More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_2043 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_2043  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 212 aa  419  1e-116  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.632575 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4820  transcriptional regulator, TetR family  27.45 
 
 		 203 aa  80.9  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.353068 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2548  TetR family transcriptional regulator  37.96 
 
 		 236 aa  71.6  0.000000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000000944763  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2751  putative transcriptional regulator, TetR family  38.74 
 
 		 229 aa  67  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0359606 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0543  TetR family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 203 aa  67  0.0000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.889127 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4331  TetR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 220 aa  67  0.0000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1637  transcriptional regulator, TetR family  37.04 
 
 		 227 aa  65.9  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0178246  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1526  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 208 aa  66.2  0.0000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0534186  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4343  transcriptional regulator, TetR family  29.8 
 
 		 225 aa  65.5  0.0000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0349599  decreased coverage  0.000000750918 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0410  TetR family transcriptional regulator  35.54 
 
 		 245 aa  64.3  0.000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.560758  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1093  TetR family transcriptional regulator  26.83 
 
 		 217 aa  63.5  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0694796  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0604  TetR family transcriptional regulator  53.73 
 
 		 205 aa  63.5  0.000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.229279 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2836  transcriptional regulator, TetR family  35.19 
 
 		 207 aa  63.2  0.000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00562159  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0137  transcriptional regulator, TetR family  32.24 
 
 		 217 aa  63.2  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1567  TetR family transcriptional regulator  32.21 
 
 		 261 aa  62.4  0.000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.865657 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3999  regulatory protein, TetR  44.74 
 
 		 258 aa  62.8  0.000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.163281  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2672  TetR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 208 aa  62  0.000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2597  putative transcriptional regulator, TetR family  52.31 
 
 		 195 aa  62  0.000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.607466 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4014  transcriptional regulator, TetR family  28.43 
 
 		 225 aa  61.6  0.000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0829  transcriptional regulator, TetR family  39.47 
 
 		 218 aa  61.2  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0857  transcriptional regulator, TetR family  39.47 
 
 		 218 aa  61.2  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.999415 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1348  transcriptional regulator, TetR family  38.89 
 
 		 218 aa  60.1  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.593778  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0966  transcriptional regulator, TetR family  42.47 
 
 		 218 aa  60.5  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00645846  normal  0.836206 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4307  TetR family transcriptional regulator  33.58 
 
 		 214 aa  60.1  0.00000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.188393  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1770  transcriptional regulator, TetR family  31.72 
 
 		 203 aa  58.9  0.00000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4876  transcriptional regulator, TetR family  47.69 
 
 		 209 aa  58.9  0.00000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.217727  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4869  regulatory protein, TetR  41.18 
 
 		 224 aa  58.5  0.00000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0153  TetR family transcriptional regulator  38.64 
 
 		 205 aa  57.8  0.0000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.10564  normal  0.9984 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1734  TetR family transcriptional regulator  39.73 
 
 		 207 aa  57.8  0.0000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0246488  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00530  transcriptional regulator  43.08 
 
 		 212 aa  57  0.0000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0521  putative transcriptional regulator, TetR family  43.84 
 
 		 215 aa  57  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0880  transcriptional regulator, TetR family  44.93 
 
 		 212 aa  57.4  0.0000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.987052  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2342  regulatory protein, TetR  36.19 
 
 		 216 aa  57  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.391158 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4891  transcriptional regulator, TetR family  29.41 
 
 		 261 aa  57  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.164408  normal  0.287477 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0032  transcriptional regulator, TetR family  36.67 
 
 		 210 aa  56.2  0.0000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4466  transcriptional regulator, TetR family  35.85 
 
 		 204 aa  56.6  0.0000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.575375  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1079  TetR family transcriptional regulator  29.57 
 
 		 215 aa  55.8  0.0000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0143  transcriptional regulator  43.08 
 
 		 264 aa  56.2  0.0000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1369  TetR family transcriptional regulator  33.67 
 
 		 208 aa  56.2  0.0000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2011  transcriptional regulator, TetR family  28.93 
 
 		 213 aa  56.2  0.0000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.27798 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5311  transcriptional regulator, TetR family  40.96 
 
 		 210 aa  55.8  0.0000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2408  transcriptional regulator, TetR family  28.1 
 
 		 239 aa  55.5  0.0000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.616889  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1864  transcriptional regulator, TetR family  28.03 
 
 		 218 aa  55.5  0.0000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.796207  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2956  transcriptional regulator, TetR family  44.83 
 
 		 207 aa  55.1  0.0000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2481  TetR family transcriptional regulator  33.02 
 
 		 231 aa  54.3  0.000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0973  TetR family transcriptional regulator  38.96 
 
 		 199 aa  54.3  0.000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.342069 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3146  TetR family transcriptional regulator  42.03 
 
 		 203 aa  54.3  0.000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.303801  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6770  TetR family transcriptional regulator  41.54 
 
 		 220 aa  54.3  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5420  TetR family transcriptional regulator  33.94 
 
 		 202 aa  54.7  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.66162  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0239  TetR family transcriptional regulator  44.62 
 
 		 229 aa  53.5  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1551  TetR family transcriptional regulator  41.54 
 
 		 221 aa  53.9  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3239  TetR family transcriptional regulator  38.04 
 
 		 234 aa  53.5  0.000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.727709  normal  0.0945396 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3950  TetR family transcriptional regulator  40.51 
 
 		 212 aa  53.5  0.000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.390353  normal  0.629082 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6278  TetR family transcriptional regulator  41.54 
 
 		 221 aa  53.9  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.185779  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0133  transcriptional regulator, TetR family  38.46 
 
 		 218 aa  53.5  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.440249 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4406  TetR family transcriptional regulator  33.67 
 
 		 223 aa  53.1  0.000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.732992  normal  0.0232179 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0235  TetR family transcriptional regulator  31.1 
 
 		 225 aa  53.5  0.000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0571  TetR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 219 aa  53.1  0.000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.22949  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2883  TetR family transcriptional regulator  36.73 
 
 		 211 aa  53.1  0.000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7950  putative transcriptional regulator, TetR family  30.29 
 
 		 218 aa  53.1  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3508  regulatory protein, TetR  33.96 
 
 		 200 aa  53.1  0.000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0988004  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1901  transcriptional regulator, TetR family  37.19 
 
 		 245 aa  53.1  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0306246  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6881  TetR family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 224 aa  52.8  0.000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0734971  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3645  transcriptional regulator, TetR family  31.36 
 
 		 199 aa  52.8  0.000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.529358  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3330  TetR family transcriptional regulator  32.23 
 
 		 225 aa  52.8  0.000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.648103  normal  0.907597 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0661  transcriptional regulator, TetR family  39.8 
 
 		 205 aa  52.4  0.000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0906  transcriptional regulator, TetR family  43.21 
 
 		 232 aa  52.4  0.000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.052988  normal  0.0196 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4218  transcriptional regulator, TetR family  29.85 
 
 		 208 aa  52.4  0.000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.566415  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0314  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 195 aa  52  0.000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0042  TetR family transcriptional regulator  36.46 
 
 		 219 aa  52  0.000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.664551  normal  0.814156 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3185  TetR family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 208 aa  52  0.000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.579993  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001979  transcriptional regulator TetR family  46.15 
 
 		 193 aa  52  0.000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.507988  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3251  TetR family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 219 aa  52  0.000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.831278  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1673  TetR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 216 aa  52  0.000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.947806  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4896  transcriptional regulator, TetR family  35.53 
 
 		 222 aa  51.6  0.000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0167  TetR family transcriptional regulator  37.1 
 
 		 213 aa  51.6  0.000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5711  TetR family transcriptional regulator  29.61 
 
 		 245 aa  51.6  0.000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0249  TetR family transcriptional regulator  31.21 
 
 		 238 aa  51.6  0.000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3170  transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 		 216 aa  51.6  0.000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5098  TetR family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 218 aa  51.6  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.11151 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2762  TetR family transcriptional regulator  37.08 
 
 		 223 aa  51.2  0.00001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0540  TetR family transcriptional regulator  29.47 
 
 		 247 aa  51.2  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000321251  hitchhiker  0.0000104132 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1718  TetR family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 228 aa  50.8  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.114077  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4578  TetR family transcriptional regulator  27.33 
 
 		 238 aa  51.2  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.127543  normal  0.45553 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4713  TetR family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 218 aa  51.6  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1410  TetR family transcriptional regulator  30.65 
 
 		 228 aa  51.2  0.00001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.398203  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4799  TetR family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 218 aa  51.6  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0557  regulatory protein TetR  28.3 
 
 		 251 aa  50.1  0.00002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1058  transcriptional regulator, TetR family  30.83 
 
 		 208 aa  50.4  0.00002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4181  transcriptional regulator, TetR family  27.7 
 
 		 227 aa  50.8  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000221958 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0850  TetR family transcriptional regulator  32.11 
 
 		 209 aa  50.8  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0204358 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2695  transcriptional regulator, TetR family  27.17 
 
 		 185 aa  50.4  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000333836  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1838  TetR family transcriptional regulator  34.52 
 
 		 195 aa  50.8  0.00002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2221  transcriptional regulator, TetR family  48.08 
 
 		 264 aa  50.1  0.00002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.104647  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1778  TetR family transcriptional regulator  29.46 
 
 		 250 aa  50.4  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.677686  unclonable  0.000000000627047 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3540  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 250 aa  50.1  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1825  TetR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 198 aa  50.4  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1458  TetR family transcriptional regulator  29.84 
 
 		 209 aa  50.8  0.00002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.121951 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2527  TetR family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 194 aa  50.4  0.00002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.490074  normal  0.267005 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3457  TetR family transcriptional regulator  37.18 
 
 		 238 aa  50.1  0.00002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>