82 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_3252 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_3252  hypothetical protein  100 
 
 		 276 aa  560  1.0000000000000001e-159  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.280544  normal  0.486528 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4489  hypothetical protein  39.83 
 
 		 262 aa  160  2e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0738  putative hydantoin racemase  37.36 
 
 		 254 aa  95.1  1e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.304234  normal  0.968812 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3417  Asp/Glu racemase  32.76 
 
 		 252 aa  80.1  0.00000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0971  Asp/Glu racemase  33.33 
 
 		 246 aa  78.2  0.0000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0912948  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1336  hydantoin racemase  29.84 
 
 		 250 aa  78.2  0.0000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000284571 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0199  Hydantoin racemase-like  28.57 
 
 		 264 aa  75.5  0.0000000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0300  Asp/Glu/hydantoin racemase  32.12 
 
 		 248 aa  74.7  0.000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0552  Asp/Glu racemase  33.54 
 
 		 248 aa  73.2  0.000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.886079  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7936  Asp/Glu/hydantoin racemase  34.36 
 
 		 256 aa  72.8  0.000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.261217  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7191  putative Hydantoin racemase  32.46 
 
 		 249 aa  72.4  0.000000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.425956  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1251  Asp/Glu/hydantoin racemase  36.76 
 
 		 250 aa  72  0.000000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0044  Asp/Glu racemase  31.18 
 
 		 245 aa  71.2  0.00000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.399037  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3885  putative Asp/Glu racemase  30.65 
 
 		 245 aa  70.9  0.00000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4993  Asp/Glu/hydantoin racemase  30.46 
 
 		 250 aa  70.5  0.00000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.561877  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4065  Asp/Glu racemase  33.53 
 
 		 279 aa  68.9  0.00000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4276  Asp/Glu/hydantoin racemase  31.15 
 
 		 251 aa  67.8  0.0000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.23954  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4023  Asp/Glu/hydantoin racemase  29.88 
 
 		 245 aa  65.9  0.0000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4136  Asp/Glu/hydantoin racemase  29.88 
 
 		 245 aa  65.9  0.0000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.29444  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4294  Asp/Glu racemase  37.7 
 
 		 252 aa  63.9  0.000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0467  Asp/Glu/hydantoin racemase  38.89 
 
 		 250 aa  62.8  0.000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0279175 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1413  Hydantoin racemase-like protein  25.73 
 
 		 262 aa  60.8  0.00000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1301  Asp/Glu/hydantoin racemase  36.9 
 
 		 285 aa  56.6  0.0000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2031  putative hydantoin racemase  30.11 
 
 		 252 aa  56.6  0.0000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1097  Asp/Glu racemase  26.64 
 
 		 261 aa  56.2  0.0000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08417  conserved hypothetical protein  31.9 
 
 		 627 aa  55.5  0.000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3382  hydantoin racemase  33.59 
 
 		 229 aa  54.3  0.000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1879  Asp/Glu/hydantoin racemase  35.71 
 
 		 278 aa  53.9  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.53096  normal  0.236918 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1925  putative hydantoin racemase  31.42 
 
 		 288 aa  54.3  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.626735 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1306  Asp/Glu/hydantoin racemase  32.85 
 
 		 278 aa  53.9  0.000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.612078  normal  0.031069 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2330  Asp/Glu/hydantoin racemase  31.42 
 
 		 288 aa  53.9  0.000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.496574 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2389  hydantoin racemase  33.53 
 
 		 280 aa  53.9  0.000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3302  hydantoin racemase  33.53 
 
 		 280 aa  53.9  0.000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3936  Asp/Glu/hydantoin racemase  31.52 
 
 		 245 aa  53.9  0.000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.104662  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1509  hydantoin racemase  33.53 
 
 		 280 aa  53.9  0.000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.722971  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2534  racemase  33.53 
 
 		 327 aa  53.5  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0701963  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2008  hydantoin racemase  33.53 
 
 		 280 aa  53.9  0.000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5279  Asp/Glu racemase  35.09 
 
 		 263 aa  53.5  0.000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0404858 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2433  hydantoin racemase  33.53 
 
 		 318 aa  53.5  0.000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1952  Asp/Glu racemase  35.71 
 
 		 279 aa  53.5  0.000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0933  Asp/Glu racemase  31.65 
 
 		 234 aa  53.1  0.000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6766  Hydantoin racemase-like protein  26.51 
 
 		 276 aa  53.1  0.000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.908818 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1988  Asp/Glu/hydantoin racemase  35.71 
 
 		 263 aa  53.1  0.000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.557931 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6113  Asp/Glu racemase  35.71 
 
 		 263 aa  53.1  0.000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1964  Asp/Glu racemase  35.71 
 
 		 263 aa  53.1  0.000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2066  racemase  33.53 
 
 		 287 aa  52.8  0.000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6268  Asp/Glu/hydantoin racemase  24.02 
 
 		 262 aa  52.4  0.000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.294272  normal  0.515263 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1297  Asp/Glu/hydantoin racemase  43.66 
 
 		 244 aa  52  0.00001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0750406  normal  0.408598 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1409  Asp/Glu racemase  31.62 
 
 		 228 aa  50.8  0.00002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0168107  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5804  Asp/Glu/hydantoin racemase  36.75 
 
 		 226 aa  51.2  0.00002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.372709  normal  0.802095 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0677  putative hydantoin racemase protein  50 
 
 		 253 aa  50.8  0.00002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0966453  normal  0.11063 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2916  Asp/Glu/hydantoin racemase  32.24 
 
 		 247 aa  50.4  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.492378  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5914  Asp/Glu/hydantoin racemase  36.71 
 
 		 241 aa  50.1  0.00004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.174556  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3334  HyuE hydantoin racemase  36.73 
 
 		 205 aa  50.1  0.00004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3190  hypothetical protein  38.16 
 
 		 216 aa  49.7  0.00005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0332  Asp/Glu racemase  26.75 
 
 		 238 aa  49.7  0.00005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3633  hypothetical protein  38.96 
 
 		 220 aa  49.7  0.00005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.127614  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1556  Asp/Glu racemase  36.52 
 
 		 267 aa  49.3  0.00006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0077  Asp/Glu racemase  25.34 
 
 		 243 aa  49.3  0.00006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.45629  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4863  Hydantoin racemase-like protein  27.66 
 
 		 259 aa  48.9  0.00009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.278835  normal  0.546582 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4060  Asp/Glu racemase  35.71 
 
 		 218 aa  48.9  0.00009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1486  Asp/Glu racemase  29.45 
 
 		 229 aa  48.9  0.00009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.293318  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1813  Asp/Glu/hydantoin racemase  29.2 
 
 		 245 aa  48.9  0.00009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.0165675 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5283  Asp/Glu/hydantoin racemase  40.54 
 
 		 241 aa  47.8  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.203611 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3409  hypothetical protein  38.89 
 
 		 219 aa  47.4  0.0003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5610  Asp/Glu/hydantoin racemase  22.09 
 
 		 247 aa  45.8  0.0008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1033  Asp/Glu racemase  35.48 
 
 		 220 aa  45.1  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.026155  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1023  Asp/Glu racemase  35.48 
 
 		 220 aa  45.1  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.493832  normal  0.560856 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2655  Asp/Glu/hydantoin racemase  30.06 
 
 		 247 aa  45.4  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3108  Asp/Glu racemase  35.06 
 
 		 213 aa  45.4  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0539324  normal  0.209365 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3463  putative hydantoin racemase  35.06 
 
 		 213 aa  45.4  0.001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1006  Asp/Glu racemase  35.48 
 
 		 220 aa  45.1  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.832843  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1959  hypothetical protein  25.95 
 
 		 245 aa  45.1  0.001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0658  Asp/Glu/hydantoin racemase  25.18 
 
 		 245 aa  44.7  0.002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.184482  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2068  Asp/Glu racemase  34.67 
 
 		 213 aa  44.3  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.2159 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5785  Asp/Glu racemase  35.62 
 
 		 241 aa  44.3  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.415529  hitchhiker  0.00131329 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1965  hypothetical protein  24.41 
 
 		 245 aa  43.5  0.004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0404  Asp/Glu racemase  36.36 
 
 		 232 aa  43.5  0.004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.000866633  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0679  Asp/Glu racemase  31.37 
 
 		 236 aa  43.1  0.005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0768431  normal  0.106443 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3770  Asp/Glu/hydantoin racemase  33.33 
 
 		 253 aa  42.4  0.007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4419  Asp/Glu racemase  31.11 
 
 		 243 aa  42.4  0.009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.192959  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5144  Asp/Glu racemase  33.8 
 
 		 223 aa  42  0.01  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.238464  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>