More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_1850 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012850  Rleg_3346  adenylosuccinate synthetase  70.07 
 
 
432 aa  654    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.474516  hitchhiker  0.00582802 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7581  adenylosuccinate synthetase  75.99 
 
 
430 aa  678    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1627  adenylosuccinate synthetase  69.93 
 
 
533 aa  636    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2616  adenylosuccinate synthetase  70.3 
 
 
432 aa  651    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.199466  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1850  adenylosuccinate synthetase  100 
 
 
430 aa  874    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0999  adenylosuccinate synthase  74.59 
 
 
448 aa  658    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.595096  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6845  adenylosuccinate synthase  75.99 
 
 
430 aa  676    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2965  adenylosuccinate synthetase  84.88 
 
 
430 aa  764    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.125391  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0940  Adenylosuccinate synthase  74.59 
 
 
430 aa  654    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0037  adenylosuccinate synthetase  74.01 
 
 
448 aa  675    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.505248  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4774  adenylosuccinate synthetase  87.21 
 
 
430 aa  775    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.114501  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1330  adenylosuccinate synthetase  90 
 
 
430 aa  800    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.396862  normal  0.220841 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1007  Adenylosuccinate synthase  75.06 
 
 
431 aa  657    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0196756 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4086  adenylosuccinate synthetase  89.3 
 
 
430 aa  790    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0852587 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0262  adenylosuccinate synthase  74.36 
 
 
431 aa  647    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3894  adenylosuccinate synthetase  89.3 
 
 
430 aa  798    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.108834  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1123  adenylosuccinate synthetase  85.12 
 
 
457 aa  766    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.565795  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5638  adenylosuccinate synthase  76.22 
 
 
430 aa  687    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.171619  normal  0.25149 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0962  Adenylosuccinate synthase  74.83 
 
 
430 aa  659    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.470264  normal  0.45689 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2144  adenylosuccinate synthase  69 
 
 
430 aa  635    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3159  adenylosuccinate synthetase  71 
 
 
432 aa  656    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3544  adenylosuccinate synthetase  69.84 
 
 
432 aa  644    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3089  adenylosuccinate synthetase  69.61 
 
 
432 aa  651    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.126084  normal  0.070043 
 
 
-
 
NC_004310  BR1683  adenylosuccinate synthetase  69.93 
 
 
429 aa  633  1e-180  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.469628  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1231  adenylosuccinate synthetase  69.7 
 
 
429 aa  630  1e-179  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1106  adenylosuccinate synthetase  68.93 
 
 
429 aa  622  1e-177  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0875  adenylosuccinate synthetase  68.53 
 
 
430 aa  623  1e-177  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0366  adenylosuccinate synthetase  67.83 
 
 
430 aa  620  1e-176  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2010  adenylosuccinate synthetase  67.83 
 
 
430 aa  620  1e-176  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.34638  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0603  adenylosuccinate synthetase  66.36 
 
 
430 aa  608  1e-173  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0285  adenylosuccinate synthetase  67.76 
 
 
429 aa  609  1e-173  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4682  adenylosuccinate synthetase  67.99 
 
 
429 aa  605  9.999999999999999e-173  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.616105 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2742  adenylosuccinate synthetase  65.97 
 
 
431 aa  595  1e-169  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0436902 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3179  adenylosuccinate synthetase  65.97 
 
 
431 aa  592  1e-168  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0510  adenylosuccinate synthetase  66.2 
 
 
429 aa  592  1e-168  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.37093  normal  0.446838 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0558  adenylosuccinate synthetase  65.12 
 
 
429 aa  593  1e-168  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00595695 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0658  adenylosuccinate synthetase  66.2 
 
 
428 aa  584  1.0000000000000001e-165  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.163412  normal  0.505489 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2683  adenylosuccinate synthetase  65.19 
 
 
429 aa  583  1.0000000000000001e-165  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1969  adenylosuccinate synthetase  64.14 
 
 
437 aa  583  1.0000000000000001e-165  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.769944  normal  0.0974254 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0475  adenylosuccinate synthetase  67.6 
 
 
429 aa  570  1e-161  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.636476  hitchhiker  0.00197029 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2784  adenylosuccinate synthetase  65.42 
 
 
429 aa  568  1e-160  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.436445  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0337  adenylosuccinate synthetase  55.4 
 
 
425 aa  510  1e-143  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.112659  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0564  adenylosuccinate synthetase  51.98 
 
 
431 aa  489  1e-137  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0461  adenylosuccinate synthetase  52.68 
 
 
430 aa  486  1e-136  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1523  adenylosuccinate synthetase  54.63 
 
 
442 aa  477  1e-133  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000140547  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5832  adenylosuccinate synthase  56.28 
 
 
432 aa  475  1e-133  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6675  adenylosuccinate synthase  56.05 
 
 
432 aa  472  1e-132  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.250077 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6199  adenylosuccinate synthase  56.28 
 
 
453 aa  474  1e-132  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0247215 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6526  adenylosuccinate synthetase  55.35 
 
 
432 aa  470  1.0000000000000001e-131  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.768523 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5753  adenylosuccinate synthase  56.18 
 
 
429 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.590489 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5997  adenylosuccinate synthase  55.94 
 
 
429 aa  467  9.999999999999999e-131  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.140056  normal  0.195081 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0203  adenylosuccinate synthetase  52.56 
 
 
431 aa  458  9.999999999999999e-129  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  8.773480000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5326  adenylosuccinate synthase  55.24 
 
 
432 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0668634 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3251  adenylosuccinate synthetase  53.27 
 
 
430 aa  458  9.999999999999999e-129  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.220385  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1978  adenylosuccinate synthetase  53.61 
 
 
432 aa  453  1.0000000000000001e-126  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3308  adenylosuccinate synthetase  50.93 
 
 
433 aa  449  1e-125  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00120298  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0662  adenylosuccinate synthetase  50.81 
 
 
431 aa  449  1e-125  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.681047  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2007  adenylosuccinate synthetase  53.74 
 
 
431 aa  445  1.0000000000000001e-124  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00017376  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3260  adenylosuccinate synthetase  51.28 
 
 
430 aa  445  1.0000000000000001e-124  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0574684  hitchhiker  0.00000000000114461 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3379  adenylosuccinate synthetase  53.23 
 
 
436 aa  445  1.0000000000000001e-124  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2029  adenylosuccinate synthetase  50.35 
 
 
429 aa  445  1.0000000000000001e-124  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00381049  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0578  adenylosuccinate synthetase  53.15 
 
 
432 aa  447  1.0000000000000001e-124  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000001206 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0518  adenylosuccinate synthetase  50.35 
 
 
430 aa  445  1.0000000000000001e-124  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.289891  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2504  adenylosuccinate synthetase  51.74 
 
 
431 aa  442  1e-123  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000458788 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0694  adenylosuccinate synthetase  51.04 
 
 
432 aa  439  9.999999999999999e-123  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0660  adenylosuccinate synthetase  52.91 
 
 
431 aa  439  9.999999999999999e-123  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3793  adenylosuccinate synthetase  51.04 
 
 
432 aa  439  9.999999999999999e-123  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0607  adenylosuccinate synthetase  51.05 
 
 
432 aa  441  9.999999999999999e-123  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.272974 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0565  adenylosuccinate synthetase  50.47 
 
 
432 aa  439  9.999999999999999e-123  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.22549e-25 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0903  Adenylosuccinate synthase  51.88 
 
 
430 aa  440  9.999999999999999e-123  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.546302  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0676  adenylosuccinate synthetase  49.66 
 
 
446 aa  439  9.999999999999999e-123  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.678663  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3648  adenylosuccinate synthetase  51.04 
 
 
432 aa  439  9.999999999999999e-123  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0552  adenylosuccinate synthetase  50.7 
 
 
432 aa  439  9.999999999999999e-123  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000000130749  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2180  adenylosuccinate synthetase  50.7 
 
 
432 aa  439  9.999999999999999e-123  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000134883  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4889  adenylosuccinate synthetase  51.52 
 
 
430 aa  435  1e-121  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0250802  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4680  adenylosuccinate synthetase  51.76 
 
 
430 aa  437  1e-121  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07600  Adenylosuccinate synthetase  50.82 
 
 
430 aa  436  1e-121  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2974  adenylosuccinate synthetase  51.04 
 
 
435 aa  437  1e-121  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.823957 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1281  adenylosuccinate synthetase  49.77 
 
 
446 aa  437  1e-121  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4765  adenylosuccinate synthetase  51.52 
 
 
430 aa  435  1e-121  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0441  adenylosuccinate synthetase  51.27 
 
 
435 aa  436  1e-121  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.83493  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4941  adenylosuccinate synthetase  51.52 
 
 
430 aa  435  1e-121  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00348011 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2958  adenylosuccinate synthetase  49.18 
 
 
428 aa  435  1e-121  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2641  adenylosuccinate synthetase  49.18 
 
 
428 aa  436  1e-121  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.536345  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1939  adenylosuccinate synthetase  51.29 
 
 
431 aa  436  1e-121  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0641  adenylosuccinate synthetase  52.34 
 
 
431 aa  434  1e-120  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00143682 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0497  adenylosuccinate synthetase  50.23 
 
 
432 aa  434  1e-120  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3914  adenylosuccinate synthetase  51.51 
 
 
432 aa  434  1e-120  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.923104  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0941  adenylosuccinate synthetase  50.12 
 
 
435 aa  434  1e-120  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0528  adenylosuccinate synthetase  51.29 
 
 
429 aa  432  1e-120  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.650318  normal  0.308275 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2661  adenylosuccinate synthetase  50.23 
 
 
431 aa  434  1e-120  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1282  adenylosuccinate synthetase  52.1 
 
 
431 aa  432  1e-120  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.705282  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02633  adenylosuccinate synthetase  51.76 
 
 
430 aa  432  1e-120  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5667  adenylosuccinate synthetase  51.52 
 
 
430 aa  434  1e-120  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65230  adenylosuccinate synthetase  51.29 
 
 
430 aa  432  1e-120  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1049  adenylosuccinate synthetase  49.88 
 
 
435 aa  433  1e-120  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4634  adenylosuccinate synthetase  50.93 
 
 
432 aa  431  1e-119  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1265  adenylosuccinate synthetase  50.69 
 
 
432 aa  428  1e-119  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0163864  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1473  adenylosuccinate synthetase  50.69 
 
 
448 aa  428  1e-119  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.209737  normal  0.290596 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2598  adenylosuccinate synthetase  50.69 
 
 
432 aa  428  1e-119  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.0051551  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>