103 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_1832 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_1832  SoxA protein  100 
 
 		 98 aa  198  1.9999999999999998e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.537733 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0205  hypothetical protein  50.48 
 
 		 108 aa  110  9e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.260069  normal  0.512826 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4342  putative sarcosine oxidase alpha subunit  51.04 
 
 		 98 aa  104  4e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.320277  normal  0.580736 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1838  putative sarcosine oxidase alpha subunit  49.48 
 
 		 99 aa  100  6e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.227251  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8314  uncharacterized NAD(FAD)-dependent dehydrogenase  48.96 
 
 		 98 aa  99.8  1e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4424  putative sarcosine oxidase alpha subunit  51 
 
 		 103 aa  97.8  5e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.178387  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4399  putative sarcosine oxidase alpha subunit  50.55 
 
 		 99 aa  93.2  1e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.265808 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1932  putative sarcosine oxidase alpha subunit  51.11 
 
 		 99 aa  92.8  1e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6534  hypothetical protein  44.33 
 
 		 130 aa  88.6  2e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.855278 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4415  hypothetical protein  42.71 
 
 		 118 aa  87.8  5e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.706002  normal  0.855895 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1687  hypothetical protein  43.88 
 
 		 102 aa  85.9  1e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.410801  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4375  hypothetical protein  51.19 
 
 		 125 aa  85.9  2e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4935  hypothetical protein  47.5 
 
 		 104 aa  84.7  4e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.254281  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2710  hypothetical protein  47.19 
 
 		 97 aa  83.2  0.000000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.678347  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5701  hypothetical protein  53.01 
 
 		 99 aa  81.3  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6065  hypothetical protein  53.01 
 
 		 99 aa  81.3  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6549  hypothetical protein  50.59 
 
 		 99 aa  81.6  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.851972  normal  0.34224 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5995  hypothetical protein  52.87 
 
 		 99 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.532298  normal  0.410232 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2707  hypothetical protein  52.44 
 
 		 123 aa  77.8  0.00000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.861787  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1892  hypothetical protein  50 
 
 		 126 aa  77.8  0.00000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00275007  normal  0.354275 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000038  hypothetical protein  38.46 
 
 		 99 aa  77.4  0.00000000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7054  hypothetical protein  52.44 
 
 		 113 aa  77  0.00000000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.385812 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5605  FAD dependent oxidoreductase  53.25 
 
 		 984 aa  74.3  0.0000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2741  putative sarcosine oxidase alpha subunit  53.33 
 
 		 96 aa  73.6  0.0000000000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00423187  normal  0.294412 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0721  FAD dependent oxidoreductase  49.37 
 
 		 983 aa  72.8  0.000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6004  hypothetical protein  55.71 
 
 		 120 aa  70.5  0.000000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.586862  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2941  hypothetical protein  42.86 
 
 		 102 aa  68.9  0.00000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5918  hypothetical protein  44.3 
 
 		 95 aa  67.8  0.00000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.0000277826  normal  0.0333521 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0089  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  33.72 
 
 		 478 aa  62  0.000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  decreased coverage  0.000828017  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2478  ferredoxin / FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  35.9 
 
 		 429 aa  61.6  0.000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1380  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  35.9 
 
 		 429 aa  60.8  0.000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1476  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  35.9 
 
 		 429 aa  60.8  0.000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0050  hypothetical protein  39.56 
 
 		 108 aa  60.5  0.000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1389  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  38.46 
 
 		 452 aa  60.1  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.232335  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0918  FAD dependent oxidoreductase  41.33 
 
 		 960 aa  59.3  0.00000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0083  hypothetical protein  38.55 
 
 		 112 aa  58.2  0.00000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5218  hypothetical protein  44 
 
 		 82 aa  57.8  0.00000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0877789  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2850  sarcosine oxidase alpha subunit  38.16 
 
 		 110 aa  57  0.00000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00413596  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2647  sarcosine oxidase subunit alpha, N-terminal  33.71 
 
 		 110 aa  57  0.00000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0375869  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2598  sarcosine oxidase, alpha subunit  33.71 
 
 		 110 aa  57  0.00000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2844  putative sarcosine oxidase, alpha subunit  33.71 
 
 		 110 aa  57  0.00000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000266999 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2563  sarcosine oxidase, alpha subunit  35.71 
 
 		 110 aa  56.6  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2065  NAD-dependent formate dehydrogenase, alpha subunit  43.21 
 
 		 132 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0305  hypothetical protein  35.63 
 
 		 101 aa  56.6  0.0000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0972  sarcosine oxidase, alpha subunit  33.72 
 
 		 103 aa  56.6  0.0000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000186283  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36330  hydrogen cyanide synthase HcnA  41.38 
 
 		 104 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.533947 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3944  hypothetical protein  34.48 
 
 		 112 aa  55.1  0.0000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.260668  normal  0.814713 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6587  putative NAD(FAD)-dependent dehydrogenase  36.05 
 
 		 106 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.29085 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4428  hypothetical protein  33.72 
 
 		 128 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.121041  normal  0.609909 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3516  ferredoxin  40.48 
 
 		 108 aa  55.1  0.0000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0641626  normal  0.579773 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2443  sarcosine oxidase alpha subunit  36.84 
 
 		 110 aa  54.7  0.0000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0360142  normal  0.998563 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0938  hypothetical protein  36.36 
 
 		 469 aa  54.3  0.0000006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.903873  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1889  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  44.74 
 
 		 77 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4725  FAD dependent oxidoreductase  35.37 
 
 		 85 aa  53.9  0.0000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1417  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  44.74 
 
 		 77 aa  53.5  0.000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0975187  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5373  hypothetical protein  34.88 
 
 		 114 aa  53.1  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.220109 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2197  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  44.74 
 
 		 77 aa  53.5  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.725852  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0883  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  44.74 
 
 		 77 aa  53.5  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6499  hypothetical protein  36 
 
 		 97 aa  53.1  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.563111  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6086  putative NAD(FAD)-dependent dehydrogenase  36.05 
 
 		 104 aa  53.5  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.825562 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01437  sarcosine oxidase alpha subunit  41.33 
 
 		 77 aa  53.1  0.000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.354445  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2889  putative sarcosine oxidase, alpha subunit  36.99 
 
 		 110 aa  53.1  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.36789  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0690  hypothetical protein  37.93 
 
 		 107 aa  52.4  0.000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0780442  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4731  hypothetical protein  34.88 
 
 		 116 aa  52.4  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.428558  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3632  hypothetical protein  34.88 
 
 		 115 aa  52.4  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.315693 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0572  hypothetical protein  43.42 
 
 		 77 aa  52.8  0.000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.313492  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0475  hypothetical protein  43.42 
 
 		 77 aa  52.8  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.284362  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3103  hydrogen cyanide synthase HcnA  40.23 
 
 		 104 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0827146  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3538  hypothetical protein  34.88 
 
 		 114 aa  52.4  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.227842  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6007  hypothetical protein  34.21 
 
 		 113 aa  52.8  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00459941  normal  0.16745 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31610  hypothetical protein  44.93 
 
 		 87 aa  52  0.000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1499  putative NAD(FAD)-dependent dehydrogenase  36.05 
 
 		 104 aa  51.6  0.000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.335982  normal  0.0119283 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1842  ferredoxin  39.47 
 
 		 84 aa  51.2  0.000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3638  hypothetical protein  32.89 
 
 		 115 aa  50.4  0.000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0468705  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4108  ferredoxin  36.25 
 
 		 85 aa  50.1  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0719298  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0755  hypothetical protein  32.18 
 
 		 107 aa  49.7  0.00001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0876  putative ferredoxin-containing oxidase  38.55 
 
 		 98 aa  49.3  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.332826 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4445  ferredoxin  44.74 
 
 		 77 aa  48.9  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.94814 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2641  sarcosine oxidase, alpha subunit  31.46 
 
 		 110 aa  49.3  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00222021  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4669  ferredoxin  32.93 
 
 		 90 aa  48.1  0.00004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.646461  normal  0.942381 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6627  hypothetical protein  32.61 
 
 		 112 aa  48.1  0.00004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.511531  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4224  ferredoxin  43.42 
 
 		 77 aa  47.4  0.00007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.117463  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4142  ferredoxin  43.42 
 
 		 77 aa  47.4  0.00007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.390351  normal  0.0464627 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4562  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  37.18 
 
 		 591 aa  47.4  0.00008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0998615  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5061  hypothetical protein  32.56 
 
 		 115 aa  46.6  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.29675 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2310  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  30.38 
 
 		 452 aa  46.2  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0886  hypothetical protein  31.03 
 
 		 101 aa  46.2  0.0002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0253  hypothetical protein  32.56 
 
 		 103 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0779  hypothetical protein  33.33 
 
 		 103 aa  44.3  0.0006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.474685 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1964  NADH dehydrogenase subunit G  36.36 
 
 		 797 aa  43.9  0.0007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0536465  normal  0.0616113 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3208  hypothetical protein  26.6 
 
 		 96 aa  43.5  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0153  hypothetical protein  31.4 
 
 		 103 aa  42.4  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1892  ferredoxin  44.74 
 
 		 77 aa  42.7  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.457953 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4124  hypothetical protein  34.62 
 
 		 78 aa  42.7  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  decreased coverage  0.00126127  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2501  sarcosine oxidase alpha subunit  27.5 
 
 		 80 aa  42.4  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.295491  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3377  ferredoxin  43.42 
 
 		 77 aa  42.4  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.264604  normal  0.288176 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2521  hypothetical protein  31.58 
 
 		 96 aa  42  0.003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.980113  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2332  hypothetical protein  35.14 
 
 		 96 aa  41.2  0.004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0376166  normal  0.710441 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0031  formate dehydrogenase, alpha subunit  27.72 
 
 		 1000 aa  41.2  0.005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3552  ferredoxin  42.11 
 
 		 77 aa  40.4  0.007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>