More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_2321 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_2321  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  100 
 
 		 367 aa  743    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4368  A/G-specific adenine glycosylase  79.5 
 
 		 371 aa  560  1e-158  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.357853  normal  0.0220919 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1199  A/G-specific adenine glycosylase  81.1 
 
 		 376 aa  548  1e-155  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4978  A/G-specific adenine glycosylase  78.96 
 
 		 349 aa  536  1e-151  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.183286  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1070  A/G-specific adenine glycosylase  78.35 
 
 		 357 aa  531  1e-150  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3227  A/G-specific adenine glycosylase  76.42 
 
 		 392 aa  524  1e-148  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.599367  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2605  A/G-specific adenine glycosylase MutY  73.14 
 
 		 415 aa  519  1e-146  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.443886  normal  0.21931 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0718  A/G-specific adenine glycosylase  59.02 
 
 		 464 aa  397  1e-109  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.912653  normal  0.826443 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7652  A/G-specific adenine glycosylase  62.54 
 
 		 405 aa  394  1e-108  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.448296  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3375  A/G-specific adenine glycosylase  62.03 
 
 		 404 aa  393  1e-108  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.421743  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1172  A/G-specific adenine glycosylase  62.64 
 
 		 355 aa  391  1e-107  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.491873  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3180  A/G-specific adenine glycosylase  59.72 
 
 		 441 aa  390  1e-107  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.91893  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3504  A/G-specific adenine glycosylase  59.44 
 
 		 441 aa  389  1e-107  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.578262 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6939  A/G-specific adenine glycosylase  61.36 
 
 		 405 aa  382  1e-105  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0201229 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0765  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  61.11 
 
 		 374 aa  375  1e-103  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1092  A/G-specific adenine glycosylase  55.52 
 
 		 388 aa  370  1e-101  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1600  A/G-specific adenine glycosylase  60.65 
 
 		 359 aa  368  1e-100  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.05241 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0701  A/G-specific adenine glycosylase  55.71 
 
 		 615 aa  360  1e-98  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0292905  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0748  A/G-specific adenine glycosylase  58.24 
 
 		 383 aa  361  1e-98  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.247553  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0493  A/G-specific adenine glycosylase  54.89 
 
 		 358 aa  353  4e-96  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0497  A/G-specific adenine glycosylase  54.6 
 
 		 358 aa  352  8e-96  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.248511  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0652  A/G-specific adenine glycosylase  54.96 
 
 		 365 aa  352  8e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.88939  normal  0.228228 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0707  A/G-specific adenine glycosylase  54.44 
 
 		 367 aa  348  9e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0262508  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0543  A/G-specific adenine glycosylase  53.78 
 
 		 370 aa  341  9e-93  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.158225  normal  0.629341 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0607  A/G-specific adenine glycosylase  51.99 
 
 		 364 aa  335  5e-91  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2195  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  52.91 
 
 		 350 aa  333  3e-90  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.591242 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0117  A/G-specific adenine glycosylase  54.52 
 
 		 367 aa  325  9e-88  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.571395  normal  0.180189 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1466  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  54.52 
 
 		 367 aa  325  1e-87  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3251  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  56.34 
 
 		 359 aa  323  3e-87  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4690  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  54.73 
 
 		 344 aa  318  1e-85  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.036705  normal  0.270203 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0414  A/G-specific adenine glycosylase  48.12 
 
 		 350 aa  308  9e-83  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0064  A/G-specific adenine glycosylase  53.06 
 
 		 369 aa  306  4.0000000000000004e-82  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.211405  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2032  A/G-specific adenine glycosylase  54.18 
 
 		 354 aa  303  2.0000000000000002e-81  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0489232  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0960  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  50.88 
 
 		 359 aa  295  1e-78  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.446889  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2097  HhH-GPD family protein  52.52 
 
 		 328 aa  295  1e-78  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.291413 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0395  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  49.86 
 
 		 345 aa  293  3e-78  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.491407 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2645  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  51.32 
 
 		 353 aa  293  4e-78  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1502  HhH-GPD family protein  51.45 
 
 		 347 aa  290  3e-77  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4368  A/G-specific adenine glycosylase  52.31 
 
 		 350 aa  287  2e-76  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.468133 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0028  A/G-specific adenine glycosylase  51.01 
 
 		 364 aa  276  4e-73  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.598212  normal  0.0354214 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2266  HhH-GPD  49.13 
 
 		 333 aa  276  6e-73  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1923  A/G-specific adenine glycosylase  42.61 
 
 		 383 aa  261  1e-68  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.417542  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6127  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  43.66 
 
 		 368 aa  249  4e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.201611  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2808  A/G-specific adenine glycosylase  43.38 
 
 		 368 aa  249  7e-65  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.964349 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0322  A/G-specific adenine glycosylase  44.77 
 
 		 352 aa  248  1e-64  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000137419  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2183  A/G-specific adenine glycosylase  43.38 
 
 		 368 aa  248  1e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0602702  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2797  A/G-specific adenine glycosylase  43.38 
 
 		 368 aa  248  1e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0480  A/G-specific adenine glycosylase  43.55 
 
 		 368 aa  246  4e-64  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0518  A/G-specific adenine glycosylase  43.42 
 
 		 370 aa  246  4.9999999999999997e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.851283  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0320  A/G-specific adenine glycosylase  42.41 
 
 		 369 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4128  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  42.45 
 
 		 375 aa  243  3e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0903  A/G-specific adenine glycosylase  39.52 
 
 		 386 aa  239  8e-62  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.98471  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0575  A/G-specific adenine glycosylase  42.69 
 
 		 368 aa  238  2e-61  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.424229  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0591  A/G-specific adenine glycosylase  42.69 
 
 		 368 aa  238  2e-61  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.677062  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2733  A/G-specific adenine glycosylase  37.22 
 
 		 388 aa  236  3e-61  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.610696  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3114  A/G-specific adenine glycosylase  42.41 
 
 		 368 aa  236  4e-61  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1508  A/G-specific adenine glycosylase  42.41 
 
 		 368 aa  236  4e-61  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.198974  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0082  A/G-specific adenine glycosylase  42.41 
 
 		 368 aa  236  4e-61  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2936  A/G-specific adenine glycosylase  42.41 
 
 		 368 aa  236  4e-61  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0759  A/G-specific adenine glycosylase  42.41 
 
 		 368 aa  236  6e-61  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0590  A/G-specific adenine glycosylase  41.43 
 
 		 353 aa  236  6e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.123434  decreased coverage  0.000793491 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0930  hypothetical protein  39.87 
 
 		 355 aa  234  2.0000000000000002e-60  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3062  A/G-specific adenine glycosylase  36.55 
 
 		 352 aa  233  6e-60  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.839676  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1764  A/G-specific adenine glycosylase  37.85 
 
 		 360 aa  232  6e-60  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0960  hypothetical protein  39.56 
 
 		 355 aa  231  1e-59  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4529  A/G-specific adenine glycosylase  36.05 
 
 		 363 aa  231  1e-59  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.593144 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0423  A/G-specific adenine glycosylase  42.37 
 
 		 382 aa  230  3e-59  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3059  A/G-specific adenine glycosylase  36.26 
 
 		 352 aa  230  3e-59  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0673  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  38.6 
 
 		 360 aa  229  8e-59  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.21066  normal  0.501858 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0256  A/G-specific adenine glycosylase  40.69 
 
 		 382 aa  228  1e-58  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4181  A/G-specific adenine glycosylase  38.48 
 
 		 386 aa  228  1e-58  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.215625  normal  0.631474 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2945  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  43.83 
 
 		 348 aa  228  2e-58  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0064  A/G-specific adenine glycosylase  37.68 
 
 		 435 aa  225  9e-58  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0522  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  43.93 
 
 		 353 aa  224  1e-57  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.000130755  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0503  A/G-specific adenine glycosylase  37.61 
 
 		 365 aa  224  1e-57  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4265  adenine DNA glycosylase  40.49 
 
 		 350 aa  224  2e-57  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.528078  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0578  A/G-specific adenine glycosylase  37.39 
 
 		 365 aa  224  2e-57  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000608246  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0491  A/G-specific adenine glycosylase  37.61 
 
 		 365 aa  224  2e-57  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000144393  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0434  A/G-specific adenine glycosylase  37.61 
 
 		 365 aa  224  2e-57  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  3.07824e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0430  A/G-specific adenine glycosylase  37.61 
 
 		 365 aa  224  2e-57  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000000440987  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0522  A/G-specific adenine glycosylase  37.61 
 
 		 365 aa  224  2e-57  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0115272  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3307  adenine DNA glycosylase  40.49 
 
 		 360 aa  224  2e-57  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0064  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  40.82 
 
 		 345 aa  224  3e-57  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000461825  normal  0.645907 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3394  adenine DNA glycosylase  40.18 
 
 		 360 aa  223  3e-57  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02791  adenine DNA glycosylase  40.49 
 
 		 350 aa  223  4e-57  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0610871  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0734  A/G-specific adenine glycosylase  40.49 
 
 		 350 aa  223  4e-57  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02754  hypothetical protein  40.49 
 
 		 350 aa  223  4e-57  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0736099  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0076  A/G-specific adenine glycosylase  40.63 
 
 		 354 aa  223  4e-57  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.80443  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0753  adenine DNA glycosylase  40.49 
 
 		 350 aa  223  4e-57  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.852915  normal  0.0133097 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3122  adenine DNA glycosylase  40.49 
 
 		 360 aa  223  4e-57  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0443  A/G-specific adenine glycosylase  39.14 
 
 		 364 aa  223  4.9999999999999996e-57  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0439  A/G-specific adenine glycosylase  37 
 
 		 365 aa  223  4.9999999999999996e-57  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000718891  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0577  A/G-specific adenine glycosylase  37.61 
 
 		 365 aa  223  4.9999999999999996e-57  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000193741  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0212  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  39.66 
 
 		 368 aa  223  4.9999999999999996e-57  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.880726  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0234  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  42.17 
 
 		 365 aa  223  4.9999999999999996e-57  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3274  adenine DNA glycosylase  39.23 
 
 		 350 aa  222  8e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3453  adenine DNA glycosylase  39.23 
 
 		 350 aa  222  9.999999999999999e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.849569 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0337  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  42.21 
 
 		 355 aa  221  9.999999999999999e-57  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.625053  normal  0.0756352 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0443  A/G-specific adenine glycosylase  43.19 
 
 		 359 aa  221  9.999999999999999e-57  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3284  adenine DNA glycosylase  39.23 
 
 		 350 aa  222  9.999999999999999e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.587115  normal  0.0228526 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>