180 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_2842 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_2842  hypothetical protein  100 
 
 		 315 aa  632  1e-180  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3907  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  71.7 
 
 		 330 aa  432  1e-120  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.3708 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3070  hypothetical protein  71.07 
 
 		 344 aa  418  1e-116  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3136  NmrA family protein  69.85 
 
 		 337 aa  404  1e-111  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0126992 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3798  NAD-dependent epimerase/dehydratase  70.13 
 
 		 344 aa  400  9.999999999999999e-111  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.387174  normal  0.267254 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1379  NmrA family protein  55.21 
 
 		 357 aa  355  3.9999999999999996e-97  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.77544  hitchhiker  0.0031746 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1217  NmrA family protein  56.44 
 
 		 343 aa  356  3.9999999999999996e-97  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000000104302  decreased coverage  0.000138071 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1163  NmrA family protein  53.99 
 
 		 340 aa  348  5e-95  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00319088  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0471  hypothetical protein  53.07 
 
 		 341 aa  343  2e-93  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.120247  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1059  hypothetical protein  53.99 
 
 		 332 aa  333  2e-90  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00000180564  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1374  hypothetical protein  52.15 
 
 		 346 aa  319  5e-86  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.920044  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1613  hypothetical protein  52.45 
 
 		 342 aa  311  1e-83  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.899214  normal  0.0629949 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_27566  predicted protein  47.24 
 
 		 381 aa  286  2.9999999999999996e-76  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.298942  normal  0.129514 
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_30690  predicted protein  41.35 
 
 		 391 aa  215  7e-55  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0211111  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4905  NmrA family protein  30.96 
 
 		 327 aa  88.2  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.554615 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1679  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  28.44 
 
 		 294 aa  87.4  3e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.165214  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2018  hypothetical protein  26.98 
 
 		 294 aa  83.6  0.000000000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.810011  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0060  hypothetical protein  28.25 
 
 		 294 aa  83.2  0.000000000000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2425  chaperon-like protein for quinone binding in photosystem II  28.71 
 
 		 320 aa  80.5  0.00000000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.126236 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5164  NmrA family protein  28.8 
 
 		 321 aa  80.5  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000496465 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0977  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.32 
 
 		 294 aa  77  0.0000000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0152042  normal  0.193057 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3201  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.8 
 
 		 301 aa  76.6  0.0000000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0008  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.96 
 
 		 311 aa  74.7  0.000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.97826 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0384  hypothetical protein  28.46 
 
 		 291 aa  73.9  0.000000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3563  NmrA-like  26.1 
 
 		 291 aa  74.3  0.000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2237  NmrA family protein  27 
 
 		 305 aa  73.6  0.000000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1232  NmrA family protein  26.58 
 
 		 297 aa  71.6  0.00000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000395859  normal  0.0148086 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0065  NmrA family protein  28.93 
 
 		 323 aa  69.7  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0063  NmrA family protein  28.93 
 
 		 323 aa  69.7  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.00000216715  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3033  NmrA family protein  25.48 
 
 		 300 aa  69.3  0.00000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.439584 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2558  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  26.8 
 
 		 291 aa  68.6  0.0000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1986  putative chaperon-like protein for quinone binding in photosystem II  25.88 
 
 		 320 aa  67.8  0.0000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0663634 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3162  NmrA-like  27.82 
 
 		 325 aa  68.2  0.0000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.186566  hitchhiker  0.00806133 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2445  NmrA family protein  27.31 
 
 		 292 aa  68.2  0.0000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.385594  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1920  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  24.92 
 
 		 328 aa  67.4  0.0000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08511  putative chaperon-like protein for quinone binding in photosystem II  27.27 
 
 		 320 aa  67.4  0.0000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1407  NmrA family protein  28.03 
 
 		 295 aa  66.6  0.0000000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00226857 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1422  NmrA family protein  26.77 
 
 		 293 aa  66.6  0.0000000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.578575 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2144  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.83 
 
 		 225 aa  66.2  0.0000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1314  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.1 
 
 		 301 aa  66.2  0.0000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000631185 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5106  NmrA family protein  26.8 
 
 		 291 aa  66.2  0.0000000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.920576  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2704  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.34 
 
 		 308 aa  66.2  0.0000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.135035  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0675  putative chaperon-like protein for quinone binding in photosystem II  28.64 
 
 		 320 aa  64.7  0.000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.240438  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2016  NmrA family protein  25.71 
 
 		 339 aa  64.7  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.675517 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4673  NmrA family protein  32.59 
 
 		 279 aa  63.2  0.000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.909291  normal  0.648206 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0075  hypothetical protein  28.52 
 
 		 305 aa  62.8  0.000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1676  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.79 
 
 		 296 aa  62.4  0.00000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13281  putative chaperon-like protein for quinone binding in photosystem II  22.64 
 
 		 320 aa  60.8  0.00000003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.425658  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2502  NmrA family protein  25.09 
 
 		 332 aa  60.8  0.00000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.174939  n/a   
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_47864  predicted protein  26.14 
 
 		 314 aa  60.5  0.00000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1250  putative chaperon-like protein for quinone binding in photosystem II  23.36 
 
 		 320 aa  59.7  0.00000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.263784  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1410  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.12 
 
 		 306 aa  58.5  0.0000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.217032  normal  0.873139 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3339  NmrA family protein  30.49 
 
 		 279 aa  58.5  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1299  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.46 
 
 		 291 aa  58.9  0.0000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1891  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.11 
 
 		 298 aa  58.2  0.0000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0168492  normal  0.486121 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4014  oxidoreductase domain protein  29.13 
 
 		 680 aa  57.4  0.0000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.876961 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0487  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.63 
 
 		 305 aa  56.6  0.0000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00126012  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0501  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase-like  32.43 
 
 		 216 aa  56.2  0.0000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.82125 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13431  putative chaperon-like protein for quinone binding in photosystem II  22.43 
 
 		 320 aa  56.2  0.0000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0479  NmrA family protein  30.66 
 
 		 289 aa  56.2  0.0000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1353  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  24.6 
 
 		 332 aa  55.8  0.0000009  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0761  putative chaperon-like protein for quinone binding in photosystem II  25.35 
 
 		 324 aa  55.5  0.000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.926297  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13181  putative chaperon-like protein for quinone binding in photosystem II  24.88 
 
 		 320 aa  55.5  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.974044  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12271  putative chaperon-like protein for quinone binding in photosystem II  24.4 
 
 		 320 aa  55.5  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0616034  normal  0.226858 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4317  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  31.51 
 
 		 218 aa  54.7  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.416594  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2674  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.24 
 
 		 211 aa  54.7  0.000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.172224  normal  0.0331815 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16011  putative chaperon-like protein for quinone binding in photosystem II  24.88 
 
 		 324 aa  55.1  0.000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.975575  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1033  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.99 
 
 		 332 aa  54.7  0.000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.19855 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1655  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.45 
 
 		 219 aa  53.9  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6482  NmrA family protein  29.06 
 
 		 315 aa  53.5  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0020  nucleoside-diphosphate-sugar epimerases  31.07 
 
 		 297 aa  53.5  0.000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000112867  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1003  NmrA-like  33.33 
 
 		 221 aa  53.5  0.000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.95557 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3977  NmrA family protein  34.23 
 
 		 209 aa  53.5  0.000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000385201 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4583  Male sterility-like  24.07 
 
 		 282 aa  53.1  0.000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7197  NmrA family protein  27.43 
 
 		 285 aa  53.1  0.000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2575  NmrA family protein  30.53 
 
 		 295 aa  53.1  0.000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2007  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.55 
 
 		 250 aa  52.4  0.000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.702052 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0529  NmrA family protein  31.93 
 
 		 304 aa  52.4  0.000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.616457  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1425  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.23 
 
 		 290 aa  52.4  0.000009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.470267  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0297  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.22 
 
 		 306 aa  52  0.00001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2309  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.47 
 
 		 307 aa  52  0.00001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.433346  normal  0.120516 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1995  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.01 
 
 		 307 aa  52.4  0.00001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.415724  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2629  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.07 
 
 		 309 aa  51.2  0.00002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.262596  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0490  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.19 
 
 		 298 aa  51.6  0.00002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2314  NmrA family protein  38.71 
 
 		 289 aa  51.6  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0857204 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2034  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.47 
 
 		 307 aa  51.2  0.00002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3700  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.29 
 
 		 227 aa  50.8  0.00003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.942866  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1309  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.96 
 
 		 293 aa  50.8  0.00003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_1559  predicted protein  31.37 
 
 		 486 aa  50.8  0.00003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0253  NmrA family protein  27.62 
 
 		 288 aa  50.8  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1350  NmrA family protein  29.38 
 
 		 296 aa  50.4  0.00004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.143431 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1312  NmrA family protein  22.74 
 
 		 295 aa  50.4  0.00004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22250  putative NADH-flavin reductase  28.21 
 
 		 215 aa  50.1  0.00005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3574  NmrA family protein  33.78 
 
 		 244 aa  49.7  0.00006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.764024 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3561  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.54 
 
 		 295 aa  49.7  0.00006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3928  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.56 
 
 		 209 aa  49.7  0.00006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3992  NmrA family protein  24.89 
 
 		 248 aa  49.7  0.00007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0898  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.55 
 
 		 309 aa  49.3  0.00008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.760567  normal  0.885082 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27560  predicted nucleoside-diphosphate sugar epimerase  28.74 
 
 		 258 aa  49.3  0.00008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.235843  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1768  hypothetical protein  25.58 
 
 		 291 aa  49.3  0.00009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>