65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_1386 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_1386  hypothetical protein  100 
 
 		 250 aa  481  1e-135  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.187593  normal  0.103822 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4519  hypothetical protein  64.11 
 
 		 261 aa  322  4e-87  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.233278  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0970  protein of unknown function DUF81  64.52 
 
 		 250 aa  315  3e-85  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0270305  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4361  hypothetical protein  62.9 
 
 		 261 aa  314  9.999999999999999e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0967728  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0777  hypothetical protein  65.84 
 
 		 259 aa  302  3.0000000000000004e-81  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.468217 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6144  hypothetical protein  63.67 
 
 		 244 aa  293  2e-78  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4272  protein of unknown function DUF81  47.58 
 
 		 251 aa  199  3e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4604  hypothetical protein  45.83 
 
 		 249 aa  190  1e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.026301  normal  0.0214445 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3764  hypothetical protein  45.83 
 
 		 249 aa  190  1e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.260566  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5700  hypothetical protein  45.83 
 
 		 249 aa  190  1e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00346849 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2148  protein of unknown function DUF81  42.02 
 
 		 243 aa  186  2e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4352  hypothetical protein  44.98 
 
 		 250 aa  186  4e-46  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.284869  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4754  protein of unknown function DUF81  44.98 
 
 		 250 aa  185  8e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.180268  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4876  protein of unknown function DUF81  45.22 
 
 		 250 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.093917 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4042  hypothetical protein  46.28 
 
 		 267 aa  181  1e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.683964 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4525  hypothetical protein  43.4 
 
 		 254 aa  176  4e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.542262  normal  0.388849 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0947  protein of unknown function DUF81  45.83 
 
 		 250 aa  175  5e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1237  hypothetical protein  47.08 
 
 		 267 aa  174  9e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.318719  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4492  hypothetical protein  46.64 
 
 		 246 aa  173  1.9999999999999998e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0716  hypothetical protein  45 
 
 		 254 aa  173  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4663  hypothetical protein  42.98 
 
 		 254 aa  172  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.518692  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3425  hypothetical protein  39.66 
 
 		 251 aa  172  5e-42  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4034  hypothetical protein  45.8 
 
 		 267 aa  171  7.999999999999999e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.232214  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3115  protein of unknown function DUF81  41.18 
 
 		 238 aa  171  1e-41  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3822  hypothetical protein  42.99 
 
 		 251 aa  170  2e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0773  hypothetical protein  44.73 
 
 		 258 aa  170  2e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.771758  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4658  hypothetical protein  43.83 
 
 		 254 aa  170  2e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.218581  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3331  protein of unknown function DUF81  42.32 
 
 		 241 aa  169  6e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3101  protein of unknown function DUF81  42.79 
 
 		 230 aa  168  7e-41  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3543  protein of unknown function DUF81  46.12 
 
 		 270 aa  165  6.9999999999999995e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0157172  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0979  hypothetical protein  42.74 
 
 		 241 aa  164  8e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1292  protein of unknown function DUF81  40.57 
 
 		 248 aa  160  2e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.404695  normal  0.692055 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2113  hypothetical protein  40.34 
 
 		 251 aa  160  2e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03620  hypothetical protein  44.3 
 
 		 250 aa  154  9e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0487694  hitchhiker  0.00000000539148 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0795  hypothetical protein  44.8 
 
 		 254 aa  150  1e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2134  hypothetical protein  39.91 
 
 		 258 aa  151  1e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1633  hypothetical protein  38.03 
 
 		 249 aa  140  3e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2443  hypothetical protein  41.74 
 
 		 278 aa  139  3.9999999999999997e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.97715 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2216  hypothetical protein  42.98 
 
 		 252 aa  137  2e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.86715  normal  0.544249 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2576  hypothetical protein  42.17 
 
 		 258 aa  137  2e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.448203  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0354  hypothetical protein  41.9 
 
 		 194 aa  115  5e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2458  hypothetical protein  36.12 
 
 		 256 aa  105  9e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.210004  normal  0.809897 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0685  hypothetical protein  41.18 
 
 		 256 aa  100  2e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0205  protein of unknown function DUF81  26.86 
 
 		 254 aa  76.6  0.0000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.670843 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0369  hypothetical protein  60.38 
 
 		 61 aa  63.9  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.660019  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2445  hypothetical protein  29.44 
 
 		 255 aa  64.3  0.000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.315917  normal  0.587426 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0058  hypothetical protein  26.42 
 
 		 245 aa  56.6  0.0000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.101674  hitchhiker  0.000370653 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0060  hypothetical protein  26.02 
 
 		 245 aa  56.2  0.0000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.128142  decreased coverage  0.0000000546938 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0062  hypothetical protein  26.02 
 
 		 245 aa  55.5  0.0000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000018824 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3052  hypothetical protein  33.05 
 
 		 123 aa  55.5  0.0000009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4638  hypothetical protein  25 
 
 		 309 aa  55.1  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0730129  hitchhiker  0.00519194 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3800  hypothetical protein  27.8 
 
 		 232 aa  53.5  0.000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.926245  hitchhiker  0.000523706 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4297  hypothetical protein  25.61 
 
 		 245 aa  53.1  0.000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.147725  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0057  hypothetical protein  25.61 
 
 		 245 aa  53.1  0.000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0531  hypothetical protein  28.1 
 
 		 257 aa  53.1  0.000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0061  protein of unknown function DUF81  25.61 
 
 		 245 aa  52.8  0.000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2841  hypothetical protein  27.82 
 
 		 257 aa  52.8  0.000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0062  hypothetical protein  25.2 
 
 		 245 aa  52.4  0.000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.33836  hitchhiker  0.00207124 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1367  hypothetical protein  25.76 
 
 		 282 aa  52  0.000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.113148 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1898  protein of unknown function DUF81  24.22 
 
 		 247 aa  47.4  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1175  protein of unknown function DUF81  26.47 
 
 		 257 aa  47.4  0.0002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.358804  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1676  protein of unknown function DUF81  24.53 
 
 		 254 aa  47  0.0003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1591  protein of unknown function DUF81  26.42 
 
 		 247 aa  43.5  0.003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0129546  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2931  hypothetical protein  26.75 
 
 		 240 aa  43.1  0.005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3036  protein of unknown function DUF81  26.23 
 
 		 261 aa  42  0.008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>