More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_1830 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_1830  SoxB protein  100 
 
 		 377 aa  760    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.01775  normal  0.260331 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0207  FAD dependent oxidoreductase  65.69 
 
 		 388 aa  494  1e-139  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.654488  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4373  FAD dependent oxidoreductase  46.28 
 
 		 385 aa  325  1e-87  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4345  FAD dependent oxidoreductase  46.17 
 
 		 376 aa  322  7e-87  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.957412 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2709  hypothetical protein  44.09 
 
 		 390 aa  303  5.000000000000001e-81  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.9016 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1890  FAD dependent oxidoreductase  43.56 
 
 		 390 aa  297  2e-79  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.125592  normal  0.229246 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6006  FAD dependent oxidoreductase  44.39 
 
 		 386 aa  295  1e-78  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7056  FAD dependent oxidoreductase  44.24 
 
 		 393 aa  294  2e-78  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.370606 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6532  FAD dependent oxidoreductase  41.76 
 
 		 374 aa  281  2e-74  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.330707  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3210  FAD dependent oxidoreductase  33.6 
 
 		 378 aa  214  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.2962  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3942  FAD dependent oxidoreductase  36.68 
 
 		 385 aa  210  3e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.741631  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0884  FAD dependent oxidoreductase  36.29 
 
 		 377 aa  207  2e-52  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0303  FAD dependent oxidoreductase  36.9 
 
 		 376 aa  202  6e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2330  FAD dependent oxidoreductase  35.03 
 
 		 394 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00484515  normal  0.869499 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3400  FAD dependent oxidoreductase  34.4 
 
 		 394 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0126015  normal  0.687523 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3636  FAD dependent oxidoreductase  32.43 
 
 		 394 aa  197  2.0000000000000003e-49  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.295113  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0781  putative FAD dependent oxidoreductase  35.62 
 
 		 391 aa  197  3e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.740851 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6625  FAD dependent oxidoreductase  32.71 
 
 		 383 aa  195  1e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0255  oxidoreductase, FAD-binding protein  34.56 
 
 		 384 aa  190  4e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2939  FAD dependent oxidoreductase  34.58 
 
 		 378 aa  190  4e-47  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4426  FAD dependent oxidoreductase  34.46 
 
 		 375 aa  187  2e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.767277 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6497  oxidoreductase  35.66 
 
 		 380 aa  187  3e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0151  FAD dependent oxidoreductase  34.5 
 
 		 389 aa  186  8e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6084  FAD dependent oxidoreductase  32.79 
 
 		 389 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.793169 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1501  FAD dependent oxidoreductase  32.35 
 
 		 389 aa  182  7e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.190283  normal  0.0251893 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0746  putative oxidoreductase  34.57 
 
 		 375 aa  181  2e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4733  FAD dependent oxidoreductase  33.15 
 
 		 383 aa  179  5.999999999999999e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.233714  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3630  FAD dependent oxidoreductase  33.15 
 
 		 383 aa  179  5.999999999999999e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.508922 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0753  FAD dependent oxidoreductase  36.36 
 
 		 384 aa  179  9e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6585  FAD dependent oxidoreductase  32.97 
 
 		 389 aa  176  4e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.19426 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4434  FAD dependent oxidoreductase  33.98 
 
 		 378 aa  172  5.999999999999999e-42  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.862237  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0048  FAD dependent oxidoreductase  33.51 
 
 		 376 aa  172  1e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2519  oxidoreductase, FAD-binding protein  35.17 
 
 		 394 aa  168  1e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.105812  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3536  FAD dependent oxidoreductase  33.6 
 
 		 382 aa  163  6e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.13999  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5371  FAD dependent oxidoreductase  33.87 
 
 		 382 aa  160  4e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.395195 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2644  FAD dependent oxidoreductase  30.34 
 
 		 396 aa  138  2e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.875281  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0271  FAD dependent oxidoreductase  27.49 
 
 		 373 aa  137  3.0000000000000003e-31  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0918  FAD dependent oxidoreductase  28.42 
 
 		 960 aa  137  4e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0721  FAD dependent oxidoreductase  27.72 
 
 		 983 aa  132  7.999999999999999e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5605  FAD dependent oxidoreductase  28.17 
 
 		 984 aa  129  7.000000000000001e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5063  FAD dependent oxidoreductase  32.75 
 
 		 383 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.200843 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0595  FAD dependent oxidoreductase  24.4 
 
 		 390 aa  127  3e-28  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.140462  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6383  FAD dependent oxidoreductase  29.34 
 
 		 389 aa  126  5e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6616  FAD dependent oxidoreductase  29.34 
 
 		 389 aa  126  5e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.144379 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4955  FAD dependent oxidoreductase  29.56 
 
 		 442 aa  126  7e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.916041  normal  0.433563 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1548  FAD dependent oxidoreductase  27.72 
 
 		 441 aa  124  2e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.746039 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6214  FAD dependent oxidoreductase  29.06 
 
 		 389 aa  124  3e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0274  FAD dependent oxidoreductase  28.53 
 
 		 381 aa  124  3e-27  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1159  putative FAD dependent oxidoreductase  27.04 
 
 		 428 aa  122  7e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1751  FAD dependent oxidoreductase  25.86 
 
 		 382 aa  121  1.9999999999999998e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.18751 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2740  FAD dependent oxidoreductase  29.32 
 
 		 401 aa  120  4.9999999999999996e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0112073  normal  0.18008 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4833  FAD dependent oxidoreductase  31.11 
 
 		 385 aa  119  7e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.866256 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2479  FAD dependent oxidoreductase  28.3 
 
 		 496 aa  119  9e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.113272  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1388  FAD dependent oxidoreductase  28.61 
 
 		 492 aa  117  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.569106  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4894  FAD dependent oxidoreductase  28.65 
 
 		 397 aa  117  1.9999999999999998e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0765  putative FAD dependent oxidoreductase  27.53 
 
 		 442 aa  117  3e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.144956 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1475  FAD dependent oxidoreductase  27.66 
 
 		 500 aa  116  6.9999999999999995e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.540838  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1379  FAD dependent oxidoreductase  27.97 
 
 		 500 aa  115  8.999999999999998e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.258536  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1730  FAD dependent oxidoreductase  26.32 
 
 		 382 aa  115  1.0000000000000001e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3826  FAD dependent oxidoreductase  25.86 
 
 		 442 aa  115  1.0000000000000001e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0688  FAD dependent oxidoreductase  28.65 
 
 		 382 aa  114  3e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.148887  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0968  FAD dependent oxidoreductase  25.63 
 
 		 383 aa  114  3e-24  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0185207  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0928  FAD dependent oxidoreductase  27.2 
 
 		 383 aa  112  8.000000000000001e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.559929 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6294  FAD dependent oxidoreductase  25.73 
 
 		 387 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1073  FAD dependent oxidoreductase  27.81 
 
 		 385 aa  112  1.0000000000000001e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4695  FAD dependent oxidoreductase  28.08 
 
 		 394 aa  111  2.0000000000000002e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.518456 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0702  D-amino acid oxidase family protein  25.42 
 
 		 442 aa  110  4.0000000000000004e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.382621  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4956  FAD dependent oxidoreductase  25.59 
 
 		 439 aa  109  6e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.579279  normal  0.246978 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2539  agaE protein  27.34 
 
 		 442 aa  108  2e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.154835  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0161  FAD dependent oxidoreductase  27.68 
 
 		 394 aa  108  2e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1284  FAD-dependent oxidoreductase  27.34 
 
 		 442 aa  107  4e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0543  hypothetical protein  27.34 
 
 		 442 aa  107  4e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1294  hypothetical protein  27.34 
 
 		 442 aa  107  4e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1362  FAD-dependent oxidoreductase  27.34 
 
 		 442 aa  107  4e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1023  FAD-dependent oxidoreductase  27.34 
 
 		 442 aa  107  4e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0272  hypothetical protein  27.34 
 
 		 442 aa  107  4e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0655938  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6672  FAD dependent oxidoreductase  28.5 
 
 		 441 aa  105  9e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.160579  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6437  FAD dependent oxidoreductase  28.5 
 
 		 441 aa  105  9e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3808  FAD dependent oxidoreductase  27.01 
 
 		 385 aa  105  1e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.876353 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6270  FAD dependent oxidoreductase  28.5 
 
 		 441 aa  105  1e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.119616 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4693  FAD dependent oxidoreductase  27.1 
 
 		 423 aa  103  4e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0926  FAD dependent oxidoreductase  28.08 
 
 		 393 aa  102  8e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7805  FAD dependent oxidoreductase  25.33 
 
 		 395 aa  102  1e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.436057  normal  1 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8165  oxidoreductase  24.52 
 
 		 460 aa  102  1e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0557691  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6064  FAD dependent oxidoreductase  26.87 
 
 		 441 aa  101  2e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1649  FAD dependent oxidoreductase  25.59 
 
 		 441 aa  100  3e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.756737  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1769  hypothetical protein  25.42 
 
 		 446 aa  101  3e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000748216 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2104  FAD dependent oxidoreductase  26.2 
 
 		 413 aa  100  3e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.508 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4659  FAD dependent oxidoreductase  27.14 
 
 		 444 aa  100  4e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1461  putative lipoprotein  26.86 
 
 		 436 aa  100  4e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3709  FAD dependent oxidoreductase  27.14 
 
 		 444 aa  100  4e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.611519  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04340  glycine/D-amino acid oxidase, deaminating  27.9 
 
 		 386 aa  100  4e-20  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.704442 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3120  FAD dependent oxidoreductase  26.12 
 
 		 385 aa  100  5e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5589  FAD dependent oxidoreductase  25.93 
 
 		 441 aa  99.8  7e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.17966 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5001  FAD dependent oxidoreductase  26.56 
 
 		 441 aa  99.8  7e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.58394  normal  0.404419 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3532  FAD dependent oxidoreductase  27.52 
 
 		 392 aa  99.8  8e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1161  FAD dependent oxidoreductase  26.73 
 
 		 444 aa  99  1e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.309102 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5640  FAD dependent oxidoreductase  26.9 
 
 		 444 aa  98.6  2e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.738738  normal  0.548415 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2224  FAD dependent oxidoreductase  26.54 
 
 		 413 aa  98.2  2e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.175364  normal  0.288847 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2637  FAD dependent oxidoreductase  25.26 
 
 		 441 aa  98.2  2e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.754665  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>