More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_1323 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_1304  FAD-dependent oxidoreductase  71.62 
 
 		 535 aa  798    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.26478  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1323  FAD-dependent oxidoreductase  100 
 
 		 545 aa  1122    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.731254  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4218  FAD-dependent oxidoreductase  55.22 
 
 		 579 aa  612  9.999999999999999e-175  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0579  FAD-dependent oxidoreductase  57.68 
 
 		 558 aa  613  9.999999999999999e-175  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0850  FAD-dependent oxidoreductase  54.73 
 
 		 555 aa  607  9.999999999999999e-173  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0192309  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4529  FAD-dependent oxidoreductase  57.17 
 
 		 559 aa  600  1e-170  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.609398  normal  0.38599 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4661  FAD-dependent oxidoreductase  57.17 
 
 		 559 aa  600  1e-170  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.135002 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0334  FAD-dependent oxidoreductase  57.35 
 
 		 553 aa  601  1e-170  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0291  FAD-dependent oxidoreductase  55.41 
 
 		 545 aa  599  1e-170  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.339644  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0817  FAD-dependent oxidoreductase  57.35 
 
 		 553 aa  601  1e-170  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0834776  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0786  FAD-dependent oxidoreductase  57.17 
 
 		 553 aa  598  1e-170  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0715  FAD-dependent oxidoreductase  58.03 
 
 		 558 aa  597  1e-169  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.520934  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7215  FAD-dependent oxidoreductase  52.3 
 
 		 569 aa  593  1e-168  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3910  FAD-dependent oxidoreductase  56.62 
 
 		 550 aa  594  1e-168  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1395  FAD-dependent oxidoreductase  56.95 
 
 		 553 aa  592  1e-168  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0428  FAD-dependent oxidoreductase  52.3 
 
 		 569 aa  593  1e-168  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00420765  normal  0.845447 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2566  FAD-dependent oxidoreductase  56.93 
 
 		 555 aa  592  1e-168  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0698  FAD-dependent oxidoreductase  57.84 
 
 		 555 aa  594  1e-168  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3177  FAD-dependent oxidoreductase  57.33 
 
 		 553 aa  590  1e-167  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3216  FAD-dependent oxidoreductase  57.22 
 
 		 553 aa  591  1e-167  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3231  FAD-dependent oxidoreductase  57.22 
 
 		 553 aa  591  1e-167  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4050  FAD-dependent oxidoreductase  53.01 
 
 		 570 aa  591  1e-167  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000538899  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2059  FAD-dependent oxidoreductase  57.03 
 
 		 553 aa  585  1e-166  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1924  FAD-dependent oxidoreductase  57.03 
 
 		 553 aa  585  1e-166  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.421754  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0853  FAD-dependent oxidoreductase  57.03 
 
 		 553 aa  585  1e-166  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0339  FAD-dependent oxidoreductase  55.05 
 
 		 584 aa  587  1e-166  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2685  FAD-dependent oxidoreductase  57.03 
 
 		 553 aa  585  1e-166  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01747  FAD-dependent oxidoreductase  57.17 
 
 		 563 aa  579  1e-164  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.178537  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1196  FAD-dependent oxidoreductase  56.26 
 
 		 554 aa  572  1.0000000000000001e-162  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2624  FAD-dependent oxidoreductase  56.01 
 
 		 535 aa  572  1.0000000000000001e-162  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.596702 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4535  FAD-dependent oxidoreductase  54.31 
 
 		 563 aa  566  1e-160  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0000237964  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0903  FAD-dependent oxidoreductase  53.97 
 
 		 540 aa  564  1.0000000000000001e-159  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4300  FAD-dependent oxidoreductase  55.93 
 
 		 578 aa  563  1.0000000000000001e-159  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0924  FAD-dependent oxidoreductase  53.52 
 
 		 541 aa  552  1e-156  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5156  FAD-dependent oxidoreductase  53.02 
 
 		 535 aa  532  1e-150  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.328253  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1015  FAD-dependent oxidoreductase  54.72 
 
 		 540 aa  535  1e-150  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.18031  normal  0.166528 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3815  FAD-dependent oxidoreductase  52.41 
 
 		 541 aa  526  1e-148  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.433248  normal  0.294357 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0888  FAD-dependent oxidoreductase  52.9 
 
 		 535 aa  508  9.999999999999999e-143  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0885397  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0563  FAD-dependent oxidoreductase  51.65 
 
 		 544 aa  497  1e-139  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.636455 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1432  FAD-dependent oxidoreductase  50.46 
 
 		 546 aa  489  1e-137  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.886265  normal  0.829223 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0776  FAD-dependent oxidoreductase  49.35 
 
 		 524 aa  485  1e-135  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.790337  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4192  FAD-dependent oxidoreductase  38.06 
 
 		 564 aa  384  1e-105  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2727  FAD-dependent oxidoreductase  36.49 
 
 		 570 aa  371  1e-101  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00614764  normal  0.0524365 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4123  FAD-dependent oxidoreductase  36.99 
 
 		 577 aa  365  1e-99  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.000743874  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3422  monooxygenase, FAD-binding  38.18 
 
 		 550 aa  363  5.0000000000000005e-99  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.448007  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0875  FAD-dependent oxidoreductase  37.08 
 
 		 581 aa  362  8e-99  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.474503  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3000  FAD-dependent oxidoreductase  38.26 
 
 		 551 aa  358  9.999999999999999e-98  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.296257 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5105  monooxygenase FAD-binding  38.05 
 
 		 550 aa  354  2e-96  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.147927  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4008  monooxygenase FAD-binding  38.25 
 
 		 578 aa  352  7e-96  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.245549  normal  0.525361 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3718  monooxygenase, FAD-binding  36.56 
 
 		 585 aa  339  8e-92  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0918353 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5380  FAD-dependent oxidoreductase  35.32 
 
 		 583 aa  338  1.9999999999999998e-91  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.189642  normal  0.0809664 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5321  FAD-dependent oxidoreductase  38.33 
 
 		 561 aa  335  9e-91  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.124532  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3526  monooxygenase, FAD-binding  39.53 
 
 		 586 aa  335  1e-90  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.120911 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1226  FAD-dependent oxidoreductase  35.36 
 
 		 588 aa  334  2e-90  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.240433 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18980  2-polyprenyl-6-methoxyphenol hydroxylase-like oxidoreductase  40.04 
 
 		 554 aa  332  8e-90  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.099299  normal  0.679289 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4781  monooxygenase FAD-binding  37.79 
 
 		 572 aa  330  6e-89  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1919  monooxygenase FAD-binding protein  39.25 
 
 		 547 aa  296  7e-79  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.136855  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4632  monooxygenase, FAD-binding  35.2 
 
 		 557 aa  287  4e-76  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1867  monooxygenase FAD-binding protein  36.89 
 
 		 594 aa  285  1.0000000000000001e-75  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.167984  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0814  monooxygenase FAD-binding  38.11 
 
 		 525 aa  271  2e-71  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0653  monooxygenase, FAD-binding  37.11 
 
 		 484 aa  239  8e-62  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3777  monooxygenase FAD-binding protein  36.66 
 
 		 504 aa  233  8.000000000000001e-60  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.598965  hitchhiker  0.00382559 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3896  monooxygenase FAD-binding protein  32.74 
 
 		 537 aa  177  6e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.228643 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0550  monooxygenase, FAD-binding  30.17 
 
 		 548 aa  167  5.9999999999999996e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.732263  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1029  monooxygenase, FAD-binding  30.17 
 
 		 548 aa  167  5.9999999999999996e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.594814  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0623  monooxygenase FAD-binding  33.33 
 
 		 533 aa  167  5.9999999999999996e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0988  monooxygenase FAD-binding  29.98 
 
 		 548 aa  166  1.0000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.622027  normal  0.120457 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4215  hypothetical protein  32 
 
 		 546 aa  162  1e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0566809  hitchhiker  0.000593788 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4142  monooxygenase, FAD-binding  29.66 
 
 		 546 aa  162  2e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.372966  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3281  pentachlorophenol-4-monooxygenase  31.63 
 
 		 414 aa  160  5e-38  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0905  monooxygenase FAD-binding  29.79 
 
 		 550 aa  158  2e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.147157 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2328  monooxygenase FAD-binding  32.66 
 
 		 480 aa  157  3e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.238819  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3025  monooxygenase FAD-binding  28.21 
 
 		 574 aa  157  5.0000000000000005e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.114894  normal  0.0108713 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0962  putative monooxygenase, FAD-binding  28.91 
 
 		 574 aa  157  6e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0576419  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1620  pentachlorophenol 4-monooxygenase; PcpB  30.19 
 
 		 548 aa  155  2e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.168334  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6396  monooxygenase FAD-binding  32.87 
 
 		 511 aa  155  2e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.572405 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0893  monooxygenase, FAD-binding  29.6 
 
 		 550 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.207082  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2512  monooxygenase FAD-binding  30.21 
 
 		 544 aa  154  4e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6034  monooxygenase FAD-binding protein  31.64 
 
 		 489 aa  152  2e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.829011  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2368  monooxygenase FAD-binding  29.06 
 
 		 549 aa  150  4e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.128155  normal  0.778169 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0779  monooxygenase, FAD-binding  30.95 
 
 		 500 aa  150  7e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.813515  normal  0.655211 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5009  monooxygenase, FAD-binding  30.88 
 
 		 506 aa  148  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2905  FAD-dependent oxidoreductase  29.35 
 
 		 548 aa  147  4.0000000000000006e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2966  FAD-dependent oxidoreductase  29.35 
 
 		 548 aa  147  4.0000000000000006e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3014  oxygenase  29.35 
 
 		 611 aa  147  6e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1172  monooxygenase, FAD-binding  30.9 
 
 		 535 aa  147  7.0000000000000006e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.570475 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0750  monooxygenase FAD-binding protein  31.4 
 
 		 485 aa  146  1e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0417  monooxygenase FAD-binding  29.37 
 
 		 501 aa  145  2e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.969537  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0969  putative pentachlorophenol 4-monooxygenase  28.89 
 
 		 548 aa  145  3e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2598  putative pentachlorophenol 4-monooxygenase  28.89 
 
 		 548 aa  145  3e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1649  hypothetical protein  30.16 
 
 		 497 aa  142  9.999999999999999e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.256973  normal  0.216495 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2311  monooxygenase FAD-binding protein  33.23 
 
 		 408 aa  142  1.9999999999999998e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2324  monooxygenase FAD-binding  28.5 
 
 		 547 aa  142  1.9999999999999998e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.261518  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4799  monooxygenase FAD-binding  29.79 
 
 		 477 aa  141  1.9999999999999998e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3421  monooxygenase FAD-binding protein  31.44 
 
 		 388 aa  141  1.9999999999999998e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.875468  normal  0.0698914 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3055  monooxygenase FAD-binding  28.69 
 
 		 408 aa  141  3e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2196  monooxygenase, FAD-binding  30.63 
 
 		 503 aa  141  3e-32  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3267  monooxygenase FAD-binding  29.09 
 
 		 486 aa  141  3e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1216  hypothetical protein  31.05 
 
 		 486 aa  141  3.9999999999999997e-32  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.795806  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0178  putative pentachlorophenol 4-monooxygenase  28.57 
 
 		 538 aa  141  3.9999999999999997e-32  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.74497  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>