31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_1361 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007964  Nham_3412  hypothetical protein  60.45 
 
 		 566 aa  666    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.295964  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1361  hypothetical protein  100 
 
 		 568 aa  1129    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.515582  normal  0.0625662 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0948  hypothetical protein  58.13 
 
 		 571 aa  619  1e-176  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0768  hypothetical protein  59.81 
 
 		 563 aa  612  9.999999999999999e-175  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.8087 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4538  hypothetical protein  57.69 
 
 		 540 aa  598  1e-170  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0865  hypothetical protein  57.38 
 
 		 564 aa  580  1e-164  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.305533 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0932  hypothetical protein  52.8 
 
 		 563 aa  549  1e-155  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0523701  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1306  hypothetical protein  34.79 
 
 		 617 aa  273  6e-72  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.580555 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6052  hypothetical protein  36.75 
 
 		 546 aa  238  3e-61  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.157473  normal  0.365189 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7239  hypothetical protein  34.58 
 
 		 528 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0074  hypothetical protein  34.25 
 
 		 592 aa  225  1e-57  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.679979  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4284  conserved hypothetical proteinn  35.37 
 
 		 597 aa  220  5e-56  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3898  hypothetical protein  34.01 
 
 		 647 aa  216  9.999999999999999e-55  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.242852  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3606  hypothetical protein  33.76 
 
 		 646 aa  215  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6670  hypothetical protein  34.38 
 
 		 590 aa  213  1e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.335645  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3589  hypothetical protein  32.23 
 
 		 552 aa  192  1e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0075093 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1905  hypothetical protein  30.05 
 
 		 423 aa  145  2e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2738  hypothetical protein  28.97 
 
 		 515 aa  134  6e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.22803  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1085  hypothetical protein  26.45 
 
 		 537 aa  117  6e-25  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.016915  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3723  hypothetical protein  30.31 
 
 		 505 aa  114  4.0000000000000004e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0067  hypothetical protein  24.36 
 
 		 502 aa  112  2.0000000000000002e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0072  hypothetical protein  24.36 
 
 		 512 aa  112  2.0000000000000002e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.387574  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4270  hypothetical protein  25 
 
 		 528 aa  110  7.000000000000001e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4817  hypothetical protein  27.22 
 
 		 424 aa  103  6e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2706  hypothetical protein  27.32 
 
 		 467 aa  100  7e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.390646  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4529  hypothetical protein  25.84 
 
 		 420 aa  100  8e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1489  hypothetical protein  26.82 
 
 		 451 aa  100  8e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.427413  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3308  hypothetical protein  25.71 
 
 		 511 aa  94  6e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3610  hypothetical protein  26.29 
 
 		 513 aa  93.2  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0252  hypothetical protein  29.33 
 
 		 400 aa  80.9  0.00000000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2813  hypothetical protein  24.14 
 
 		 386 aa  44.7  0.004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>