38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_1471 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_7708  phage integrase family protein  100 
 
 		 624 aa  1274    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0733345  normal  0.10035 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7406  phage integrase family protein  100 
 
 		 624 aa  1274    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.305016  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7313  phage integrase family protein  100 
 
 		 624 aa  1274    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3330  hypothetical protein  100 
 
 		 624 aa  1274    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.619294  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1471  putative phage integrase  100 
 
 		 624 aa  1274    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.249966  normal  1 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0268  hypothetical protein  100 
 
 		 624 aa  1274    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6207  Phage integrase  34.29 
 
 		 475 aa  194  4e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6254  phage integrase  25 
 
 		 616 aa  139  1e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7366  integrase family protein  26.19 
 
 		 645 aa  125  3e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7360  phage integrase  23.93 
 
 		 688 aa  117  6e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0191  phage integrase family protein  23.14 
 
 		 568 aa  93.6  1e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0245389  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0803  hypothetical protein  29.53 
 
 		 721 aa  92.4  2e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.148345  normal  0.675671 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4886  phage integrase family protein  30.88 
 
 		 707 aa  86.7  0.000000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.717526 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0530  phage integrase family protein  23.37 
 
 		 724 aa  82.4  0.00000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.553889  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4986  phage integrase family protein  23.37 
 
 		 724 aa  82.4  0.00000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.173206  normal  1 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3931  phage integrase family protein  26.72 
 
 		 741 aa  82.4  0.00000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.117648  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3035  phage integrase family protein  23.37 
 
 		 724 aa  82.4  0.00000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.661955  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3162  hypothetical protein  25.65 
 
 		 714 aa  81.3  0.00000000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.541887  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4231  phage integrase  25.41 
 
 		 717 aa  79.3  0.0000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.295856  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4142  hypothetical protein  26.35 
 
 		 713 aa  79  0.0000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.285848  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2815  phage integrase family protein  27.71 
 
 		 709 aa  75.1  0.000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.952182  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3615  site-specific recombinase, phage integrase family  23.03 
 
 		 533 aa  70.9  0.00000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.455772  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2616  integrase family protein  26.26 
 
 		 572 aa  68.2  0.0000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0168  hypothetical protein  23.86 
 
 		 693 aa  67.4  0.0000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0071  site-specific recombinase, phage integrase family protein  22.16 
 
 		 700 aa  60.8  0.00000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.420538  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1150  phage integrase family protein  24.93 
 
 		 742 aa  57.4  0.0000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4322  hypothetical protein  20.97 
 
 		 606 aa  54.7  0.000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4224  hypothetical protein  24.33 
 
 		 707 aa  53.9  0.000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2253  hypothetical protein  29.95 
 
 		 714 aa  53.5  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3481  phage integrase family protein  22.69 
 
 		 600 aa  53.5  0.00001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.487769  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3442  phage integrase family protein  22.69 
 
 		 600 aa  53.5  0.00001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0097  site-specific recombinase, phage integrase family protein  23.45 
 
 		 617 aa  48.9  0.0003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0069  integrase family protein  22.5 
 
 		 517 aa  46.2  0.002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1214  phage integrase family protein  23.36 
 
 		 236 aa  45.8  0.003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1897  integrase family protein  25.39 
 
 		 680 aa  45.4  0.003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.17871  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3463  integrase family protein  25.39 
 
 		 680 aa  45.4  0.003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2022  phage integrase  23.88 
 
 		 650 aa  45.1  0.004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1962  phage integrase family site specific recombinase  23.99 
 
 		 642 aa  45.1  0.004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000374969 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>