183 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_2932 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009485  BBta_2932  hypothetical protein  100 
 
 
137 aa  283  5e-76  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.241273  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1687  hypothetical protein  83.94 
 
 
137 aa  242  1e-63  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0475632  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3587  hypothetical protein  81.75 
 
 
137 aa  239  1e-62  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.400148 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1979  protein of unknown function DUF35  81.02 
 
 
137 aa  237  4e-62  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0353441  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1880  hypothetical protein  79.56 
 
 
137 aa  233  9e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0682045 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2010  hypothetical protein  67.15 
 
 
137 aa  197  5e-50  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.392361  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3402  hypothetical protein  62.41 
 
 
136 aa  169  1e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0631046 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2934  hypothetical protein  56.56 
 
 
144 aa  131  4e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.431872  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8196  hypothetical protein  41.09 
 
 
319 aa  118  3e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2788  hypothetical protein  38.64 
 
 
132 aa  111  4e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.159844  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3765  hypothetical protein  40.15 
 
 
550 aa  110  6e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.981168 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3692  hypothetical protein  40.15 
 
 
550 aa  110  6e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3705  hypothetical protein  39.39 
 
 
550 aa  107  6e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.724372  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4017  hypothetical protein  38.57 
 
 
155 aa  105  1e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.188869  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2138  hypothetical protein  38.35 
 
 
321 aa  104  3e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0905  hypothetical protein  40.91 
 
 
135 aa  104  3e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  hitchhiker  0.00718711  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1903  hypothetical protein  40.15 
 
 
132 aa  103  7e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.539737  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2821  hypothetical protein  40.48 
 
 
315 aa  103  8e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.875118  normal  0.0237416 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5254  hypothetical protein  40.77 
 
 
133 aa  102  2e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1602  hypothetical protein  36.76 
 
 
143 aa  101  3e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3482  protein of unknown function DUF35  37.59 
 
 
319 aa  101  4e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.893274  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0899  hypothetical protein  37.59 
 
 
131 aa  100  5e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.312493  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2483  hypothetical protein  40.62 
 
 
548 aa  99.8  1e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.207424 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3311  hypothetical protein  37.5 
 
 
135 aa  99.4  1e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.367067 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4171  hypothetical protein  40.62 
 
 
548 aa  99.8  1e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2337  protein of unknown function DUF35  40.62 
 
 
149 aa  94.7  4e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0582  hypothetical protein  37.69 
 
 
137 aa  94.7  4e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00877368  normal  0.438267 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4323  hypothetical protein  38.93 
 
 
541 aa  94  7e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.51495 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0510  hypothetical protein  36.09 
 
 
143 aa  92  3e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0843  hypothetical protein  36.09 
 
 
145 aa  90.5  7e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3114  hypothetical protein  35.43 
 
 
130 aa  90.1  9e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0274298  normal  0.392807 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0235  hypothetical protein  38.58 
 
 
136 aa  87.8  5e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.737012  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2351  hypothetical protein  35.48 
 
 
130 aa  87.8  5e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.387375  normal  0.674763 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0860  hypothetical protein  35.97 
 
 
138 aa  87  7e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4045  hypothetical protein  40.91 
 
 
141 aa  87  7e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.589309 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5301  hypothetical protein  35.56 
 
 
143 aa  86.7  9e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.653983 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6630  hypothetical protein  37.19 
 
 
120 aa  86.3  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0233518  normal  0.987358 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4493  hypothetical protein  36.09 
 
 
148 aa  85.9  2e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5255  hypothetical protein  37.93 
 
 
324 aa  84.3  4e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.338508 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2662  hypothetical protein  38.61 
 
 
136 aa  84.3  5e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5005  hypothetical protein  34.56 
 
 
129 aa  84.3  5e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.264526  normal  0.0828633 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1758  hypothetical protein  32.26 
 
 
130 aa  84  7e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.799098  normal  0.109738 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1804  hypothetical protein  35.2 
 
 
140 aa  83.2  1e-15  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.983 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2623  hypothetical protein  38.1 
 
 
305 aa  83.2  1e-15  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.140164  normal  0.486862 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13575  hypothetical protein  38.05 
 
 
311 aa  82.8  2e-15  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000328171 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5850  hypothetical protein  34.11 
 
 
152 aa  81.3  4e-15  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0806522  normal 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5453  hypothetical protein  34.11 
 
 
152 aa  81.3  4e-15  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0654575  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4760  hypothetical protein  37.61 
 
 
318 aa  81.3  5e-15  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.247642  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4674  hypothetical protein  37.61 
 
 
318 aa  81.3  5e-15  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5059  hypothetical protein  37.61 
 
 
317 aa  80.5  6e-15  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.945383  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3318  hypothetical protein  34.13 
 
 
312 aa  80.9  6e-15  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000206651 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3606  protein of unknown function DUF35  32.58 
 
 
130 aa  80.5  7e-15  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.215549  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2101  hypothetical protein  36.09 
 
 
139 aa  80.5  7e-15  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.416637  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1695  hypothetical protein  33.33 
 
 
152 aa  79.7  1e-14  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4265  hypothetical protein  29.92 
 
 
146 aa  79.7  1e-14  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.16799  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0635  hypothetical protein  33.33 
 
 
152 aa  79.7  1e-14  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.525049  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0553  hypothetical protein  33.33 
 
 
152 aa  79.7  1e-14  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0530  hypothetical protein  33.33 
 
 
152 aa  79.7  1e-14  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1644  hypothetical protein  33.33 
 
 
152 aa  79.7  1e-14  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.982412  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5644  hypothetical protein  33.33 
 
 
152 aa  80.1  1e-14  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1671  hypothetical protein  33.33 
 
 
152 aa  79.7  1e-14  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4786  hypothetical protein  33.86 
 
 
144 aa  79  2e-14  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.259655  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0859  hypothetical protein  33.9 
 
 
132 aa  78.2  4e-14  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0302426  normal  0.401608 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0060  protein of unknown function DUF35  33.06 
 
 
136 aa  77.4  6e-14  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3856  protein of unknown function DUF35  31.78 
 
 
322 aa  76.3  1e-13  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.343505  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4072  hypothetical protein  39.33 
 
 
142 aa  75.5  2e-13  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1501  hypothetical protein  29.55 
 
 
133 aa  75.5  3e-13  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1994  hypothetical protein  35.71 
 
 
120 aa  75.5  3e-13  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.253194  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3828  hypothetical protein  33.07 
 
 
132 aa  74.7  4e-13  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1511  hypothetical protein  33.62 
 
 
317 aa  74.3  5e-13  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4054  hypothetical protein  33.88 
 
 
151 aa  73.9  7e-13  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0163629  normal  0.53534 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4566  putative thiolase subunit  33.07 
 
 
132 aa  73.2  1e-12  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00449482  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1832  hypothetical protein  33.63 
 
 
138 aa  72.8  2e-12  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0184205  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0892  hypothetical protein  34.13 
 
 
142 aa  72.8  2e-12  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.204366  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6833  hypothetical protein  37.04 
 
 
121 aa  72  2e-12  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2745  nucleic-acid-binding protein containing a Zn-ribbon  26.77 
 
 
135 aa  70.5  7e-12  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0775897 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2582  hypothetical protein  36.51 
 
 
123 aa  69.7  1e-11  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.709226  normal  0.0256768 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2015  hypothetical protein  35 
 
 
136 aa  69.3  2e-11  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.196649  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0549  hypothetical protein  36.52 
 
 
132 aa  68.2  3e-11  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5500  hypothetical protein  31.78 
 
 
132 aa  68.2  4e-11  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4179  hypothetical protein  32.65 
 
 
145 aa  67.8  5e-11  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5278  hypothetical protein  36.11 
 
 
135 aa  67.4  6e-11  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3932  protein of unknown function DUF35  38.37 
 
 
144 aa  67.4  6e-11  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3652  hypothetical protein  37.78 
 
 
136 aa  67.4  7e-11  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.92305  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4412  hypothetical protein  29.92 
 
 
132 aa  66.6  1e-10  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  5.85754e-05  normal  0.649702 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2094  hypothetical protein  26.77 
 
 
128 aa  66.6  1e-10  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5096  hypothetical protein  33.33 
 
 
128 aa  66.6  1e-10  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0340  protein of unknown function DUF35  33.63 
 
 
134 aa  66.6  1e-10  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  decreased coverage  2.62786e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3806  hypothetical protein  29.92 
 
 
132 aa  65.9  2e-10  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0032  hypothetical protein  30.66 
 
 
138 aa  65.9  2e-10  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.662095  normal  0.14279 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0128  hypothetical protein  33.61 
 
 
127 aa  65.1  3e-10  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0885  protein of unknown function DUF35  31.97 
 
 
333 aa  65.5  3e-10  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0146  protein of unknown function DUF35  33.61 
 
 
127 aa  65.1  3e-10  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4153  hypothetical protein  29.13 
 
 
132 aa  65.5  3e-10  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.280027  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0042  hypothetical protein  29.93 
 
 
138 aa  64.7  4e-10  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0051  hypothetical protein  29.93 
 
 
138 aa  64.7  4e-10  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0173713  normal  0.0421472 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0387  hypothetical protein  29.13 
 
 
129 aa  64.3  5e-10  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.448785  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0023  hypothetical protein  33.67 
 
 
130 aa  63.9  6e-10  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7489  hypothetical protein  28.93 
 
 
139 aa  63.9  7e-10  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.840415  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2152  hypothetical protein  29.66 
 
 
311 aa  63.9  7e-10  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>