More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_2259 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009485  BBta_2259  putative glycosyl transferase  100 
 
 
313 aa  633  1e-180  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4238  glycosyl transferase family protein  79.47 
 
 
332 aa  503  1e-141  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.440412  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1592  glycosyl transferase family protein  78.1 
 
 
346 aa  492  9.999999999999999e-139  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0866  glycosyl transferase family protein  66.56 
 
 
327 aa  410  1e-113  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0256  glycosyl transferase family protein  65.89 
 
 
317 aa  377  1e-104  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.759794  normal  0.0678648 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2299  glycosyl transferase family protein  58.61 
 
 
332 aa  377  1e-103  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.705135  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16010  Glycosyl transferase, family 2  59.14 
 
 
322 aa  358  5e-98  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.000000647727  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0549  glycosyl transferase family protein  61.24 
 
 
321 aa  352  4e-96  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  unclonable  0.00000233931  normal  0.956589 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0021  glycosyl transferase family 2  56.58 
 
 
330 aa  346  3e-94  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2940  glycosyl transferase family protein  57.61 
 
 
318 aa  346  3e-94  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4209  glycosyl transferase family 2  53.57 
 
 
346 aa  335  3.9999999999999995e-91  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.220629 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0173  glycosyl transferase family 2  56.95 
 
 
325 aa  334  1e-90  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0585  glycosyl transferase family protein  58.9 
 
 
310 aa  327  2.0000000000000001e-88  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3000  glycosyl transferase family 2  61.51 
 
 
330 aa  325  4.0000000000000003e-88  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4546  glycosyl transferase family 2  51.45 
 
 
335 aa  311  1e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.947898  normal  0.992745 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4442  glycosyl transferase family 2  53.75 
 
 
314 aa  310  2e-83  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.302046 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4380  glycosyl transferase family 2  53.75 
 
 
314 aa  310  2e-83  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4281  glycosyl transferase family 2  51.96 
 
 
335 aa  306  2.0000000000000002e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.405999 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0148  succinoglycan biosynthesis protein  51.66 
 
 
334 aa  302  6.000000000000001e-81  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1891  glycosyl transferase family 2  46.46 
 
 
307 aa  286  2.9999999999999996e-76  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0644224  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1245  glycosyl transferase family 2  46.77 
 
 
324 aa  275  7e-73  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.0000000219954  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0843  glycosyl transferase family 2  46.75 
 
 
314 aa  273  2.0000000000000002e-72  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1189  glycosyltransferase, group 2 family protein  46.05 
 
 
310 aa  269  5e-71  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1737  glycosyl transferase family protein  43.73 
 
 
312 aa  252  6e-66  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1566  cell wall membrane glycosyltransferase  47.62 
 
 
314 aa  248  8e-65  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.901523  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1400  glycosyltransferase-like protein  43.33 
 
 
317 aa  230  2e-59  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5439  glycosyl transferase family protein  39.8 
 
 
318 aa  214  1.9999999999999998e-54  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.409954  normal  0.431845 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0532  glycosyl transferase family 2  34.02 
 
 
315 aa  155  1e-36  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.356755  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1259  glycosyl transferase family protein  30.38 
 
 
303 aa  151  2e-35  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1662  glycosyl transferase family protein  34.01 
 
 
308 aa  150  4e-35  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1292  hypothetical protein  31.4 
 
 
309 aa  149  6e-35  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.833177 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0596  dolichol-phosphate mannosyltransferase  35.24 
 
 
305 aa  147  3e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1495  glycosyl transferase family protein  28.81 
 
 
308 aa  145  1e-33  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.025805  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1802  glycosyl transferase family protein  30.23 
 
 
307 aa  143  3e-33  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.319238  normal  0.13058 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2490  glycosyl transferase family 2  34.67 
 
 
344 aa  138  1e-31  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0916  glycosyl transferase family 2  31.79 
 
 
336 aa  135  9.999999999999999e-31  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0696  glycosyl transferase family 2  34.53 
 
 
310 aa  131  1.0000000000000001e-29  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.646152  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2780  glycosyl transferase family 2  32.49 
 
 
319 aa  130  3e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0778  glycosyl transferase family protein  29.29 
 
 
305 aa  126  4.0000000000000003e-28  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.703306  normal  0.211437 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0520  glycosyl transferase family 2  34.23 
 
 
221 aa  121  9.999999999999999e-27  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1537  glycosyl transferase family 2  31.51 
 
 
308 aa  120  3.9999999999999996e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2302  glycosyl transferase family protein  30.07 
 
 
287 aa  109  8.000000000000001e-23  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1061  glycosyl transferase family 2  29.97 
 
 
448 aa  107  3e-22  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0151  histidinol-phosphate phosphatase family protein  32.88 
 
 
410 aa  106  5e-22  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2933  glycosyl transferase family 2  30.9 
 
 
355 aa  104  2e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.175593 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_190  histidinol-phosphate phosphatase protein/glycosyl transferase  32.88 
 
 
410 aa  104  2e-21  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00438992  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3067  glycosyl transferase family protein  27.43 
 
 
394 aa  103  3e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.936306  normal  0.593332 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2124  glycosyl transferase family protein  27.1 
 
 
340 aa  102  1e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5487  glycosyl transferase family 2  29.79 
 
 
394 aa  100  2e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1765  glycosyl transferase family protein  28.76 
 
 
229 aa  100  4e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3168  glycosyl transferase family 2  29.76 
 
 
299 aa  100  5e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.912354  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3586  glycosyl transferase family 2  32.76 
 
 
272 aa  99  8e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0202  histidinol-phosphate phosphatase family protein/glycosyl transferase, group 2 family protein  32.43 
 
 
410 aa  98.2  1e-19  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.631531  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4222  glycosyl transferase family protein  28.86 
 
 
420 aa  97.8  2e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0451  glycosyl transferase family protein  29.17 
 
 
414 aa  96.7  4e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.252184  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1077  glycosyl transferase family protein  27.67 
 
 
298 aa  97.1  4e-19  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.273313  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2117  glycosyl transferase family protein  26.87 
 
 
304 aa  96.3  6e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.322002  normal  0.308153 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2273  glycosyl transferase family 2  28.46 
 
 
295 aa  95.5  1e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1913  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  27.74 
 
 
382 aa  94.4  2e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0660  glycosyl transferase family 2  30.4 
 
 
414 aa  94.4  2e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.77196  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02590  Glycosyl transferase, family 2  28.04 
 
 
328 aa  94.7  2e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.105398  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0430  glycosyl transferase family 2  30.47 
 
 
301 aa  93.6  3e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0400  glycosyl transferase family protein  28.15 
 
 
344 aa  93.2  5e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.156434  normal  0.0492083 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3898  glycosyl transferase family 2  28.4 
 
 
285 aa  92  1e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1727  glycosyl transferase family protein  27.66 
 
 
329 aa  92  1e-17  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.350304  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0794  glycosyl transferase family 2  28.42 
 
 
291 aa  91.3  2e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0447  glycosyl transferase family 2  31.44 
 
 
284 aa  91.3  2e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.397578  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7655  putative glycosyltransferase  29.82 
 
 
276 aa  90.9  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0478  glycosyl transferase family protein  28.83 
 
 
371 aa  91.3  2e-17  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001053  glycosyltransferase  25.74 
 
 
333 aa  90.9  3e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.110978  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0589  glycosyl transferase family protein  27.23 
 
 
226 aa  90.1  4e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0818  glycosyl transferase family 2  28.81 
 
 
411 aa  90.1  5e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2396  glycosyl transferase family protein  28.92 
 
 
313 aa  89.4  7e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5098  glycosyl transferase family protein  27.27 
 
 
336 aa  88.2  1e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2674  family 2 glycosyl transferase  30.8 
 
 
285 aa  88.6  1e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.49432  normal  0.387912 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2676  glycosyl transferase family protein  29.51 
 
 
282 aa  87.8  2e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.305044  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0214  glycosyl transferase family protein  28.78 
 
 
378 aa  87.8  2e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.840225  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0341  glycosyl transferase family protein  29.2 
 
 
302 aa  87.8  2e-16  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3771  glycosyl transferase family protein  29.31 
 
 
238 aa  87.8  2e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6738  glycosyl transferase family 2  31.11 
 
 
257 aa  87.4  3e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0240271  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6872  glycosyl transferase family 2  29.02 
 
 
266 aa  87.4  3e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4293  glycosyl transferase family protein  28.02 
 
 
531 aa  87  3e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1579  glycosyl transferase family protein  31.25 
 
 
287 aa  86.3  7e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.21948  normal  0.274424 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4444  glycosyl transferase family protein  28.29 
 
 
519 aa  85.9  8e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3099  glycosyl transferase family protein  28.64 
 
 
232 aa  85.9  8e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000071788  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0043  glycosyl transferase family protein  27.27 
 
 
231 aa  85.9  9e-16  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.803192  hitchhiker  0.000270685 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3136  glycosyl transferase family protein  26.87 
 
 
305 aa  85.9  9e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4518  glycosyl transferase family protein  27.16 
 
 
346 aa  85.1  0.000000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000506598  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3852  glycosyl transferase family protein  32.33 
 
 
271 aa  85.5  0.000000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.228313 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0044  glycosyltransferase  25.97 
 
 
352 aa  84.7  0.000000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000117079  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4432  glycosyl transferase family 2  27.63 
 
 
527 aa  84.7  0.000000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4453  glycosyl transferase family 2  27.63 
 
 
527 aa  85.1  0.000000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2408  glycosyl transferase family 2  27.76 
 
 
293 aa  84.3  0.000000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3480  glycosyl transferase family protein  25.8 
 
 
336 aa  84  0.000000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.324933 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0138  glycosyl transferase family protein  30.73 
 
 
389 aa  84  0.000000000000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.15479  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2557  glycosyl transferase family 2  24.44 
 
 
321 aa  83.6  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3061  glycosyl transferase family protein  34.14 
 
 
480 aa  82.8  0.000000000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0151807  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0087  glycosyl transferase family 2  26.12 
 
 
450 aa  82.8  0.000000000000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7628  glycosyl transferase family 2  26.95 
 
 
306 aa  82.8  0.000000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.325444  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0165  glycosyl transferase family protein  24.53 
 
 
321 aa  82.4  0.000000000000008  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000128177 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>