More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_2421 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009485  BBta_2421  putative ABC spermidine/putrescine transporter permease protein  100 
 
 
291 aa  568  1e-161  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3162  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.22 
 
 
282 aa  207  2e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0280655 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3517  ABC polyamine/opine transporter, inner membrane subunit  42.22 
 
 
282 aa  207  2e-52  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0497  spermidine/putrescine ABC transporter permease  43.43 
 
 
288 aa  198  7.999999999999999e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.157918  normal  0.264404 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7194  ABC transporter permease  41.64 
 
 
293 aa  196  5.000000000000001e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3638  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.85 
 
 
291 aa  195  7e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.50975 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8491  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.53 
 
 
288 aa  191  9e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.251225  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4044  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.87 
 
 
283 aa  185  6e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.341213  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3745  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.47 
 
 
299 aa  181  1e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.807342  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4262  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40 
 
 
593 aa  181  1e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4323  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.15 
 
 
284 aa  180  2e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.125571  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0864  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.06 
 
 
308 aa  176  5e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0858  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.57 
 
 
308 aa  172  3.9999999999999995e-42  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.895819  normal 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8305  ABC transporter membrane spanning protein (mannopine)  35.19 
 
 
285 aa  171  1e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5049  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.5 
 
 
283 aa  171  2e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6501  ABC transporter permease  37.31 
 
 
285 aa  170  3e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.126106  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1480  ABC transporter, permease protein  35.29 
 
 
276 aa  169  6e-41  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00172714  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2818  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.15 
 
 
293 aa  166  4e-40  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.913053 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3045  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.76 
 
 
331 aa  165  9e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2812  ABC spermidine/putrescine transporter, inner membrane subunit  37.34 
 
 
328 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2804  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.52 
 
 
299 aa  164  1.0000000000000001e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.22661  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2992  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.43 
 
 
328 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6067  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.53 
 
 
323 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7681  ABC spermidine/putrescine transporter, inner membrane subunit  40.87 
 
 
297 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.962209  normal  0.12531 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6347  ABC spermidine/putrescine transporter, inner membrane subunit  37.34 
 
 
328 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2384  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.76 
 
 
328 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.833701  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3017  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.76 
 
 
328 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2998  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.76 
 
 
328 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.131392  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3395  ABC opine/polyamine transporter, inner membrane subunit  37.83 
 
 
290 aa  163  3e-39  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.445606  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3040  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.83 
 
 
290 aa  163  3e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.662155  normal  0.855546 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2907  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.93 
 
 
331 aa  163  4.0000000000000004e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2485  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.3 
 
 
283 aa  163  4.0000000000000004e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0734345  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1950  putrescine ABC transporter, permease protein  38.89 
 
 
326 aa  162  4.0000000000000004e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.443162  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0724  putrescine ABC transporter, permease protein PotH  38.46 
 
 
326 aa  162  8.000000000000001e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0632  putrescine ABC transporter, permease protein PotH  38.46 
 
 
326 aa  162  8.000000000000001e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0371718  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2018  putrescine ABC transport system, permease protein  38.46 
 
 
326 aa  161  1e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3605  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.96 
 
 
295 aa  161  1e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0391464 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1787  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.2 
 
 
669 aa  161  1e-38  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4438  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.39 
 
 
296 aa  160  2e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2578  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.29 
 
 
283 aa  160  3e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.946532  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1937  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.63 
 
 
606 aa  160  3e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1508  ABC spermidine/putrescine transporter, inner membrane subunit  40 
 
 
301 aa  159  4e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0734046  normal  0.0460711 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0938  ABC putrescine transporter, inner membrane subunit PotH  36.63 
 
 
324 aa  158  9e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.123183  normal  0.465808 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4662  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.63 
 
 
324 aa  158  9e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.93633  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4154  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.34 
 
 
296 aa  158  9e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.700172  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3242  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  39.19 
 
 
314 aa  158  1e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.549497  normal  0.829711 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5507  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.03 
 
 
299 aa  158  1e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0425652 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6629  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.84 
 
 
301 aa  158  1e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.125858  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3863  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35 
 
 
306 aa  157  2e-37  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0668504  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2375  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.4 
 
 
304 aa  156  3e-37  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.113051  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1648  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.57 
 
 
274 aa  156  3e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.301683 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6152  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.3 
 
 
301 aa  156  4e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4673  putrescine ABC transporter, permease protein  32.55 
 
 
317 aa  156  5.0000000000000005e-37  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3448  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.38 
 
 
298 aa  155  6e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.420206 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3231  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.82 
 
 
287 aa  155  7e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2278  putrescine ABC transporter, permease protein  35.07 
 
 
309 aa  155  7e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0728081  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0785  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.67 
 
 
313 aa  155  8e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.361491  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2090  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.23 
 
 
305 aa  155  9e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.394579  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4729  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.18 
 
 
326 aa  155  9e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.264999  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3634  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.18 
 
 
326 aa  155  9e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.350151 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5048  ABC spermidine/putrescine transporter, inner membrane subunit  34.44 
 
 
308 aa  154  1e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.145296  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2097  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.63 
 
 
313 aa  155  1e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.036296  normal  0.0908673 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2666  spermidine/putrescine ABC transporter, permease protein, putative  38.27 
 
 
284 aa  154  2e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0393724  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6248  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.31 
 
 
291 aa  154  2e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.358621 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2400  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  37.6 
 
 
318 aa  154  2e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0272456  normal  0.898727 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4418  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.45 
 
 
290 aa  154  2e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.62757  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7051  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.26 
 
 
290 aa  154  2e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.14054 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1016  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  34.24 
 
 
330 aa  153  2.9999999999999998e-36  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.725697  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3235  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.71 
 
 
274 aa  153  2.9999999999999998e-36  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0620959  normal  0.806351 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1952  ABC polyamine transporter, inner membrane subunit  34.44 
 
 
309 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00258406  normal  0.610972 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1765  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.61 
 
 
308 aa  153  4e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.806732 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4378  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35 
 
 
305 aa  153  4e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6330  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.61 
 
 
308 aa  153  4e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.508263  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2367  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.83 
 
 
597 aa  153  4e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1749  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.61 
 
 
308 aa  153  4e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3815  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.64 
 
 
305 aa  152  5e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.972091  normal  0.192229 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2307  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.93 
 
 
309 aa  152  5e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.622  normal  0.150857 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1200  spermidine/putrescine ABC transporter permease  32.45 
 
 
282 aa  152  5.9999999999999996e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.163674  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1298  spermidine/putrescine ABC transporter permease  32.45 
 
 
282 aa  152  5.9999999999999996e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1011  binding-protein-dependent transporter inner membrane component  35.82 
 
 
289 aa  152  5.9999999999999996e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.263438 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1670  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.1 
 
 
309 aa  152  5.9999999999999996e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0925484  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1673  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.1 
 
 
309 aa  152  5.9999999999999996e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4994  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.08 
 
 
290 aa  152  7e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1262  ABC-type spermidine/putrescine transport system  38.07 
 
 
322 aa  152  7e-36  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0312  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.32 
 
 
303 aa  152  7e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.696873  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0595  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.09 
 
 
413 aa  152  7e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0354  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.05 
 
 
305 aa  151  1e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0181159  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8171  ABC transporter membrane spanning protein  37.6 
 
 
289 aa  151  1e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.123234  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2707  ABC transporter membrane spanning protein (mannopine)  35.06 
 
 
259 aa  151  1e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.139329  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6001  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.93 
 
 
290 aa  151  1e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0489699  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2914  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.39 
 
 
278 aa  151  1e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1511  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.65 
 
 
309 aa  151  1e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.35956 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0348  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.71 
 
 
302 aa  150  2e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4430  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.96 
 
 
304 aa  150  2e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.119366  normal  0.546229 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3521  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.97 
 
 
296 aa  150  2e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.248217 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5402  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  34.32 
 
 
306 aa  150  2e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.434189  decreased coverage  0.000259931 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2860  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.53 
 
 
305 aa  150  3e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.055919  normal  0.0738554 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2581  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.04 
 
 
274 aa  150  3e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000217072  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3648  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.09 
 
 
288 aa  150  3e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4698  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.31 
 
 
418 aa  150  3e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>