More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_3533 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009485  BBta_5619  SPINDLY family O-linked N-acetylglucosamine transferase  62.14 
 
 
739 aa  933  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.474452 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3533  SPINDLY family O-linked N-acetylglucosamine transferase  100 
 
 
742 aa  1507  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5618  SPINDLY family O-linked N-acetylglucosamine transferase  60.08 
 
 
739 aa  852  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.645263 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6522  SPINDLY family O-linked N-acetylglucosamine transferase  54 
 
 
740 aa  735  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.722582  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5617  SPINDLY family O-linked N-acetylglucosamine transferase  61.33 
 
 
739 aa  880  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.277247 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3801  TPR repeat-containing protein  43.68 
 
 
713 aa  540  1e-152  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.386604  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4439  Tetratricopeptide TPR_4  42.45 
 
 
715 aa  538  1e-151  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0166  TPR repeat-containing protein  33.52 
 
 
754 aa  333  1e-89  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.268335  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3339  TPR repeat-containing protein  32.69 
 
 
732 aa  332  1e-89  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.469864 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0153  TPR repeat-containing protein  32.41 
 
 
754 aa  320  8e-86  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.372833  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2997  TPR repeat-containing protein  31.74 
 
 
708 aa  306  6e-82  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0127987 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2855  hypothetical protein  32.09 
 
 
937 aa  306  9e-82  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0152  TPR repeat-containing protein  29.78 
 
 
828 aa  306  1e-81  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3824  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  34.86 
 
 
1106 aa  304  3e-81  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.138221 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0165  TPR repeat-containing protein  29.85 
 
 
828 aa  305  3e-81  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0585605  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2993  TPR repeat-containing protein  29.85 
 
 
789 aa  303  7e-81  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00312978 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1841  TPR repeat-containing protein  27.77 
 
 
3035 aa  300  8e-80  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3065  TPR repeat-containing protein  29.03 
 
 
734 aa  297  5e-79  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.0065343  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3340  TPR repeat-containing protein  29.3 
 
 
828 aa  295  2e-78  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.710571 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2992  TPR repeat-containing protein  29.3 
 
 
824 aa  295  2e-78  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000746825 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_863  predicted protein  29.45 
 
 
708 aa  291  4e-77  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.622244  normal  0.0203568 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1636  TPR repeat-containing protein  30.14 
 
 
968 aa  290  8e-77  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.992619 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2809  TPR repeat-containing protein  31.43 
 
 
717 aa  287  5e-76  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3037  TPR repeat-containing protein  31.53 
 
 
717 aa  286  1e-75  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.657903 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3741  TPR repeat-containing protein  33.69 
 
 
1106 aa  285  2e-75  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1840  TPR repeat-containing protein  28.69 
 
 
3560 aa  283  6e-75  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0641  TPR repeat-containing protein  27.11 
 
 
1094 aa  281  3e-74  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.230386  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0151  TPR repeat-containing protein  32.23 
 
 
833 aa  281  4e-74  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2093  TPR repeat-containing protein  31.21 
 
 
1714 aa  278  3e-73  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1509  TPR domain-containing protein  28.95 
 
 
699 aa  277  5e-73  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  unclonable  0.000367862  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1802  TPR repeat-containing protein  32.62 
 
 
822 aa  274  5e-72  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.984059  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0164  TPR repeat-containing protein  30.64 
 
 
833 aa  273  6e-72  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.863115  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3269  TPR repeat-containing protein  31.68 
 
 
693 aa  273  8e-72  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.306934  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0637  TPR repeat-containing protein  30.32 
 
 
4489 aa  273  9e-72  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4728  TPR repeat-containing protein  29.19 
 
 
718 aa  268  3e-70  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.346608 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3825  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  34.58 
 
 
589 aa  261  3e-68  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0624707 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0863  TPR repeat-containing protein  30.83 
 
 
647 aa  261  3e-68  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.399235 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0148  TPR repeat-containing protein  32.57 
 
 
619 aa  257  6e-67  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0161  TPR repeat-containing protein  32.46 
 
 
598 aa  256  8e-67  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3369  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.18 
 
 
667 aa  256  1e-66  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0774784  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0293  TPR repeat-containing protein  28.68 
 
 
789 aa  254  3e-66  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0121  TPR repeat-containing protein  26.13 
 
 
732 aa  254  6e-66  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.261868  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27710  glycosyl transferase,TPR repeat protein  30.14 
 
 
1221 aa  253  8e-66  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1233  TPR repeat-containing protein  26.48 
 
 
909 aa  251  3e-65  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.161918  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1827  TPR repeat-containing protein  26.28 
 
 
761 aa  250  8e-65  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0460239  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2996  TPR repeat-containing protein  29.53 
 
 
626 aa  247  7e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.637966  normal  0.0209641 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3854  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.48 
 
 
723 aa  246  9e-64  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0100  TPR domain-containing protein  30.36 
 
 
790 aa  246  1e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.990506 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0441  TPR repeat-containing protein  29.32 
 
 
1085 aa  245  2e-63  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.239248 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2822  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.26 
 
 
529 aa  246  2e-63  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1668  TPR domain-containing protein  29.22 
 
 
776 aa  243  9e-63  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.329119  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3451  TPR domain-containing protein  29.22 
 
 
776 aa  243  9e-63  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0799942  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3099  TPR domain-containing protein  29.22 
 
 
776 aa  243  9e-63  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3742  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.6 
 
 
589 aa  242  1e-62  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2876  TPR domain-containing protein  29.22 
 
 
821 aa  243  1e-62  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00731  hypothetical protein  25.78 
 
 
816 aa  241  5e-62  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.456129 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1232  TPR repeat-containing protein  25.11 
 
 
750 aa  240  8e-62  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.967237  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3835  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.78 
 
 
790 aa  239  1e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.304839  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0094  TPR domain-containing protein  31.27 
 
 
821 aa  239  1e-61  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.822931  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3338  TPR repeat-containing protein  31.17 
 
 
595 aa  238  2e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.257374 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3873  TPR repeat-containing protein  31.1 
 
 
776 aa  238  4e-61  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.661818  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1087  TPR repeat-containing protein  26.69 
 
 
808 aa  238  4e-61  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2601  TPR domain/SecC motif-containing domain protein  31.59 
 
 
585 aa  237  5e-61  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0346889  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3955  TPR repeat-containing protein  28.94 
 
 
776 aa  236  1e-60  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3331  TPR repeat-containing protein  37.23 
 
 
633 aa  236  1e-60  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.332967  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0051  TPR repeat-containing protein  29.74 
 
 
633 aa  235  2e-60  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00284913  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0785  TPR repeat-containing protein  28.61 
 
 
796 aa  233  1e-59  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.225465  hitchhiker  0.00421983 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2288  TPR repeat-containing protein  28.08 
 
 
740 aa  231  3e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0461  TPR repeat-containing protein  29.27 
 
 
627 aa  229  9e-59  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.999909  normal  0.380381 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2569  Methyltransferase type 11  28.84 
 
 
1143 aa  229  2e-58  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1986  sulfotransferase  28.22 
 
 
1415 aa  225  3e-57  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.634546  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3368  Tetratricopeptide domain protein  28.03 
 
 
596 aa  225  3e-57  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0699  FkbM family methyltransferase  30.82 
 
 
921 aa  224  6e-57  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.25199 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0238  TPR repeat-containing protein  27.72 
 
 
780 aa  216  9e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2869  tetratricopeptide TPR_2  27.72 
 
 
780 aa  216  9e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0616  TPR repeat-containing protein  25.81 
 
 
974 aa  216  1e-54  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2639  tetratricopeptide TPR_2  34.18 
 
 
552 aa  215  3e-54  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5235  hypothetical protein  28.35 
 
 
797 aa  214  5e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.050699  normal  0.568835 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0605  tetratricopeptide domain-containing protein  29.57 
 
 
553 aa  212  2e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.335277  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1389  TPR repeat-containing protein  28.82 
 
 
700 aa  210  7e-53  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.874801 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2520  methyltransferase type 12  31.19 
 
 
1116 aa  207  5e-52  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3210  TPR domain-containing protein  30.4 
 
 
781 aa  206  1e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0220  TPR repeat-containing protein  26.16 
 
 
779 aa  205  2e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.991207  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4399  TPR repeat-containing protein  27.15 
 
 
727 aa  202  1e-50  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.516213 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0825  TPR repeat-containing protein  23.68 
 
 
739 aa  202  2e-50  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.423694  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0732  TPR repeat-containing protein  25.21 
 
 
706 aa  201  5e-50  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1582  Methyltransferase type 12  27.32 
 
 
1144 aa  196  1e-48  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0702  TPR repeat-containing protein  31.88 
 
 
667 aa  196  2e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.274193  normal  0.091435 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3361  TPR repeat-containing protein  26.35 
 
 
750 aa  193  8e-48  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.311751 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1755  TPR repeat-containing protein  29.09 
 
 
647 aa  191  5e-47  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0455441 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0114  TPR repeat-containing protein  27.01 
 
 
724 aa  190  9e-47  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.029745  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1161  hypothetical protein  32.46 
 
 
637 aa  188  3e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.143311  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1874  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.38 
 
 
793 aa  179  1e-43  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2139  TPR repeat-containing protein  28.19 
 
 
654 aa  177  6e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.43176  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1162  hypothetical protein  30.52 
 
 
633 aa  177  6e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1202  TPR repeat-containing protein  21.79 
 
 
632 aa  174  5e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0122  TPR repeat-containing protein  23.24 
 
 
660 aa  170  7e-41  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.142603  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0103  TPR repeat-containing protein  27.53 
 
 
733 aa  169  2e-40  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.467133  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1104  TPR repeat-containing protein  31.74 
 
 
616 aa  167  7e-40  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0451  TPR repeat-containing protein  32.11 
 
 
574 aa  166  2e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.871153  normal  0.12833 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>