More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_2128 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009485  BBta_2128  putative ABC transporter ATP-binding protein  100 
 
 
516 aa  1022    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1721  ABC transporter related  63.38 
 
 
507 aa  621  1e-177  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0492105  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1905  ABC transporter related  62.98 
 
 
507 aa  617  1e-175  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.308353  normal  0.5938 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4038  ABC transporter related  60.4 
 
 
506 aa  605  9.999999999999999e-173  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0969  ABC transporter related  59.63 
 
 
500 aa  600  1e-170  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4909  ABC transporter related  63.11 
 
 
505 aa  600  1e-170  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.368986  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0148  putative sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  59.76 
 
 
496 aa  595  1e-169  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.361964  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3782  ABC transporter related  59.23 
 
 
500 aa  596  1e-169  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4706  putative sugar ABC transporter, ATP-binding protein  59.43 
 
 
500 aa  597  1e-169  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.706122  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4798  putative sugar ABC transporter, ATP-binding protein  59.23 
 
 
500 aa  594  1e-168  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04097  predicted sugar transporter subunit: ATP-binding component of ABC superfamily  59.03 
 
 
500 aa  593  1e-168  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3765  ABC transporter related protein  59.03 
 
 
500 aa  592  1e-168  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04061  hypothetical protein  59.03 
 
 
500 aa  593  1e-168  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4067  ABC transporter related  59.55 
 
 
496 aa  594  1e-168  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0983  ABC transporter related  58.62 
 
 
501 aa  593  1e-168  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0476  putative sugar ABC transporter periplasmic sugar-binding protein  59.55 
 
 
496 aa  594  1e-168  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.251819  normal  0.0934917 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4482  putative sugar ABC transporter, ATP-binding protein  59.23 
 
 
500 aa  594  1e-168  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4228  ABC transporter related protein  60.37 
 
 
506 aa  592  1e-168  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0413  ABC transporter related  59.03 
 
 
500 aa  594  1e-168  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1417  ABC transporter related  59.55 
 
 
515 aa  583  1.0000000000000001e-165  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.441776  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4767  ABC transporter-related protein  61.24 
 
 
503 aa  579  1e-164  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.883977 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5049  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (ribose)  57.09 
 
 
512 aa  562  1.0000000000000001e-159  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2058  ABC transporter related  52.43 
 
 
499 aa  523  1e-147  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1987  ABC transporter related  52.63 
 
 
500 aa  520  1e-146  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.063033 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1987  ABC transporter related  52.63 
 
 
499 aa  520  1e-146  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.479214  hitchhiker  0.000308121 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1224  ABC transporter related  49.6 
 
 
510 aa  516  1.0000000000000001e-145  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4096  ABC transporter related  54.02 
 
 
525 aa  515  1.0000000000000001e-145  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2148  ABC transporter related  52.32 
 
 
499 aa  516  1.0000000000000001e-145  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.123365  normal  0.259949 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0767  putative sugar uptake ABC transporter ATP-binding protein  54.05 
 
 
501 aa  517  1.0000000000000001e-145  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.162932 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4208  ABC transporter related  54.02 
 
 
525 aa  515  1.0000000000000001e-145  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.577364  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2074  ABC transporter related  52.43 
 
 
499 aa  518  1.0000000000000001e-145  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.144534  hitchhiker  0.0000031172 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6222  sugar ABC transporter ATP-binding protein  56.52 
 
 
503 aa  518  1.0000000000000001e-145  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.597291 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3534  ABC transporter related  50.9 
 
 
523 aa  506  9.999999999999999e-143  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.116696 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2119  ABC transporter related  51.79 
 
 
504 aa  501  1e-140  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.307687  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1854  ABC transporter related  54.14 
 
 
505 aa  494  9.999999999999999e-139  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.99038  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1048  ABC transporter related  53.88 
 
 
506 aa  493  9.999999999999999e-139  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3040  ABC transporter related protein  52.2 
 
 
529 aa  493  9.999999999999999e-139  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0420  ABC transporter related protein  52.98 
 
 
507 aa  486  1e-136  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5626  ABC transporter related  55.42 
 
 
504 aa  486  1e-136  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.000841006  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5991  ABC transporter related  55.42 
 
 
504 aa  486  1e-136  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.122815  normal  0.14883 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6482  ABC transporter related  55.21 
 
 
504 aa  484  1e-135  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.611957  normal  0.251961 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4809  ABC transporter related  53.37 
 
 
549 aa  483  1e-135  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0173038  hitchhiker  0.00297179 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2251  ABC transporter-related protein  54.08 
 
 
511 aa  484  1e-135  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.687423  hitchhiker  0.00000468234 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5925  ABC transporter related  55.01 
 
 
504 aa  479  1e-134  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.737944  normal  0.893001 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6194  ABC transporter related  55.01 
 
 
504 aa  479  1e-134  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.399399  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2343  ATP binding protein of ABC transporter  55.28 
 
 
502 aa  476  1e-133  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5962  ABC transporter related  54.51 
 
 
503 aa  477  1e-133  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0248969 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5517  ABC transporter related  52.77 
 
 
516 aa  476  1e-133  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.422457  normal  0.0683787 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0046  sugar ABC transporter ATPase  49.09 
 
 
513 aa  470  1.0000000000000001e-131  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0138528  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0279  ABC transporter related  49.8 
 
 
526 aa  458  1e-127  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.60123  normal  0.12609 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2025  ABC transporter related  49.6 
 
 
519 aa  456  1e-127  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.770144 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0380  ABC transporter related  47.11 
 
 
544 aa  448  1.0000000000000001e-124  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01030  monosaccharide ABC transporter ATP-binding protein  47.4 
 
 
522 aa  443  1e-123  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4341  ABC sugar transporter, fused ATPase subunits  46.51 
 
 
544 aa  441  9.999999999999999e-123  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.80164 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4739  ABC transporter related  46.76 
 
 
497 aa  439  9.999999999999999e-123  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.383875  hitchhiker  0.00325994 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4365  ABC transporter related  44.34 
 
 
585 aa  411  1e-113  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.309192  normal  0.0851247 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01050  monosaccharide ABC transporter ATP-binding protein  47.59 
 
 
526 aa  400  9.999999999999999e-111  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.552248  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0946  ABC transporter related  47.06 
 
 
499 aa  395  1e-109  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0298167  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1684  ABC transporter related  44.16 
 
 
519 aa  398  1e-109  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.200207  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3330  ABC transporter related protein  41.01 
 
 
497 aa  398  1e-109  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1029  ABC transporter-related protein  41.55 
 
 
506 aa  398  1e-109  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.724261 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3699  ABC transporter related protein  42.25 
 
 
510 aa  390  1e-107  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.92688  normal  0.324088 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0975  ABC transporter related  42.43 
 
 
495 aa  388  1e-106  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000220508  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1986  ABC transporter related  40.16 
 
 
501 aa  382  1e-105  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.437257  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2370  ABC sugar transporter, ATPase subunit  43.33 
 
 
518 aa  380  1e-104  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2010  ABC transporter related  38.99 
 
 
500 aa  380  1e-104  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5245  ABC transporter related  43.93 
 
 
514 aa  380  1e-104  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.835189 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4608  ABC transporter related  42.65 
 
 
519 aa  379  1e-104  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0164  ABC transporter related  38.76 
 
 
496 aa  376  1e-103  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2172  ABC transporter-like  41.06 
 
 
517 aa  376  1e-103  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.327318  normal  0.453102 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0046  L-arabinose transporter ATP-binding protein  44.94 
 
 
522 aa  378  1e-103  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.54995  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0624  ABC sugar transporter, ATPase subunit  44.17 
 
 
512 aa  377  1e-103  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0885  ABC sugar transporter, ATPase subunit  42.36 
 
 
506 aa  375  1e-103  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.533742  normal  0.302538 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3347  ABC transporter related  41.65 
 
 
513 aa  375  1e-103  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0920182  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3328  ABC transporter related  42.92 
 
 
512 aa  376  1e-103  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5601  ribose import ATP-binding protein RbsA  40.28 
 
 
506 aa  378  1e-103  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5039  ABC transporter related  42.92 
 
 
512 aa  376  1e-103  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1508  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  41.1 
 
 
496 aa  377  1e-103  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.106354  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0343  ABC transporter related  41.51 
 
 
497 aa  376  1e-103  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0289  ABC transporter related  40.85 
 
 
506 aa  376  1e-103  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.266417 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1612  ABC transporter related  41.1 
 
 
496 aa  377  1e-103  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4967  ABC transporter related  43.12 
 
 
513 aa  377  1e-103  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1760  ribose ABC transporter ATP-binding protein  41.1 
 
 
496 aa  377  1e-103  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.185473  hitchhiker  0.0000761209 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0411  ABC transporter related  40.98 
 
 
494 aa  375  1e-103  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.046808  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5135  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (ribose)  41.63 
 
 
524 aa  374  1e-102  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.543478  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0634  ribose ABC transporter ATP-binding protein  38.9 
 
 
494 aa  374  1e-102  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.97602  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0578  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  38.9 
 
 
494 aa  374  1e-102  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0577  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  38.9 
 
 
494 aa  374  1e-102  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2687  ABC transporter related  40.63 
 
 
495 aa  374  1e-102  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2929  ABC transporter related  43.72 
 
 
521 aa  374  1e-102  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.180289 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0415  ABC transporter related  40.97 
 
 
503 aa  373  1e-102  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000110391  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0724  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  38.9 
 
 
494 aa  374  1e-102  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.79429e-30 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4589  L-arabinose transporter ATP-binding protein  43.62 
 
 
515 aa  372  1e-102  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00173683 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1344  ABC transporter related  42.56 
 
 
524 aa  372  1e-102  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0501  ABC transporter related  40.8 
 
 
511 aa  375  1e-102  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00548503 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2215  ABC transporter related  43.32 
 
 
509 aa  373  1e-102  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0215537  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2238  ABC transporter related  43.32 
 
 
504 aa  373  1e-102  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1305  ABC transporter related  42.36 
 
 
524 aa  371  1e-101  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4447  ABC transporter related  43.25 
 
 
513 aa  369  1e-101  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00416844 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1425  ABC transporter related  41.56 
 
 
524 aa  369  1e-101  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0484861  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>