More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_3567 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_3567  putative thiolase  100 
 
 		 378 aa  758    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3314  thiolase  77.78 
 
 		 404 aa  579  1e-164  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2105  thiolase  77.25 
 
 		 404 aa  570  1e-161  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0715913  normal  0.0186682 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3952  putative thiolase  78.04 
 
 		 378 aa  549  1e-155  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.130005  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3972  thiolase  59.84 
 
 		 383 aa  406  1.0000000000000001e-112  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.330404 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3322  thiolase  59.84 
 
 		 383 aa  407  1.0000000000000001e-112  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.00152041  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0860  putative thiolase  52.67 
 
 		 384 aa  367  1e-100  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.016172  normal  0.461503 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3886  thiolase  56.95 
 
 		 381 aa  362  5.0000000000000005e-99  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.266996  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0233  putative thiolase  45.62 
 
 		 388 aa  305  8.000000000000001e-82  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5279  thiolase  38.61 
 
 		 385 aa  219  5e-56  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3512  thiolase  35.83 
 
 		 390 aa  216  5e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0147  thiolase  38.07 
 
 		 402 aa  208  1e-52  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0129  thiolase  37.8 
 
 		 402 aa  207  3e-52  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5255  thiolase  38.57 
 
 		 389 aa  205  8e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2581  thiolase  36.87 
 
 		 385 aa  204  1e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0313462 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51190  thiolase  36.44 
 
 		 383 aa  204  3e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000113364 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4368  thiolase  36.44 
 
 		 383 aa  202  9.999999999999999e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.739547  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2336  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  37.92 
 
 		 382 aa  201  1.9999999999999998e-50  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5111  thiolase  37.27 
 
 		 390 aa  199  7.999999999999999e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000299159  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0177  thiolase  37 
 
 		 403 aa  197  3e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.96187  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6845  thiolase  35.68 
 
 		 383 aa  192  6e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2277  thiolase  33.69 
 
 		 383 aa  191  1e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.573629 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4625  thiolase  33.25 
 
 		 390 aa  191  2.9999999999999997e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6629  thiolase  37.7 
 
 		 381 aa  190  2.9999999999999997e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.023971  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0342  thiolase  35.79 
 
 		 381 aa  184  2.0000000000000003e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.516645  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5776  thiolase  36.1 
 
 		 393 aa  179  8e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.158542  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2009  hypothetical protein  36.78 
 
 		 380 aa  177  2e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.992719  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4062  putative thiolase  35.45 
 
 		 383 aa  171  1e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1074  thiolase  33.24 
 
 		 384 aa  171  2e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3829  acetyl-CoA acetyltransferase  33.78 
 
 		 388 aa  168  1e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.401188  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4152  acetyl-CoA acetyltransferase  34.32 
 
 		 389 aa  169  1e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.500938  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4071  thiolase  34.24 
 
 		 382 aa  167  2e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.197027  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4413  acetyl-CoA acetyltransferase  34.32 
 
 		 389 aa  166  5.9999999999999996e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00900083  normal  0.500105 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3483  Thiolase  34.58 
 
 		 383 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2744  putative thiolase/acetyl-CoA acetyltransferase, PaaJ-like  30.53 
 
 		 406 aa  164  3e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0906041 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4180  putative acetyl-CoA C-acetyltransferase  31.32 
 
 		 394 aa  163  4.0000000000000004e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.785914  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2362  acetyl-CoA acetyltransferase  32.88 
 
 		 386 aa  163  5.0000000000000005e-39  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3226  hypothetical protein  32.94 
 
 		 388 aa  163  5.0000000000000005e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3215  hypothetical protein  32.94 
 
 		 388 aa  163  5.0000000000000005e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.128121  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3277  hypothetical protein  32.94 
 
 		 388 aa  163  5.0000000000000005e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0150  acetyl-CoA acetyltransferase  31.17 
 
 		 387 aa  162  8.000000000000001e-39  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.964414  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5499  acetyl-CoA acetyltransferase  33.51 
 
 		 391 aa  160  2e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0457  acetyl-CoA acetyltransferase  31.2 
 
 		 391 aa  160  2e-38  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4787  acetyl-CoA acetyltransferase  34.38 
 
 		 387 aa  160  5e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0607631  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3805  acetyl-CoA acetyltransferase  32.44 
 
 		 388 aa  159  5e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1626  acetyl-CoA acetyltransferase  32.39 
 
 		 387 aa  159  6e-38  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1757  acetyl-CoA acetyltransferase  33.06 
 
 		 391 aa  158  1e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.439431  normal  0.143058 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4565  acetyl-CoA acetyltransferase  33.42 
 
 		 388 aa  158  1e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.153409  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0837  acetyl-CoA acetyltransferase  31.2 
 
 		 390 aa  158  2e-37  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0339  acetyl-CoA acetyltransferase  30.42 
 
 		 388 aa  157  2e-37  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00626565  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7411  acetyl-CoA acetyltransferase  34.68 
 
 		 383 aa  157  3e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0063  lipid-transfer protein  35.65 
 
 		 390 aa  156  6e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2935  acetyl-CoA acetyltransferase-like protein  34.79 
 
 		 383 aa  155  7e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.220087  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0156  acetyl-CoA acetyltransferase  30.46 
 
 		 388 aa  154  2e-36  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4354  thiolase  32.11 
 
 		 387 aa  154  2e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5006  acetyl-CoA acetyltransferase  32.68 
 
 		 382 aa  153  5.9999999999999996e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.815912  normal  0.11432 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0896  Thiolase  31.5 
 
 		 388 aa  152  8e-36  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2931  hypothetical protein  31.98 
 
 		 379 aa  152  1e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1391  acetyl-CoA acetyltransferase  32.26 
 
 		 387 aa  152  1e-35  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2839  hypothetical protein  35.17 
 
 		 388 aa  152  1e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00983373  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1437  acetyl-CoA acetyltransferase  30.89 
 
 		 392 aa  151  2e-35  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0544817  normal  0.0152215 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4266  hypothetical protein  31.76 
 
 		 381 aa  150  3e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.804759  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3319  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  32.3 
 
 		 384 aa  150  3e-35  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.16037  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2151  nonspecific lipid-transfer protein  30.52 
 
 		 403 aa  150  4e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3858  hypothetical protein  34.02 
 
 		 390 aa  150  4e-35  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.198117  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3607  acetyl-CoA acetyltransferase  33.52 
 
 		 382 aa  149  6e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.241671  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0765  acetyl-CoA acetyltransferase  31.78 
 
 		 388 aa  149  7e-35  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.155191  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0435  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  29.92 
 
 		 387 aa  149  1.0000000000000001e-34  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0597  Thiolase  32.64 
 
 		 387 aa  148  1.0000000000000001e-34  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0386  acetyl-CoA acetyltransferase  32.88 
 
 		 387 aa  149  1.0000000000000001e-34  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2350  acetyl-CoA acetyltransferase  33.24 
 
 		 382 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.731467  normal  0.759568 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3310  hypothetical protein  31.65 
 
 		 393 aa  148  2.0000000000000003e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.408434 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1309  acetyl-CoA acetyltransferase  30.83 
 
 		 387 aa  147  3e-34  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0879061 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2477  3-ketoacyl-CoA thiolase  31.84 
 
 		 388 aa  147  3e-34  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0031  hypothetical protein  31.47 
 
 		 402 aa  147  4.0000000000000006e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.761011  normal  0.262129 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3651  Acetyl-CoA acetyltransferase-like protein  31.43 
 
 		 387 aa  147  4.0000000000000006e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.48348  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0316  acetyl-CoA C-acetyltransferase (acetoacetyl-CoA thiolase) (AcaB-6)  30.05 
 
 		 380 aa  146  5e-34  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3115  acetyl-CoA acetyltransferase  33.24 
 
 		 382 aa  146  5e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.119662  normal  0.439972 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3588  thiolase  32.43 
 
 		 379 aa  146  7.0000000000000006e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.446493 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1879  putative lipid transfer protein  30.53 
 
 		 379 aa  146  7.0000000000000006e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0403443 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2509  acetyl-CoA acetyltransferase  29.37 
 
 		 388 aa  145  8.000000000000001e-34  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.481347  normal  0.719039 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0041  hypothetical protein  31.47 
 
 		 402 aa  145  9e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3401  Acetyl-CoA acetyltransferase-like protein  34.87 
 
 		 380 aa  145  9e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0771846 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0050  hypothetical protein  31.47 
 
 		 402 aa  145  9e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0851197  normal  0.0510911 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1978  hypothetical protein  30.79 
 
 		 379 aa  145  1e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0960116  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5302  putative nonspecific lipid-transfer protein  32.54 
 
 		 388 aa  144  2e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.739228 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3523  3-ketoacyl-CoA thiolase  29.49 
 
 		 384 aa  144  2e-33  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4069  putative thiolase  32.35 
 
 		 372 aa  144  2e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.655327  normal  0.671191 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0844  thiolase  35.81 
 
 		 384 aa  144  2e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2141  lipid-transfer protein  31.89 
 
 		 392 aa  144  3e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.219592  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4716  DitF protein  31.12 
 
 		 453 aa  144  3e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.300284 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2782  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  30.73 
 
 		 392 aa  143  5e-33  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.133795  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4309  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  32.16 
 
 		 378 aa  143  5e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1008  Acetyl-CoA acetyltransferase-like protein  29.87 
 
 		 385 aa  142  6e-33  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.011821 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1277  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  30.51 
 
 		 397 aa  142  7e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1631  propanoyl-CoA C-acyltransferase  29.03 
 
 		 387 aa  142  8e-33  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2721  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  34.36 
 
 		 395 aa  142  9e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0859  thiolase  30.29 
 
 		 389 aa  142  9.999999999999999e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.823302  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0675  Beta-ketoacyl synthase  30.56 
 
 		 395 aa  141  1.9999999999999998e-32  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2242  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  30.26 
 
 		 389 aa  140  3e-32  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>