More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_3451 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_3451  hypothetical protein  100 
 
 		 116 aa  236  8e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.1001 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0596  hypothetical protein  100 
 
 		 116 aa  236  8e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.429127  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2661  putative transposase  61.21 
 
 		 121 aa  139  1.9999999999999998e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.225009  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4349  putative transposase  61.21 
 
 		 121 aa  139  1.9999999999999998e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.715691 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0006  putative transposase  61.21 
 
 		 121 aa  139  1.9999999999999998e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2809  putative transposase  61.21 
 
 		 121 aa  139  1.9999999999999998e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1589  hypothetical protein  61.21 
 
 		 121 aa  139  1.9999999999999998e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.171898  normal  0.419285 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4715  transposase, IS4 family protein  54.63 
 
 		 113 aa  119  9.999999999999999e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.54309 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4381  transposase, IS4 family protein  54.63 
 
 		 113 aa  119  9.999999999999999e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.537387  normal  0.716599 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2631  transposase, IS4 family protein  54.63 
 
 		 113 aa  119  9.999999999999999e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0670539  normal  0.393546 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2617  transposase, IS4 family protein  54.63 
 
 		 113 aa  119  9.999999999999999e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.699065  normal  0.338204 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4302  transposase, IS4 family protein  53.7 
 
 		 113 aa  117  3.9999999999999996e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.657565  normal  0.592473 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2822  transposase, IS4  50 
 
 		 127 aa  112  1.0000000000000001e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0310  transposase, IS4  50 
 
 		 210 aa  110  5e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.664621  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1095  transposase, IS4  50 
 
 		 210 aa  110  5e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.282833 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2919  transposase, IS4  50 
 
 		 210 aa  110  5e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.62912 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3104  putative transposase  57.78 
 
 		 96 aa  107  6e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.660761  normal  0.0351076 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0677  transposase, IS4  50 
 
 		 164 aa  106  9.000000000000001e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.321651 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0250  transposase IS4 family protein  53.04 
 
 		 142 aa  106  9.000000000000001e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.00554315  hitchhiker  0.00627953 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2677  transposase IS4 family protein  53.04 
 
 		 142 aa  106  9.000000000000001e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.183927  normal  0.153389 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0225  transposase, IS4  50 
 
 		 164 aa  104  4e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1053  transposase, IS4  50 
 
 		 164 aa  104  4e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.133687  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1352  transposase, IS4  50 
 
 		 164 aa  104  4e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.238339  normal  0.0658866 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3066  transposase, IS4  50 
 
 		 164 aa  104  4e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.298578  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1158  transposase  51.82 
 
 		 138 aa  102  2e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2121  hypothetical protein  50 
 
 		 113 aa  102  2e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7671  transposase  51.82 
 
 		 131 aa  102  2e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.807085  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8144  transposase IS4 family protein  43.93 
 
 		 135 aa  101  3e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6401  hypothetical protein  50.94 
 
 		 251 aa  99.4  1e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010518  Mrad2831_6448  putative transposase  50.94 
 
 		 251 aa  99.4  1e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0047  transposase IS4  47.22 
 
 		 177 aa  99.4  2e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.683119  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0621  transposase IS4  47.22 
 
 		 177 aa  99.4  2e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0830  transposase IS4  47.22 
 
 		 177 aa  99.4  2e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.172478  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2019  transposase IS4  47.22 
 
 		 177 aa  99.4  2e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2650  transposase IS4  47.22 
 
 		 177 aa  99.4  2e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7770  hypothetical protein  47.06 
 
 		 255 aa  98.2  4e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.885835  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3519  putative transposase  44.33 
 
 		 251 aa  94.7  3e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.343195  normal  0.0901515 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9114  transposase protein  45.45 
 
 		 122 aa  94  7e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2971  transposase  48.15 
 
 		 254 aa  93.2  1e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.213916 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3793  Transposase and inactivated derivatives-like protein  45.45 
 
 		 252 aa  92.8  1e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.183907 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2954  transposase  48.15 
 
 		 254 aa  93.2  1e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2172  transposase  48.15 
 
 		 254 aa  93.2  1e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.10979  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2604  transposase  48.15 
 
 		 254 aa  93.2  1e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.656707  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0705  transposase  48.15 
 
 		 254 aa  93.2  1e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0367  transposase  48.15 
 
 		 254 aa  93.2  1e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.350235  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0773  ISSod6, transposase  42.48 
 
 		 252 aa  92  3e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2732  ISSod6, transposase  42.48 
 
 		 252 aa  92  3e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3272  ISSod6, transposase  42.48 
 
 		 252 aa  92  3e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3478  ISSod6, transposase  42.48 
 
 		 252 aa  92  3e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0074  ISSod6, transposase  42.48 
 
 		 252 aa  92  3e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.0426639  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0097  ISSod6, transposase  42.48 
 
 		 252 aa  92  3e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0162  ISSod6, transposase  42.48 
 
 		 252 aa  92  3e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.760495  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0548  hypothetical protein  45.45 
 
 		 128 aa  90.9  5e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6331  hypothetical protein  43.64 
 
 		 253 aa  90.9  5e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5939  hypothetical protein  44.04 
 
 		 266 aa  90.9  6e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.754111  normal  0.0437323 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1798  hypothetical protein  43.64 
 
 		 253 aa  90.5  8e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0976503  normal  0.0275179 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1612  hypothetical protein  43.64 
 
 		 253 aa  90.5  8e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.687153  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1002  hypothetical protein  43.64 
 
 		 253 aa  90.5  8e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0160346  normal  0.296217 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1562  ISSod6, transposase  43.12 
 
 		 252 aa  90.1  9e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2909  ISSod6 transposase  43.12 
 
 		 252 aa  90.1  9e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7095  transposase  48.48 
 
 		 102 aa  90.1  9e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6137  transposase  46.3 
 
 		 254 aa  89.7  1e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.876431 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6168  transposase  46.3 
 
 		 254 aa  89.7  1e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0563  hypothetical protein  42.99 
 
 		 159 aa  89.7  1e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4642  Transposase and inactivated derivatives-like protein  47.17 
 
 		 252 aa  89.4  1e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.555712 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3969  Transposase and inactivated derivatives-like protein  47.17 
 
 		 252 aa  89.4  1e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6167  transposase  46.3 
 
 		 254 aa  89.7  1e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6478  transposase  46.3 
 
 		 254 aa  89.7  1e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.525266 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6118  transposase  46.3 
 
 		 254 aa  89.7  1e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.770853 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4475  hypothetical protein  46.43 
 
 		 259 aa  89.4  1e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3433  putative transposase  54.43 
 
 		 91 aa  89  2e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.520481  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0593  transposase, IS4 family protein  40.74 
 
 		 121 aa  89  2e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3738  Transposase and inactivated derivatives-like protein  46.36 
 
 		 251 aa  87.8  4e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6240  transposase IS5 family protein  42.73 
 
 		 253 aa  88.2  4e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.879301 
 
 
-
 
NC_003296  RS03021  putative insertion sequence  47.13 
 
 		 94 aa  87.4  5e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.161487 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0537  transposase, IS4 family protein  40.74 
 
 		 193 aa  87.8  5e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.246162 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01953  ISSod6, transposase  38.6 
 
 		 249 aa  84.7  3e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0375505  n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4677  transposase, IS4 family protein  41.44 
 
 		 116 aa  84.7  3e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.692976  normal  0.0315597 
 
 
-
 
NC_004310  BR0534  ISBm1, transposase orfB  49.07 
 
 		 138 aa  84.7  4e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.162326  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0538  ISBm1, transposase orfB  49.07 
 
 		 138 aa  84.7  4e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1753  ISCc1, transposase OrfB  40.74 
 
 		 115 aa  84.3  4e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.303366  normal  0.533232 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0291  transposase (IS4 family)  40.65 
 
 		 171 aa  83.2  0.000000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  4.34578e-32  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1375  transposase, ISSod6  38.6 
 
 		 249 aa  81.3  0.000000000000004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0481  putative transposase  45.24 
 
 		 95 aa  81.3  0.000000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.988677  normal  0.294669 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6121  putative transposase  50.62 
 
 		 86 aa  81.3  0.000000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0006  transposase, IS4  39.81 
 
 		 122 aa  79.7  0.00000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.345636  normal  0.178212 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0180  transposase, IS4  39.81 
 
 		 176 aa  79.7  0.00000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.501437  normal  0.605644 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0435  transposase, IS4  39.81 
 
 		 176 aa  79.7  0.00000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.264496  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0973  transposase, IS4  39.81 
 
 		 122 aa  80.1  0.00000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.922887  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1015  transposase, IS4  39.81 
 
 		 176 aa  79.7  0.00000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.186494 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1282  transposase, IS4  39.81 
 
 		 122 aa  80.1  0.00000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.080194  normal  0.261741 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1592  transposase, IS4  39.81 
 
 		 122 aa  80.1  0.00000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.596907 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2824  transposase, IS4  39.81 
 
 		 122 aa  80.1  0.00000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2861  transposase, IS4  39.81 
 
 		 122 aa  80.1  0.00000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2923  transposase, IS4  39.81 
 
 		 122 aa  80.1  0.00000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3013  transposase, IS4  39.81 
 
 		 122 aa  80.1  0.00000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3037  transposase, IS4  39.81 
 
 		 122 aa  80.1  0.00000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3116  transposase, IS4  39.81 
 
 		 157 aa  79.7  0.00000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.206046  normal  1 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0124  transposase (IS4 family)  39.84 
 
 		 171 aa  80.1  0.00000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0242  transposase (IS4 family)  39.84 
 
 		 171 aa  79.7  0.00000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>