67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_3425 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_3425  putative copper tolerance protein  100 
 
 		 151 aa  315  1e-85  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.792125  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6520  putative copper tolerance protein (cupredoxin)  72.66 
 
 		 153 aa  206  1e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.264526  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4824  blue (type1) copper domain-containing protein  55.33 
 
 		 160 aa  171  3.9999999999999995e-42  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.904248  normal  0.294152 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4603  blue (type1) copper domain-containing protein  60.47 
 
 		 160 aa  166  1e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.258245 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7873  blue (type 1) copper domain protein  53.02 
 
 		 156 aa  164  5e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4902  blue (type1) copper domain-containing protein  57.04 
 
 		 156 aa  162  2.0000000000000002e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4269  blue (type1) copper domain-containing protein  52.41 
 
 		 161 aa  161  3e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.25109 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1092  blue (type 1) copper domain protein  48.12 
 
 		 165 aa  160  6e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9844  copper tolerance protein  41.45 
 
 		 159 aa  134  3.0000000000000003e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5030  blue (type1) copper domain-containing protein  44.59 
 
 		 159 aa  134  3.0000000000000003e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.4583  normal  0.77741 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9849  copper tolerance protein  40.79 
 
 		 159 aa  132  9.999999999999999e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2668  blue (type1) copper domain-containing protein  46.9 
 
 		 163 aa  133  9.999999999999999e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.975423  normal  0.234604 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2197  blue (type 1) copper domain protein  51.16 
 
 		 164 aa  131  3.9999999999999996e-30  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2721  blue (type1) copper domain-containing protein  50.39 
 
 		 166 aa  129  1.0000000000000001e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0479159  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1260  blue (type1) copper domain-containing protein  43.61 
 
 		 272 aa  127  5.0000000000000004e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0922125  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1267  blue (type1) copper domain-containing protein  43.14 
 
 		 171 aa  121  3e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00034808 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5685  blue (type 1) copper domain protein  46.22 
 
 		 168 aa  121  3e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1635  oxidoreductase  47.06 
 
 		 181 aa  119  9.999999999999999e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.400621  normal  0.0387336 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3913  blue (type 1) copper domain protein  40.79 
 
 		 162 aa  118  1.9999999999999998e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.444429  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5863  blue (type 1) copper domain protein  42.54 
 
 		 159 aa  119  1.9999999999999998e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4027  blue (type 1) copper domain protein  40.79 
 
 		 162 aa  118  1.9999999999999998e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0457304  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3487  blue (type1) copper domain-containing protein  39.73 
 
 		 170 aa  118  1.9999999999999998e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1833  blue (type 1) copper domain protein  36.48 
 
 		 159 aa  115  1.9999999999999998e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00584393 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6116  putative oxido-reductase protein CopI  38.31 
 
 		 158 aa  115  3e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.251154  normal  1 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4551  blue (type1) copper domain-containing protein  44.54 
 
 		 171 aa  112  1.0000000000000001e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0734  blue (type 1) copper domain protein  42.02 
 
 		 159 aa  110  1.0000000000000001e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.227893  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5106  blue (type 1) copper domain protein  37.5 
 
 		 160 aa  109  1.0000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00549955 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0575  blue (type1) copper domain-containing protein  40.77 
 
 		 154 aa  108  2.0000000000000002e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0159129  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1667  blue (type1) copper domain-containing protein  37.74 
 
 		 164 aa  108  3e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.393546 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1207  blue (type 1) copper domain protein  38.31 
 
 		 160 aa  105  2e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0922177  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2909  blue (type1) copper domain-containing protein  42.86 
 
 		 163 aa  105  2e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.272302  normal  0.0133564 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2601  blue (type1) copper domain-containing protein  38.31 
 
 		 160 aa  104  3e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.377321  normal  0.709674 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2655  blue (type1) copper domain-containing protein  41.18 
 
 		 164 aa  103  6e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.366193  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3995  blue (type1) copper domain-containing protein  36.5 
 
 		 180 aa  102  2e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.704782  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3980  blue (type 1) copper domain protein  38.61 
 
 		 166 aa  102  3e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3854  uncharacterized copper-binding protein  35.57 
 
 		 177 aa  101  3e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.874975 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3263  putative copper binding protein  42.86 
 
 		 176 aa  100  6e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0125  copper-binding protein  33.91 
 
 		 177 aa  100  9e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2231  blue (type1) copper domain-containing protein  34.44 
 
 		 177 aa  99  2e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.503031  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2350  hypothetical protein  31.49 
 
 		 182 aa  97.1  8e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27840  hypothetical protein  33.89 
 
 		 205 aa  96.7  1e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4053  transposase Tn3 family protein  36.71 
 
 		 166 aa  94.7  4e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1676  blue (type1) copper domain-containing protein  30.72 
 
 		 167 aa  88.6  3e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.549233  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2159  plastocyanin/azurin family copper binding protein  30.59 
 
 		 175 aa  85.5  2e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.0076427  normal  0.727347 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1700  blue (type1) copper domain-containing protein  27.33 
 
 		 175 aa  85.1  3e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00435665 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3583  hypothetical protein  28.65 
 
 		 175 aa  85.1  3e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2232  hypothetical protein  28.57 
 
 		 185 aa  84.7  4e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.53865  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0348  blue (type1) copper domain-containing protein  36.29 
 
 		 189 aa  84.3  5e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.471869 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0969  hypothetical protein  31.68 
 
 		 169 aa  80.9  0.000000000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001394  hypothetical protein  30 
 
 		 188 aa  72.8  0.000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000508588  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06367  hypothetical protein  31.09 
 
 		 188 aa  72.8  0.000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0713  hypothetical protein  29.03 
 
 		 190 aa  69.3  0.00000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2149  nitrite reductase, copper-containing  27.27 
 
 		 534 aa  60.8  0.000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1660  blue (type 1) copper domain protein  26.89 
 
 		 314 aa  58.9  0.00000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2073  blue (type1) copper domain-containing protein  25.87 
 
 		 161 aa  48.9  0.00002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.256815  normal  0.746059 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2921  blue (type 1) copper domain protein  29.91 
 
 		 125 aa  48.5  0.00003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0439603  normal  0.638215 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1641  multicopper oxidase type 3  29.93 
 
 		 526 aa  46.6  0.0001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.972736  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2109  hypothetical protein  21.52 
 
 		 153 aa  45.1  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2238  multicopper oxidase type 3  24.77 
 
 		 505 aa  43.5  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.468125  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1802  blue (type1) copper domain-containing protein  22.83 
 
 		 179 aa  42.7  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.495145 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3015  hypothetical protein  25.68 
 
 		 123 aa  42.7  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0676858  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18341  plastocyanin  25.41 
 
 		 119 aa  42  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.259314 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3677  hypothetical protein  25.76 
 
 		 157 aa  42  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0503  multicopper oxidase, type 3  25.53 
 
 		 479 aa  41.2  0.005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.16251 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1088  plastocyanin  23.23 
 
 		 125 aa  41.2  0.006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000603452 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0185  blue (type1) copper domain-containing protein  29.03 
 
 		 315 aa  40.8  0.007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.312922 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1576  hypothetical protein  22.82 
 
 		 167 aa  40.4  0.008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0471287  hitchhiker  0.0000128418 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>