50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_1228 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_1228  hypothetical protein  100 
 
 		 137 aa  276  9e-74  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.505674  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4322  phage integrase family protein  57.25 
 
 		 193 aa  159  2e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.205034  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0500  integrase family protein  37.14 
 
 		 188 aa  82  0.000000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2812  integrase family protein  36.43 
 
 		 188 aa  79.3  0.00000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1839  phage integrase family protein  34.03 
 
 		 193 aa  71.6  0.000000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.637517  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0081  integrase family protein  33.33 
 
 		 189 aa  63.9  0.0000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1689  phage integrase family protein  29.58 
 
 		 190 aa  63.2  0.000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0076  integrase family protein  31.91 
 
 		 189 aa  62.4  0.000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0140  hypothetical protein  37.5 
 
 		 194 aa  60.8  0.000000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2063  phage integrase family protein  25.71 
 
 		 188 aa  58.5  0.00000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.668188  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0163  integrase family protein  29.08 
 
 		 189 aa  57.8  0.00000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1075  integrase family protein  27.46 
 
 		 190 aa  53.1  0.000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013168  Cyan8802_4647  integrase family protein  30.15 
 
 		 223 aa  52  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1222  site-specific tyrosine recombinase XerC  33.61 
 
 		 306 aa  52  0.000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.120622 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2946  phage integrase family protein  28.37 
 
 		 190 aa  51.2  0.000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.329988 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0163  integrase family protein  31.3 
 
 		 342 aa  50.1  0.00001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.70922  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3476  integrase family protein  31.34 
 
 		 174 aa  47.8  0.00005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0787  formylmethanofuran dehydrogenase subunit E-like protein  31.31 
 
 		 320 aa  46.6  0.0001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  decreased coverage  0.00453269  unclonable  0.000000000000100471 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0563  phage integrase family protein  34.85 
 
 		 191 aa  46.6  0.0001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  hitchhiker  0.00000738062  normal  0.655724 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0945  phage integrase family protein  34.85 
 
 		 211 aa  46.6  0.0001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.237394  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0936  phage integrase family protein  33.06 
 
 		 168 aa  45.8  0.0002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0566684  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_5002  hypothtical protein  35.37 
 
 		 308 aa  45.4  0.0002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0748381  hitchhiker  0.0000000255834 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5700  integrase family protein  54.17 
 
 		 226 aa  45.1  0.0004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1030  site-specific tyrosine recombinase XerC  30.56 
 
 		 307 aa  44.3  0.0006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0791  integrase family protein  31.78 
 
 		 209 aa  43.9  0.0007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.334688  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2215  site-specific tyrosine recombinase XerC  32.11 
 
 		 306 aa  43.5  0.0009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0563  site-specific tyrosine recombinase XerC  32.11 
 
 		 306 aa  43.5  0.0009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.792208  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0772  integrase family protein  30.23 
 
 		 209 aa  43.5  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0092  integrase family protein  29.27 
 
 		 270 aa  43.1  0.001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.554655  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4012  tyrosine recombinase XerC  29.92 
 
 		 294 aa  43.5  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00152232  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0083  site-specific tyrosine recombinase XerC  32.73 
 
 		 322 aa  43.1  0.001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0722  phage integrase family protein  29.7 
 
 		 306 aa  42.7  0.002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0599364 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2501  site-specific tyrosine recombinase XerC  31.78 
 
 		 312 aa  42.4  0.002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.504706  normal  0.936606 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00295  site-specific recombinase, phage integrase family protein  28.21 
 
 		 297 aa  42.4  0.002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0758  phage integrase family protein  29.41 
 
 		 304 aa  42.4  0.002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.000222973  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3124  integrase family protein  29.82 
 
 		 323 aa  42.4  0.002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3403  site-specific tyrosine recombinase XerC  30.56 
 
 		 313 aa  42  0.003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4897  integrase family protein  30.23 
 
 		 336 aa  42  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0180  site-specific tyrosine recombinase XerC  33.33 
 
 		 324 aa  42  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2797  phage integrase family protein  33.04 
 
 		 451 aa  41.6  0.004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0119  integrase family protein  30.23 
 
 		 209 aa  41.2  0.004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3042  tyrosine recombinase XerD subunit  33.01 
 
 		 294 aa  40.8  0.006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000138339  normal  0.959316 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2933  site-specific tyrosine recombinase XerC  31.48 
 
 		 313 aa  40.8  0.006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.83049  normal  1 
 
 
-
 
NC_013386  Adeg_2179  integrase family protein  28.77 
 
 		 288 aa  40.8  0.006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.353401  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1456  integrase family protein  29.63 
 
 		 337 aa  40.8  0.007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.699839  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0492  phage integrase family site specific recombinase  33.98 
 
 		 294 aa  40.4  0.008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0248661  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0553  site-specific tyrosine recombinase XerC  34.15 
 
 		 329 aa  40.4  0.008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.172687  normal  0.167276 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0401  site-specific tyrosine recombinase XerC  32.53 
 
 		 324 aa  40.4  0.009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.145415 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1639  integrase family protein  31.3 
 
 		 301 aa  40.4  0.009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0514216  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1344  integrase family protein  28.7 
 
 		 292 aa  40.4  0.009  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000678444  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>