45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_3395 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_3395  hypothetical protein  100 
 
 		 160 aa  320  4e-87  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.614366  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1896  hypothetical protein  49.62 
 
 		 135 aa  114  5e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1369  crcB family protein  50.88 
 
 		 254 aa  112  2.0000000000000002e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1325  camphor resistance protein CrcB  50.88 
 
 		 270 aa  112  2.0000000000000002e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3845  protein of unknown function DUF302  56.19 
 
 		 133 aa  110  8.000000000000001e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0744952 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0949  hypothetical protein  42.97 
 
 		 150 aa  109  1.0000000000000001e-23  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.811465  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0376  protein of unknown function DUF302  43.38 
 
 		 148 aa  107  8.000000000000001e-23  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2075  hypothetical protein  44.19 
 
 		 150 aa  106  1e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1260  hypothetical protein  51.15 
 
 		 157 aa  104  5e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1764  protein of unknown function DUF302  40.8 
 
 		 154 aa  102  2e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1380  protein of unknown function DUF302  39.13 
 
 		 179 aa  100  9e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1673  hypothetical protein  39.55 
 
 		 172 aa  99.8  1e-20  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.00536019  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6375  protein of unknown function DUF302  44.12 
 
 		 165 aa  99.8  1e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2096  hypothetical protein  37.91 
 
 		 150 aa  99  2e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1941  hypothetical protein  38.93 
 
 		 172 aa  96.3  2e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05960  hypothetical protein  36.43 
 
 		 306 aa  94  7e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0678707  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8650  protein of unknown function DUF302  40.32 
 
 		 132 aa  93.6  1e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.997368  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4835  hypothetical protein  38.99 
 
 		 197 aa  93.6  1e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1823  hypothetical protein  45.45 
 
 		 131 aa  91.7  4e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001057  putative inner membrane or exported protein  38.64 
 
 		 148 aa  90.9  7e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1272  hypothetical protein  38.74 
 
 		 121 aa  90.5  8e-18  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0512  hypothetical protein  32.8 
 
 		 152 aa  89  2e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.915743  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2874  hypothetical protein  45.61 
 
 		 143 aa  89  3e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8087  protein of unknown function DUF302  37.5 
 
 		 163 aa  88.2  4e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2735  hypothetical protein  40.87 
 
 		 131 aa  87.8  6e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2556  hypothetical protein  38.58 
 
 		 150 aa  86.7  1e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.299096  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0007  protein of unknown function DUF302  39.2 
 
 		 135 aa  85.1  4e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.120765 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1972  protein of unknown function DUF302  41.94 
 
 		 123 aa  84.7  5e-16  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1779  hypothetical protein  33.33 
 
 		 151 aa  82.8  0.000000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2704  hypothetical protein  38.18 
 
 		 132 aa  81.3  0.000000000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.556991  normal  0.238987 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5867  hypothetical protein  37.86 
 
 		 202 aa  80.9  0.000000000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.244323  normal  0.372797 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4835  hypothetical protein  34.45 
 
 		 122 aa  75.5  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.770482  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4909  domain of unknown function superfamily  34.45 
 
 		 122 aa  75.5  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4859  hypothetical protein  34.45 
 
 		 122 aa  75.5  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.103571 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4906  hypothetical protein  37.5 
 
 		 122 aa  74.7  0.0000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0532643 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4759  hypothetical protein  37.5 
 
 		 122 aa  74.7  0.0000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.61827  normal  0.706872 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0349  periplasmic protein  34.25 
 
 		 168 aa  74.3  0.0000000000006  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.112084  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0543  protein of unknown function DUF302  31.85 
 
 		 147 aa  70.1  0.00000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3562  hypothetical protein  40 
 
 		 150 aa  68.2  0.00000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1665  hypothetical protein  35.1 
 
 		 149 aa  68.2  0.00000000005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2794  hypothetical protein  33.03 
 
 		 147 aa  62  0.000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.4262  normal  0.709682 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5442  hypothetical protein  32.54 
 
 		 138 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.821645  normal  0.0692077 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1559  protein of unknown function DUF302  35.44 
 
 		 144 aa  58.2  0.00000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.874349  normal  0.0163758 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0971  protein of unknown function DUF302  29.76 
 
 		 126 aa  43.9  0.0008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.294774 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2887  protein of unknown function DUF302  27.05 
 
 		 127 aa  42.4  0.003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>