More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_3060 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_3060  putative outer membrane protein and related peptidoglycan-associated (lipo)proteins  100 
 
 		 707 aa  1401    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3825  OmpA/MotB domain-containing protein  33.64 
 
 		 729 aa  310  9e-83  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.263673  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0753  OmpA domain-containing protein  38.52 
 
 		 464 aa  233  7.000000000000001e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.767935 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5270  OmpA/MotB domain protein  34.18 
 
 		 464 aa  223  9e-57  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0502  OmpA/MotB  34.55 
 
 		 463 aa  217  5.9999999999999996e-55  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.605644 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0884  OmpA/MotB  34.92 
 
 		 464 aa  213  1e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.138624  normal  0.799439 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1196  OmpA/MotB domain-containing protein  33.17 
 
 		 459 aa  211  6e-53  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4927  OmpA/MotB  34.52 
 
 		 464 aa  210  7e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.989181  normal  0.828832 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0631  OmpA/MotB  35.99 
 
 		 463 aa  199  1.0000000000000001e-49  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0772  OmpA/MotB  34 
 
 		 464 aa  198  3e-49  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.226683 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1480  OmpA/MotB domain protein  27.06 
 
 		 612 aa  150  6e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.172439  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3081  OmpA/MotB  26.21 
 
 		 653 aa  128  3e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2669  OmpA/MotB domain-containing protein  28.57 
 
 		 652 aa  124  4e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.650206 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1009  OmpA family outer membrane protein  28.57 
 
 		 652 aa  124  6e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1903  hypothetical protein  28.34 
 
 		 684 aa  121  4.9999999999999996e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00294448 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3101  OmpA domain protein  27.77 
 
 		 617 aa  116  2.0000000000000002e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.409183  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3590  OmpA/MotB  47.5 
 
 		 451 aa  115  3e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.663745 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0218  OmpA/MotB domain-containing protein  27.63 
 
 		 642 aa  114  5e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0701  hypothetical protein  27.43 
 
 		 630 aa  112  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.127075  normal  0.0818214 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3187  hypothetical protein  28.36 
 
 		 669 aa  111  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1877  OmpA/MotB  45.83 
 
 		 434 aa  111  4.0000000000000004e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0777893 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3382  hypothetical protein  27.72 
 
 		 670 aa  111  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1976  OmpA/MotB domain protein  44.35 
 
 		 441 aa  109  2e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0260904  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4921  OmpA/MotB domain protein  31.2 
 
 		 320 aa  106  2e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.730269  normal  0.0282337 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3914  OmpA/MotB  29.5 
 
 		 658 aa  106  2e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2909  OmpA/MotB domain-containing protein  32.77 
 
 		 316 aa  105  3e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2436  outer membrane protein  43.65 
 
 		 320 aa  104  4e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04698  OmpA family domain protein  30.67 
 
 		 268 aa  104  5e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0684754  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3511  hypothetical protein  28.57 
 
 		 668 aa  104  6e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.789255 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0626  OmpA/MotB domain-containing protein  28.36 
 
 		 768 aa  104  6e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.577172 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0418  OmpA/MotB domain-containing protein  30.51 
 
 		 316 aa  102  2e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.661169 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2185  outer membrane protein  45.71 
 
 		 694 aa  102  2e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.138653 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0457  OmpA/MotB domain-containing protein  30.08 
 
 		 316 aa  102  2e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.518918  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3573  OmpA/MotB family outer membrane protein  30.08 
 
 		 320 aa  101  4e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2956  OmpA domain-containing protein  31.36 
 
 		 311 aa  101  4e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0391  OmpA/MotB domain-containing protein  30.08 
 
 		 316 aa  102  4e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.908149  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3652  ompA family protein  31.36 
 
 		 310 aa  101  5e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0672699  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3627  ompA family protein  31.36 
 
 		 310 aa  101  6e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.574456  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3635  OmpA family domain-containing protein  31.36 
 
 		 310 aa  100  9e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.837065  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2828  OmpA domain-containing protein  31.36 
 
 		 310 aa  100  1e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1715  ompA family protein  31.36 
 
 		 310 aa  100  1e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.706939  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0052  ompA family protein  31.36 
 
 		 310 aa  100  1e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.757478  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3149  ompA family protein  31.36 
 
 		 310 aa  100  1e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0483  OmpA/MotB domain-containing protein  29.66 
 
 		 316 aa  100  1e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2622  OmpA/MotB  29.66 
 
 		 247 aa  99.4  2e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4812  OmpA/MotB domain protein  40.91 
 
 		 1755 aa  98.6  3e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1255  Outer membrane protein and related peptidoglycan-associated (lipo)proteins-like  38.98 
 
 		 422 aa  98.2  4e-19  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.201684  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0282  OmpA/MotB domain protein  41.9 
 
 		 230 aa  97.1  1e-18  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000802819  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5600  OmpA/MotB domain protein  47.12 
 
 		 537 aa  95.9  2e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.372086  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4115  OmpA/MotB domain protein  37.91 
 
 		 525 aa  95.5  3e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1338  OmpA family protein  43.69 
 
 		 229 aa  94.7  5e-18  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1570  OmpA/MotB domain-containing protein  44.64 
 
 		 498 aa  94.4  6e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00583575 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1585  OmpA family outer membrane protein  45.71 
 
 		 517 aa  94.4  7e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.167386  normal  0.202036 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1157  OmpA/MotB domain-containing protein  46.73 
 
 		 506 aa  93.6  1e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.729214 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2532  OmpA/MotB  47.52 
 
 		 319 aa  94  1e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  unclonable  0.0000000000651702  n/a   
 
 
 
NC_008639  Cpha266_1209  OmpA/MotB domain-containing protein  42.24 
 
 		 369 aa  93.2  1e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.469659  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2842  OmpA/MotB domain-containing protein  36.99 
 
 		 256 aa  92.8  2e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.148982 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2141  outer membrane protein  43.81 
 
 		 510 aa  93.2  2e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.496848  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0127  outer membrane protein  45.19 
 
 		 415 aa  92  3e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.017735  normal  0.0709429 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3747  OmpA/MotB family outer membrane protein  38.81 
 
 		 542 aa  92  3e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.598443  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0644  OmpA/MotB domain protein  41.75 
 
 		 306 aa  92.4  3e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.927259  normal  0.0953573 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1035  OmpA/MotB domain protein  41.75 
 
 		 360 aa  92  3e-17  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4033  OmpA/MotB domain protein  43.4 
 
 		 374 aa  91.7  4e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.659004  normal  0.277798 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0258  OmpA/MotB domain-containing protein  44.44 
 
 		 231 aa  91.7  4e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.686752  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3804  OmpA/MotB domain protein  38.28 
 
 		 543 aa  91.3  5e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2768  OmpA/MotB  40 
 
 		 294 aa  91.7  5e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.961309  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1731  OmpA/MotB domain protein  35.82 
 
 		 623 aa  90.9  7e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.134193  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3770  OmpA/MotB domain-containing protein  38.64 
 
 		 440 aa  90.9  8e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3868  OmpA/MotB domain protein  44.66 
 
 		 412 aa  90.9  8e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4687  hypothetical protein  41.82 
 
 		 237 aa  90.5  9e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.427745  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1537  OmpA/MotB domain protein  43.69 
 
 		 229 aa  90.5  9e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01947  lipoprotein  28.69 
 
 		 277 aa  90.1  1e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.331066 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0388  OmpA/MotB domain protein  43.51 
 
 		 459 aa  90.1  1e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.134908  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0313  OmpA/MotB domain-containing protein  42.72 
 
 		 537 aa  90.1  1e-16  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0125359  hitchhiker  0.00574347 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0746  V-type H(+)-translocating pyrophosphatase  43.27 
 
 		 890 aa  89.7  1e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.34227  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6933  OmpA/MotB domain protein  40 
 
 		 630 aa  90.1  1e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.453004 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53500  hypothetical protein  41.82 
 
 		 237 aa  90.5  1e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00118983 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2018  OmpA/MotB domain-containing protein  44.44 
 
 		 242 aa  90.5  1e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0046  OmpA/MotB domain protein  40.78 
 
 		 432 aa  89.4  2e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.970824  normal  0.132697 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0280  OmpA/MotB domain-containing protein  42.45 
 
 		 215 aa  89.4  2e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0488759  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2617  OmpA family protein  40.19 
 
 		 225 aa  89.4  2e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.19379  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0689  OmpA/MotB domain protein  45.87 
 
 		 443 aa  89.4  2e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000828786  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2042  OmpA/MotB  37.23 
 
 		 286 aa  89  3e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2727  OmpA/MotB  44.23 
 
 		 398 aa  89  3e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3650  OmpA/MotB domain-containing protein  41.82 
 
 		 222 aa  89  3e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3888  OmpA/MotB domain protein  38.06 
 
 		 544 aa  89  3e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.457406  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1805  outer membrane protein OmpA  46.53 
 
 		 321 aa  88.6  4e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1152  OmpA family protein  39.6 
 
 		 233 aa  88.2  4e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0000620554  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0019  OmpA/MotB domain-containing protein  45.71 
 
 		 510 aa  88.6  4e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0746655  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1325  hypothetical protein  39.81 
 
 		 656 aa  87.8  5e-16  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.532479 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3897  OmpA/MotB domain-containing protein  39.09 
 
 		 287 aa  87.8  6e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000323001  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3744  OmpA/MotB domain protein  38.03 
 
 		 679 aa  87.8  7e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.000811796  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1284  OmpA/MotB domain protein  41.18 
 
 		 456 aa  87.4  8e-16  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3975  OmpA/MotB domain protein  36.54 
 
 		 1026 aa  87.4  8e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0116692  normal  0.107099 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3730  OmpA/MotB domain protein  42.31 
 
 		 440 aa  87.4  9e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.331233  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4333  OmpA/MotB domain-containing protein  40.65 
 
 		 454 aa  87.4  9e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000720866  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1782  OmpA/MotB domain-containing protein  39.05 
 
 		 288 aa  86.7  0.000000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000133592  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1376  OmpA/MotB domain protein  60.56 
 
 		 468 aa  87  0.000000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000480584  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0382  OmpA/MotB domain protein  42.75 
 
 		 459 aa  87  0.000000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2769  OmpA/MotB domain protein  41.28 
 
 		 215 aa  87  0.000000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>