66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_3682 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_3682  putative membrane protein of unknown function with YeeE/YedE motives  100 
 
 		 180 aa  350  4e-96  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.137172  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1695  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  44.77 
 
 		 181 aa  136  1e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000630724 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2310  YeeE/YedE family protein  49.36 
 
 		 173 aa  132  3e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.996502  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0624  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  45.68 
 
 		 175 aa  124  5e-28  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0175  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  43.27 
 
 		 176 aa  122  2e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00121367 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1868  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  37.14 
 
 		 180 aa  118  3.9999999999999996e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.212789  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2856  hypothetical protein  39.55 
 
 		 175 aa  118  4.9999999999999996e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1978  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  39.75 
 
 		 174 aa  117  7.999999999999999e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.248725  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0801  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  38.41 
 
 		 171 aa  116  9.999999999999999e-26  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.897087  normal  0.163376 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2969  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  40.36 
 
 		 172 aa  115  3e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1597  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  41.61 
 
 		 170 aa  112  3e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1168  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  39.51 
 
 		 172 aa  107  7.000000000000001e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.709858  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1629  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  41.98 
 
 		 175 aa  101  5e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.301211 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0053  hypothetical protein  37.5 
 
 		 344 aa  95.9  3e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.101016  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0054  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  37.5 
 
 		 352 aa  95.9  3e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0689897  normal  0.802997 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3344  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  39.18 
 
 		 177 aa  90.5  1e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3015  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  45.19 
 
 		 133 aa  89  4e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4308  hypothetical protein  35.33 
 
 		 174 aa  87  1e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.219797 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1835  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  37.42 
 
 		 177 aa  86.7  2e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2804  hypothetical protein  34.19 
 
 		 180 aa  83.6  0.000000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1156  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  40.82 
 
 		 407 aa  77.4  0.0000000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.643231  normal  0.0925546 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0812  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  43.84 
 
 		 462 aa  73.2  0.000000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0788  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  30.36 
 
 		 175 aa  64.7  0.0000000007  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0768937  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1214  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  32.32 
 
 		 100 aa  63.9  0.000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0826897  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0171  YeeE/YedE  29.65 
 
 		 162 aa  63.2  0.000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.96637  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0512  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  34.81 
 
 		 176 aa  61.2  0.000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1366  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  32.85 
 
 		 182 aa  60.5  0.00000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1463  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  32.08 
 
 		 165 aa  60.8  0.00000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2596  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  31.79 
 
 		 171 aa  58.5  0.00000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.127536 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4545  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  36.53 
 
 		 407 aa  58.2  0.00000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0891031  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4108  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  29.09 
 
 		 169 aa  57  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.629553  normal  0.177629 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2716  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  33.13 
 
 		 171 aa  53.5  0.000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.653376  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2080  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  31.82 
 
 		 412 aa  53.1  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2811  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  33.33 
 
 		 171 aa  53.5  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.647947  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1489  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  32.52 
 
 		 412 aa  53.1  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3774  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  32.87 
 
 		 374 aa  51.2  0.000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2630  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  33.54 
 
 		 171 aa  50.4  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.671855  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1172  hypothetical protein  30.53 
 
 		 373 aa  50.4  0.00001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000126927  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1576  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  28.57 
 
 		 373 aa  50.1  0.00002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3126  YeeE/YedE  35.29 
 
 		 361 aa  48.9  0.00003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3826  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  30.72 
 
 		 405 aa  49.3  0.00003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000399635 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2101  inner membrane protein YeeE  30.22 
 
 		 344 aa  48.9  0.00004  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0719  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  27.84 
 
 		 183 aa  47  0.0001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0556  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  29.05 
 
 		 174 aa  47  0.0001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.0000027249  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0571  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  34.65 
 
 		 423 aa  46.2  0.0002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.484751  normal  0.560137 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11778  hypothetical protein  29.46 
 
 		 185 aa  46.6  0.0002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2224  hypothetical protein  31.68 
 
 		 421 aa  45.8  0.0003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0511  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  38.55 
 
 		 330 aa  45.8  0.0003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000000413537  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00550  predicted transporter component  29.22 
 
 		 385 aa  45.8  0.0003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1848  putative inner membrane protein  29.86 
 
 		 402 aa  45.4  0.0004  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2820  YeeE/YedE  29.94 
 
 		 170 aa  45.4  0.0004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1673  putative inner membrane protein  29.86 
 
 		 402 aa  45.4  0.0005  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1492  putative inner membrane protein  29.86 
 
 		 402 aa  45.4  0.0005  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4366  hypothetical protein  33.33 
 
 		 363 aa  45.4  0.0005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2608  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  30.58 
 
 		 186 aa  44.7  0.0007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.104048 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4250  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  35.11 
 
 		 363 aa  44.3  0.0008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.778498  normal  0.233136 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4955  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  34.29 
 
 		 370 aa  44.3  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.363072  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0047  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  26.43 
 
 		 180 aa  43.1  0.002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.607535  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0269  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  38.36 
 
 		 187 aa  43.5  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0449  hypothetical protein  30 
 
 		 394 aa  43.5  0.002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1170  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  25.81 
 
 		 368 aa  42.7  0.003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.100634  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1086  YeeE/YedE family protein  41.82 
 
 		 144 aa  42.4  0.003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0490771  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1716  YeeE/YedE  31.91 
 
 		 135 aa  42.7  0.003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.539971  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0258  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  34.48 
 
 		 163 aa  41.6  0.006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3453  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  25.6 
 
 		 371 aa  40.8  0.01  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12633  hypothetical protein  50 
 
 		 185 aa  40.8  0.01  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.318164  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>