More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_3869 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_3869  putative ABC-type branched-chain amino acid transport system, periplasmic component  100 
 
 		 519 aa  1055    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.222307 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0962  putative ABC-type branched-chain amino acid transport system, periplasmic component  70.71 
 
 		 512 aa  735    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0963  putative ABC-type branched-chain amino acid transport system, periplasmic component  62.6 
 
 		 517 aa  628  1e-179  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0961  putative ABC-type branched-chain amino acid transport system, periplasmic component  57.97 
 
 		 496 aa  597  1e-169  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.731254  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1828  hypothetical protein  52.02 
 
 		 539 aa  512  1e-144  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  hitchhiker  0.00860183  normal  0.522901 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1635  putative branched-chain amino acid ABC transporter  53.32 
 
 		 497 aa  432  1e-120  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.314294  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0953  extracellular ligand-binding receptor  40.65 
 
 		 426 aa  244  3.9999999999999997e-63  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1725  putative leucine/isoleucine/valine-binding protein precursor  38.25 
 
 		 393 aa  228  3e-58  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0712  putative lipoprotein  33.88 
 
 		 480 aa  188  2e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1221  Extracellular ligand-binding receptor  32.8 
 
 		 472 aa  184  4.0000000000000006e-45  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0653937 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0974  Extracellular ligand-binding receptor  31.25 
 
 		 408 aa  182  1e-44  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2369  extracellular ligand-binding receptor  34.31 
 
 		 423 aa  181  2e-44  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.391884  normal  0.390615 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3153  extracellular ligand-binding receptor  33.42 
 
 		 398 aa  174  3.9999999999999995e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.154593  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3540  extracellular ligand-binding receptor  35.99 
 
 		 377 aa  172  2e-41  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.229705  normal  0.129038 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1033  extracellular ligand-binding receptor  31.81 
 
 		 416 aa  167  4e-40  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.344987  hitchhiker  0.000487812 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1004  Extracellular ligand-binding receptor  31.54 
 
 		 416 aa  166  8e-40  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2746  Extracellular ligand-binding receptor  34.25 
 
 		 385 aa  164  3e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.12331  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3111  Extracellular ligand-binding receptor  34.25 
 
 		 385 aa  164  4.0000000000000004e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0920  extracellular ligand-binding receptor  33.25 
 
 		 382 aa  163  7e-39  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2079  Extracellular ligand-binding receptor  31.74 
 
 		 386 aa  156  7e-37  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2059  Extracellular ligand-binding receptor  34.69 
 
 		 375 aa  156  8e-37  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0558608  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1595  extracellular ligand-binding receptor  32.12 
 
 		 411 aa  155  2e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.523513  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3001  extracellular ligand-binding receptor  33.06 
 
 		 392 aa  154  4e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2864  Leu/Ile/Val-binding signal peptide protein  35.31 
 
 		 385 aa  154  5e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.110112  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3178  extracellular ligand-binding receptor  31.62 
 
 		 386 aa  153  5.9999999999999996e-36  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.677267  normal  0.56284 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1615  extracellular ligand-binding receptor  30.42 
 
 		 411 aa  151  2e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.308041 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4184  extracellular ligand-binding receptor  31.58 
 
 		 377 aa  147  7.0000000000000006e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.891545 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0335  Extracellular ligand-binding receptor  33.52 
 
 		 374 aa  146  8.000000000000001e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1131  extracellular ligand-binding receptor  34.08 
 
 		 385 aa  145  2e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5604  putative extracellular ligand-binding receptor  31.52 
 
 		 386 aa  144  3e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.236032 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1307  Extracellular ligand-binding receptor  28.46 
 
 		 425 aa  144  5e-33  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.168587  normal  0.0355411 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0108  Extracellular ligand-binding receptor  32.37 
 
 		 388 aa  140  3.9999999999999997e-32  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0825  extracellular ligand-binding receptor  28.9 
 
 		 380 aa  140  7e-32  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0921  extracellular ligand-binding receptor  29.49 
 
 		 382 aa  135  9.999999999999999e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.589524  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5877  putative branched-chain amino acid ABC transporter periplasmic component  29.28 
 
 		 379 aa  135  9.999999999999999e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2750  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  28.82 
 
 		 425 aa  134  3e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0109739  normal  0.254921 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0768  extracellular ligand-binding receptor  31.65 
 
 		 380 aa  134  3e-30  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.567193 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0358  extracellular ligand-binding receptor  28.48 
 
 		 386 aa  131  2.0000000000000002e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00342329  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03096  putative Leu/Ile/Val-binding lipoprotein transmembrane  30.81 
 
 		 386 aa  130  6e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0735365  normal  0.368181 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4876  extracellular ligand-binding receptor  31.25 
 
 		 378 aa  129  1.0000000000000001e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.983185  normal  0.391676 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4060  extracellular ligand-binding receptor  31.99 
 
 		 384 aa  129  1.0000000000000001e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.255859 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5396  extracellular ligand-binding receptor  28.43 
 
 		 378 aa  125  3e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21341  hypothetical protein  28.71 
 
 		 342 aa  122  1.9999999999999998e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.551591 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1738  leucine/isoleucine/valine-binding protein precursor  29.89 
 
 		 409 aa  117  3.9999999999999997e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0827731 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0443  Extracellular ligand-binding receptor  29.84 
 
 		 382 aa  116  1.0000000000000001e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.363055  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2248  Extracellular ligand-binding receptor  30.11 
 
 		 410 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0188  Extracellular ligand-binding receptor  31.4 
 
 		 386 aa  115  2.0000000000000002e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0452  extracellular ligand-binding receptor  29.84 
 
 		 382 aa  115  2.0000000000000002e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.128382  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0210  Extracellular ligand-binding receptor  27.65 
 
 		 592 aa  115  2.0000000000000002e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.019468 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3562  putative leucine/isoleucine/valine-binding protein precursor  30.34 
 
 		 409 aa  113  9e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4342  extracellular ligand-binding receptor  29.86 
 
 		 373 aa  112  1.0000000000000001e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.688129 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2080  Extracellular ligand-binding receptor  29.27 
 
 		 383 aa  112  1.0000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3339  extracellular ligand-binding receptor  29.83 
 
 		 410 aa  112  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.154352  normal  0.135284 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3606  extracellular ligand-binding receptor  30.7 
 
 		 395 aa  110  5e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.316629 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7082  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic-binding protein  29.43 
 
 		 407 aa  110  7.000000000000001e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1879  putative amino acids-binding transmembrane protein  28.69 
 
 		 383 aa  110  9.000000000000001e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.399388  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0789  extracellular ligand-binding receptor  29.43 
 
 		 383 aa  109  1e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.394286  normal  0.786087 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4394  extracellular ligand-binding receptor  29.15 
 
 		 406 aa  108  2e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4246  Extracellular ligand-binding receptor  30.37 
 
 		 409 aa  108  2e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2010  Extracellular ligand-binding receptor  26.17 
 
 		 377 aa  107  5e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.467518  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1693  extracellular ligand-binding receptor  26.42 
 
 		 377 aa  107  5e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.502178  normal  0.251064 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1040  Extracellular ligand-binding receptor  27.25 
 
 		 382 aa  106  9e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.098407 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0531  extracellular ligand-binding receptor  26.44 
 
 		 386 aa  105  1e-21  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000267349  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4935  Extracellular ligand-binding receptor  26.81 
 
 		 389 aa  105  2e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.682713  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4704  Extracellular ligand-binding receptor  26.9 
 
 		 371 aa  105  2e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5294  putative ABC-type branched-chain amino acid transporter, periplasmic binding protein  28.21 
 
 		 406 aa  104  3e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3815  extracellular ligand-binding receptor  27.49 
 
 		 368 aa  103  6e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3504  extracellular ligand-binding receptor  29.85 
 
 		 392 aa  103  8e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0407454  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3597  extracellular ligand-binding receptor  22.86 
 
 		 398 aa  103  9e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3029  Extracellular ligand-binding receptor  27.68 
 
 		 370 aa  102  1e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.518701  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4823  extracellular ligand-binding receptor  27.96 
 
 		 437 aa  102  1e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.615465 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3748  extracellular ligand-binding receptor  27.4 
 
 		 370 aa  102  2e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.178822  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0508  extracellular ligand-binding receptor  26.65 
 
 		 403 aa  101  3e-20  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000199641  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3009  extracellular ligand-binding receptor  27.73 
 
 		 415 aa  100  5e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000545529  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5732  extracellular ligand-binding receptor  26.5 
 
 		 403 aa  100  5e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.588725 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4684  extracellular ligand-binding receptor  28.04 
 
 		 406 aa  100  5e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1452  ABC-type branched-chain amino acid transport system, periplasmic component  25.46 
 
 		 458 aa  100  8e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.691281  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3566  extracellular ligand-binding receptor  27.76 
 
 		 411 aa  100  9e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.172998  normal  0.680161 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7081  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic-binding protein  29.05 
 
 		 407 aa  100  9e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.220124  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1428  Extracellular ligand-binding receptor  26.18 
 
 		 401 aa  99.8  1e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3561  extracellular ligand-binding receptor  30.56 
 
 		 409 aa  99.8  1e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4245  ABC transporter substrate-binding protein  28.86 
 
 		 410 aa  98.6  2e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0681  extracellular ligand-binding receptor  28.91 
 
 		 382 aa  99  2e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.35117  normal  0.336917 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3749  extracellular ligand-binding receptor  28.45 
 
 		 374 aa  97.8  4e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.314564  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0299  extracellular ligand-binding receptor  27.35 
 
 		 378 aa  97.4  6e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4101  extracellular ligand-binding receptor  25.9 
 
 		 387 aa  97.4  6e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3560  extracellular ligand-binding receptor  28.66 
 
 		 411 aa  97.1  6e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.726041  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1020  twin-arginine translocation pathway signal  27.68 
 
 		 383 aa  96.7  8e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1779  hypothetical protein  31.55 
 
 		 438 aa  95.9  1e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3030  Extracellular ligand-binding receptor  28.16 
 
 		 374 aa  96.3  1e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.394704  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4100  extracellular ligand-binding receptor  29.26 
 
 		 387 aa  95.9  2e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.199713  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0550  extracellular ligand-binding receptor  28.24 
 
 		 383 aa  95.1  2e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0334765 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0045  extracellular ligand-binding receptor  27.57 
 
 		 385 aa  95.5  2e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.406138  normal  0.264074 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2001  Extracellular ligand-binding receptor  28.84 
 
 		 411 aa  95.5  2e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1739  extracellular ligand-binding receptor  31.17 
 
 		 410 aa  95.5  2e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.152869 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4388  extracellular ligand-binding receptor  30.06 
 
 		 372 aa  95.1  3e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.861875 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0065  Extracellular ligand-binding receptor  27.3 
 
 		 385 aa  94.7  3e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1661  hypothetical protein  30.57 
 
 		 430 aa  94.7  4e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.429909  normal  0.749387 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0549  extracellular ligand-binding receptor  25.88 
 
 		 384 aa  94.7  4e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0807314 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0352  extracellular ligand-binding receptor  28.41 
 
 		 410 aa  94.7  4e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.115416  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>