More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_2170 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_2170  putative thiosulfate sulfurtransferase  100 
 
 		 245 aa  496  1e-139  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0147  rhodanese domain-containing protein  54.58 
 
 		 263 aa  250  1e-65  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.102174  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1220  Rhodanese domain protein  53.45 
 
 		 260 aa  229  3e-59  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000562605 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1502  ankyrin repeat protein/rhodanese-like domain protein  53.45 
 
 		 260 aa  229  3e-59  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48690  Rhodanese-like protein with Ankyrin repeat  47.41 
 
 		 261 aa  207  1e-52  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1461  ankyrin repeat-containing protein  50.64 
 
 		 258 aa  207  1e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00626856 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2350  ankyrin  50 
 
 		 255 aa  200  9.999999999999999e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0469  rhodanese domain-containing protein  47.66 
 
 		 272 aa  190  2e-47  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.596122 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2117  rhodanese-like domain/ankyrin repeat-containing protein  45.34 
 
 		 254 aa  185  5e-46  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1423  ankyrin  50.99 
 
 		 152 aa  142  7e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.853849 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2101  Ankyrin  42.57 
 
 		 153 aa  129  4.0000000000000003e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000501004 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3944  ankyrin  40.13 
 
 		 174 aa  109  5e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0207728 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1462  ankyrin repeat-containing protein  45.51 
 
 		 196 aa  106  3e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00626856 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0470  rhodanese domain-containing protein  57.14 
 
 		 656 aa  105  8e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.468272  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2348  ankyrin  41.84 
 
 		 149 aa  94.7  1e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.614743  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7751  ankyrin  41.36 
 
 		 196 aa  94  2e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.493999  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0063  thiosulfate sulfurtransferase  51.22 
 
 		 106 aa  91.3  1e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0289  Thiosulfate sulfurtransferase  50.63 
 
 		 106 aa  89.7  4e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1458  rhodanese-like protein  50 
 
 		 108 aa  86.7  4e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3931  Thiosulfate sulfurtransferase  48.05 
 
 		 107 aa  84  0.000000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0923  rhodanese-like protein  45.45 
 
 		 110 aa  82.4  0.000000000000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0562249  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0701  thiosulfate sulfurtransferase GlpE  41.67 
 
 		 107 aa  81.6  0.00000000000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  3.6297700000000005e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1435  hypothetical protein  40 
 
 		 1585 aa  81.3  0.00000000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.015567 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5138  thiosulfate sulfurtransferase  45 
 
 		 109 aa  80.9  0.00000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.945855  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3940  rhodanese domain-containing protein  50 
 
 		 102 aa  80.5  0.00000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00983264  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4128  Thiosulfate sulfurtransferase  45.45 
 
 		 107 aa  80.1  0.00000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.801099  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0429  thiosulfate sulfurtransferase  45 
 
 		 110 aa  79.7  0.00000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0835156  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1048  rhodanese domain-containing protein  40.48 
 
 		 106 aa  79.3  0.00000000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00818929  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0398  thiosulfate sulfurtransferase  42.86 
 
 		 110 aa  79  0.00000000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0432  thiosulfate sulfurtransferase  42.86 
 
 		 110 aa  79  0.00000000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.822865  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0099  rhodanese domain-containing protein  47.3 
 
 		 102 aa  78.6  0.00000000000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.973774  normal  0.0985137 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0063  rhodanese domain-containing protein  48.65 
 
 		 102 aa  78.6  0.00000000000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00465337  unclonable  0.0000000104645 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4342  rhodanese domain-containing protein  47.3 
 
 		 101 aa  78.2  0.0000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00306912  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4482  rhodanese domain-containing protein  47.3 
 
 		 101 aa  78.2  0.0000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0767225  normal  0.0196392 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4287  Rhodanese domain protein  47.3 
 
 		 101 aa  78.2  0.0000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.137948  hitchhiker  0.000000372785 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3903  rhodanese domain-containing protein  47.3 
 
 		 123 aa  77.8  0.0000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00219695  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0056  rhodanese domain-containing protein  47.3 
 
 		 101 aa  78.2  0.0000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000464911  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2151  Ankyrin  37.33 
 
 		 490 aa  78.6  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.712677 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07690  thiosulfate sulfurtransferase  41.46 
 
 		 110 aa  77.8  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0582831 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2899  thiosulfate sulfurtransferase  44.59 
 
 		 107 aa  78.2  0.0000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.105523  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4016  thiosulfate sulfurtransferase  43.04 
 
 		 109 aa  77  0.0000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0229  Thiosulfate sulfurtransferase  41.56 
 
 		 106 aa  76.6  0.0000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.369653  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2896  ankyrin-related protein  35.46 
 
 		 346 aa  76.6  0.0000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3711  rhodanese domain-containing protein  45.95 
 
 		 101 aa  75.9  0.0000000000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00389658  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0105  rhodanese domain-containing protein  45.95 
 
 		 102 aa  75.5  0.0000000000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.294035  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3902  rhodanese domain-containing protein  45.95 
 
 		 101 aa  75.1  0.0000000000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000421055  normal  0.492067 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3994  rhodanese domain-containing protein  45.95 
 
 		 101 aa  75.1  0.0000000000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000232889  normal  0.0196861 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4106  rhodanese domain-containing protein  45.95 
 
 		 101 aa  75.1  0.0000000000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000617215  normal  0.479241 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4638  thiosulfate sulfurtransferase  42.86 
 
 		 108 aa  74.7  0.000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3807  thiosulfate sulfurtransferase  41.77 
 
 		 108 aa  73.9  0.000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03276  thiosulfate sulfurtransferase  41.77 
 
 		 108 aa  73.9  0.000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.757846  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0289  Rhodanese domain protein  41.77 
 
 		 108 aa  73.9  0.000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3901  thiosulfate sulfurtransferase  41.77 
 
 		 108 aa  73.9  0.000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03228  hypothetical protein  41.77 
 
 		 108 aa  73.9  0.000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.801313  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0458  Ankyrin  40.34 
 
 		 161 aa  74.3  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.510961  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3622  thiosulfate sulfurtransferase  41.77 
 
 		 108 aa  73.9  0.000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4672  glpE protein  45.95 
 
 		 101 aa  74.3  0.000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1484  hypothetical protein  37.9 
 
 		 790 aa  73.9  0.000000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002142  thiosulfate sulfurtransferase GlpE  46.15 
 
 		 106 aa  74.3  0.000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000271125  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4733  thiosulfate sulfurtransferase  41.77 
 
 		 108 aa  73.9  0.000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46860  thiosulfate sulfurtransferase  42.86 
 
 		 112 aa  74.3  0.000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0733  thiosulfate sulfurtransferase  41.03 
 
 		 110 aa  73.9  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00276  thiosulfate sulfurtransferase  45.21 
 
 		 106 aa  73.9  0.000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_5133  predicted protein  42.31 
 
 		 184 aa  73.2  0.000000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.648247  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2416  thiosulfate sulfurtransferase  45.21 
 
 		 106 aa  73.2  0.000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000293751  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1217  hypothetical protein  34.31 
 
 		 1402 aa  73.2  0.000000000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000624156 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3705  thiosulfate sulfurtransferase  41.77 
 
 		 108 aa  73.6  0.000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.155763 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3439  ankyrin  42.52 
 
 		 337 aa  73.6  0.000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.41623  hitchhiker  0.000120862 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0219  Ankyrin  37.1 
 
 		 382 aa  72.8  0.000000000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  1.41533e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0548  rhodanese-like domain protein  39.24 
 
 		 106 aa  72.4  0.000000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0289  thiosulfate sulfurtransferase  40.51 
 
 		 108 aa  72.4  0.000000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0159  thiosulfate sulfurtransferase  42.86 
 
 		 109 aa  72.4  0.000000000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3755  thiosulfate sulfurtransferase  42.86 
 
 		 109 aa  72.4  0.000000000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3995  thiosulfate sulfurtransferase  42.86 
 
 		 109 aa  72.4  0.000000000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2380  hypothetical protein  35.38 
 
 		 305 aa  72  0.000000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.691759  normal  0.155983 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4804  thiosulfate sulfurtransferase  41.56 
 
 		 109 aa  72  0.000000000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.598839  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3834  thiosulfate sulfurtransferase  39.24 
 
 		 110 aa  71.2  0.00000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0925193  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00068  glpE protein  43.59 
 
 		 103 aa  70.5  0.00000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3617  rhodanese-like protein  45.83 
 
 		 102 aa  70.5  0.00000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000690475  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0340  hypothetical protein  31.06 
 
 		 2413 aa  71.2  0.00000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.259192 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0703  hypothetical protein  31.65 
 
 		 762 aa  70.1  0.00000000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0096  glpE protein  43.84 
 
 		 103 aa  70.5  0.00000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00139877  normal  0.0140048 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3653  ankyrin repeat-containing protein  45.13 
 
 		 195 aa  70.1  0.00000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1284  ankyrin  38.79 
 
 		 870 aa  70.1  0.00000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.226002  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4314  ankyrin  40.54 
 
 		 426 aa  68.9  0.00000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.327235  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1865  hypothetical protein  36.21 
 
 		 138 aa  68.9  0.00000000007  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000370925 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4630  thiosulfate sulfurtransferase  37.97 
 
 		 106 aa  67.8  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.432848 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0393  hypothetical protein  38 
 
 		 821 aa  68.6  0.0000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0871  hypothetical protein  31.13 
 
 		 646 aa  67.4  0.0000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.985956 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3726  thiosulfate sulfurtransferase  41.03 
 
 		 108 aa  67.8  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3717  thiosulfate sulfurtransferase  41.03 
 
 		 108 aa  67  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3833  thiosulfate sulfurtransferase  41.03 
 
 		 108 aa  67  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.851697 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3895  thiosulfate sulfurtransferase  41.03 
 
 		 108 aa  67  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3792  thiosulfate sulfurtransferase  41.03 
 
 		 108 aa  67  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.332585  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1071  hypothetical protein  35.19 
 
 		 347 aa  66.6  0.0000000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1000  ankyrin  36.52 
 
 		 494 aa  65.9  0.0000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0337  thiosulfate:cyanide sulfurtransferase (rhodanese)  38.36 
 
 		 100 aa  65.9  0.0000000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0382  ankyrin repeat protein  33.33 
 
 		 891 aa  65.5  0.0000000009  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1244  ankyrin-like protein  37.19 
 
 		 1099 aa  64.7  0.000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0582  ankyrin  37.72 
 
 		 344 aa  64.7  0.000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>