More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_3832 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007406  Nwi_1676  leucyl aminopeptidase  76.75 
 
 
500 aa  763    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.933774  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1462  leucyl aminopeptidase  64.79 
 
 
498 aa  647    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.428409  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2481  leucyl aminopeptidase  76.35 
 
 
500 aa  758    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2314  leucyl aminopeptidase  75.55 
 
 
499 aa  766    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.916882  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2965  leucyl aminopeptidase  77.35 
 
 
500 aa  748    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.434941  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2339  leucyl aminopeptidase  76.55 
 
 
500 aa  768    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3470  leucyl aminopeptidase  75.15 
 
 
500 aa  778    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.987898  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3832  leucyl aminopeptidase  100 
 
 
499 aa  1008    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.454822 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3337  leucyl aminopeptidase  62.32 
 
 
497 aa  607  9.999999999999999e-173  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.39658 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2221  Leucyl aminopeptidase  61.62 
 
 
539 aa  590  1e-167  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.258541 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1756  leucyl aminopeptidase  62.05 
 
 
495 aa  586  1e-166  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.09073  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5835  peptidase M17 leucyl aminopeptidase domain protein  61.08 
 
 
500 aa  583  1.0000000000000001e-165  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.829477  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1070  leucyl aminopeptidase  63.1 
 
 
496 aa  583  1.0000000000000001e-165  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.32941  decreased coverage  0.00000385423 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1214  leucyl aminopeptidase  63.76 
 
 
496 aa  577  1.0000000000000001e-163  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0455494  decreased coverage  0.00000170751 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0650  leucyl aminopeptidase  61.02 
 
 
542 aa  568  1e-161  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0557  leucyl aminopeptidase  58.81 
 
 
503 aa  569  1e-161  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0287473 
 
 
-
 
NC_004310  BR0689  leucyl aminopeptidase  57.72 
 
 
497 aa  565  1e-160  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.167828  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3944  Leucyl aminopeptidase  59.92 
 
 
497 aa  565  1e-160  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.253806  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3937  Leucyl aminopeptidase  59.92 
 
 
497 aa  565  1e-160  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0971426 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0680  leucyl aminopeptidase  57.72 
 
 
497 aa  563  1.0000000000000001e-159  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3651  leucyl aminopeptidase  60.72 
 
 
497 aa  560  1e-158  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0766  leucyl aminopeptidase  63.46 
 
 
497 aa  556  1e-157  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.133463 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1545  leucyl aminopeptidase  61.95 
 
 
497 aa  553  1e-156  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.87214  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2600  leucyl aminopeptidase  60.53 
 
 
498 aa  552  1e-156  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.080884  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5097  leucyl aminopeptidase  58.68 
 
 
500 aa  546  1e-154  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.803796  normal  0.160134 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0454  leucyl aminopeptidase  56.63 
 
 
500 aa  504  1e-141  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2531  leucyl aminopeptidase  55.34 
 
 
493 aa  457  1e-127  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.353426  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1227  leucyl aminopeptidase  50.74 
 
 
494 aa  451  1e-125  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.11793  normal  0.494822 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3051  Leucyl aminopeptidase  53.72 
 
 
487 aa  446  1.0000000000000001e-124  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00163591  normal  0.235432 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1191  leucyl aminopeptidase  53.74 
 
 
488 aa  437  1e-121  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.239585  normal  0.359971 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1204  leucyl aminopeptidase  52.33 
 
 
514 aa  432  1e-120  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.453819  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1761  leucyl aminopeptidase  51.47 
 
 
481 aa  426  1e-118  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.297998 
 
 
-
 
NC_002978  WD0054  leucyl aminopeptidase  47.84 
 
 
500 aa  425  1e-117  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0642  leucyl aminopeptidase  50.44 
 
 
500 aa  422  1e-117  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0369  leucyl aminopeptidase  49.89 
 
 
500 aa  423  1e-117  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1122  leucyl aminopeptidase  48.87 
 
 
489 aa  419  1e-116  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.289699 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0412  leucyl aminopeptidase  52.91 
 
 
489 aa  414  1e-114  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0249677 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1815  leucyl aminopeptidase  56.91 
 
 
488 aa  409  1e-113  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.453666 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1543  leucyl aminopeptidase  48.55 
 
 
489 aa  397  1e-109  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2899  leucyl aminopeptidase  48.55 
 
 
489 aa  396  1e-109  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.886783  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0890  leucyl aminopeptidase  53.72 
 
 
485 aa  396  1e-109  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.119935  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0903  leucyl aminopeptidase  48.1 
 
 
533 aa  374  1e-102  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0577205 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0950  leucyl aminopeptidase  49.35 
 
 
491 aa  365  1e-100  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.111685  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0200  aminopeptidase A/I  43.59 
 
 
497 aa  364  2e-99  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000277663  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0475  cytosol aminopeptidase  45.59 
 
 
506 aa  360  5e-98  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  hitchhiker  0.00320613  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0616  leucyl aminopeptidase  42.83 
 
 
508 aa  357  2.9999999999999997e-97  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.294283 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11650  leucyl aminopeptidase  44.83 
 
 
496 aa  357  2.9999999999999997e-97  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3514  leucyl aminopeptidase  43.5 
 
 
510 aa  355  7.999999999999999e-97  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3637  leucyl aminopeptidase  43.5 
 
 
510 aa  355  1e-96  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0897  leucyl aminopeptidase  43.72 
 
 
518 aa  355  1e-96  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3443  Leucyl aminopeptidase  43.5 
 
 
510 aa  355  1e-96  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0850  leucyl aminopeptidase  43.5 
 
 
510 aa  354  2e-96  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1271  cytosol aminopeptidase  44.59 
 
 
496 aa  347  3e-94  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0802  leucyl aminopeptidase  42.15 
 
 
511 aa  346  6e-94  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.515855 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3221  leucyl aminopeptidase  42.15 
 
 
511 aa  346  6e-94  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3324  peptidase M17, leucyl aminopeptidase domain-containing protein  42.15 
 
 
511 aa  345  2e-93  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2115  Leucyl aminopeptidase  46.59 
 
 
492 aa  343  2.9999999999999997e-93  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.299036 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0989  leucyl aminopeptidase  43.51 
 
 
496 aa  343  5e-93  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.345357  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0959  cytosol aminopeptidase  43.5 
 
 
511 aa  342  5.999999999999999e-93  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3527  leucyl aminopeptidase  42.74 
 
 
512 aa  341  2e-92  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00117428  normal  0.357164 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2725  leucyl aminopeptidase  42.62 
 
 
492 aa  341  2e-92  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00941459  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1516  leucyl aminopeptidase  42.71 
 
 
491 aa  341  2e-92  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0890319 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1091  leucyl aminopeptidase  45.5 
 
 
496 aa  340  2.9999999999999998e-92  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0961  leucyl aminopeptidase  44.35 
 
 
500 aa  340  2.9999999999999998e-92  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0222  leucyl aminopeptidase  44.88 
 
 
496 aa  339  5e-92  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0191998  normal  0.929203 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1725  Leucyl aminopeptidase  48.18 
 
 
496 aa  337  3.9999999999999995e-91  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3082  leucyl aminopeptidase  44.09 
 
 
498 aa  336  5.999999999999999e-91  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0737217 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1921  PepA aminopeptidase  47.69 
 
 
496 aa  336  7e-91  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.428802  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2140  Leucyl aminopeptidase  43.85 
 
 
496 aa  335  7.999999999999999e-91  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.727293  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1018  leucyl aminopeptidase  42.98 
 
 
497 aa  334  2e-90  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0980  leucyl aminopeptidase  42.07 
 
 
497 aa  334  2e-90  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0986  leucyl aminopeptidase  43.2 
 
 
497 aa  335  2e-90  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.481713  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4237  leucyl aminopeptidase  42.98 
 
 
497 aa  334  2e-90  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2996  leucyl aminopeptidase  41.78 
 
 
515 aa  333  4e-90  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.143119 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1282  leucyl aminopeptidase  42.98 
 
 
495 aa  333  6e-90  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2389  leucyl aminopeptidase  45.82 
 
 
556 aa  332  8e-90  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.0738051 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0699  leucyl aminopeptidase  45.83 
 
 
487 aa  326  6e-88  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0267193  normal  0.882342 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0558  PepA aminopeptidase  42.18 
 
 
497 aa  324  2e-87  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.548083  hitchhiker  0.0000733214 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14470  leucyl aminopeptidase  41.98 
 
 
495 aa  325  2e-87  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1016  leucyl aminopeptidase  47.87 
 
 
482 aa  322  8e-87  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0516  leucyl aminopeptidase  42.66 
 
 
495 aa  322  9.999999999999999e-87  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.204663  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2169  leucyl aminopeptidase  45.41 
 
 
510 aa  321  1.9999999999999998e-86  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.176164 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2787  leucyl aminopeptidase  43.55 
 
 
499 aa  319  9e-86  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.151843  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0623  leucyl aminopeptidase  43.51 
 
 
536 aa  318  1e-85  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000022147  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1233  Leucyl aminopeptidase  44.31 
 
 
536 aa  318  1e-85  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1748  leucyl aminopeptidase  40.65 
 
 
493 aa  317  4e-85  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2676  leucyl aminopeptidase  41.97 
 
 
511 aa  317  4e-85  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00321125  normal  0.944442 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0871  leucyl aminopeptidase  42.45 
 
 
502 aa  316  5e-85  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0238632  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0924  leucyl aminopeptidase  42.45 
 
 
502 aa  315  8e-85  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.317075  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0746  leucyl aminopeptidase  42.89 
 
 
518 aa  315  9.999999999999999e-85  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.483343  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2510  leucyl aminopeptidase  39.95 
 
 
493 aa  314  1.9999999999999998e-84  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2827  leucyl aminopeptidase  42.04 
 
 
502 aa  314  1.9999999999999998e-84  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.246514  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0795  leucyl aminopeptidase  41.81 
 
 
502 aa  314  1.9999999999999998e-84  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2595  leucyl aminopeptidase  45.87 
 
 
486 aa  314  2.9999999999999996e-84  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0344474 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2909  leucyl aminopeptidase  42.04 
 
 
502 aa  313  2.9999999999999996e-84  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.112327  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3119  leucyl aminopeptidase  41.57 
 
 
502 aa  313  4.999999999999999e-84  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000000969621  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0295  leucyl aminopeptidase  43.85 
 
 
488 aa  313  5.999999999999999e-84  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2515  leucyl aminopeptidase  43.16 
 
 
503 aa  313  5.999999999999999e-84  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.880203  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2466  leucyl aminopeptidase  43.39 
 
 
503 aa  313  5.999999999999999e-84  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3006  leucyl aminopeptidase  42.04 
 
 
502 aa  313  5.999999999999999e-84  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.132109  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>