  1e-119  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4001  SufS subfamily cysteine desulfurase  51.87 
 
 
666 aa  429  1e-119  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.077192 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5792  SufS subfamily cysteine desulfurase  52.67 
 
 
641 aa  430  1e-119  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0152868 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0306  SufS subfamily cysteine desulfurase  52.31 
 
 
414 aa  430  1e-119  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0801844 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3517  SufS subfamily cysteine desulfurase  52.53 
 
 
650 aa  431  1e-119  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0543  SufS subfamily cysteine desulfurase  50.61 
 
 
679 aa  426  1e-118  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.266344 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0710  SufS subfamily cysteine desulfurase  52.35 
 
 
414 aa  426  1e-118  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.548374  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4655  SufS subfamily cysteine desulfurase  50.76 
 
 
644 aa  427  1e-118  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.00370812  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2622  cysteine desulphurases, SufS  51.77 
 
 
666 aa  426  1e-118  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.795615 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1552  cysteine desulphurases, SufS  51.49 
 
 
682 aa  428  1e-118  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1549  cysteine desulfurase, SufS subfamily  51.26 
 
 
673 aa  426  1e-118  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0186902 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1232  SufS subfamily cysteine desulfurase  50.86 
 
 
629 aa  425  1e-118  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.153291  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21000  Cysteine desulfurase, SufS-like protein  51.75 
 
 
604 aa  424  1e-117  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.382512  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3227  SufS subfamily cysteine desulfurase  50.25 
 
 
662 aa  424  1e-117  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.545837  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16690  Cysteine desulfurase, SufS-like protein  51.75 
 
 
604 aa  424  1e-117  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0735  aminotransferase, class V  49.38 
 
 
404 aa  422  1e-117  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1427  SufS subfamily cysteine desulfurase  50.51 
 
 
664 aa  423  1e-117  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  7.69952e-06 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1815  selenocysteine lyase  49.5 
 
 
665 aa  422  1e-117  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.653401  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0799  cysteine desulfurase  49.63 
 
 
423 aa  424  1e-117  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.635677  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1894  cysteine desulfurase, SufS subfamily  52.04 
 
 
630 aa  423  1e-117  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0199  putative cysteine desulfurase  53.27 
 
 
660 aa  420  1e-116  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.75031  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1904  cysteine desulphurases, SufS  53.27 
 
 
660 aa  421  1e-116  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.256271  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1818  SufS family cysteine desulfurase  53.02 
 
 
660 aa  421  1e-116  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.295345  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4732  cysteine desulfurase, SufS subfamily  49.14 
 
 
420 aa  420  1e-116  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1407  putative cysteine desulfurase  53.27 
 
 
660 aa  420  1e-116  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1338  cysteine desulfurase, SufS subfamily  49.51 
 
 
674 aa  421  1e-116  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.986463 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0754  SufS subfamily cysteine desulfurase  50.63 
 
 
608 aa  419  1e-116  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.633954 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1896  cysteine desulfurase, SufS subfamily  53.67 
 
 
427 aa  421  1e-116  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1178  SufS subfamily cysteine desulfurase  49.51 
 
 
672 aa  421  1e-116  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0228689 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>