56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_1254 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_1254  hypothetical protein  100 
 
 		 376 aa  764    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.413052  normal  0.0375347 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3251  dehydrogenase  51.84 
 
 		 373 aa  347  2e-94  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.976387  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3712  saccharopine dehydrogenase  50.28 
 
 		 367 aa  345  1e-93  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0633  hypothetical protein  49.72 
 
 		 367 aa  343  2e-93  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.419888  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1243  saccharopine dehydrogenase  49 
 
 		 365 aa  343  2e-93  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1936  saccharopine dehydrogenase  49.86 
 
 		 392 aa  340  2e-92  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2920  saccharopine dehydrogenase  49.72 
 
 		 367 aa  333  3e-90  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1645  saccharopine dehydrogenase  49.29 
 
 		 366 aa  329  4e-89  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.733408 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1737  saccharopine dehydrogenase  49.29 
 
 		 366 aa  329  4e-89  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.406485 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2269  saccharopine dehydrogenase  49.86 
 
 		 366 aa  329  4e-89  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.044171  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2080  saccharopine dehydrogenase  49.86 
 
 		 366 aa  329  4e-89  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.599315  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1723  saccharopine dehydrogenase  49.29 
 
 		 366 aa  329  4e-89  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1645  saccharopine dehydrogenase  49.29 
 
 		 366 aa  329  4e-89  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6355  saccharopine dehydrogenase  49.29 
 
 		 366 aa  329  4e-89  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0976  hypothetical protein  49.57 
 
 		 366 aa  329  5.0000000000000004e-89  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.175424  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2136  saccharopine dehydrogenase  49.57 
 
 		 366 aa  329  5.0000000000000004e-89  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.112826  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2308  hypothetical protein  49 
 
 		 366 aa  328  7e-89  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2656  saccharopine dehydrogenase  48.43 
 
 		 373 aa  328  1.0000000000000001e-88  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1536  saccharopine dehydrogenase  48.43 
 
 		 366 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.938044 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5016  saccharopine dehydrogenase  48.72 
 
 		 366 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.288707  normal  0.105633 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1992  putative saccharopine dehydrogenase, NAD-binding  48.62 
 
 		 365 aa  326  4.0000000000000003e-88  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.899138  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2268  Saccharopine dehydrogenase  48.72 
 
 		 365 aa  324  2e-87  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.87049  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4331  saccharopine dehydrogenase  48.32 
 
 		 379 aa  318  7.999999999999999e-86  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0566  saccharopine dehydrogenase  47.63 
 
 		 385 aa  318  1e-85  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.411174 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5587  Saccharopine dehydrogenase  47.43 
 
 		 376 aa  306  4.0000000000000004e-82  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0890714  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3051  TrkA-N:saccharopine dehydrogenase  45.89 
 
 		 393 aa  304  2.0000000000000002e-81  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.995368  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2810  saccharopine dehydrogenase  46.29 
 
 		 380 aa  301  9e-81  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.111095  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3947  Saccharopine dehydrogenase  45.45 
 
 		 379 aa  301  1e-80  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.35469  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1846  Saccharopine dehydrogenase  46.76 
 
 		 389 aa  299  5e-80  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2420  Saccharopine dehydrogenase  42.94 
 
 		 354 aa  299  6e-80  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.870969  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0269  saccharopine dehydrogenase  47.29 
 
 		 385 aa  298  7e-80  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.901872  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2037  saccharopine dehydrogenase  47.75 
 
 		 389 aa  295  1e-78  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1303  hypothetical protein  43.37 
 
 		 362 aa  291  2e-77  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1304  hypothetical protein  43.37 
 
 		 362 aa  291  2e-77  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3208  saccharopine dehydrogenase  45.48 
 
 		 397 aa  288  1e-76  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2155  saccharopine dehydrogenase  44.94 
 
 		 367 aa  285  5.999999999999999e-76  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5033  Saccharopine dehydrogenase  41.88 
 
 		 354 aa  271  2e-71  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0002  Saccharopine dehydrogenase  42.66 
 
 		 360 aa  266  5.999999999999999e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.717423  hitchhiker  0.0043893 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0002  Saccharopine dehydrogenase  43.34 
 
 		 360 aa  265  7e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0292492 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1791  saccharopine dehydrogenase  31.23 
 
 		 392 aa  152  1e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.493672  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2611  Saccharopine dehydrogenase  31.8 
 
 		 413 aa  148  2.0000000000000003e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1254  Saccharopine dehydrogenase  32.21 
 
 		 385 aa  146  7.0000000000000006e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0384  Saccharopine dehydrogenase  29.48 
 
 		 384 aa  146  7.0000000000000006e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0854083  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1622  saccharopine dehydrogenase  28.84 
 
 		 348 aa  108  1e-22  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.871276  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0527  saccharopine dehydrogenase  29.86 
 
 		 347 aa  108  2e-22  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0647  saccharopine dehydrogenase  29.23 
 
 		 348 aa  106  7e-22  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0657  saccharopine dehydrogenase  29.8 
 
 		 346 aa  103  6e-21  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1035  saccharopine dehydrogenase  26.98 
 
 		 369 aa  78.6  0.0000000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.002622 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1836  Saccharopine dehydrogenase  27.27 
 
 		 387 aa  57.8  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.973025 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15850  UbiD family decarboxylase  36.75 
 
 		 376 aa  53.5  0.000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.647693  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG01150  spermidine synthase, putative  23.45 
 
 		 748 aa  51.6  0.00002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA02370  saccharopine dehydrogenase (NADP+, L-glutamate-forming), putative  23.29 
 
 		 934 aa  52  0.00002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.840978  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2707  saccharopine dehydrogenase  21.74 
 
 		 439 aa  48.5  0.0002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2300  Saccharopine dehydrogenase  34.86 
 
 		 408 aa  46.6  0.0006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0134168  hitchhiker  0.00267876 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0572  saccharopine dehydrogenase  27.46 
 
 		 388 aa  46.2  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.20382 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0106  saccharopine dehydrogenase (NADP+, L-glutamate forming)  25.15 
 
 		 380 aa  43.5  0.006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>