More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_2505 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_2505  alpha/beta family hydrolase  100 
 
 		 279 aa  566  1e-160  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4878  alpha/beta hydrolase fold  71.53 
 
 		 279 aa  394  1e-108  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0658691 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2473  hypothetical protein  56.93 
 
 		 286 aa  321  8e-87  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4384  alpha/beta hydrolase fold protein  50.19 
 
 		 283 aa  272  4.0000000000000004e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.944451 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4064  alpha/beta hydrolase fold  47.35 
 
 		 283 aa  268  1e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5863  alpha/beta hydrolase fold  51.49 
 
 		 270 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.648074  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0800  alpha/beta hydrolase fold  47.89 
 
 		 267 aa  234  2.0000000000000002e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.156653 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0911  alpha/beta hydrolase fold protein  49.8 
 
 		 276 aa  231  9e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.139412 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4082  alpha/beta hydrolase fold  47.6 
 
 		 272 aa  227  1e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7536  Alpha/beta hydrolase  50.21 
 
 		 270 aa  224  1e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0534  putative peroxidase  46 
 
 		 281 aa  219  5e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.476086  normal  0.88579 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6102  alpha/beta hydrolase fold  51.91 
 
 		 270 aa  219  5e-56  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5458  alpha/beta hydrolase fold protein  47.84 
 
 		 270 aa  216  4e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.306625  normal  0.0166355 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1764  alpha/beta hydrolase fold  48.94 
 
 		 271 aa  215  7e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.718391  normal  0.0637777 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6565  alpha/beta hydrolase fold  50.64 
 
 		 270 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.250077 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0733  alpha/beta hydrolase fold  42.96 
 
 		 280 aa  208  9e-53  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.204474  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5717  alpha/beta hydrolase fold  49.36 
 
 		 270 aa  205  5e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6081  alpha/beta hydrolase fold  49.36 
 
 		 270 aa  205  5e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3907  alpha/beta hydrolase fold  44.92 
 
 		 269 aa  202  4e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.0000000804884  normal  0.943348 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4021  alpha/beta hydrolase fold protein  44.92 
 
 		 269 aa  202  4e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  unclonable  0.000000197083  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7140  alpha/beta hydrolase fold protein  39.42 
 
 		 425 aa  176  5e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR2178  hydrolase, putative  41.95 
 
 		 233 aa  173  1.9999999999999998e-42  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2090  putative hydrolase  42.19 
 
 		 233 aa  172  5e-42  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.787524  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1790  alpha/beta hydrolase fold  32.95 
 
 		 287 aa  141  9.999999999999999e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.333084  hitchhiker  0.00365614 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0648  alpha/beta hydrolase fold protein  35 
 
 		 226 aa  132  7.999999999999999e-30  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0281045 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9382  alpha/beta hydrolase fold protein  30.57 
 
 		 259 aa  123  3e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2181  alpha/beta hydrolase fold  33.08 
 
 		 273 aa  123  4e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1695  alpha/beta hydrolase fold protein  34.45 
 
 		 284 aa  123  4e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.194275  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2398  alpha/beta hydrolase fold protein  30.54 
 
 		 282 aa  123  4e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.240634  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0351  alpha/beta hydrolase fold  29.35 
 
 		 283 aa  122  9e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.825015  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2251  Alpha/beta hydrolase fold-1  33.89 
 
 		 284 aa  119  3.9999999999999996e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.154511  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1622  alpha/beta hydrolase fold  34.33 
 
 		 284 aa  120  3.9999999999999996e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4536  alpha/beta hydrolase fold protein  34.25 
 
 		 279 aa  119  6e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.821334  normal  0.0123379 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0017  alpha/beta hydrolase fold  30.68 
 
 		 327 aa  118  9.999999999999999e-26  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0512561 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5414  alpha/beta hydrolase fold protein  30.47 
 
 		 261 aa  115  6e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0420195 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0653  alpha/beta hydrolase fold protein  29.32 
 
 		 310 aa  113  3e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.754721  normal  0.0538261 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1788  alpha/beta hydrolase fold protein  27.69 
 
 		 279 aa  112  7.000000000000001e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0842408  hitchhiker  0.00140329 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3317  putative hydrolase or acyltransferase  29.46 
 
 		 296 aa  111  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3325  putative hydrolase or acyltransferase  29.46 
 
 		 296 aa  110  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0252993  normal  0.633189 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2025  alpha/beta hydrolase fold protein  31.73 
 
 		 276 aa  111  2.0000000000000002e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0565493 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3241  putative hydrolase or acyltransferase  29.57 
 
 		 296 aa  110  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1067  alpha/beta hydrolase fold protein  31.2 
 
 		 239 aa  110  3e-23  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3421  putative hydrolase or acyltransferase  29.57 
 
 		 296 aa  110  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0121666 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0585  alpha/beta hydrolase fold  27.87 
 
 		 285 aa  109  5e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.474837  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3027  alpha/beta hydrolase fold protein  30.8 
 
 		 285 aa  109  5e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1382  alpha/beta hydrolase fold  32.16 
 
 		 287 aa  109  5e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.327578  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3834  alpha/beta hydrolase fold  29.66 
 
 		 270 aa  107  2e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.441877 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4047  alpha/beta hydrolase fold  29.66 
 
 		 270 aa  107  3e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0148  alpha/beta hydrolase fold  30.38 
 
 		 266 aa  107  3e-22  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.443703  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4540  alpha/beta fold family hydrolase  30.04 
 
 		 270 aa  106  5e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5301  putative oxidoreductase protein  30.17 
 
 		 258 aa  105  6e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0102616  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0321  alpha/beta hydrolase fold protein  32.56 
 
 		 264 aa  105  1e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1350  alpha/beta hydrolase fold  28.9 
 
 		 270 aa  104  1e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.114885 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1295  3-oxoadipate enol-lactonase  29.84 
 
 		 265 aa  104  1e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.523958  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3365  alpha/beta hydrolase fold  29.66 
 
 		 265 aa  105  1e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.6363  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2555  alpha/beta hydrolase fold protein  33.05 
 
 		 234 aa  104  2e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.249679  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3368  alpha/beta hydrolase fold protein  29.43 
 
 		 326 aa  103  5e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2668  alpha/beta hydrolase fold  30.45 
 
 		 280 aa  103  5e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.105125  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2684  alpha/beta hydrolase fold  30.45 
 
 		 280 aa  102  9e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.9064  normal  0.0215233 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2639  alpha/beta hydrolase fold  30.45 
 
 		 280 aa  102  9e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3293  alpha/beta hydrolase fold  30.43 
 
 		 323 aa  102  1e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.104393  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4089  hydrolase, alpha/beta fold family  29.46 
 
 		 262 aa  100  2e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.05653  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3910  alpha/beta hydrolase fold  32.32 
 
 		 263 aa  100  2e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.399825  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3157  alpha/beta fold family hydrolase  30.19 
 
 		 266 aa  100  4e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3988  alpha/beta hydrolase fold protein  31.94 
 
 		 263 aa  99.8  4e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3177  Alpha/beta hydrolase fold-1  30.29 
 
 		 272 aa  99.8  4e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.97494  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0341  alpha/beta hydrolase fold  32.56 
 
 		 265 aa  100  4e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3943  3-oxoadipate enol-lactonase  31.3 
 
 		 265 aa  99  7e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0394549  normal  0.0878902 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2120  alpha/beta hydrolase fold protein  29.86 
 
 		 284 aa  99.4  7e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.466438 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0595  putative lactone hydrolase  31.94 
 
 		 265 aa  98.2  1e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.208776 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0572  alpha/beta hydrolase fold  30.89 
 
 		 266 aa  98.2  1e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3352  alpha/beta superfamily hydrolase  29.66 
 
 		 314 aa  97.4  2e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0154019  normal  0.941858 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1108  alpha/beta hydrolase fold  30.99 
 
 		 246 aa  97.4  2e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00367251  hitchhiker  0.00365287 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1299  hypothetical protein  27.43 
 
 		 262 aa  97.8  2e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.000000570356  normal  0.587837 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0737  alpha/beta hydrolase fold protein  28.24 
 
 		 273 aa  97.1  3e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.755425  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1595  alpha/beta hydrolase fold  25.84 
 
 		 275 aa  96.7  4e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.649162  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0636  alpha/beta hydrolase fold protein  29.15 
 
 		 263 aa  96.3  5e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1106  alpha/beta hydrolase fold protein  28.37 
 
 		 283 aa  96.3  5e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.112481  normal  0.804859 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1808  hypothetical protein  26.92 
 
 		 219 aa  96.3  6e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3981  alpha/beta hydrolase fold  30.77 
 
 		 268 aa  95.5  9e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.260972 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0115  alpha/beta hydrolase fold protein  27 
 
 		 267 aa  95.5  9e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4208  alpha/beta hydrolase fold protein  29.96 
 
 		 268 aa  95.1  1e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1259  3-oxoadipate enol-lactonase  29.96 
 
 		 261 aa  94.7  2e-18  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1287  alpha/beta hydrolase fold protein  31.17 
 
 		 255 aa  94.4  2e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.00130508  normal  0.0205637 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2189  3-oxoadipate enol-lactonase  31.73 
 
 		 259 aa  94  2e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0350  alpha/beta hydrolase fold protein  29.01 
 
 		 308 aa  93.6  3e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.931364 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0307  hypothetical protein  26.46 
 
 		 264 aa  94  3e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1385  3-oxoadipate enol-lactonase  30.86 
 
 		 256 aa  93.6  3e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.279159  normal  0.947236 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1367  3-oxoadipate enol-lactonase  30.86 
 
 		 256 aa  93.6  3e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3606  alpha/beta hydrolase fold  28.29 
 
 		 265 aa  92.8  5e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000510854 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5863  alpha/beta hydrolase fold protein  29.73 
 
 		 265 aa  92.8  5e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.279453 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1401  3-oxoadipate enol-lactonase  30.86 
 
 		 256 aa  93.2  5e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.926851 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0832  alpha/beta hydrolase fold  29.01 
 
 		 266 aa  92.4  6e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2308  alpha/beta fold family hydrolase  27 
 
 		 283 aa  92.4  7e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.628895 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0291  hypothetical protein  26.07 
 
 		 264 aa  92  9e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0392  alpha/beta hydrolase fold  27.03 
 
 		 273 aa  91.7  1e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3847  Alpha/beta hydrolase fold-1  31.01 
 
 		 263 aa  91.7  1e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1192  alpha/beta superfamily hydrolase  27.17 
 
 		 287 aa  90.9  2e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.696402  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2134  alpha/beta hydrolase fold  30.62 
 
 		 250 aa  91.3  2e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.470034  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1236  alpha/beta fold family hydrolase  30.13 
 
 		 239 aa  90.9  2e-17  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.000165889  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>