More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_2483 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_2483  putative Beta-lactamase  100 
 
 		 290 aa  600  1e-170  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3408  Beta-lactamase  45.35 
 
 		 288 aa  225  7e-58  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.126776  normal  0.0176052 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1111  Beta-lactamase  41.13 
 
 		 299 aa  206  3e-52  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3944  beta-lactamase  36.78 
 
 		 293 aa  188  9e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.896409  hitchhiker  0.000201992 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4124  beta-lactamase  36.4 
 
 		 293 aa  187  1e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3954  beta-lactamase  36.4 
 
 		 293 aa  186  3e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4063  beta-lactamase  36.02 
 
 		 293 aa  186  4e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.534302  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4017  beta-lactamase  36.02 
 
 		 293 aa  185  6e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3880  beta-lactamase-like  39.02 
 
 		 297 aa  180  2e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.24697  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3259  Beta-lactamase  37.87 
 
 		 298 aa  173  2.9999999999999996e-42  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000588922  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2146  Beta-lactamase  33.8 
 
 		 290 aa  172  3.9999999999999995e-42  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.727489  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4572  Beta-lactamase  36.96 
 
 		 294 aa  171  9e-42  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0562  beta-lactamase domain protein  35.48 
 
 		 294 aa  159  3e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.155939  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1904  beta-lactamase-like protein  35.29 
 
 		 289 aa  131  1.0000000000000001e-29  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.177058 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1743  beta-lactamase-like  31.82 
 
 		 289 aa  130  2.0000000000000002e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0220  beta-lactamase domain protein  29.76 
 
 		 276 aa  103  2e-21  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  1.90359e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5001  beta-lactamase domain protein  29.81 
 
 		 350 aa  103  4e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0521507  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1851  beta-lactamase domain protein  34.25 
 
 		 335 aa  102  8e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.406949  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2500  beta-lactamase-like  32.29 
 
 		 308 aa  95.5  9e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.763303  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0619  beta-lactamase domain protein  34.59 
 
 		 240 aa  85.5  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.256454 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1760  Zn-dependent hydrolase including glyoxylases  29.18 
 
 		 229 aa  78.6  0.0000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2072  beta-lactamase domain-containing protein  41.18 
 
 		 210 aa  74.7  0.000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.760558  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1399  beta-lactamase domain protein  30.06 
 
 		 230 aa  70.9  0.00000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.290066 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5043  Beta-lactamase-like  29.55 
 
 		 294 aa  70.1  0.00000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6334  beta-lactamase-like  30.11 
 
 		 294 aa  70.1  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1745  beta-lactamase domain-containing protein  30.11 
 
 		 294 aa  70.1  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.462526  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0035  beta-lactamase domain protein  34.85 
 
 		 210 aa  68.9  0.00000000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1138  beta-lactamase domain-containing protein  28.12 
 
 		 221 aa  68.6  0.0000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1919  beta-lactamase domain protein  29.79 
 
 		 243 aa  67  0.0000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000566164  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1761  beta-lactamase domain-containing protein  29.55 
 
 		 294 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1669  beta-lactamase domain-containing protein  28.98 
 
 		 289 aa  65.9  0.0000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1666  beta-lactamase domain-containing protein  28.98 
 
 		 289 aa  65.9  0.0000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1345  beta-lactamase domain-containing protein  30.18 
 
 		 230 aa  65.9  0.0000000008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4053  beta-lactamase domain-containing protein  32.17 
 
 		 212 aa  65.5  0.000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000967513 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0469  beta-lactamase domain-containing protein  29.93 
 
 		 215 aa  65.1  0.000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0169041  hitchhiker  0.000497753 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1515  beta-lactamase domain-containing protein  29.55 
 
 		 294 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.488843 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2012  hypothetical protein  28.57 
 
 		 213 aa  64.3  0.000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0010295  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0451  beta-lactamase domain protein  35.26 
 
 		 213 aa  64.3  0.000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2946  beta-lactamase domain protein  27.66 
 
 		 263 aa  63.5  0.000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0735  beta-lactamase domain-containing protein  26.82 
 
 		 205 aa  64.3  0.000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.204457  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1085  beta-lactamase domain protein  31.38 
 
 		 263 aa  63.5  0.000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1578  hydroxyacylglutathione hydrolase  33.08 
 
 		 256 aa  63.5  0.000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.156565 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2508  beta-lactamase domain protein  33.79 
 
 		 214 aa  63.5  0.000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.523411 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8202  beta-lactamase domain-containing protein  29.25 
 
 		 339 aa  63.2  0.000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0946  beta-lactamase-like  26.78 
 
 		 295 aa  61.6  0.00000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0619  beta-lactamase domain-containing protein  31.06 
 
 		 273 aa  61.2  0.00000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1123  beta-lactamase-like protein  28.57 
 
 		 214 aa  61.2  0.00000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0569426  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3589  Beta-lactamase-like  30.71 
 
 		 298 aa  60.5  0.00000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2162  beta-lactamase domain-containing protein  30 
 
 		 266 aa  60.5  0.00000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.353123  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5856  beta-lactamase domain protein  34.62 
 
 		 213 aa  60.1  0.00000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.518272  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0390  beta-lactamase domain protein  33.33 
 
 		 318 aa  59.7  0.00000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2719  beta-lactamase domain protein  26.09 
 
 		 218 aa  59.7  0.00000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.227848  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25370  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  23 
 
 		 207 aa  59.3  0.00000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.555955 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2898  beta-lactamase domain protein  24.6 
 
 		 375 aa  58.5  0.0000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0890  beta-lactamase-like  26.99 
 
 		 295 aa  58.5  0.0000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2282  metallo-beta-lactamase family protein  26.58 
 
 		 297 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0400528  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1201  metallo-beta-lactamase family protein  26.19 
 
 		 198 aa  58.2  0.0000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2218  beta-lactamase domain-containing protein  34.45 
 
 		 217 aa  58.5  0.0000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.250629  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04020  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  27.38 
 
 		 222 aa  57.8  0.0000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.626574 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2576  beta-lactamase domain-containing protein  33.56 
 
 		 214 aa  57.8  0.0000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.835238  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0028  beta-lactamase domain-containing protein  34.92 
 
 		 220 aa  57.4  0.0000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0137537  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2304  metallo-beta-lactamase family protein  29.03 
 
 		 294 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2172  metallo-beta-lactamase family protein  29.03 
 
 		 300 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.642158  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2799  beta-lactamase domain protein  33.56 
 
 		 214 aa  57.8  0.0000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.130329  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0387  beta-lactamase domain-containing protein  35.2 
 
 		 231 aa  58.2  0.0000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.084331  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0561  beta-lactamase-like  26.18 
 
 		 260 aa  57.8  0.0000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_6720  putative metallo-beta-lactamase family protein  27.45 
 
 		 292 aa  57.8  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.790401  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3707  beta-lactamase domain-containing protein  28.48 
 
 		 209 aa  57.8  0.0000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000107683  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2116  metallo-beta-lactamase family protein  29.03 
 
 		 307 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4188  beta-lactamase domain-containing protein  27.22 
 
 		 361 aa  57.4  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3547  hypothetical protein  35.8 
 
 		 255 aa  57  0.0000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.152924  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2960  putative hydrolase  33.61 
 
 		 217 aa  57  0.0000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0047526 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3270  hydroxyacylglutathione hydrolase  39.08 
 
 		 256 aa  57  0.0000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21890  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  32.46 
 
 		 229 aa  56.6  0.0000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0120239 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2916  beta-lactamase-like protein  33.12 
 
 		 239 aa  56.6  0.0000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1675  beta-lactamase domain protein  32.31 
 
 		 242 aa  57  0.0000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2524  beta-lactamase domain-containing protein  32.09 
 
 		 215 aa  57  0.0000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0317  beta-lactamase domain-containing protein  30.34 
 
 		 214 aa  56.6  0.0000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.605621  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0571  Zn-dependent hydrolase  26.75 
 
 		 260 aa  56.6  0.0000005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1618  beta-lactamase domain-containing protein  29.45 
 
 		 296 aa  56.2  0.0000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000015165  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1661  beta-lactamase domain protein  31.34 
 
 		 241 aa  56.6  0.0000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5335  beta-lactamase domain-containing protein  32.35 
 
 		 213 aa  56.6  0.0000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.311932  normal  0.0822687 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0773  beta-lactamase domain protein  26.24 
 
 		 320 aa  56.2  0.0000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000303439 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1263  beta-lactamase domain protein  33.12 
 
 		 231 aa  56.2  0.0000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.795749 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0786  metallo-beta-lactamase family protein  31.54 
 
 		 208 aa  56.2  0.0000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0221878  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0134  beta-lactamase-like  33.33 
 
 		 222 aa  56.2  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0720  beta-lactamase domain-containing protein  28.38 
 
 		 210 aa  56.2  0.0000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.199097  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2954  beta-lactamase domain-containing protein  25.12 
 
 		 214 aa  55.8  0.0000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3471  beta-lactamase domain protein  37.36 
 
 		 206 aa  56.2  0.0000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1470  beta-lactamase domain-containing protein  27.27 
 
 		 210 aa  55.8  0.0000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000000122516  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0900  metallo-beta-lactamase family protein  28.1 
 
 		 198 aa  55.8  0.0000008  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1446  beta-lactamase domain-containing protein  30.65 
 
 		 215 aa  55.8  0.0000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.746343  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1713  metallo-beta-lactamase family protein  32.41 
 
 		 212 aa  55.8  0.0000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0922  beta-lactamase domain-containing protein  28.66 
 
 		 298 aa  55.8  0.0000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.470849  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1171  beta-lactamase domain protein  29.23 
 
 		 303 aa  55.8  0.0000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.361402  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0830  beta-lactamase domain-containing protein  27.86 
 
 		 288 aa  55.8  0.0000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0917  hydroxyacylglutathione hydrolase  35 
 
 		 258 aa  55.8  0.0000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0932864 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0334  beta-lactamase domain-containing protein  31.33 
 
 		 212 aa  55.8  0.0000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0830  metallo-beta-lactamase family protein  26.79 
 
 		 198 aa  55.5  0.0000009  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0389556  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2391  metallo-beta-lactamase family protein  29.75 
 
 		 215 aa  55.1  0.000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.178829  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>