131 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_3149 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_3149  precorrin-6A reductase  100 
 
 		 257 aa  504  9.999999999999999e-143  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.724633  normal  0.712178 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4722  precorrin-6x reductase  56.2 
 
 		 273 aa  256  2e-67  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.245541  normal  0.411006 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3120  precorrin-6A reductase  55.51 
 
 		 265 aa  254  7e-67  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5189  precorrin-6x reductase  55.37 
 
 		 273 aa  253  2.0000000000000002e-66  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.668996 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5261  precorrin-6x reductase  55.69 
 
 		 271 aa  243  3e-63  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.527912  normal  0.416364 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2154  precorrin-6x reductase  53.94 
 
 		 253 aa  237  1e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0179311  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5688  precorrin-6x reductase  55.28 
 
 		 250 aa  235  4e-61  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0122424  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3512  precorrin-6x reductase  50.43 
 
 		 255 aa  229  5e-59  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.42135  normal  0.748332 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2814  cobalt-precorrin-6x reductase  50 
 
 		 266 aa  228  9e-59  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.659993 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2317  cobalt-precorrin-6x reductase  52.72 
 
 		 249 aa  224  1e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.398392  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3181  cobalt-precorrin-6x reductase  51.65 
 
 		 259 aa  221  9.999999999999999e-57  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.264616  normal  0.537996 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2377  cobalt-precorrin-6x reductase  47.7 
 
 		 249 aa  217  1e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2443  precorrin-6x reductase  54.66 
 
 		 253 aa  211  7.999999999999999e-54  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.00747936  normal  0.0784333 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1472  cobalt-precorrin-6x reductase  51.04 
 
 		 247 aa  210  2e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.212621  normal  0.776259 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2825  cobalt-precorrin-6x reductase  51.04 
 
 		 247 aa  209  3e-53  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2926  precorrin-6A reductase  45.83 
 
 		 251 aa  209  3e-53  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.422905  hitchhiker  0.00352486 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1522  cobalt-precorrin-6x reductase  51.87 
 
 		 247 aa  209  3e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.642834  normal  0.196786 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0337  cobalt-precorrin-6x reductase  46.67 
 
 		 253 aa  206  3e-52  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2215  precorrin-6A reductase  45.16 
 
 		 253 aa  206  3e-52  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1885  cobalt-precorrin-6x reductase  49.17 
 
 		 259 aa  203  2e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1548  precorrin-6x reductase  43.67 
 
 		 249 aa  201  9.999999999999999e-51  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0805  precorrin-6x reductase  48.35 
 
 		 266 aa  199  3e-50  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.955549  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3281  precorrin-6x reductase  49.81 
 
 		 287 aa  196  3e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.954465 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0021  cobalt-precorrin-6x reductase  46.47 
 
 		 246 aa  196  5.000000000000001e-49  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.342454 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2739  cobalt-precorrin-6x reductase  43.75 
 
 		 252 aa  195  6e-49  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0747566  normal  0.206921 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5847  precorrin-6x reductase  50.97 
 
 		 249 aa  185  5e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.760322  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0256  cobalt-precorrin-6x reductase  47.35 
 
 		 245 aa  182  6e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000182781  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1299  cobalt-precorrin-6x reductase  47.3 
 
 		 248 aa  181  1e-44  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1263  cobalt-precorrin-6x reductase  47.3 
 
 		 248 aa  181  1e-44  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3263  precorrin-6x reductase  50.84 
 
 		 253 aa  177  1e-43  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.101094 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7178  cobalt-precorrin-6x reductase  43.87 
 
 		 256 aa  177  2e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.183428  normal  0.0616428 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1886  cobalt-precorrin-6x reductase  50.67 
 
 		 248 aa  176  4e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2180  precorrin-6x reductase  45.37 
 
 		 248 aa  171  1e-41  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0136003  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2478  precorrin-6x reductase  41.56 
 
 		 244 aa  170  2e-41  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0390699  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6989  precorrin-6x reductase  46.32 
 
 		 250 aa  169  5e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.463236  normal  0.655339 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6023  cobalt-precorrin-6x reductase  48.65 
 
 		 256 aa  168  7e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00000257009  normal  0.17843 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1927  precorrin-6x reductase  41.46 
 
 		 253 aa  162  4.0000000000000004e-39  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.338007  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12106  cobalt-precorrin-6x reductase  42.32 
 
 		 244 aa  160  1e-38  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.165074  normal  0.705272 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2628  cobalt-precorrin-6x reductase  45.95 
 
 		 229 aa  159  3e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.246451  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1780  precorrin-6x reductase  42.6 
 
 		 241 aa  156  3e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.171878  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1522  cobalt-precorrin-6x reductase  44.67 
 
 		 268 aa  155  5.0000000000000005e-37  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0287326  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2537  precorrin-6A reductase  41.74 
 
 		 230 aa  153  2e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.571905  normal  0.796536 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2500  precorrin-6x reductase  43.15 
 
 		 244 aa  151  1e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.21321 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0566  precorrin-6x reductase  42.35 
 
 		 253 aa  150  2e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.853215  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17710  precorrin-6A reductase  41.45 
 
 		 250 aa  148  9e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.262033  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0359  precorrin-6x reductase  43.26 
 
 		 244 aa  147  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.218038 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1197  cobalt-precorrin-6x reductase  42.74 
 
 		 243 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.305612  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2485  cobalt-precorrin-6x reductase  41.22 
 
 		 242 aa  140  9.999999999999999e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1677  cobalt-precorrin-6x reductase  42.74 
 
 		 243 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0206927  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2530  cobalt-precorrin-6x reductase  41.22 
 
 		 242 aa  140  9.999999999999999e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.639819  normal  0.534019 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5596  Precorrin-6A reductase  41.77 
 
 		 250 aa  140  3e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0340084  normal  0.622554 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2522  cobalt-precorrin-6x reductase  41.22 
 
 		 242 aa  139  3.9999999999999997e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.14189 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4710  cobalt-precorrin-6x reductase  39.3 
 
 		 239 aa  139  6e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.54445 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2988  precorrin-6A reductase  42.21 
 
 		 251 aa  137  2e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.432734  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4569  cobalt-precorrin-6x reductase  38.94 
 
 		 239 aa  137  2e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2881  precorrin-6A reductase  44 
 
 		 243 aa  135  9e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4880  precorrin-6x reductase, putative  37.44 
 
 		 246 aa  133  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1690  precorrin-6A reductase  40.25 
 
 		 248 aa  134  1.9999999999999998e-30  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0972101  normal  0.0269101 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0601  cobalt-precorrin-6x reductase  38.5 
 
 		 242 aa  132  6e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.156008  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4622  cobalt-precorrin-6x reductase  40.17 
 
 		 239 aa  131  9e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.44815  normal  0.12698 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4420  cobalt-precorrin-6x reductase  37.28 
 
 		 246 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0536098 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1650  cobalt-precorrin-6x reductase  43.15 
 
 		 243 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.459955 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3140  cobalt-precorrin-6x reductase  39.65 
 
 		 245 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.167362  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0378  precorrin-6x reductase  41.22 
 
 		 245 aa  128  8.000000000000001e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.656441  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4832  cobalt-precorrin-6x reductase  38.87 
 
 		 239 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0805988  normal  0.545776 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5478  cobalt-precorrin-6x reductase  39.84 
 
 		 269 aa  127  2.0000000000000002e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.737923 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26460  cobalt-precorrin-6x reductase  38.94 
 
 		 242 aa  125  7e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00807093  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5366  cobalt-precorrin-6x reductase  40.27 
 
 		 242 aa  125  8.000000000000001e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.791925 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1248  cobalt-precorrin-6x reductase  40.27 
 
 		 242 aa  125  9e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0495203  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2245  cobalt-precorrin-6x reductase  37.72 
 
 		 242 aa  125  1e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.99555  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4888  cobalt-precorrin-6x reductase  38.33 
 
 		 239 aa  124  1e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.179164  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1614  precorrin-6x reductase  42.18 
 
 		 239 aa  123  2e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3377  precorrin-6A reductase  36.36 
 
 		 262 aa  121  9e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.223591 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0310  precorrin-6A reductase  37.4 
 
 		 248 aa  118  9.999999999999999e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2395  cobalt-precorrin-6x reductase  41.15 
 
 		 256 aa  115  7.999999999999999e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2116  cobalt-precorrin-6x reductase  40.71 
 
 		 244 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.253146  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1971  cobalt-precorrin-6x reductase  40.71 
 
 		 244 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.711869  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1158  cobalt-precorrin-6x reductase  40.71 
 
 		 244 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.358764  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1599  cobalt-precorrin-6x reductase  40.71 
 
 		 244 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00760442  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0260  cobalt-precorrin-6x reductase  40.71 
 
 		 244 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0900  cobalt-precorrin-6x reductase  40.71 
 
 		 244 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.12855  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1954  cobalt-precorrin-6x reductase  40.27 
 
 		 244 aa  112  5e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.216473  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4828  cobalt-precorrin-6x reductase  44.93 
 
 		 243 aa  107  1e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0932291 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0176  precorrin-6x reductase  40.74 
 
 		 248 aa  103  2e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1577  cobalt-precorrin-6x reductase  43.23 
 
 		 246 aa  100  2e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0167988  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1565  cobalt-precorrin-6x reductase  42.29 
 
 		 243 aa  100  2e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.108176  normal  0.15041 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1595  cobalt-precorrin-6x reductase  41.67 
 
 		 246 aa  94  2e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.635785  normal  0.303988 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1379  precorrin-6x reductase  27.95 
 
 		 655 aa  92  8e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1276  precorrin-6x reductase  24.4 
 
 		 407 aa  81.6  0.00000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00118855  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0705  precorrin-6x reductase  23.04 
 
 		 246 aa  73.2  0.000000000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0316  precorrin-6x reductase  28.69 
 
 		 249 aa  72  0.000000000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1301  precorrin-6x reductase  27.94 
 
 		 261 aa  70.1  0.00000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0210  precorrin-6x reductase/cobalamin biosynthetic protein CbiD  28.38 
 
 		 602 aa  69.3  0.00000000006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0618  bifunctional: precorrin-3 methyltransferase/precorrin-6X reductase oxidoreductase protein  30.08 
 
 		 519 aa  68.2  0.0000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.157389  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0936  precorrin-6x reductase  25.56 
 
 		 261 aa  68.2  0.0000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0236244 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2148  cobalt-precorrin-6x reductase  28.94 
 
 		 263 aa  68.2  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1552  precorrin-6x reductase  28.45 
 
 		 259 aa  67.8  0.0000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0296992  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2361  cobalt-precorrin-6x reductase  28.51 
 
 		 263 aa  67.4  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.48077 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2202  cobalt-precorrin-6x reductase  28.94 
 
 		 263 aa  67  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1297  precorrin-6x reductase  31.4 
 
 		 256 aa  66.2  0.0000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00514043 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>