More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_2529 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009485  BBta_2529  putative monooxygenase  100 
 
 
450 aa  897    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1550  putative nitrilotriacetate monooxygenase subunit A  61.54 
 
 
451 aa  545  1e-154  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.12121  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3854  putative monooxygenase  61.11 
 
 
492 aa  536  1e-151  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.436036  normal  0.791068 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0160  putative monooxygenase  60.5 
 
 
469 aa  526  1e-148  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2448  putative nitrilotriacetate monooxygenase component A  62.12 
 
 
495 aa  517  1.0000000000000001e-145  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1255  nitrilotriacetate monooxygenase component A  62.12 
 
 
468 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1181  nitrilotriacetate monooxygenase component A  61.89 
 
 
468 aa  514  1.0000000000000001e-145  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5868  putative nitrilotriacetate monooxygenase component A  63.95 
 
 
445 aa  514  1.0000000000000001e-145  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.478941  normal  0.0701056 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1300  putative nitrilotriacetate monooxygenase  52.86 
 
 
451 aa  451  1e-125  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0896409  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3282  nitrilotriacetate monooxygenase component A  51.33 
 
 
459 aa  442  1e-123  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1558  nitrilotriacetate monooxygenase subunit A  52.28 
 
 
458 aa  426  1e-118  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2409  hypothetical protein  52 
 
 
454 aa  420  1e-116  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0433  monooxygenase  52.52 
 
 
472 aa  421  1e-116  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.744526  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8274  monooxygenase  51.04 
 
 
442 aa  421  1e-116  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.104481 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3782  nitrilotriacetate monooxygenase  47.99 
 
 
455 aa  415  1e-114  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4307  putative nitrilotriacetate monooxygenase  48.06 
 
 
449 aa  410  1e-113  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.355403  hitchhiker  0.00147548 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2568  nitrilotriacetate monooxygenase component A (NtA monooxygenase component A) (NtA-MO A)  51.12 
 
 
447 aa  410  1e-113  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1849  nitrilotriacetate monooxygenase component A  50.11 
 
 
452 aa  405  1.0000000000000001e-112  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.896869  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2676  nitrilotriacetate monooxygenase component A (NtA monooxygenase component A) (NtA-MO A)  49.89 
 
 
448 aa  406  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3292  nitrilotriacetate monooxygenase component A  48.2 
 
 
447 aa  403  1e-111  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.451548  normal  0.084467 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1126  nitrilotriacetate monooxygenase component A  48.31 
 
 
453 aa  396  1e-109  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3283  nitrilotriacetate monooxygenase component A (NtA monooxygenase component A) (NtA-MO A)  47.71 
 
 
474 aa  398  1e-109  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1693  putative monooxygenase  49.2 
 
 
449 aa  395  1e-108  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0841245  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2556  nitrilotriacetate monooxygenase component A  48.97 
 
 
455 aa  390  1e-107  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2100  putative xenobiotic (desulfurization)monooxygenase subunit A, NtaA/SnaA/SoxA/DszA family  46.73 
 
 
457 aa  385  1e-106  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2773  xenobiotic (desulfurization)monooxygenase subunit A  48.74 
 
 
452 aa  385  1e-106  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1378  hypothetical protein  48.38 
 
 
434 aa  384  1e-105  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0574353  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1266  xenobiotic compound monooxygenase A subunit  45.15 
 
 
457 aa  384  1e-105  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.476784  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7232  xenobiotic (desulfurization)monooxygenase subunit A  45.9 
 
 
458 aa  383  1e-105  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.177104  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4356  nitrilotriacetate monooxygenase component A  47.39 
 
 
449 aa  383  1e-105  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.191629  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4142  monooxygenase-like  45.27 
 
 
454 aa  380  1e-104  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.279616  normal  0.0146609 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3188  xenobiotic compound monooxygenase A subunit  45.75 
 
 
446 aa  378  1e-104  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22400  xenobiotic compound monooxygenase, DszA family, A subunit protein  46.21 
 
 
453 aa  379  1e-104  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6404  nitrilotriacetate monooxygenase component A  47.06 
 
 
457 aa  377  1e-103  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0247936  normal  0.261136 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4330  xenobiotic compound monooxygenase A subunit  44.52 
 
 
457 aa  375  1e-103  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0251  xenobiotic compound monooxygenase A subunit  45.1 
 
 
439 aa  377  1e-103  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.441756 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2156  xenobiotic (desulfurization)monooxygenase subunit A  46.62 
 
 
458 aa  377  1e-103  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4938  putative monooxygenase  49.55 
 
 
451 aa  373  1e-102  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.131533  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0150  putative monooxygenase  46.01 
 
 
445 aa  372  1e-102  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.323467 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4857  nitrilotriacetate monooxygenase component A  47.06 
 
 
449 aa  370  1e-101  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.140464  normal  0.511595 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2175  nitrilotriacetate monooxygenase component A  46.5 
 
 
445 aa  369  1e-101  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4521  monooxygenase-like protein  45.37 
 
 
455 aa  366  1e-100  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.81326 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5125  putative monooxygenase protein  45.88 
 
 
450 aa  365  1e-99  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1908  putative xenobiotic (desulfurization)monooxygenase subunit A, NtaA/SnaA/SoxA/DszA family  46.52 
 
 
454 aa  360  3e-98  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.504324  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1784  nitrilotriacetate monooxygenase component A  45.01 
 
 
429 aa  358  8e-98  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.156784  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2352  nitrilotriacetate monooxygenase, A subunit, putative  45.23 
 
 
434 aa  358  9.999999999999999e-98  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.742121  normal  0.6128 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1851  nitrilotriacetate monooxygenase component A  44.3 
 
 
452 aa  358  9.999999999999999e-98  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1853  xenobiotic compound monooxygenase A subunit  43.89 
 
 
456 aa  358  9.999999999999999e-98  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21340  xenobiotic compound monooxygenase, DszA family, A subunit  43.78 
 
 
450 aa  358  9.999999999999999e-98  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.341615  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21740  xenobiotic compound monooxygenase, DszA family, A subunit  45.05 
 
 
442 aa  358  9.999999999999999e-98  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.77772  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4213  putative nitrilotriacetate monooxygenase component A protein  43.92 
 
 
449 aa  355  5.999999999999999e-97  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4419  nitrilotriacetate monooxygenase  46.98 
 
 
455 aa  354  1e-96  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.332959  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1369  luciferase-like protein  48.16 
 
 
454 aa  354  2e-96  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.174728  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4825  xenobiotic compound monooxygenase A subunit  44.62 
 
 
441 aa  353  5e-96  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5661  monooxygenase  45.25 
 
 
467 aa  352  8e-96  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.394617 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43950  monoxygenase, NtaA/DszA family  46.22 
 
 
448 aa  350  3e-95  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.182023  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3332  putative monooxygenase  46.01 
 
 
451 aa  350  3e-95  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0770  coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  44.39 
 
 
450 aa  349  5e-95  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29430  nitrilotriacetate monooxygenase  43.62 
 
 
436 aa  349  6e-95  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.64384  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3311  Nrd protein  44.17 
 
 
457 aa  349  7e-95  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3116  Nrd protein  44.59 
 
 
444 aa  348  1e-94  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.554502 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6386  monooxygenase protein  43.49 
 
 
450 aa  348  2e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0181294  normal  0.0362961 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0349  xenobiotic compound monooxygenase, DszA family, A subunit  44.42 
 
 
441 aa  347  2e-94  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3435  Nrd protein  44.37 
 
 
444 aa  347  2e-94  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.218631 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2024  xenobiotic compound monooxygenase A subunit  43.12 
 
 
460 aa  347  3e-94  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4106  nitrilotriacetate monooxygenase  45.08 
 
 
445 aa  347  3e-94  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5093  NtaA/SnaA/SoxA family monooxygenase  43.08 
 
 
445 aa  346  5e-94  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1172  NtaA/SnaA/SoxA family monooxygenase  41.82 
 
 
451 aa  346  5e-94  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.259723  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4737  nitrilotriacetate monooxygenase component A  43.44 
 
 
441 aa  345  1e-93  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4542  putative monooxygenase protein  43.76 
 
 
450 aa  343  2.9999999999999997e-93  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0938197 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3452  putative monooxygenase  45.8 
 
 
447 aa  343  2.9999999999999997e-93  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000752171 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2361  xenobiotic compound monooxygenase A subunit  40.54 
 
 
441 aa  343  4e-93  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.43651  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5007  NtaA/SnaA/SoxA family monooxygenase  43.08 
 
 
442 aa  342  8e-93  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.643407  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1773  putative nitrilotriacetate monooxygenase component A protein  42.47 
 
 
448 aa  341  1e-92  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.702307  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5298  Nrd protein  45.33 
 
 
461 aa  341  2e-92  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0826228  normal  0.019429 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2378  xenobiotic compound monooxygenase A subunit  40.99 
 
 
440 aa  340  2.9999999999999998e-92  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0105  nitrilotriacetate monooxygenase component A  43.79 
 
 
448 aa  340  4e-92  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00568077 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4844  Nrd protein  44.62 
 
 
448 aa  338  9.999999999999999e-92  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.426791  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2318  nitrilotriacetate monooxygenase component A  46.28 
 
 
431 aa  337  2.9999999999999997e-91  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0779  putative nitrilotriacetate monooxygenase  46.28 
 
 
431 aa  337  2.9999999999999997e-91  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.0000264103  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1731  putative EDTA monooxygenase  46.15 
 
 
431 aa  337  3.9999999999999995e-91  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.136958  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1847  putative EDTA monooxygenase  46.15 
 
 
431 aa  337  3.9999999999999995e-91  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00146661  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0518  putative EDTA monooxygenase  46.15 
 
 
431 aa  337  3.9999999999999995e-91  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.043498  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1639  putative EDTA monooxygenase  46.15 
 
 
431 aa  337  3.9999999999999995e-91  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0538792  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3891  coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  43.34 
 
 
439 aa  336  5.999999999999999e-91  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.68944  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6152  nitrilotriacetate monooxygenase protein, component A  43.31 
 
 
444 aa  335  9e-91  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0293921  hitchhiker  0.000273361 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2456  nitrilotriacetate monooxygenase component A  45.92 
 
 
431 aa  334  2e-90  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00745552  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7195  monooxygenase  42.95 
 
 
443 aa  334  2e-90  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0485069  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21660  monooxygenase, NtaA/SnaA/SoxA family  42.73 
 
 
441 aa  333  4e-90  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.714961  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0268  putative nitrilotriacetate monooxygenase component A  43.4 
 
 
448 aa  332  1e-89  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2364  xenobiotic compound monooxygenase A subunit  41.69 
 
 
445 aa  331  1e-89  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2176  nitrilotriacetate monooxygenase component A  43.08 
 
 
445 aa  330  2e-89  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.699045 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2658  NtaA/SnaA/SoxA family monooxygenase  44.96 
 
 
439 aa  330  4e-89  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.104132  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0906  nitrilotriacetate monooxygenase component A  43.67 
 
 
441 aa  329  5.0000000000000004e-89  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.457793  normal  0.708091 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0408  hypothetical protein  40.9 
 
 
458 aa  326  4.0000000000000003e-88  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6653  putative nitrilotriacetate monooxygenase component A  43.51 
 
 
448 aa  327  4.0000000000000003e-88  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.743567  normal  0.503054 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2283  coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  43.26 
 
 
440 aa  325  7e-88  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.161392 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1381  xenobiotic compound DszA family monooxygenase  40.05 
 
 
440 aa  325  1e-87  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.559516  normal  0.652987 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6442  monooxygenase protein  40.99 
 
 
451 aa  324  2e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.01748 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2535  NtaA/SnaA/SoxA family monooxygenase  41.69 
 
 
444 aa  323  3e-87  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.354477  normal  0.017296 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>