More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_2873 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009485  BBta_2873  hypothetical protein  100 
 
 
405 aa  811    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.326467  normal  0.0265941 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2694  OsmC-like protein  73.7 
 
 
406 aa  597  1e-169  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2280  OsmC-like protein  71.89 
 
 
406 aa  572  1.0000000000000001e-162  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.423404 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1673  OsmC-like protein  71.81 
 
 
409 aa  563  1.0000000000000001e-159  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3633  OsmC-like protein  68.87 
 
 
406 aa  547  1e-154  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.525721 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1835  OsmC-like protein  68.38 
 
 
407 aa  544  1e-154  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1930  OsmC family protein  69.53 
 
 
407 aa  541  9.999999999999999e-153  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0101124  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7018  OsmC family protein  61.29 
 
 
412 aa  479  1e-134  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00716876 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5571  OsmC family protein  56.9 
 
 
408 aa  446  1.0000000000000001e-124  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0439292 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0049  OsmC family protein  58.59 
 
 
406 aa  442  1e-123  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1777  OsmC-like protein  57.11 
 
 
410 aa  429  1e-119  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0113862  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0941  OsmC family protein  57.36 
 
 
409 aa  429  1e-119  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.3755  normal  0.451532 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4048  OsmC family protein  54.19 
 
 
415 aa  426  1e-118  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.0000134708  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4103  OsmC family protein  53.94 
 
 
402 aa  414  1e-114  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.671514  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12698  hypothetical protein  49.26 
 
 
405 aa  402  1e-111  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1840  hypothetical protein  54.48 
 
 
405 aa  404  1e-111  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.949047 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1206  OsmC family protein  51.82 
 
 
413 aa  400  9.999999999999999e-111  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.423514  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1013  OsmC-like protein  55.33 
 
 
423 aa  394  1e-108  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.325781  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3762  OsmC family protein  51.72 
 
 
410 aa  385  1e-106  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3655  OsmC family protein  51.72 
 
 
410 aa  386  1e-106  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5429  OsmC family protein  47.38 
 
 
397 aa  350  2e-95  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6443  OsmC family protein  52.53 
 
 
408 aa  337  2.9999999999999997e-91  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.588479  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6150  OsmC family protein  52.41 
 
 
408 aa  333  2e-90  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.773624  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0979  OsmC family protein  48.01 
 
 
418 aa  328  1.0000000000000001e-88  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6635  OsmC family protein  47.78 
 
 
411 aa  325  8.000000000000001e-88  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.659004  hitchhiker  0.00000360166 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3394  hypothetical protein  55.93 
 
 
251 aa  269  8e-71  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.689408  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0226  hypothetical protein  54.66 
 
 
257 aa  248  1e-64  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0227  hypothetical protein  55.37 
 
 
257 aa  244  9.999999999999999e-64  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3055  OsmC-like family protein  51.59 
 
 
255 aa  238  2e-61  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2450  hypothetical protein  46.85 
 
 
258 aa  233  6e-60  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1127  putative redox protein  43.78 
 
 
256 aa  228  2e-58  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1911  hydrolase of the alpha/beta superfamily protein  45.53 
 
 
259 aa  227  3e-58  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0630248  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0403  OsmC family protein  54.33 
 
 
259 aa  227  3e-58  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1200  putative redox protein  44.59 
 
 
256 aa  214  1.9999999999999998e-54  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000020196 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3247  putative redox protein  44.35 
 
 
250 aa  210  4e-53  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.184697  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2961  OsmC-like family protein  42.74 
 
 
250 aa  204  3e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0745233  normal  0.293641 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2376  putative redox protein  41.15 
 
 
259 aa  193  4e-48  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0234  alpha/beta hydrolase fold protein  42.74 
 
 
256 aa  182  1e-44  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.104073 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1067  hypothetical protein  56.55 
 
 
145 aa  167  4e-40  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0889291  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4769  OsmC family protein  58.52 
 
 
153 aa  164  3e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00807264  hitchhiker  0.00049584 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2717  OsmC-like protein  50.38 
 
 
135 aa  140  4.999999999999999e-32  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00712413 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4175  hypothetical protein  47.01 
 
 
135 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.214068  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3145  redox protein regulator of disulfide bond formation, OsmC-like  45.24 
 
 
132 aa  103  6e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.102127 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48750  hypothetical protein  43.59 
 
 
135 aa  102  8e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000274485 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1403  OsmC family protein  44.44 
 
 
132 aa  102  1e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0655694  normal  0.111545 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1950  OsmC family protein  43.75 
 
 
132 aa  101  2e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.378128  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1390  OsmC family protein  47.46 
 
 
130 aa  100  4e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.51882  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0921  OsmC family protein  44.83 
 
 
136 aa  100  4e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.418667  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0908  OsmC-like protein  47.46 
 
 
130 aa  100  4e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1368  OsmC family protein  43.66 
 
 
130 aa  100  4e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0210899 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1856  OsmC family protein  41.27 
 
 
129 aa  99  1e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.610023  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1923  OsmC-like protein  42.64 
 
 
127 aa  99  1e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1267  OsmC family protein  46.61 
 
 
130 aa  99.4  1e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1301  OsmC family protein  46.61 
 
 
130 aa  98.6  2e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0499071 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4533  OsmC-like protein  45.76 
 
 
130 aa  97.4  3e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.257374 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1917  OsmC family protein  45.76 
 
 
130 aa  95.5  1e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.591016  normal  0.655521 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2484  OsmC family protein  38.97 
 
 
133 aa  94.4  3e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.092178 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0982  OsmC family protein  49.14 
 
 
127 aa  94  4e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1440  OsmC family protein  46.55 
 
 
142 aa  93.6  6e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0732  OsmC family protein  43.31 
 
 
137 aa  91.3  2e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.560509  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0974  OsmC family protein  39.06 
 
 
128 aa  91.3  3e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.637714  normal  0.331477 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3799  OsmC family protein  42.37 
 
 
133 aa  89.4  1e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.732158  normal  0.104892 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3725  OsmC family protein  42.37 
 
 
133 aa  89.4  1e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.196532 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4564  OsmC-like protein  42.37 
 
 
133 aa  89.4  1e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1438  OsmC family protein  44.55 
 
 
137 aa  88.2  2e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.139134 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1628  OsmC-like protein  35.51 
 
 
138 aa  87  5e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0181271 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4937  OsmC family protein  41.32 
 
 
133 aa  86.7  7e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.659641 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2297  OsmC-like protein  40.68 
 
 
133 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.922047  normal  0.948773 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3491  OsmC family protein  35.96 
 
 
131 aa  84  0.000000000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5525  OsmC family protein  39.83 
 
 
133 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2658  OsmC family protein  38.13 
 
 
133 aa  82  0.00000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.653298  normal  0.498397 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2142  OsmC family protein  37.4 
 
 
129 aa  81.6  0.00000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3689  OsmC family protein  39.83 
 
 
133 aa  82  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.952273 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1578  dienelactone hydrolase  26.23 
 
 
255 aa  79  0.0000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1082  OsmC-like family protein  39.02 
 
 
141 aa  78.6  0.0000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0521945  normal  0.207247 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0518  OsmC-like protein superfamily protein  39.83 
 
 
153 aa  77.8  0.0000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0819  hypothetical protein  28.65 
 
 
253 aa  76.6  0.0000000000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2898  OsmC-like protein  35.54 
 
 
135 aa  76.3  0.0000000000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.533642 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0240  hypothetical protein  38.98 
 
 
133 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1423  hypothetical protein  38.98 
 
 
133 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2657  putative hydrolase  38.98 
 
 
133 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0949  hydrolase  38.98 
 
 
133 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1919  OsmC family protein  36.8 
 
 
131 aa  75.9  0.000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.148561  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1483  hypothetical protein  29.34 
 
 
237 aa  75.9  0.000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2518  hypothetical protein  38.98 
 
 
133 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0608844  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2193  OsmC family protein  36.36 
 
 
129 aa  75.1  0.000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.208378  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3616  osmotically inducible protein  39.42 
 
 
129 aa  75.5  0.000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000818818  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1832  OsmC-like protein  36.44 
 
 
133 aa  73.2  0.000000000009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3965  OsmC family protein  32.56 
 
 
132 aa  72  0.00000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0601  dienelactone hydrolase  29.91 
 
 
259 aa  72  0.00000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0457  Lysophospholipase-like protein  27.03 
 
 
274 aa  68.6  0.0000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5556  OsmC-like protein  32.79 
 
 
130 aa  67.8  0.0000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.0000078778  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0351  OsmC family protein  27.35 
 
 
134 aa  67.8  0.0000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.999657  normal  0.881663 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0276  hypothetical protein  37.29 
 
 
129 aa  67.4  0.0000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3526  OsmC family protein  30.47 
 
 
177 aa  67.4  0.0000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.7407  normal  0.298467 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1619  hypothetical protein  37.29 
 
 
129 aa  67.4  0.0000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1436  OsmC family protein  33.05 
 
 
134 aa  67  0.0000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0929  putative hydrolase  29 
 
 
252 aa  66.6  0.0000000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.119531  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4072  hypothetical protein  26.32 
 
 
134 aa  65.5  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0853904  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1560  OsmC family protein  42.31 
 
 
88 aa  65.5  0.000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>