176 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_3217 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_3217  hypothetical protein  100 
 
 		 282 aa  563  1.0000000000000001e-159  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1969  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like protein  40.07 
 
 		 363 aa  161  1e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0935555 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2752  phospholipase/carboxylesterase  35.89 
 
 		 309 aa  148  1.0000000000000001e-34  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0579  esterase, putative  37.55 
 
 		 324 aa  147  2.0000000000000003e-34  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1400  phospholipase/Carboxylesterase  32.61 
 
 		 325 aa  142  7e-33  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3566  phospholipase/carboxylesterase  37.7 
 
 		 331 aa  139  6e-32  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07050  hypothetical protein  38.19 
 
 		 322 aa  139  7e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0646  hypothetical protein  38.49 
 
 		 322 aa  137  2e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.399454  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3127  phospholipase/Carboxylesterase  33.33 
 
 		 314 aa  127  2.0000000000000002e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.539584 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13327  esterase lipoprotein lpqC  34.9 
 
 		 304 aa  117  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000167103  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1493  phospholipase/Carboxylesterase  30.41 
 
 		 317 aa  115  6.9999999999999995e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.030471  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0967  putative esterase  35.8 
 
 		 244 aa  113  3e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.127871 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5085  polyhydroxybutyrate depolymerase  32.95 
 
 		 313 aa  112  7.000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0474117  normal  0.355318 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3854  putative lipoprotein  33.76 
 
 		 336 aa  111  2.0000000000000002e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.496382  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10685  lipoprotein lpqP  41.89 
 
 		 280 aa  108  7.000000000000001e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.132448  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0297  lpqC, putative  34.68 
 
 		 306 aa  107  3e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.433259  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1204  phospholipase/carboxylesterase  32.52 
 
 		 335 aa  107  3e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.299935  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3891  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like protein  31.06 
 
 		 298 aa  103  2e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.947481  normal  0.780646 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1590  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like protein  33.71 
 
 		 353 aa  104  2e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.255211  normal  0.12664 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1573  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like protein  36.55 
 
 		 326 aa  103  4e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1651  poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like protein  34.59 
 
 		 323 aa  101  1e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0627752  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2408  carbohydrate esterase family 1 protein  29.72 
 
 		 316 aa  99.8  4e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.211104  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5398  hypothetical protein  31.98 
 
 		 302 aa  99  8e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.330044  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0726  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like protein  30.89 
 
 		 462 aa  96.3  6e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.401494  normal  0.100919 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4595  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like protein  30.71 
 
 		 344 aa  92.8  6e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2261  putative esterase/lipase/thioesterase  32.04 
 
 		 361 aa  91.7  1e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.556081  normal  0.0820217 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3966  phospholipase/carboxylesterase  29.55 
 
 		 795 aa  90.9  2e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0373  polyhydroxybutyrate depolymerase  37.64 
 
 		 357 aa  91.3  2e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0880654  hitchhiker  0.00622899 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1167  hypothetical protein  30.28 
 
 		 471 aa  88.2  1e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.428408  normal  0.287821 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1290  hypothetical protein  35.42 
 
 		 305 aa  88.2  1e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4460  polyhydroxybutyrate depolymerase  30.15 
 
 		 322 aa  86.3  5e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.403398  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1953  putative hydrolase  26.83 
 
 		 308 aa  85.5  9e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.0001445  hitchhiker  0.00199711 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3485  hypothetical protein  31.64 
 
 		 269 aa  83.2  0.000000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7236  putative LpqP (hydrolase/esterase)  34.27 
 
 		 405 aa  83.2  0.000000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0397136  normal  0.31443 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2301  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like  38.16 
 
 		 232 aa  83.2  0.000000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0072  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like  33.16 
 
 		 392 aa  79.7  0.00000000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0713  poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like protein  33.01 
 
 		 287 aa  78.6  0.0000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0080  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like protein  33.79 
 
 		 286 aa  77.8  0.0000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3576  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like  29.02 
 
 		 451 aa  73.2  0.000000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.875939  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3106  putative lipoprotein  27.73 
 
 		 341 aa  73.2  0.000000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2040  esterase-like protein  24.46 
 
 		 1002 aa  68.2  0.0000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.400928  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0824  poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase  34.96 
 
 		 492 aa  67  0.0000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0168099  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1740  poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase  34.96 
 
 		 492 aa  67  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.548806  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1342  poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase precursor  34.96 
 
 		 492 aa  67  0.0000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.968046  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0529  poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase  34.96 
 
 		 492 aa  67  0.0000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0624  poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase precursor  34.96 
 
 		 492 aa  67  0.0000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.520528  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1547  poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase  34.96 
 
 		 492 aa  66.6  0.0000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1570  poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase precursor  34.96 
 
 		 492 aa  66.6  0.0000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4602  esterase, PHB depolymerase  33.33 
 
 		 317 aa  64.3  0.000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.462256  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0493  esterase, PHB depolymerase family  30.61 
 
 		 378 aa  63.9  0.000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_92192  predicted protein  26.05 
 
 		 486 aa  62.8  0.000000007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.865019  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2713  poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase  32.17 
 
 		 492 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.381426  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7674  putative polyhydroxy-alkanoate/butyrate(PHA/PHB) depolymerase  31.87 
 
 		 529 aa  60.5  0.00000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1240  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like  29.09 
 
 		 370 aa  60.1  0.00000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.194401 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1759  Carboxylesterase  29.84 
 
 		 223 aa  59.7  0.00000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000153879  hitchhiker  0.00754405 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0935  putative polyhydroxyalkanoate depolymerase  24.8 
 
 		 343 aa  59.3  0.00000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_26429  predicted protein  25.93 
 
 		 363 aa  59.3  0.00000007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000229905  normal  0.222049 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2626  carboxylesterase  29.84 
 
 		 223 aa  59.3  0.00000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000180149  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3487  hypothetical protein  23.73 
 
 		 332 aa  59.3  0.00000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2701  carboxylesterase  29.84 
 
 		 223 aa  59.3  0.00000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0223431  normal  1 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9052  polyhydroxybutyrate depolymerase  28.36 
 
 		 366 aa  58.5  0.0000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1173  esterase, PHB depolymerase family  28.57 
 
 		 410 aa  58.2  0.0000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1990  esterase, PHB depolymerase family  28.85 
 
 		 406 aa  57.4  0.0000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000642829  normal  0.085302 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3660  PHB depolymerase family esterase  30.88 
 
 		 381 aa  56.6  0.0000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.741995  normal  0.231581 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0137  esterase, PHB depolymerase  33.61 
 
 		 392 aa  55.8  0.0000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0568  esterase, PHB depolymerase family  32.79 
 
 		 395 aa  55.5  0.0000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2820  esterase, PHB depolymerase family  28.1 
 
 		 352 aa  55.5  0.0000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000611867  hitchhiker  0.00921779 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1385  putative Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase  25.15 
 
 		 464 aa  55.5  0.000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.516849  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31730  esterase, PHB depolymerase family  32.5 
 
 		 331 aa  55.1  0.000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0284  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like  31.71 
 
 		 215 aa  55.1  0.000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0711  esterase, PHB depolymerase  33.61 
 
 		 392 aa  55.5  0.000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.612274  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1536  putative polyhydroxybutyrate depolymerase  26.26 
 
 		 276 aa  55.1  0.000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.26582  normal  0.221996 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1463  esterase, PHB depolymerase family  33.05 
 
 		 363 aa  55.1  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0308241  normal  0.241375 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2633  PHB depolymerase family esterase  29.2 
 
 		 422 aa  55.1  0.000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.655829 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6529  hypothetical protein  28.26 
 
 		 222 aa  55.5  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0555425 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3198  putative polyhydroxybutyrate depolymerase  26.75 
 
 		 279 aa  54.7  0.000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.396095  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1940  PHB depolymerase family esterase  27.06 
 
 		 433 aa  54.3  0.000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3857  PHB depolymerase family esterase  28.49 
 
 		 414 aa  54.7  0.000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3303  glycoside hydrolase family 62  27.92 
 
 		 436 aa  53.5  0.000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000382833  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2650  hypothetical protein  26.25 
 
 		 355 aa  53.9  0.000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.376354  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0371  esterase, PHB depolymerase  29.1 
 
 		 394 aa  53.5  0.000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2149  hypothetical protein  29.69 
 
 		 343 aa  52.8  0.000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00000536767  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2268  esterase, PHB depolymerase family  29.92 
 
 		 344 aa  52.8  0.000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.493113  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2066  phospholipase/carboxylesterase  29.75 
 
 		 238 aa  52.8  0.000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.565731  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0388  PHB depolymerase family esterase  32.37 
 
 		 442 aa  52.4  0.000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.140919  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0082  esterase, PHB depolymerase  24.58 
 
 		 414 aa  52.4  0.000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05267  feruloyl esterase (Eurofung)  27.22 
 
 		 270 aa  51.6  0.00001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1999  phospholipase/carboxylesterase family protein  28.89 
 
 		 221 aa  52  0.00001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6990  phospholipase/Carboxylesterase  25.14 
 
 		 276 aa  51.6  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0030979 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1984  esterase, PHB depolymerase family  28.07 
 
 		 337 aa  51.6  0.00001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000502853  normal  0.034342 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3488  hypothetical protein  26.78 
 
 		 447 aa  52  0.00001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4301  PHB depolymerase family esterase  33.59 
 
 		 368 aa  51.6  0.00001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4230  phospholipase/Carboxylesterase  27.56 
 
 		 268 aa  51.2  0.00002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.58568  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2265  carboxylesterase  28.49 
 
 		 221 aa  50.8  0.00002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2337  carboxylesterase  28.49 
 
 		 221 aa  51.2  0.00002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.387077  normal  0.0702195 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2056  esterase, PHB depolymerase family  27.03 
 
 		 334 aa  50.8  0.00002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.10962  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2770  PHB depolymerase family esterase  24.46 
 
 		 544 aa  51.6  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1945  esterase, PHB depolymerase family  30.71 
 
 		 344 aa  50.4  0.00003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.198099  normal  0.0353299 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04140  carboxylesterase  28.04 
 
 		 222 aa  50.4  0.00003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.628824  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2022  carboxylesterase  27.08 
 
 		 226 aa  50.1  0.00004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000559029  normal  0.99764 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>