33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_3589 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009485  BBta_3589  hypothetical protein  100 
 
 
552 aa  1105  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0075093 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1306  hypothetical protein  45 
 
 
617 aa  322  1e-86  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.580555 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6670  hypothetical protein  42.09 
 
 
590 aa  322  2e-86  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.335645  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0768  hypothetical protein  34.38 
 
 
563 aa  230  6e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.8087 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3412  hypothetical protein  32.62 
 
 
566 aa  212  1e-53  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.295964  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1361  hypothetical protein  32.23 
 
 
568 aa  192  1e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.515582  normal  0.0625662 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0932  hypothetical protein  31.43 
 
 
563 aa  192  1e-47  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0523701  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0948  hypothetical protein  32.48 
 
 
571 aa  186  7e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0865  hypothetical protein  31.97 
 
 
564 aa  180  5e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.305533 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4538  hypothetical protein  30.85 
 
 
540 aa  174  5e-42  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3898  hypothetical protein  30.99 
 
 
647 aa  171  3e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.242852  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3606  hypothetical protein  30.73 
 
 
646 aa  171  3e-41  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7239  hypothetical protein  29.47 
 
 
528 aa  168  3e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4284  conserved hypothetical proteinn  30.37 
 
 
597 aa  167  6e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6052  hypothetical protein  28.16 
 
 
546 aa  153  7e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.157473  normal  0.365189 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0074  hypothetical protein  28.02 
 
 
592 aa  150  4e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.679979  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4270  hypothetical protein  26.35 
 
 
528 aa  136  9e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0072  hypothetical protein  26.48 
 
 
512 aa  126  1e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.387574  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0067  hypothetical protein  26.48 
 
 
502 aa  125  2e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1489  hypothetical protein  24.35 
 
 
451 aa  110  6e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.427413  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2738  hypothetical protein  25.85 
 
 
515 aa  109  1e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.22803  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4817  hypothetical protein  22.4 
 
 
424 aa  99  2e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3723  hypothetical protein  27.03 
 
 
505 aa  95.5  2e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2706  hypothetical protein  24.23 
 
 
467 aa  86.3  1e-15  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.390646  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0252  hypothetical protein  24.53 
 
 
400 aa  84.7  4e-15  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3308  hypothetical protein  22.1 
 
 
511 aa  82  3e-14  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1905  hypothetical protein  21.45 
 
 
423 aa  80.5  7e-14  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3610  hypothetical protein  22.64 
 
 
513 aa  79  2e-13  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4529  hypothetical protein  23.32 
 
 
420 aa  67.4  6e-10  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1085  hypothetical protein  23.23 
 
 
537 aa  66.6  1e-09  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.016915  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001325  Capsular polysaccharide synthesis enzyme CpsB  25.34 
 
 
401 aa  52.4  2e-05  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.138283  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1071  hypothetical protein  20.73 
 
 
380 aa  51.6  4e-05  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05206  hypothetical protein  23.24 
 
 
408 aa  50.4  9e-05  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>