58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_2883 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009485  BBta_2883  hypothetical protein  100 
 
 
272 aa  558  1e-158  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.126409 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1846  hypothetical protein  78.68 
 
 
272 aa  443  1e-123  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.140697  normal  0.77685 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1947  hypothetical protein  76.84 
 
 
272 aa  439  1e-122  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.334258  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3621  hypothetical protein  78.31 
 
 
272 aa  431  1e-120  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.574773 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1666  hypothetical protein  77.1 
 
 
271 aa  422  1e-117  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1097  hypothetical protein  68.09 
 
 
271 aa  357  1e-97  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00235966  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2125  hypothetical protein  67.7 
 
 
269 aa  353  2e-96  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.04664  normal  0.0539112 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3292  hypothetical protein  60.59 
 
 
271 aa  338  7e-92  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1776  hypothetical protein  65.59 
 
 
274 aa  334  9e-91  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0657384 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1503  hypothetical protein  62.76 
 
 
276 aa  332  3e-90  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.979061  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2258  hypothetical protein  61.54 
 
 
279 aa  321  8e-87  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.761835 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4744  hypothetical protein  58.74 
 
 
294 aa  317  9e-86  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3350  hypothetical protein  61.11 
 
 
271 aa  310  1e-83  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.834671  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4813  hypothetical protein  60.67 
 
 
259 aa  300  2e-80  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00575572 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3550  hypothetical protein  58.16 
 
 
257 aa  292  4e-78  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.354619  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3459  hypothetical protein  58.16 
 
 
257 aa  292  5e-78  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5282  hypothetical protein  58.16 
 
 
257 aa  291  7e-78  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.393918  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3969  hypothetical protein  57.74 
 
 
257 aa  290  2e-77  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0539312 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2364  hypothetical protein  56.07 
 
 
257 aa  290  2e-77  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4977  hypothetical protein  56.18 
 
 
260 aa  290  2e-77  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.589508  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1435  hypothetical protein  58.33 
 
 
261 aa  290  2e-77  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5125  hypothetical protein  56.9 
 
 
260 aa  286  3e-76  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.039985 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2576  hypothetical protein  56.9 
 
 
257 aa  285  4e-76  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2570  hypothetical protein  56.38 
 
 
266 aa  284  9e-76  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.333865  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2409  hypothetical protein  55.16 
 
 
259 aa  281  1e-74  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.558045  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37210  hypothetical protein  56.36 
 
 
265 aa  280  2e-74  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00953297  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3193  hypothetical protein  53.12 
 
 
265 aa  277  1e-73  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2200  protein of unknown function DUF1445  53.54 
 
 
262 aa  277  2e-73  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1142  hypothetical protein  53.97 
 
 
261 aa  274  1e-72  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.585996  normal  0.426804 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3152  hypothetical protein  50.56 
 
 
300 aa  272  4e-72  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.808227  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0707  protein of unknown function DUF1445  53.64 
 
 
267 aa  272  5e-72  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00164756  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1597  hypothetical protein  49.62 
 
 
265 aa  271  7e-72  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3576  hypothetical protein  50.2 
 
 
267 aa  271  7e-72  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5194  hypothetical protein  52.19 
 
 
262 aa  268  9e-71  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.633751  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5379  hypothetical protein  48.68 
 
 
268 aa  267  1e-70  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.477329  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01960  hypothetical protein  52.59 
 
 
256 aa  266  3e-70  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3555  protein of unknown function DUF1445  51.55 
 
 
260 aa  266  4e-70  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.14927  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5735  hypothetical protein  53.14 
 
 
251 aa  263  2e-69  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0093  hypothetical protein  49.61 
 
 
270 aa  263  3e-69  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0174  hypothetical protein  50 
 
 
279 aa  263  3e-69  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0321  hypothetical protein  50.98 
 
 
263 aa  262  5e-69  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19220  hypothetical protein  52.59 
 
 
270 aa  260  2e-68  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0498  hypothetical protein  50.4 
 
 
264 aa  260  2e-68  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1731  hypothetical protein  49.61 
 
 
269 aa  259  4e-68  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.22733 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1103  hypothetical protein  49.43 
 
 
263 aa  255  4e-67  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00199325  normal  0.0783421 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2449  hypothetical protein  50 
 
 
270 aa  255  5e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5849  hypothetical protein  52.12 
 
 
268 aa  255  6e-67  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  decreased coverage  0.00315108  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2483  hypothetical protein  49.8 
 
 
259 aa  248  1e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0307873 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4424  hypothetical protein  49 
 
 
254 aa  246  3e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0369265  normal  0.270561 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3512  hypothetical protein  50 
 
 
269 aa  243  2e-63  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.635527 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0610  hypothetical protein  48.94 
 
 
260 aa  238  7e-62  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3393  hypothetical protein  48.55 
 
 
261 aa  236  3e-61  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0256921 
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_13975  predicted protein  47.15 
 
 
290 aa  234  1e-60  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.722114  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0534  hypothetical protein  50 
 
 
267 aa  233  2e-60  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.645229  normal  0.0111523 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0337  protein of unknown function DUF1445  45.96 
 
 
255 aa  233  3e-60  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.915447  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22470  hypothetical protein  46.86 
 
 
261 aa  221  1e-56  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006687  CNE05290  conserved hypothetical protein  43.08 
 
 
276 aa  189  3e-47  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2940  protein of unknown function DUF1445  59.09 
 
 
137 aa  131  9e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>