225 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_2435 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_2435  hypothetical protein  100 
 
 		 272 aa  560  1.0000000000000001e-159  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.834577  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5865  hypothetical protein  67.84 
 
 		 258 aa  367  1e-101  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3259  hypothetical protein  64.57 
 
 		 259 aa  348  7e-95  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.990579  normal  0.190994 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1723  hypothetical protein  62.35 
 
 		 266 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0366  hypothetical protein  62.35 
 
 		 266 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0274  hypothetical protein  62.35 
 
 		 266 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06420  hypothetical protein  60.89 
 
 		 252 aa  325  6e-88  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.155687  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0595  hypothetical protein  60.89 
 
 		 252 aa  324  8.000000000000001e-88  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0005  hypothetical protein  59.69 
 
 		 270 aa  324  9e-88  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.76896  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1880  hypothetical protein  61.94 
 
 		 266 aa  324  1e-87  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0893  hypothetical protein  61.94 
 
 		 266 aa  324  1e-87  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4577  hypothetical protein  59.53 
 
 		 277 aa  323  1e-87  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00594696  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1179  hypothetical protein  61.94 
 
 		 266 aa  324  1e-87  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2156  hypothetical protein  61.94 
 
 		 266 aa  324  1e-87  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6280  hypothetical protein  65.99 
 
 		 260 aa  314  9e-85  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0130  hypothetical protein  55.47 
 
 		 275 aa  314  9e-85  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2951  hypothetical protein  64.78 
 
 		 260 aa  307  1.0000000000000001e-82  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0369  hypothetical protein  63.56 
 
 		 260 aa  306  3e-82  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.244738  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2920  hypothetical protein  56.91 
 
 		 252 aa  298  7e-80  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.9923  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2772  hypothetical protein  56.5 
 
 		 252 aa  296  2e-79  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2118  hypothetical protein  55.24 
 
 		 252 aa  293  2e-78  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0624243  normal  0.300984 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2862  hypothetical protein  55.28 
 
 		 252 aa  292  3e-78  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.191254  normal  0.477951 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2722  hypothetical protein  55.92 
 
 		 251 aa  292  3e-78  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.453  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2936  LamB/YcsF family protein  56.33 
 
 		 251 aa  291  6e-78  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.597487  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2385  hypothetical protein  51.63 
 
 		 264 aa  273  2.0000000000000002e-72  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.707785  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2481  hypothetical protein  50.59 
 
 		 260 aa  266  2e-70  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1143  LamB/YcsF family protein  40.4 
 
 		 257 aa  210  2e-53  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.395519  normal  0.256013 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3294  LamB/YcsF family protein  43.25 
 
 		 255 aa  209  5e-53  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0177  LamB/YcsF family protein  44.4 
 
 		 252 aa  208  9e-53  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4034  LamB/YcsF family protein  41.02 
 
 		 253 aa  207  1e-52  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5327  LamB/YcsF family protein  42.46 
 
 		 254 aa  206  3e-52  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2956  LamB/YcsF family protein  43.82 
 
 		 254 aa  205  7e-52  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2042  LamB/YcsF family protein  44.05 
 
 		 255 aa  201  1.9999999999999998e-50  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2622  LamB/YcsF family protein  42.69 
 
 		 255 aa  196  4.0000000000000005e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.180431 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1970  LamB/YcsF family protein  41.7 
 
 		 254 aa  195  8.000000000000001e-49  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.149579  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0083  LamB/YcsF family protein  41.25 
 
 		 304 aa  195  8.000000000000001e-49  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0465  LamB/YcsF family protein  40.38 
 
 		 261 aa  194  1e-48  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4134  LamB/YcsF family protein  40.24 
 
 		 257 aa  193  3e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.607272 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1503  LamB/YcsF family protein  43.36 
 
 		 255 aa  192  4e-48  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0456158 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2834  LamB/YcsF family protein  42 
 
 		 254 aa  192  4e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.886287  normal  0.829022 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7659  LamB/YcsF family protein  41.06 
 
 		 255 aa  192  5e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.54081  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3426  LamB/YcsF family protein  39.37 
 
 		 256 aa  192  7e-48  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.864417  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3392  LamB/YcsF family protein  41.06 
 
 		 253 aa  191  1e-47  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0612122 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3119  LamB/YcsF family protein  37.05 
 
 		 253 aa  190  2e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5378  LamB/YcsF family protein  39.51 
 
 		 256 aa  191  2e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2847  LamB/YcsF family protein  37.05 
 
 		 253 aa  190  2e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0708  LamB/YcsF family protein  39.37 
 
 		 258 aa  190  2e-47  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00425486  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6351  LamB/YcsF family protein  41.6 
 
 		 254 aa  189  2.9999999999999997e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1572  LamB/YcsF family protein  42.52 
 
 		 270 aa  189  5e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.265456 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3513  LamB/YcsF family protein  40.56 
 
 		 251 aa  189  5.999999999999999e-47  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.655915 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2973  LamB/YcsF family protein  42.23 
 
 		 301 aa  187  2e-46  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0191185  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0374  LamB/YcsF family protein  39.37 
 
 		 274 aa  187  2e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.336565 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4727  LamB/YcsF family protein  41.9 
 
 		 254 aa  185  8e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.812327  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4813  LamB/YcsF family protein  41.9 
 
 		 254 aa  185  8e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.297543 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3099  LamB/YcsF family protein  39.22 
 
 		 256 aa  185  8e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.489969 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5112  LamB/YcsF family protein  41.9 
 
 		 254 aa  185  8e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.267702 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3454  LamB/YcsF family protein  39.22 
 
 		 256 aa  184  1.0000000000000001e-45  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2043  LamB/YcsF family protein  39.29 
 
 		 256 aa  184  1.0000000000000001e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.815905 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3086  LamB/YcsF family protein  35.46 
 
 		 253 aa  183  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.621895  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2060  LamB/YcsF family protein  37.9 
 
 		 252 aa  183  2.0000000000000003e-45  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.284201  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0592  LamB/YcsF family protein  39.15 
 
 		 264 aa  184  2.0000000000000003e-45  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0413581  normal  0.62944 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3118  LamB/YcsF family protein  36.25 
 
 		 253 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000358938  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0320  LamB/YcsF family protein  40.71 
 
 		 257 aa  183  3e-45  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0497  LamB/YcsF family protein  38.4 
 
 		 254 aa  182  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5728  LamB/YcsF family protein  39.52 
 
 		 252 aa  182  4.0000000000000006e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.536045  normal  0.717107 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2634  LamB/YcsF family protein  40 
 
 		 254 aa  182  7e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.412357  decreased coverage  0.0000404715 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0099  LamB/YcsF family protein  40.24 
 
 		 254 aa  181  9.000000000000001e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0180068 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0093  LamB/YcsF family protein  42.11 
 
 		 252 aa  181  9.000000000000001e-45  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19260  uncharacterized lactam utilization protein B-like protein  42.11 
 
 		 255 aa  181  1e-44  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1594  LamB/YcsF family protein  38.58 
 
 		 256 aa  181  1e-44  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2808  LamB/YcsF family protein  35.86 
 
 		 253 aa  181  2e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2872  LamB/YcsF family protein  35.86 
 
 		 254 aa  181  2e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2150  LamB/YcsF family protein  35.46 
 
 		 253 aa  181  2e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0608  LamB/YcsF family protein  37.85 
 
 		 253 aa  180  2.9999999999999997e-44  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.329744  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2592  LamB/YcsF family protein  36.47 
 
 		 256 aa  179  2.9999999999999997e-44  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0541  LamB/YcsF family protein  39.68 
 
 		 249 aa  179  2.9999999999999997e-44  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0476  LamB/YcsF family protein  40.8 
 
 		 260 aa  179  4e-44  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.26266  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2770  LamB/YcsF family protein  38.49 
 
 		 299 aa  179  4e-44  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.00407074  hitchhiker  0.0000126458 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5851  LamB/YcsF family protein  35.71 
 
 		 254 aa  179  5.999999999999999e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  decreased coverage  0.00357056  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3100  LamB/YcsF family protein  35.46 
 
 		 253 aa  178  7e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09670  uncharacterized lactam utilization protein B-like protein  40.49 
 
 		 253 aa  177  1e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.673064  normal  0.33099 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1712  LamB/YcsF family protein  37.01 
 
 		 255 aa  177  1e-43  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  decreased coverage  0.00394761  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2880  LamB/YcsF family protein  35.46 
 
 		 253 aa  178  1e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.178795  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3095  LamB/YcsF family protein  35.46 
 
 		 253 aa  178  1e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1696  LamB/YcsF family protein  38 
 
 		 250 aa  177  2e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2401  LamB/YcsF family protein  39.3 
 
 		 258 aa  177  2e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3558  LamB/YcsF family protein  41.83 
 
 		 255 aa  177  2e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.455471  normal  0.87063 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1526  LamB/YcsF family protein  37.01 
 
 		 255 aa  177  2e-43  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1662  LamB/YcsF family protein  38 
 
 		 250 aa  177  2e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2198  LamB/YcsF family protein  40.62 
 
 		 250 aa  176  3e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.929247  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1948  LamB/YcsF family protein  37.05 
 
 		 251 aa  176  3e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000410312  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0313  LamB/YcsF family protein  39.84 
 
 		 249 aa  176  4e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1504  LamB/YcsF family protein  38.13 
 
 		 262 aa  176  5e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1451  LamB/YcsF family protein  40.16 
 
 		 252 aa  176  5e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1899  LamB/YcsF family protein  36.61 
 
 		 255 aa  175  9e-43  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0902  LamB/YcsF family protein  41.73 
 
 		 255 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.773139  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0519  LamB/YcsF family protein  39.61 
 
 		 256 aa  173  1.9999999999999998e-42  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0807  hypothetical protein  39.11 
 
 		 247 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0535  LamB/YcsF family protein  39.29 
 
 		 256 aa  174  1.9999999999999998e-42  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.884685  normal  0.0105482 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2338  LamB/YcsF family protein  37.98 
 
 		 256 aa  173  2.9999999999999996e-42  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>