More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_3660 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007947  Mfla_0167  response regulator receiver domain-containing protein  66.78 
 
 
921 aa  1212  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000281851 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0316  ABC transporter related  66.89 
 
 
901 aa  1184  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1743  ABC transporter related  56.38 
 
 
917 aa  1034  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00128073 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3660  ABC transporter permease ATP-binding protein  100 
 
 
924 aa  1861  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.388882  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7849  ABC transporter permease ATP-binding protein  57.95 
 
 
915 aa  1045  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0180786  normal  0.28937 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5115  ABC transporter related  55.03 
 
 
906 aa  973  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5974  putative ABC transporter ATP-binding protein/permease  66.37 
 
 
916 aa  1197  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1824  ABC transporter related  69.44 
 
 
926 aa  1326  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4845  ABC transporter related  54.38 
 
 
928 aa  951  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.771087  normal  0.268191 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4915  ABC transporter related  74.29 
 
 
933 aa  1392  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1504  ABC transporter related  69.15 
 
 
914 aa  1257  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.13475  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3446  ABC transporter related  64.64 
 
 
922 aa  1180  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0210  ABC transporter related  56.56 
 
 
916 aa  979  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.10228  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3216  hypothetical protein  55.26 
 
 
901 aa  924  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.881603  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0165  RND efflux system, cytoplasmic membrane extrusion protein  71.09 
 
 
1079 aa  712  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.243814  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2633  ABC transporter, ATP-binding protein/permease  68.8 
 
 
1066 aa  712  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2340  ABC multidrug efflux pump, fused duplicated ATPase and inner membrane subunits  64.56 
 
 
927 aa  1132  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0626468  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1432  ABC transporter related  61.52 
 
 
908 aa  1081  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1684  response regulator receiver domain-containing protein  63.34 
 
 
919 aa  1154  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00676218  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1612  ABC transporter related  55.64 
 
 
935 aa  1014  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1561  ABC transporter related  55.52 
 
 
918 aa  1016  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69070  putative ATP-binding/permease fusion ABC transporter  65.49 
 
 
916 aa  1166  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4686  ABC transporter related  68.8 
 
 
912 aa  1210  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.248247 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0018  ABC transporter related  59.39 
 
 
909 aa  1037  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2361  ABC transporter related  65.51 
 
 
936 aa  1191  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0787622  normal  0.702477 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1309  RND efflux system, cytoplasmic membrane extrusion protein  71.09 
 
 
1071 aa  712  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3896  ABC transporter related  55.35 
 
 
901 aa  924  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.184002 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2776  response regulator receiver domain-containing protein  71.09 
 
 
1089 aa  712  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.591057  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3685  ABC transporter, ATP binding protein  65.71 
 
 
911 aa  1210  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3968  ABC transporter, ATP binding protein  65.82 
 
 
911 aa  1211  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0759  ABC transporter related  65.49 
 
 
918 aa  1170  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.207246  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3898  ABC transporter permease and ATP-binding protein  66.26 
 
 
913 aa  1220  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3778  ABC transporter permease and ATP-binding protein  66.41 
 
 
913 aa  1223  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0174984  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3788  ABC transporter, ATP binding protein  66.3 
 
 
913 aa  1224  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4831  ABC transporter, ATP binding protein  65.49 
 
 
911 aa  1206  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1151  ABC transporter related  60.92 
 
 
994 aa  1129  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.64731  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2950  ABC transporter related  58.36 
 
 
943 aa  1070  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3790  ABC transporter related  56.81 
 
 
912 aa  1023  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0500  ABC transporter related  58.97 
 
 
912 aa  1019  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9217  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  55.01 
 
 
913 aa  965  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.808205  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3880  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  56.01 
 
 
914 aa  963  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.859575  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1497  ABC transporter related  65.51 
 
 
936 aa  1193  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16780  ABC transporter, ATP binding/permease hybrid protein  63.37 
 
 
911 aa  1127  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.200958  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3855  ABC transporter permease and ATP-binding protein  66.41 
 
 
913 aa  1224  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0749  ABC transporter related  58.02 
 
 
904 aa  1002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.118496  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3419  ABC transporter related  68.42 
 
 
929 aa  1236  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5750  ABC transporter related  50.21 
 
 
942 aa  855  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.295356  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5883  ABC transporter related  61.31 
 
 
942 aa  1065  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0565  ABC transporter related  58.86 
 
 
912 aa  1034  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.620253  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5268  ABC transporter related  55.02 
 
 
906 aa  974  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.155488  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1950  ABC transporter related  67.75 
 
 
921 aa  1228  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.62728  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0229  ABC transporter related  65.71 
 
 
911 aa  1210  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3775  ABC transporter, ATP binding protein  65.82 
 
 
911 aa  1211  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0081  ABC transporter related  58.07 
 
 
911 aa  1003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.111976  normal  0.167025 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6206  ABC transporter related  62.42 
 
 
936 aa  1077  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.84654  normal  0.203674 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0810  ABC transporter related  57.86 
 
 
932 aa  1026  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3836  ABC transporter, ATP binding protein  65.82 
 
 
911 aa  1209  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.932304  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0536  ABC transporter related  58.97 
 
 
912 aa  1031  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.94583  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2180  ABC transporter related  66.15 
 
 
927 aa  1211  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4664  ABC transporter related  73.03 
 
 
927 aa  1340  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.113948 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0987  ABC-2:ABC transporter related  61.5 
 
 
920 aa  1117  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.149444  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0139  RND efflux system, cytoplasmic membrane extrusion protein  71.09 
 
 
1071 aa  712  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0170  ABC-2 type transport system  71.84 
 
 
925 aa  1336  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.476544  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1350  ABC transporter, ATP binding/permease protein  70.96 
 
 
922 aa  1327  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0555  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  58.32 
 
 
907 aa  1008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5207  ABC transporter permease/ATP-binding protein  55.25 
 
 
906 aa  976  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.468455  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0228  ABC transporter related protein  65.82 
 
 
911 aa  1211  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2686  ABC transporter, ATP-binding protein  69.92 
 
 
930 aa  1280  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0438  RND efflux system, cytoplasmic membrane extrusion protein  71.09 
 
 
1017 aa  726  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1039  RND efflux system, cytoplasmic membrane extrusion protein  71.09 
 
 
1082 aa  712  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03336  fused ribosome-associated ATPase: ATP-binding protein/ATP-binding protein/predicted membrane protein  65.82 
 
 
911 aa  1211  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03288  hypothetical protein  65.82 
 
 
911 aa  1211  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3159  ABC transporter, 2 fused ATPase and 1 inner membrane subunits  54.98 
 
 
901 aa  925  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.827226  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3577  ABC transporter related  73.09 
 
 
930 aa  1332  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5442  ABC transporter-like  55.68 
 
 
906 aa  979  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0350358 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0170  response regulator receiver domain-containing protein  64.82 
 
 
930 aa  1147  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.696598  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1134  ABC transporter related  38.66 
 
 
651 aa  387  1e-106  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2905  ABC transporter related  41.91 
 
 
512 aa  381  1e-104  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.725658  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4697  ABC transporter related  42.14 
 
 
582 aa  374  1e-102  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.793973  normal  0.717601 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1304  ABC transporter related  40.7 
 
 
590 aa  364  4e-99  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1795  ABC transporter related  41.68 
 
 
578 aa  363  1e-98  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3106  ABC transporter related  41.29 
 
 
510 aa  362  2e-98  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2813  ABC transporter, ATP-binding protein  37.37 
 
 
580 aa  358  3e-97  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2901  ABC transporter related  37.37 
 
 
580 aa  358  3e-97  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2512  ABC transporter related  37.69 
 
 
583 aa  350  5e-95  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.58848  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1328  ABC transporter-related protein  36.76 
 
 
576 aa  348  2e-94  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1779  ABC transporter, ATPase subunit  38.47 
 
 
579 aa  347  6e-94  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2943  ABC transporter related protein  37.23 
 
 
585 aa  344  4e-93  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.773013  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3038  ABC transporter related  38.63 
 
 
588 aa  343  6e-93  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1421  ABC transporter related  39.5 
 
 
599 aa  342  2e-92  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.316011  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1285  ABC transporter related  36.83 
 
 
579 aa  340  6e-92  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0880  ABC transporter ATP-binding protein  37.25 
 
 
578 aa  340  6e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0912  ABC transporter ATP-binding protein  37.25 
 
 
578 aa  340  6e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0965  ABC transporter ATP-binding protein  37.25 
 
 
578 aa  340  7e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0852  ABC transporter, ATP-binding protein  37.25 
 
 
578 aa  340  9e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0944  ABC transporter ATP-binding protein  37.25 
 
 
578 aa  340  9e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1381  ABC transporter related  38.39 
 
 
587 aa  339  2e-91  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  hitchhiker  3.41514e-05 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0859  ABC transporter, ATP-binding protein  37.23 
 
 
578 aa  336  9e-91  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2369  ABC transporter related  39 
 
 
575 aa  336  1e-90  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.296305  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2848  ABC transporter related protein  37.23 
 
 
578 aa  336  1e-90  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>