More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_2471 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009485  BBta_2471  adenylate/guanylate cyclase  100 
 
 
391 aa  788    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1395  adenylate/guanylate cyclase  60.87 
 
 
399 aa  478  1e-133  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0858263  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1213  adenylate/guanylate cyclase  58.82 
 
 
399 aa  449  1e-125  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.782915  normal  0.51515 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3791  adenylate/guanylate cyclase  37.47 
 
 
410 aa  261  2e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3496  adenylate/guanylate cyclase  37.98 
 
 
407 aa  259  5.0000000000000005e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.7892 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4273  putative adenylate/guanylate cyclase  39.39 
 
 
421 aa  256  5e-67  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.889875  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5435  hypothetical protein  36.29 
 
 
404 aa  243  3e-63  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.423535  normal  0.185404 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0854  adenylate/guanylate cyclase  37.19 
 
 
464 aa  232  1e-59  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0956  adenylate/guanylate cyclase  38.64 
 
 
401 aa  226  5.0000000000000005e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0836  adenylate/guanylate cyclase  38.3 
 
 
401 aa  226  7e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.805634 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0773  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  36.91 
 
 
465 aa  223  3e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3993  putative adenylate/guanylate cyclase  39.13 
 
 
388 aa  223  4e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.339564  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3512  adenylate/guanylate cyclase  35.79 
 
 
411 aa  220  3e-56  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.596783  normal  0.617288 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3188  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  35.81 
 
 
411 aa  220  3.9999999999999997e-56  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3384  adenylate/guanylate cyclase  35.06 
 
 
427 aa  216  5e-55  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.141185  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3196  adenylate/guanylate cyclase  37.34 
 
 
406 aa  215  9.999999999999999e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2654  adenylate/guanylate cyclase  37.95 
 
 
517 aa  215  9.999999999999999e-55  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7122  putative adenylate/guanylate cyclase  34.46 
 
 
447 aa  214  1.9999999999999998e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.526481  normal  0.239769 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5969  putative adenylate/guanylate cyclase  33.33 
 
 
447 aa  211  2e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.552237  normal  0.155439 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5268  adenylate/guanylate cyclase  38.72 
 
 
379 aa  209  7e-53  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0287319  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0018  adenylate/guanylate cyclase  35.33 
 
 
420 aa  207  3e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0171686 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6772  adenylate/guanylate cyclase  35.08 
 
 
416 aa  202  6e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.942447  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0986  adenylate/guanylate cyclase  35.49 
 
 
400 aa  201  9.999999999999999e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0675159  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7519  adenylate/guanylate cyclase  35.08 
 
 
426 aa  200  3e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.156263  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5605  adenylate cyclase  32.04 
 
 
450 aa  198  1.0000000000000001e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0582  adenylate/guanylate cyclase  35.4 
 
 
425 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0247859  hitchhiker  0.00751197 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0574  adenylate/guanylate cyclase  34.75 
 
 
396 aa  194  2e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0606  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  36 
 
 
466 aa  192  1e-47  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.387711  normal  0.106969 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0617  adenylate/guanylate cyclase  36 
 
 
424 aa  192  1e-47  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.654981  normal  0.11859 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2619  adenylate/guanylate cyclase  36.01 
 
 
381 aa  185  1.0000000000000001e-45  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.556471 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2756  putative adenylate/guanylate cyclase  32.18 
 
 
406 aa  181  2e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4590  putative adenylate/guanylate cyclase  31.49 
 
 
494 aa  180  2.9999999999999997e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0480836  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3482  adenylate/guanylate cyclase  30.39 
 
 
405 aa  179  4.999999999999999e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.285449  normal  0.641305 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3770  adenylate/guanylate cyclase  28.99 
 
 
405 aa  176  6e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.154148  normal  0.656684 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4896  putative adenylate/guanylate cyclase  32.83 
 
 
401 aa  176  8e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.549571 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4661  putative adenylate/guanylate cyclase  31.7 
 
 
424 aa  175  9.999999999999999e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.249101  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2375  adenylate/guanylate cyclase  35.41 
 
 
348 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.165554  decreased coverage  0.00302475 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3875  putative adenylate/guanylate cyclase  33.25 
 
 
367 aa  167  2e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.579671  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2359  adenylate/guanylate cyclase  33.67 
 
 
370 aa  167  4e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.071599  normal  0.155439 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2682  adenylate/guanylate cyclase  31.73 
 
 
367 aa  148  1.0000000000000001e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1264  adenylate/guanylate cyclase with GAF sensor(s)  41.56 
 
 
584 aa  109  7.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1295  adenylate/guanylate cyclase with GAF sensor(s)  40 
 
 
584 aa  107  3e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2515  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  37.38 
 
 
650 aa  107  4e-22  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.764918 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28331  guanylate cyclase  34.65 
 
 
632 aa  103  4e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.345698 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0400  adenylate/guanylate cyclase  35.8 
 
 
864 aa  102  2e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1131  adenylate cyclase  27.9 
 
 
483 aa  100  3e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1135  adenylate cyclase  27.9 
 
 
483 aa  100  4e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1583  adenylate/guanylate cyclase  38.12 
 
 
483 aa  100  5e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.0000000336338  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3735  adenylate/guanylate cyclase  29.09 
 
 
860 aa  99  1e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0169064  normal  0.419577 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5021  adenylate/guanylate cyclase  38.46 
 
 
348 aa  98.2  2e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2413  GAF/PAS/PAC sensor-containing adenylate/guanylate cyclase  28.29 
 
 
861 aa  97.8  3e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0015  putative adenylate/guanylate cyclase  29.64 
 
 
284 aa  97.4  4e-19  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.391867  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3501  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  31.65 
 
 
652 aa  96.3  8e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.703236  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3744  GAF/PAS/PAC sensor-containing adenylate/guanylate cyclase  34.57 
 
 
858 aa  93.6  5e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0091  adenylate/guanylate cyclase  32.93 
 
 
859 aa  92.8  1e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.101175 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0647  adenylate/guanylate cyclase  29.5 
 
 
911 aa  92.4  1e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.707555  normal  0.864231 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0671  adenylate/guanylate cyclase with integral membrane sensor  36.53 
 
 
500 aa  91.7  2e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0415363  normal  0.502054 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4017  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  32.98 
 
 
701 aa  92  2e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.556421 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1889  putative adenylate/guanylate cyclase  34.36 
 
 
645 aa  90.5  5e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0331  putative adenylate/guanylate cyclase  25.91 
 
 
641 aa  90.5  5e-17  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4698  adenylate/guanylate cyclase  35.9 
 
 
735 aa  90.1  6e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3621  putative adenylate/guanylate cyclase  31.35 
 
 
607 aa  89.7  7e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1986  adenylate cyclase, putative  33.33 
 
 
636 aa  89  1e-16  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.00000955851  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6677  ferredoxin  37.67 
 
 
577 aa  88.2  2e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.869083  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2195  putative adenylate/guanylate cyclase  32.8 
 
 
641 aa  88.6  2e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.595097 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1986  adenylate/guanylate cyclase  30.59 
 
 
643 aa  88.2  2e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1999  adenylate/guanylate cyclase  32.8 
 
 
524 aa  88.6  2e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1502  adenylate/guanylate cyclase  40 
 
 
561 aa  87.8  3e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000770351  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2338  GAF sensor-containing adenylate/guanylate cyclase  35.37 
 
 
1180 aa  87.4  4e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0263037  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1110  adenylate/guanylate cyclase  29.13 
 
 
348 aa  87.4  4e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0224811  normal  0.236606 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3155  adenylate/guanylate cyclase  33.54 
 
 
1172 aa  87  5e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.386213  hitchhiker  0.00095291 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0280  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  30.6 
 
 
656 aa  85.5  0.000000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4585  adenylate/guanylate cyclase  37.01 
 
 
744 aa  85.5  0.000000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0862409  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1218  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  32.1 
 
 
611 aa  84.7  0.000000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3090  putative Chase2 sensor protein  32.14 
 
 
614 aa  85.1  0.000000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00483  adenylate cyclase  31.87 
 
 
358 aa  84.7  0.000000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1046  adenylate/guanylate cyclase  30.86 
 
 
726 aa  85.1  0.000000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000197957  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1658  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  32.52 
 
 
577 aa  85.1  0.000000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.791017  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0663  putative adenylate/guanylate cyclase  34.69 
 
 
632 aa  84.7  0.000000000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.389437  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0296  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  30.6 
 
 
672 aa  84.3  0.000000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0401  adenylate/guanylate cyclase catalytic domain-containing protein  27.35 
 
 
797 aa  84  0.000000000000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.173302  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1100  putative adenylate/guanylate cyclase  30.86 
 
 
479 aa  84.3  0.000000000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3568  adenylate/guanylate cyclase  32.45 
 
 
526 aa  84  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.456079 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3884  adenylate/guanylate cyclase  34.42 
 
 
667 aa  84  0.000000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1643  adenylate/guanylate cyclase  32.52 
 
 
536 aa  84.3  0.000000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.292421  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2343  adenylate/guanylate cyclase with integral membrane sensor  35.51 
 
 
465 aa  83.6  0.000000000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3412  adenylate/guanylate cyclase  27.35 
 
 
1207 aa  83.2  0.000000000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.210507 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0078  adenylate/guanylate cyclase with integral membrane sensor  31 
 
 
585 aa  82.4  0.00000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0981996 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1173  ribosomal protein L19  29.02 
 
 
460 aa  82.4  0.00000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000211521 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3755  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  31.05 
 
 
678 aa  82.8  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4571  adenylate/guanylate cyclase with GAF sensor and FHA domain protein  30.22 
 
 
546 aa  82.8  0.00000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.226096  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1406  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  36.03 
 
 
757 aa  81.6  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.9726 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2364  putative adenylate/guanylate cyclase  35.71 
 
 
558 aa  81.3  0.00000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1276  hypothetical protein  25.4 
 
 
701 aa  80.9  0.00000000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2694  putative PAS/PAC sensor protein  34.17 
 
 
969 aa  80.9  0.00000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0176534  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0940  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  31.38 
 
 
597 aa  80.9  0.00000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.326683  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0231  putative adenylate/guanylate cyclase  31.11 
 
 
675 aa  80.9  0.00000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0742762  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3177  adenylate/guanylate cyclase with GAF and PAS/PAC sensors  35.63 
 
 
971 aa  80.5  0.00000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2543  adenylate/guanylate cyclase  29.56 
 
 
712 aa  80.5  0.00000000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.00000118563  normal  0.086844 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2239  adenylate/guanylate cyclase  35.37 
 
 
1156 aa  80.5  0.00000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.159061  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>