225 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_2489 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009485  BBta_2489  non-heme manganese-containing catalase  100 
 
 
421 aa  866    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1673  catalase  81.45 
 
 
277 aa  374  1e-102  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.849273  normal  0.361845 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47080  Mn-containing catalase  49.03 
 
 
291 aa  233  5e-60  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2788  manganese containing catalase  48.04 
 
 
291 aa  231  1e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5095  catalase  49.62 
 
 
293 aa  229  9e-59  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1436  catalase  48.44 
 
 
293 aa  224  2e-57  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3129  catalase  48.67 
 
 
290 aa  224  2e-57  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.147017 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2044  Catalase  47.71 
 
 
290 aa  223  4.9999999999999996e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000198818 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0318  non-heme catalase KatN  48.62 
 
 
294 aa  222  9.999999999999999e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1645  catalase  46.77 
 
 
296 aa  220  3e-56  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1858  catalase  47.47 
 
 
292 aa  218  1e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.724494 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1415  catalase  47.47 
 
 
292 aa  218  2e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.449813  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4798  catalase  46.36 
 
 
300 aa  217  2.9999999999999998e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.137059 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1863  catalase  47.47 
 
 
292 aa  217  2.9999999999999998e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.958813 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1921  catalase  47.47 
 
 
292 aa  217  4e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0512858  hitchhiker  0.000184673 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1597  catalase  47.47 
 
 
292 aa  217  4e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.577365 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3293  Catalase  46.24 
 
 
326 aa  216  5e-55  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1348  DNA mismatch endonuclease  46.72 
 
 
298 aa  214  2.9999999999999995e-54  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.30931  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2997  Mn-containing catalase  46.72 
 
 
314 aa  213  3.9999999999999995e-54  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3122  Mn-containing catalase  46.72 
 
 
298 aa  213  7e-54  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.393204  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4409  catalase  45.74 
 
 
303 aa  211  2e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5037  Catalase  43.73 
 
 
310 aa  205  1e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.134226 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2921  Catalase  45.63 
 
 
324 aa  202  7e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.370195  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5251  catalase  43.71 
 
 
301 aa  199  7e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1329  Catalase  46.35 
 
 
276 aa  194  2e-48  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.714734  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1578  catalase  44.53 
 
 
304 aa  193  6e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6253  catalase  44.53 
 
 
304 aa  193  6e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6729  catalase  44.53 
 
 
301 aa  193  6e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5520  catalase  43.75 
 
 
308 aa  192  8e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.793802  normal  0.807876 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0288  manganese containing catalase  46.06 
 
 
245 aa  181  2e-44  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1620  manganese containing catalase  44.49 
 
 
230 aa  180  4.999999999999999e-44  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00266489 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0376  manganese containing catalase  46.15 
 
 
249 aa  179  5.999999999999999e-44  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.233969 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3821  manganese containing catalase  43.59 
 
 
230 aa  177  2e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00457633  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2781  manganese containing catalase  44.81 
 
 
260 aa  174  3.9999999999999995e-42  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3384  catalase  43.16 
 
 
231 aa  171  2e-41  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.000494245  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1780  Catalase  43.14 
 
 
205 aa  159  8e-38  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1864  Catalase  45.65 
 
 
224 aa  154  4e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.299932  normal  0.0213876 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1730  hypothetical protein  47.24 
 
 
165 aa  141  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.666521  decreased coverage  0.00187959 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0036  hypothetical protein  50.33 
 
 
175 aa  139  7e-32  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0130409 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0886  catalase  37.56 
 
 
302 aa  139  7.999999999999999e-32  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3526  hypothetical protein  45.57 
 
 
164 aa  139  1e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0815  Catalase  36.68 
 
 
308 aa  139  1e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.683068  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0221  Catalase  38.86 
 
 
286 aa  132  1.0000000000000001e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4540  protein of unknown function DUF892  45.86 
 
 
165 aa  131  3e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.369842 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3563  hypothetical protein  48.77 
 
 
166 aa  130  3e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.892765  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2165  Catalase  41.71 
 
 
189 aa  130  5.0000000000000004e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.114172  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1848  Catalase  37.07 
 
 
301 aa  129  9.000000000000001e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.13214  normal  0.135263 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03960  Catalase  38.89 
 
 
227 aa  129  1.0000000000000001e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00363943  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1136  hypothetical protein  46.71 
 
 
165 aa  129  1.0000000000000001e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1447  manganese containing catalase  32.94 
 
 
270 aa  128  2.0000000000000002e-28  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4275  protein of unknown function DUF892  44.59 
 
 
165 aa  127  3e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1016  catalase  40.88 
 
 
228 aa  127  4.0000000000000003e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00169796  unclonable  0.00000000343768 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5614  protein of unknown function DUF892  48.68 
 
 
168 aa  126  6e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.255585 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2984  hypothetical protein  46.67 
 
 
164 aa  126  7e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.602458 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5592  protein of unknown function DUF892  44.31 
 
 
166 aa  126  7e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.544575  hitchhiker  0.00495302 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5296  Catalase  32.39 
 
 
287 aa  126  8.000000000000001e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0565655  normal  0.201236 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2836  Catalase  29.39 
 
 
284 aa  125  1e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0774925 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1392  manganese containing catalase  38.46 
 
 
190 aa  125  1e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0196  hypothetical protein  45.22 
 
 
169 aa  125  2e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3365  hypothetical protein  45.39 
 
 
198 aa  125  2e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.430964  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4247  protein of unknown function DUF892  46.5 
 
 
166 aa  125  2e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4833  protein of unknown function DUF892  41.98 
 
 
180 aa  124  2e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1737  hypothetical protein  45.68 
 
 
166 aa  124  3e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.997374  normal  0.0699743 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1600  Catalase  30.12 
 
 
316 aa  123  5e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4791  hypothetical protein  43.23 
 
 
165 aa  123  5e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0934  spore coat peptide assembly protein CotJC  36.72 
 
 
188 aa  123  8e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0072871  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0517  Catalase  29.95 
 
 
290 aa  122  9.999999999999999e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1068  spore coat protein CotJC  36.87 
 
 
188 aa  122  9.999999999999999e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00620626  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0993  protein of unknown function DUF892  42 
 
 
217 aa  121  1.9999999999999998e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0740  hypothetical protein  44.81 
 
 
192 aa  122  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2545  hypothetical protein  44.3 
 
 
168 aa  121  1.9999999999999998e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2220  protein of unknown function DUF892  44.59 
 
 
175 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1104  Catalase  38.25 
 
 
231 aa  122  1.9999999999999998e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000426374  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1680  Catalase  30.43 
 
 
290 aa  121  1.9999999999999998e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.110771 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0656  manganese containing catalase  39.67 
 
 
189 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.807783  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5596  hypothetical protein  47.68 
 
 
166 aa  121  1.9999999999999998e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.756785  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2066  hypothetical protein  41.32 
 
 
195 aa  121  3e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0139243 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0895  cotJC protein  39.67 
 
 
189 aa  120  4.9999999999999996e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000660321  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7975  protein of unknown function DUF892  44.81 
 
 
179 aa  120  4.9999999999999996e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4479  cotJC protein  39.13 
 
 
189 aa  120  7e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.163427 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0440  Catalase  39.34 
 
 
189 aa  119  7e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2659  hypothetical protein  41.92 
 
 
217 aa  119  9e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5807  Catalase  35.53 
 
 
275 aa  119  9.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.12571  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0414  manganese containing catalase  35.87 
 
 
203 aa  119  9.999999999999999e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0606  catalase  31.87 
 
 
297 aa  119  9.999999999999999e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0766  cotJC protein  39.13 
 
 
189 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000213334  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0714  cotJC protein  39.13 
 
 
189 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000298472  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0701  spore coat-associated protein JC  39.13 
 
 
189 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000246142  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0803  spore coat-associated protein JC  39.13 
 
 
189 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000303709  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0857  cotJC protein  39.13 
 
 
189 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0899  cotJC protein  39.13 
 
 
189 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.71221e-44 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0967  cotJC protein  39.13 
 
 
189 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000889969  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2189  manganese containing catalase  37.7 
 
 
189 aa  117  3e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1213  manganese containing catalase  38.15 
 
 
190 aa  117  3e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.645424  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4780  hypothetical protein  46 
 
 
183 aa  117  5e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.786292 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3491  hypothetical protein  43.23 
 
 
163 aa  116  7.999999999999999e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3294  hypothetical protein  44 
 
 
163 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.335875 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3827  hypothetical protein  51.22 
 
 
149 aa  115  1.0000000000000001e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2909  manganese containing catalase  36.22 
 
 
190 aa  115  1.0000000000000001e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2075  catalase  28.83 
 
 
285 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.13632 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>