More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_2791 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009485  BBta_2791  hypothetical protein  100 
 
 
141 aa  284  2.9999999999999996e-76  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.402578  normal  0.193338 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1370  CBS domain-containing protein  60.71 
 
 
171 aa  186  1e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1350  CBS domain containing membrane protein  58.57 
 
 
168 aa  183  6e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4046  CBS domain-containing protein  58.57 
 
 
141 aa  181  3e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1918  CBS domain-containing protein  61.48 
 
 
146 aa  177  4e-44  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.406809  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4720  CBS domain containing membrane protein  60.16 
 
 
130 aa  171  1.9999999999999998e-42  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.236602  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1031  hypothetical protein  58.82 
 
 
143 aa  165  2e-40  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4373  CBS domain-containing protein  60.66 
 
 
154 aa  155  2e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2016  CBS domain-containing protein  48.94 
 
 
144 aa  134  5e-31  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2074  signal transduction protein  46.1 
 
 
142 aa  112  1.0000000000000001e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.350465  normal  0.315482 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0213  CBS domain-containing protein  34.15 
 
 
863 aa  75.1  0.0000000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1435  CBS domain containing protein  37.24 
 
 
427 aa  74.7  0.0000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0215  CBS domain-containing protein  34.96 
 
 
863 aa  74.7  0.0000000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0535  CBS domain-containing protein  37.12 
 
 
256 aa  74.3  0.0000000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.483194 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1387  CBS domain containing protein  33.33 
 
 
148 aa  73.2  0.000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0527  CBS domain containing protein  33.33 
 
 
147 aa  72.8  0.000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5608  signal transduction protein  31.75 
 
 
151 aa  72  0.000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.606425  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17480  predicted signal-transduction protein containing cAMP-binding and CBS domains  37.5 
 
 
191 aa  71.2  0.000000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2529  CBS domain containing membrane protein  34 
 
 
149 aa  70.9  0.000000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00130386  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1740  signal transduction protein  31.97 
 
 
138 aa  70.9  0.000000000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.247067 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2915  Chloride channel core  34.13 
 
 
897 aa  70.5  0.000000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1812  CBS domain containing membrane protein  37.6 
 
 
132 aa  70.1  0.000000000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1761  CBS domain-containing protein  27.34 
 
 
315 aa  69.7  0.00000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000282472  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0964  putative signal transduction protein with CBS domains  31.11 
 
 
132 aa  68.9  0.00000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4216  Chloride channel core  32.58 
 
 
863 aa  69.3  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.298005 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1695  signal transduction protein  32 
 
 
281 aa  68.9  0.00000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000133254 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0027  CBS domain containing protein  35.71 
 
 
210 aa  68.6  0.00000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.63793  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0239  signal transduction protein  30.53 
 
 
128 aa  68.2  0.00000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.371768 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3347  CBS domain-containing protein  31.58 
 
 
384 aa  68.2  0.00000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.401544  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1039  putative signal transduction protein with CBS domains  32.81 
 
 
260 aa  68.6  0.00000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0447  signal-transduction protein  33.33 
 
 
145 aa  68.2  0.00000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.285729  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2488  CBS domain-containing protein  32.8 
 
 
366 aa  68.2  0.00000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0447094  normal  0.553019 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1795  CBS domain-containing protein  32.79 
 
 
251 aa  67.8  0.00000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.346551  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3316  CBS domain-containing protein  34.09 
 
 
144 aa  67.8  0.00000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00011902  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2035  CBS domain-containing protein  35.94 
 
 
143 aa  67.8  0.00000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1302  CBS domain containing protein  32.81 
 
 
769 aa  67.8  0.00000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3833  putative signal transduction protein with CBS domains  38.89 
 
 
201 aa  67.4  0.00000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0502745  normal  0.174348 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0878  CBS domain containing protein  31.11 
 
 
880 aa  67.4  0.00000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5546  CBS domain containing membrane protein  31.03 
 
 
230 aa  67  0.00000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.103522  normal  0.484256 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2349  CBS domain-containing protein  30.83 
 
 
384 aa  67  0.00000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.747363  hitchhiker  0.000220473 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0318  CBS domain-containing protein  34.96 
 
 
370 aa  67  0.00000000009  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.147887  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0616  CBS domain-containing protein  32.54 
 
 
280 aa  67  0.00000000009  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  decreased coverage  0.000000000848956 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2041  CBS domain containing membrane protein  33.83 
 
 
227 aa  66.6  0.0000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000255814  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1308  putative signal transduction protein with CBS domains  27.33 
 
 
161 aa  66.6  0.0000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6174  CBS domain containing membrane protein  32.61 
 
 
246 aa  66.2  0.0000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0966  hypothetical protein  31.25 
 
 
331 aa  66.2  0.0000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2169  putative signal transduction protein with CBS domains  32.52 
 
 
261 aa  66.2  0.0000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2529  CBS domain containing protein  32.82 
 
 
146 aa  65.5  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.48063  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2232  CBS domain containing membrane protein  31.41 
 
 
164 aa  65.5  0.0000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.510755 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0675  signal transduction protein  28.24 
 
 
147 aa  66.2  0.0000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2162  Cl- channel, voltage gated  31.78 
 
 
862 aa  65.5  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.30551 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0830  CBS domain-containing protein  32.26 
 
 
366 aa  65.9  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0891  polynucleotide adenylyltransferase region  31.25 
 
 
883 aa  65.9  0.0000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1882  CBS domain-containing protein  30.5 
 
 
149 aa  65.9  0.0000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000211918  hitchhiker  0.00000438045 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6307  putative signal transduction protein with CBS domains  31.25 
 
 
229 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0019  CBS domain-containing protein  29.05 
 
 
410 aa  65.9  0.0000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1962  CBS domain-containing protein  32.06 
 
 
136 aa  65.5  0.0000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.946  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2707  signal-transduction protein  32.35 
 
 
141 aa  65.9  0.0000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.44759 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2625  CBS domain containing protein  32.82 
 
 
146 aa  65.5  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2358  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  32.5 
 
 
494 aa  65.5  0.0000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.890412  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0171  signal transduction protein  35.34 
 
 
132 aa  65.9  0.0000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.900499  normal  0.567274 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1801  CBS domain-containing protein  29.37 
 
 
149 aa  65.1  0.0000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0256126  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3021  CBS domain containing membrane protein  29.73 
 
 
149 aa  65.1  0.0000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1330  signal transduction protein  32.82 
 
 
146 aa  65.5  0.0000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2201  homoserine O-acetyltransferase  34.59 
 
 
490 aa  65.5  0.0000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0429253  normal  0.79235 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1262  CBS domain containing membrane protein  29.73 
 
 
149 aa  65.1  0.0000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00178252  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2021  CBS domain containing membrane protein  33.11 
 
 
164 aa  65.5  0.0000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2202  CBS domain-containing protein  30.2 
 
 
152 aa  65.5  0.0000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.00000112787  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3605  hypothetical protein  32.52 
 
 
139 aa  64.7  0.0000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.103373  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3318  protein of unknown function DUF190  33.09 
 
 
436 aa  64.7  0.0000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.17404  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1395  HPP family protein  27.86 
 
 
416 aa  64.3  0.0000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.877198  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2320  CBS domain-containing protein  29.53 
 
 
150 aa  64.3  0.0000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000465345  n/a   
 
 
-
 
NC_014249  Aazo_5334  Cl- channel voltage-gated family protein  31.45 
 
 
863 aa  64.3  0.0000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.817477  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3995  CBS domain-containing protein  29.37 
 
 
133 aa  64.3  0.0000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3268  CBS domain-containing protein  33.05 
 
 
142 aa  63.9  0.0000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0490  signal transduction protein  27.33 
 
 
158 aa  63.9  0.0000000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.630311  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1253  CBS domain-containing protein  28.47 
 
 
150 aa  63.9  0.0000000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.515572 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0916  CBS domain-containing protein  29.32 
 
 
225 aa  63.9  0.0000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0373364 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1028  CBS domain containing membrane protein  32.19 
 
 
226 aa  63.9  0.0000000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0495705 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2338  CBS domain containing membrane protein  29.17 
 
 
247 aa  63.9  0.0000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1703  CBS domain containing membrane protein  31.51 
 
 
148 aa  63.9  0.0000000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.311156  normal  0.0624027 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1780  putative signal transduction protein with CBS domains  34.17 
 
 
141 aa  63.5  0.0000000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3596  CBS domain-containing protein  32.64 
 
 
241 aa  63.5  0.0000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.247468  normal  0.0301148 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0303  signal transduction protein  28.89 
 
 
320 aa  63.5  0.0000000009  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.123815  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2260  CBS domain-containing protein  29.93 
 
 
150 aa  63.5  0.0000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000586041  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0914  putative signal transduction protein with CBS domains  31.54 
 
 
131 aa  63.2  0.000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.0000312526  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1505  CBS domain-containing protein  28 
 
 
282 aa  63.2  0.000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.206773  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1873  hypothetical protein  30.82 
 
 
229 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.994541 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0310  hypothetical protein  34.31 
 
 
284 aa  62.8  0.000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1789  CBS domain-containing protein  30.08 
 
 
385 aa  63.5  0.000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.228479  normal  0.180957 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1420  polyA polymerase family protein  30.4 
 
 
880 aa  63.2  0.000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0185526  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0302  signal transduction protein  33.86 
 
 
282 aa  63.5  0.000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.983478  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0947  CBS domain-containing protein  32.69 
 
 
689 aa  62.4  0.000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1342  putative acetoin utilization protein AcuB  28.35 
 
 
149 aa  62.4  0.000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3557  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  34.38 
 
 
605 aa  62.4  0.000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1614  CBS domain-containing protein  32.26 
 
 
431 aa  62.4  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1614  CBS domain containing membrane protein  30.4 
 
 
155 aa  62.8  0.000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.267585  normal  0.113023 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0666  CBS domain-containing protein  32 
 
 
264 aa  62  0.000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1383  signal transduction protein  30.4 
 
 
282 aa  62.4  0.000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.56563 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1209  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  31.67 
 
 
499 aa  62.4  0.000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  unclonable  0.000000206103  hitchhiker  0.00000852941 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>