More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_2755 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_2755  putative isochorismatase  100 
 
 		 228 aa  465  9.999999999999999e-131  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1017  isochorismatase hydrolase  79.74 
 
 		 233 aa  363  1e-99  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2014  isochorismatase hydrolase  73.73 
 
 		 226 aa  321  6e-87  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.35213  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2658  isochorismatase hydrolase  73.43 
 
 		 223 aa  318  3e-86  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.481302  normal  0.112501 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1695  isochorismatase hydrolase  73.73 
 
 		 226 aa  319  3e-86  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.305053  normal  0.0828387 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1123  isochorismatase hydrolase  73.49 
 
 		 226 aa  318  3.9999999999999996e-86  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2027  isochorismatase hydrolase  70.05 
 
 		 240 aa  317  1e-85  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0107803  hitchhiker  0.00287244 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3053  isochorismatase hydrolase  67.12 
 
 		 230 aa  304  7e-82  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0333292  normal  0.223788 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6446  isochorismatase hydrolase  65.16 
 
 		 236 aa  297  8e-80  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.443341  normal  0.0975575 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0732  isochorismatase hydrolase  67.26 
 
 		 240 aa  288  3e-77  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.044592 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2765  isochorismatase hydrolase  66.97 
 
 		 230 aa  285  5e-76  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2809  isochorismatase hydrolase  66.97 
 
 		 230 aa  285  5e-76  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.168317 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5238  isochorismatase hydrolase  58.82 
 
 		 231 aa  273  1.0000000000000001e-72  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.51684  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03716  conserved hypothetical protein  64.22 
 
 		 222 aa  271  4.0000000000000004e-72  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03665  hypothetical protein  64.22 
 
 		 222 aa  271  4.0000000000000004e-72  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4203  isochorismatase family protein  64.22 
 
 		 222 aa  271  4.0000000000000004e-72  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000421381 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1373  isochorismatase family protein  60.09 
 
 		 231 aa  270  9e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0213344 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5651  hypothetical protein  60.19 
 
 		 223 aa  267  1e-70  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.101784  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46626  predicted protein  59.45 
 
 		 227 aa  267  1e-70  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0275  isochorismatase hydrolase  60.65 
 
 		 223 aa  263  2e-69  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0199791  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6450  isochorismatase hydrolase  57.41 
 
 		 222 aa  259  3e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0382853 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4480  isochorismatase hydrolase  56.42 
 
 		 222 aa  258  4e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1163  isochorismatase hydrolase  59.26 
 
 		 225 aa  258  5.0000000000000005e-68  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.427272  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0848  isochorismatase hydrolase  57.8 
 
 		 236 aa  257  1e-67  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.171362  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1354  isochorismatase family protein  57.14 
 
 		 225 aa  251  6e-66  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0764  hypothetical protein  63.86 
 
 		 229 aa  238  5e-62  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0418642  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3021  isochorismatase hydrolase  54.63 
 
 		 232 aa  234  7e-61  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1649  isochorismatase hydrolase  47.78 
 
 		 281 aa  230  1e-59  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.137775  normal  0.599986 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1705  isochorismatase hydrolase  53.78 
 
 		 239 aa  223  2e-57  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.936948 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2024  isochorismatase hydrolase  53.78 
 
 		 239 aa  223  2e-57  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.166105  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3023  isochorismatase hydrolase  53.33 
 
 		 233 aa  221  7e-57  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1111  isochorismatase hydrolase  52.16 
 
 		 239 aa  218  7.999999999999999e-56  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.77446  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1371  isochorismatase family protein  50 
 
 		 230 aa  216  2e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.16071  normal  0.0672215 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0839  isochorismatase hydrolase  52.02 
 
 		 232 aa  216  2e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4623  putative isochorismatase family protein  50.45 
 
 		 227 aa  214  7e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0276016 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0273  isochorismatase hydrolase  51.06 
 
 		 234 aa  214  8e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.221084  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6453  isochorismatase hydrolase  50.23 
 
 		 234 aa  214  9e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.344539  normal  0.0179591 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5240  isochorismatase hydrolase  49.12 
 
 		 230 aa  212  4.9999999999999996e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.599557  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4478  isochorismatase hydrolase  49.32 
 
 		 234 aa  210  1e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5654  hypothetical protein  46.55 
 
 		 233 aa  209  3e-53  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0766  isochorismatase family protein  50 
 
 		 231 aa  208  6e-53  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0251753  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0850  isochorismatase hydrolase  52.71 
 
 		 227 aa  207  1e-52  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.633323  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0676  isochorismatase hydrolase  49.77 
 
 		 247 aa  206  2e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.456581 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06124  isochorismatase family hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G08700)  48.84 
 
 		 389 aa  205  5e-52  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.189791 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_26363  predicted protein  46.15 
 
 		 230 aa  204  9e-52  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1165  isochorismatase hydrolase  47.85 
 
 		 228 aa  203  2e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.712866  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1356  isochorismatase family protein  48.53 
 
 		 228 aa  200  9.999999999999999e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6450  isochorismatase hydrolase  49.1 
 
 		 241 aa  200  9.999999999999999e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0709723  normal  0.0611102 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2912  isochorismatase hydrolase  43.67 
 
 		 240 aa  183  2.0000000000000003e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.333712  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4501  isochorismatase hydrolase  44.17 
 
 		 231 aa  180  1e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3936  pyrimidine utilization protein B  32.73 
 
 		 241 aa  128  8.000000000000001e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.259493  hitchhiker  0.00944074 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5250  isochorismatase hydrolase  31.25 
 
 		 266 aa  123  3e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2114  putative isochorismatase family protein, rutB  31.44 
 
 		 231 aa  120  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01014  predicted enzyme  31 
 
 		 230 aa  119  4.9999999999999996e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2584  isochorismatase hydrolase  31 
 
 		 231 aa  119  4.9999999999999996e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.118098 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01021  hypothetical protein  31 
 
 		 230 aa  119  4.9999999999999996e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1126  putative isochorismatase family protein, rutB  31 
 
 		 231 aa  119  4.9999999999999996e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1129  putative isochorismatase family protein, rutB  31 
 
 		 231 aa  119  6e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.880561  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2631  isochorismatase hydrolase  30.57 
 
 		 231 aa  117  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.662963  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3979  isochorismatase hydrolase  32 
 
 		 233 aa  116  1.9999999999999998e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.406396 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1578  isochorismatase hydrolase  29.73 
 
 		 264 aa  117  1.9999999999999998e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.488451  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00761  isochorismatase family protein  32.13 
 
 		 244 aa  116  1.9999999999999998e-25  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1248  putative isochorismatase family protein, rutB  30.43 
 
 		 231 aa  116  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1822  isochorismatase hydrolase  30.91 
 
 		 248 aa  116  3e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.709387  normal  0.03112 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0992  isochorismatase hydrolase  35.35 
 
 		 224 aa  111  9e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1269  putative isochorismatase family protein  31.34 
 
 		 274 aa  109  4.0000000000000004e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.544851 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2056  isochorismatase hydrolase  32.43 
 
 		 248 aa  105  6e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.647626  normal  0.0831182 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1076  isochorismatase hydrolase  34.23 
 
 		 247 aa  103  1e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0373691  normal  0.029222 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1583  isochorismatase hydrolase  32.73 
 
 		 258 aa  102  4e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.418934 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1737  isochorismatase hydrolase  31.98 
 
 		 248 aa  98.2  9e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1524  isochorismatase hydrolase  30.13 
 
 		 230 aa  98.2  9e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.405798 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72660  hypothetical protein  29.46 
 
 		 217 aa  96.7  2e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.280253  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6308  hypothetical protein  29.46 
 
 		 217 aa  96.3  4e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.542442  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1156  isochorismatase family protein  31.9 
 
 		 246 aa  94.7  9e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0998  isochorismatase hydrolase  31.9 
 
 		 245 aa  95.1  9e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4490  isochorismatase hydrolase  31.1 
 
 		 220 aa  93.2  3e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.628501  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4839  isochorismatase hydrolase  29.26 
 
 		 252 aa  93.2  3e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.722387  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2859  isochorismatase hydrolase  30.56 
 
 		 212 aa  92.8  4e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.607414  normal  0.0688366 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2981  isochorismatase family protein  30.23 
 
 		 227 aa  91.7  8e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0757911  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1936  isochorismatase hydrolase  33.85 
 
 		 207 aa  91.3  1e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1826  isochorismatase superfamily hydrolase  36.05 
 
 		 196 aa  90.9  2e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.436754  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2598  isochorismatase hydrolase  31.28 
 
 		 181 aa  90.9  2e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1404  isochorismatase hydrolase  36.63 
 
 		 196 aa  90.5  2e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.00231254  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3885  isochorismatase hydrolase  36.05 
 
 		 196 aa  90.9  2e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.421083 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1434  isochorismatase hydrolase  35.47 
 
 		 196 aa  89.7  3e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0935045  normal  0.33777 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1030  isochorismatase hydrolase  30.16 
 
 		 203 aa  88.6  8e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1257  isochorismatase hydrolase  32.04 
 
 		 201 aa  87.8  1e-16  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.35565 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17210  nicotinamidase-like amidase  29.5 
 
 		 256 aa  87  2e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2385  isochorismatase hydrolase  29.56 
 
 		 221 aa  86.3  4e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0780  isochorismatase hydrolase  31.34 
 
 		 243 aa  85.9  5e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.473619  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5987  putative isochorismatase family protein  32.99 
 
 		 204 aa  85.1  8e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.104192 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0804  isochorismatase hydrolase  31.63 
 
 		 204 aa  84.7  0.000000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.901897  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1098  isochorismatase hydrolase  30.73 
 
 		 201 aa  84.7  0.000000000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3116  isochorismatase hydrolase  31.1 
 
 		 224 aa  84  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0141  isochorismatase hydrolase  30.53 
 
 		 214 aa  83.6  0.000000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2058  isochorismatase hydrolase  26.64 
 
 		 214 aa  82.4  0.000000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2928  isochorismatase hydrolase  33.33 
 
 		 204 aa  82  0.000000000000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.820644 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3595  hypothetical protein  33.51 
 
 		 198 aa  81.6  0.000000000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.181748  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2126  isochorismatase hydrolase  33.93 
 
 		 182 aa  81.6  0.000000000000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.996682  normal  0.575884 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0124  isochorismatase hydrolase  30.98 
 
 		 180 aa  81.6  0.000000000000009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.963178  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>