More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_3476 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_3476  putative cation efflux family protein, CzcD-like protein  100 
 
 		 296 aa  590  1e-167  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.606573  normal  0.771262 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2468  cation diffusion facilitator family transporter  67.01 
 
 		 295 aa  393  1e-108  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.376521 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3065  cation diffusion facilitator family transporter  60 
 
 		 295 aa  348  5e-95  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.686004  normal  0.910257 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3290  cation diffusion facilitator family transporter  59.66 
 
 		 295 aa  346  2e-94  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.208123  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2384  cation diffusion facilitator family transporter  63.95 
 
 		 295 aa  344  1e-93  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.336168 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0463  cation efflux transporter  64.29 
 
 		 295 aa  343  2e-93  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.632211  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0867  cation diffusion facilitator family transporter  61.09 
 
 		 295 aa  339  2.9999999999999998e-92  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.851238 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0050  cation diffusion facilitator family transporter  55.41 
 
 		 317 aa  338  5.9999999999999996e-92  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.374526 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5513  cation diffusion facilitator family transporter  58.87 
 
 		 295 aa  331  1e-89  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.281094  normal  0.363198 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3264  cation diffusion facilitator family transporter  59.52 
 
 		 295 aa  329  3e-89  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2658  cation diffusion facilitator family transporter  57.45 
 
 		 295 aa  326  2.0000000000000001e-88  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2115  cation diffusion facilitator family transporter  63.95 
 
 		 295 aa  325  6e-88  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.922775  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0023  cation diffusion facilitator family transporter  54.61 
 
 		 295 aa  320  1.9999999999999998e-86  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.556428 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3075  cation diffusion facilitator family transporter  56.34 
 
 		 304 aa  317  2e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.553073  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2239  cation diffusion facilitator family transporter  54.48 
 
 		 302 aa  309  4e-83  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0407082  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1178  cation diffusion facilitator family transporter  55.59 
 
 		 300 aa  308  6.999999999999999e-83  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00185198  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1598  cation diffusion facilitator family transporter  56.89 
 
 		 302 aa  303  2.0000000000000002e-81  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1568  cation efflux family protein  55.48 
 
 		 302 aa  297  1e-79  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1514  cation efflux family protein  55.48 
 
 		 302 aa  297  1e-79  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2809  cation diffusion facilitator family transporter  55.12 
 
 		 304 aa  295  7e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.252612  normal  0.010552 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2198  cation diffusion facilitator family transporter  53.98 
 
 		 293 aa  294  2e-78  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.776966  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2294  cation diffusion facilitator family transporter  52.63 
 
 		 306 aa  280  1e-74  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.38282  normal  0.177312 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3261  cation efflux system protein  52.11 
 
 		 305 aa  280  2e-74  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.826048  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1013  metal cation efflux protein CzrB  52.28 
 
 		 302 aa  280  2e-74  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.323499  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2446  cation diffusion facilitator family transporter  51.22 
 
 		 304 aa  266  2e-70  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.526861  normal  0.400869 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1536  cation diffusion facilitator family transporter  48.28 
 
 		 295 aa  266  4e-70  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.503443  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0607  cation diffusion facilitator family transporter  51.19 
 
 		 309 aa  264  1e-69  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.212656  normal  0.0107339 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1114  cation efflux protein  42.96 
 
 		 305 aa  226  3e-58  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0597  cation diffusion facilitator family transporter  44.69 
 
 		 302 aa  226  4e-58  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1021  cation diffusion facilitator family transporter  43.66 
 
 		 346 aa  222  7e-57  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0225  cation diffusion facilitator family transporter  43.21 
 
 		 312 aa  217  2e-55  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1483  cation diffusion facilitator family transporter  40.71 
 
 		 308 aa  215  5.9999999999999996e-55  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0980  cation diffusion facilitator family transporter  40.14 
 
 		 305 aa  212  7e-54  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2073  cation diffusion facilitator family transporter  39.02 
 
 		 308 aa  211  1e-53  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.981542 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2025  cation diffusion facilitator family transporter  39.52 
 
 		 313 aa  205  6e-52  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0165078  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1043  cation efflux protein  41.39 
 
 		 320 aa  203  2e-51  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1731  cation diffusion facilitator family transporter  41.37 
 
 		 315 aa  203  3e-51  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.560975  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5864  cation diffusion facilitator family transporter  41.97 
 
 		 300 aa  202  5e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.499716  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1439  cation efflux protein  39.25 
 
 		 293 aa  200  1.9999999999999998e-50  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0109958  normal  0.777573 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1801  cation efflux family protein  41.39 
 
 		 376 aa  199  3.9999999999999996e-50  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0942158  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_273  cation efflux protein  37.28 
 
 		 311 aa  190  2e-47  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.02572  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0729  cation diffusion facilitator family transporter  40.49 
 
 		 304 aa  189  4e-47  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07750  cation diffusion facilitator family transporter  39.93 
 
 		 330 aa  189  5e-47  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0311  cation diffusion facilitator family transporter  36.59 
 
 		 311 aa  186  4e-46  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2568  cation diffusion facilitator family transporter  33.58 
 
 		 332 aa  186  6e-46  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.364379 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1334  cation diffusion facilitator family transporter  39.07 
 
 		 312 aa  185  7e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.215207  hitchhiker  0.000886879 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2873  cation diffusion facilitator family transporter  41.42 
 
 		 314 aa  185  8e-46  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1770  cation diffusion facilitator family transporter  37.91 
 
 		 315 aa  185  9e-46  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1206  cation diffusion facilitator family transporter  41.54 
 
 		 316 aa  184  2.0000000000000003e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3146  cation efflux family protein  39.24 
 
 		 296 aa  182  4.0000000000000006e-45  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.440371  hitchhiker  0.000651912 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1661  cation diffusion facilitator family transporter  37.28 
 
 		 331 aa  182  5.0000000000000004e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1850  cation diffusion facilitator family transporter  37.55 
 
 		 315 aa  180  2.9999999999999997e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0331  cation efflux family protein  37.28 
 
 		 311 aa  175  7e-43  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2804  cation diffusion facilitator family transporter  37.2 
 
 		 303 aa  175  8e-43  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5667  cation diffusion facilitator family transporter  38.16 
 
 		 328 aa  174  9.999999999999999e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2106  cation diffusion facilitator family transporter  38.63 
 
 		 315 aa  172  3.9999999999999995e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3707  cation diffusion facilitator family transporter  37.37 
 
 		 319 aa  173  3.9999999999999995e-42  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0354783  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0487  cation diffusion facilitator family transporter  37.37 
 
 		 319 aa  172  5e-42  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4099  cation diffusion facilitator family transporter  38.03 
 
 		 304 aa  172  7.999999999999999e-42  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.932753  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4669  cation diffusion facilitator family transporter  39.93 
 
 		 332 aa  171  1e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0432  cation diffusion facilitator family transporter  34.5 
 
 		 331 aa  167  2.9999999999999998e-40  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1928  cation diffusion facilitator family transporter  39.85 
 
 		 305 aa  166  4e-40  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.479128  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0446  cation diffusion facilitator family transporter  38.97 
 
 		 328 aa  166  5e-40  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.48861  normal  0.265047 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4244  cation diffusion facilitator family transporter  40.07 
 
 		 339 aa  165  8e-40  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.337864 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0470  cation diffusion facilitator family transporter  32.14 
 
 		 337 aa  164  2.0000000000000002e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0457303  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1127  cation diffusion facilitator family transporter  32.64 
 
 		 323 aa  161  1e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.197623  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1954  cation diffusion facilitator family transporter  37.21 
 
 		 328 aa  157  1e-37  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0806665 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1683  cation diffusion facilitator family transporter  37.26 
 
 		 308 aa  157  2e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000676071  normal  0.070124 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1521  cation diffusion facilitator family transporter  32.87 
 
 		 309 aa  157  3e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1256  cation diffusion facilitator family transporter  36.92 
 
 		 303 aa  156  3e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.513971  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3750  cation diffusion facilitator family transporter  33.56 
 
 		 326 aa  156  5.0000000000000005e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.220836  hitchhiker  0.0009443 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2871  cation efflux protein  33.45 
 
 		 317 aa  155  6e-37  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0724  cation diffusion facilitator family transporter  35.66 
 
 		 315 aa  153  2.9999999999999998e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000152803  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0526  cation diffusion facilitator family transporter  36.11 
 
 		 327 aa  151  1e-35  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3895  cation diffusion facilitator family transporter  34.27 
 
 		 307 aa  151  2e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.640647  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0749  cation diffusion facilitator family transporter  35.41 
 
 		 338 aa  150  2e-35  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2000  cation diffusion facilitator family transporter  39.62 
 
 		 285 aa  150  2e-35  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.7679  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4790  cation efflux family protein  31.27 
 
 		 297 aa  149  5e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4333  cation efflux protein  31.27 
 
 		 297 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0589  cation diffusion facilitator family transporter  33.83 
 
 		 285 aa  146  5e-34  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000134664  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4937  cation efflux protein  32.53 
 
 		 298 aa  145  1e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.451266 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1143  cation efflux protein  35.22 
 
 		 331 aa  144  1e-33  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.344034  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1509  putative transport system permease protein  28.52 
 
 		 314 aa  142  9e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000073133  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3741  cation diffusion facilitator family transporter  31.03 
 
 		 292 aa  141  9.999999999999999e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2581  cation diffusion facilitator family transporter  35.18 
 
 		 325 aa  140  1.9999999999999998e-32  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0646  cation diffusion facilitator family transporter  33.45 
 
 		 289 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.186266  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12610  putative transporter  32.17 
 
 		 298 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.686969  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11850  cation diffusion facilitator family transporter  30.21 
 
 		 312 aa  140  3e-32  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2262  ferrous iron efflux protein F  30.29 
 
 		 302 aa  139  4.999999999999999e-32  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000896639  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2628  cation efflux protein  33.45 
 
 		 325 aa  139  7.999999999999999e-32  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.620911  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0400  cation diffusion facilitator family transporter  28.37 
 
 		 327 aa  138  1e-31  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2574  cation diffusion facilitator family transporter  34.83 
 
 		 310 aa  138  1e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4774  cation diffusion facilitator family transporter  32.04 
 
 		 290 aa  137  2e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00437993 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4459  ferrous iron efflux protein F  31.75 
 
 		 300 aa  137  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.709567  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1146  putative transporter  31.12 
 
 		 298 aa  137  2e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2795  ferrous iron efflux protein F  30.74 
 
 		 301 aa  137  2e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00102947  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4390  ferrous iron efflux protein F  31.75 
 
 		 300 aa  137  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.228028 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4392  ferrous iron efflux protein F  31.75 
 
 		 300 aa  137  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.123338  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4307  ferrous iron efflux protein F  31.75 
 
 		 300 aa  137  3.0000000000000003e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0484  cation efflux protein  31.83 
 
 		 298 aa  135  8e-31  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>