More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_2753 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_2753  serine protease DO-like precursor  100 
 
 		 345 aa  668    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1030  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  56.37 
 
 		 318 aa  325  7e-88  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.652034  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2210  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  54.75 
 
 		 319 aa  325  1e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2505  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  54.57 
 
 		 318 aa  323  4e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.121518  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0476  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  58.18 
 
 		 316 aa  323  4e-87  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.236131  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1879  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  55.41 
 
 		 318 aa  322  5e-87  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0111  2-alkenal reductase  51.53 
 
 		 348 aa  319  3.9999999999999996e-86  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.153202 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0953  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  54.43 
 
 		 339 aa  314  1.9999999999999998e-84  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00207331 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4054  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  54.04 
 
 		 364 aa  302  6.000000000000001e-81  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.779263  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3659  2-alkenal reductase  50 
 
 		 341 aa  280  3e-74  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.149627  normal  0.297116 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4302  2-alkenal reductase  49.12 
 
 		 347 aa  265  8.999999999999999e-70  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.519822 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0630  putative serine protease  48.54 
 
 		 347 aa  262  6.999999999999999e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.677401  normal  0.0127211 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0143  2-alkenal reductase  44.23 
 
 		 318 aa  259  3e-68  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0599702  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2676  HtrA2 peptidase  42.94 
 
 		 351 aa  257  2e-67  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0673345 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1370  2-alkenal reductase  48.72 
 
 		 323 aa  256  4e-67  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.876764 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1357  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  45.7 
 
 		 351 aa  255  6e-67  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2807  HtrA2 peptidase  43 
 
 		 308 aa  254  2.0000000000000002e-66  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0175  trypsin-like serine protease  47.42 
 
 		 347 aa  252  8.000000000000001e-66  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0707716  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0641  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  39.39 
 
 		 381 aa  215  9.999999999999999e-55  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0866  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  45.51 
 
 		 343 aa  209  4e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0862974  normal  0.586989 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1169  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  39.51 
 
 		 384 aa  209  4e-53  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3362  peptidase S1C, Do  43.61 
 
 		 464 aa  207  3e-52  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000016609  decreased coverage  0.00312332 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4344  2-alkenal reductase  40.42 
 
 		 382 aa  204  3e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0879  protease Do  37.96 
 
 		 476 aa  202  7e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000781376  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0331  trypsin domain/PDZ domain-containing protein  43.23 
 
 		 464 aa  202  8e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00109847  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1880  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  38.32 
 
 		 386 aa  202  9e-51  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0947444  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2948  serine endoprotease  39.32 
 
 		 478 aa  200  1.9999999999999998e-50  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1726  protease Do  43.27 
 
 		 513 aa  201  1.9999999999999998e-50  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.618401  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1528  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  43.32 
 
 		 311 aa  200  3.9999999999999996e-50  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3776  PDZ/DHR/GLGF  41.61 
 
 		 483 aa  199  5e-50  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0736  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  38.18 
 
 		 386 aa  199  5e-50  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000000182436  normal  0.877655 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3863  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  41.37 
 
 		 334 aa  197  1.0000000000000001e-49  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.593328  normal  0.848378 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3394  protease Do  42.11 
 
 		 476 aa  197  2.0000000000000003e-49  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0792545  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4610  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  39.51 
 
 		 428 aa  196  4.0000000000000005e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.861127 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3083  trypsin-like serine protease  41.76 
 
 		 462 aa  196  5.000000000000001e-49  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0484  2-alkenal reductase  41.79 
 
 		 388 aa  196  6e-49  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000148342  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3546  2-alkenal reductase  38.64 
 
 		 407 aa  195  9e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.416625  hitchhiker  0.00882944 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2121  2-alkenal reductase  41.58 
 
 		 525 aa  195  9e-49  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0197  HtrA2 peptidase  37.54 
 
 		 369 aa  195  9e-49  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2079  HtrA2 peptidase  38.67 
 
 		 420 aa  195  1e-48  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.376096  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0929  protease Do  35.67 
 
 		 473 aa  195  1e-48  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000572701  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3457  protease Do  39.93 
 
 		 476 aa  194  2e-48  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0912  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  41.29 
 
 		 303 aa  193  3e-48  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000212061  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1378  HtrA2 peptidase  43.49 
 
 		 379 aa  192  6e-48  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000042799 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0590  2-alkenal reductase  37.65 
 
 		 453 aa  192  8e-48  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000722472  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1014  peptidase S1C, Do  42.15 
 
 		 476 aa  192  1e-47  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3437  peptidase S1C, Do  42.31 
 
 		 472 aa  191  1e-47  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1101  PDZ/DHR/GLGF  37.39 
 
 		 385 aa  191  1e-47  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.280141 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2700  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  37.46 
 
 		 387 aa  191  1e-47  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.885449  hitchhiker  0.000142466 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0412  putative exported serine protease, HtrA/AlgW-like  40.93 
 
 		 407 aa  191  1e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4295  protease Do  41.15 
 
 		 466 aa  192  1e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000836052  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5059  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  35.24 
 
 		 415 aa  191  1e-47  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.269801 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0424  2-alkenal reductase  41.98 
 
 		 444 aa  191  1e-47  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.943038  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3861  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  41.88 
 
 		 317 aa  191  2e-47  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2815  protease Do  42.7 
 
 		 485 aa  190  2.9999999999999997e-47  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.351815  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3672  2-alkenal reductase  36.77 
 
 		 424 aa  189  4e-47  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0308  protease Do  41.09 
 
 		 481 aa  190  4e-47  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.582048 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3020  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  41.77 
 
 		 324 aa  190  4e-47  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0747  2-alkenal reductase  41.82 
 
 		 385 aa  189  5e-47  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0721582  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2309  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  40.8 
 
 		 326 aa  189  5e-47  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00460586  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0015  2-alkenal reductase  36.28 
 
 		 411 aa  189  5.999999999999999e-47  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6606  HtrA2 peptidase  39.23 
 
 		 393 aa  189  5.999999999999999e-47  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.211294  normal  0.127864 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2013  peptidase S1C, Do  43.72 
 
 		 480 aa  189  8e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.000140166  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1435  peptidase S1C, Do  42.59 
 
 		 545 aa  189  8e-47  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.600827 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0986  HtrA2 peptidase  39.54 
 
 		 382 aa  188  1e-46  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00462206 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2461  protease Do  36.2 
 
 		 487 aa  187  2e-46  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.282198 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1784  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  41.91 
 
 		 385 aa  187  2e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.98033  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0342  2-alkenal reductase  40.36 
 
 		 402 aa  187  2e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.35857  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3620  protease Do  42.42 
 
 		 495 aa  187  3e-46  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3690  HtrA2 peptidase  35.28 
 
 		 396 aa  187  3e-46  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.104241  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0758  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  34.29 
 
 		 375 aa  186  4e-46  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0147516  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2895  2-alkenal reductase  37.29 
 
 		 389 aa  186  5e-46  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.253415  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2395  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  40.6 
 
 		 327 aa  186  6e-46  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00219283 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0112  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  44.36 
 
 		 450 aa  186  6e-46  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.542288  normal  0.312815 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2745  2-alkenal reductase  40.07 
 
 		 403 aa  186  6e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.526629  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2959  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  41.44 
 
 		 380 aa  186  7e-46  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.528569  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0100  protease DO  40.43 
 
 		 456 aa  185  9e-46  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000901293  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0671  protease Do  41.18 
 
 		 473 aa  185  1.0000000000000001e-45  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0470073  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0365  protease Do  34.15 
 
 		 459 aa  185  1.0000000000000001e-45  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3198  protease Do  37.91 
 
 		 474 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2227  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  42.67 
 
 		 312 aa  184  1.0000000000000001e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.247792  hitchhiker  0.0000126621 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1850  protease Do  37.65 
 
 		 535 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.308912  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0080  protease degQ  41.15 
 
 		 471 aa  183  3e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2464  HtrA2 peptidase  36.53 
 
 		 415 aa  184  3e-45  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0366  2-alkenal reductase  39.64 
 
 		 401 aa  184  3e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.850857  normal  0.376935 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0357  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  39.64 
 
 		 401 aa  184  3e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.12639  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0347  protease Do  33.85 
 
 		 459 aa  183  4.0000000000000006e-45  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.342826  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3668  PDZ/DHR/GLGF domain protein  42.28 
 
 		 304 aa  183  4.0000000000000006e-45  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.610552  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0494  peptidase S1C, Do  36.21 
 
 		 506 aa  183  4.0000000000000006e-45  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1208  protease Do  36.97 
 
 		 475 aa  183  4.0000000000000006e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0118678  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3965  protease Do  42.54 
 
 		 514 aa  183  4.0000000000000006e-45  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.938465  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1164  protease Do  41.82 
 
 		 464 aa  182  5.0000000000000004e-45  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0251777  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5561  peptidase S1C, Do  39.46 
 
 		 488 aa  183  5.0000000000000004e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2005  protease Do  41.79 
 
 		 475 aa  183  5.0000000000000004e-45  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1611  protease Do  39.13 
 
 		 482 aa  183  5.0000000000000004e-45  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.4051  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0817  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  40.71 
 
 		 384 aa  182  6e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3233  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  42.21 
 
 		 398 aa  182  6e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2668  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  39.64 
 
 		 401 aa  182  6e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0439  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  39.64 
 
 		 401 aa  182  6e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0418  2-alkenal reductase  39.64 
 
 		 401 aa  182  6e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00163437 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>